北醫大引進個人化新一代定序系統「Miseq 定序儀」,將由轉譯醫學研究中心提
供專業服務
為擴展本校轉譯醫學及基因體學研究,本校於 2012 年 10 月添購 MiSeq 新一代定序系統,於 11 月裝機完成,擬將成立定序設施實 驗室提供定序服務,近期會對外公告開放試營運。
近年來,隨著相關技術的快速發展與成熟,新一代定序(Next Generation Sequencing, NGS)方法已被廣泛應用於各類型的生命科學研究工作上。利用 NGS 技術,研究 人員可針對 DNA 與 RNA 進行高速定序,以進行基因序列變異、基因結構異常、基 因表現量、基因體甲基化修飾等研究。NGS 所產出的高通量與高解析度的資料,加 速了基因體學、生物醫學、環境科學等領域的發展。 Illumina 新一代定序系統為目前市占率最高 的定序平台。由 101 年度教育部獎補助款 所補助購置的 Miseq 定序儀是 Illumina 最新 推出的個人化新一代定序系統。其優點在 於可機動且有效率地進行定序工作。利用 CSMA(Clonal Single Molecule Array)與 Reversible Terminator 技術,MiSeq 可在 8~ 48 小時內完成一次包含了 DNA 增幅、定 序以及基本數據分析的工作流程。搭配現 有分子生物學的技術,此系統可進行多種類型的定序工作,如:特定區域再定序 (target region resequencing)、放大子定序(amplicon sequencing)、癌症相關基因定 序(cancer panel sequencing)、轉錄體定序(transcriptome sequencing)、微小核糖核 酸定序(Small RNA sequencing)、菌相定序分析(16S metagenomics)、微生物基因 體定序(small genome sequencing)等。【圖:Miseq 定序儀】
為發揮系統最佳效能並維持定序品質之穩 定性,MiSeq 定序儀目前由研發處共同儀器 中心委託本校轉譯醫學研究中心成立諮詢 團隊,由諮詢團隊協助進行人員操作訓 練、儀器測試與管理。待測試完成後,將 成立定序設施實驗室提供定序服務。此 外,定序設施實驗室亦規劃成立生物資訊 小組,提供後續分析上的諮詢與協助。
(文/研究發展處)【圖:MiSeq 定序儀目前委託轉譯醫學研究中心成立諮詢團隊, 協助人員操作訓練、儀器測試與管理】