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國立成功大學
邁向頂尖大學計畫出國案報告書
報告名稱：赴新加坡 Oral 參加 The 24th International Conference
on Genome Informatics 出國案報告書
出國期間：2013.12.16-2013.12.18
經費來源：邁向頂尖大學計畫經費
單位：電機資訊學院電機所
職稱：博士生
姓名：楊子賢
聯絡電話：0972065058
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中華民國 102 年 12 月 20 日
中文及英文摘要(各 200-300 字)
中文摘要
這一次的出國訪新加坡，是參加計算生物學上最重要的研討會之一 GIW2013。今年的研討會 是 2013 年 12 月 16 日到 2013 年 12 月 18 日，是由新加坡大學所主辦的。這一次參與 GIW2013，
來到新加坡，也走了新加坡的一些地方，對台灣對國際研討會舉辦上的硬體不足的狀況有一些建 議。在研究上，我們在 GIW2013 發表了實驗室對基因轉錄調控的相關研究，也在 workshop 上給 了一個口頭報告。透過與不同國家的計算生物學家們的交流，我們對計算生物學上最新的研究領 域，如 NGS 資料分析，基因體的結構分析，有了進一步的認識，接下來會在這個方面也下長足 的研究心力。
英文摘要
GIW2013 is one of the most important international conferences in computational systems biology. In this year, it is held on 16/Dec/2013 to 18/Dec/2013 by National University of Singapore. To attend this conference, we took the plane to Singapore and stayed there for about five days. During these days, we have also investigated different advances in the infrastructures in the city of Singapore. We found out that there are some issues for the hardware in Taiwan to improve. In the workshop of GIW2013, I gave an oral presentation on my research topic of transcriptional regulation. Some of the feedbacks form the attendants are very innovative and helpful for my future work in multiple transcription factor
transcriptional regulation. I have also learnt a lot from different professionals in the field of
computational biology. Different new aspects of research, such as the analysis of NGS data, the structure of DNA promoter region, the 3D structure of RNA and the prediction and analysis of CRM in metazoan species, was introduced in different workshops of GIW2013. These newly built research area will soon be taken into consideration in my future research. All in all, this is a very good experience for me not only to further polish my research ability but also to give me a new chance of considering the drawback of our nation.
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目次
目的 ... 4
過程 ... 4
心得 ... 5
報告心得方面 ... 5
研究方面心得 ... 5
生活心得 ... 6
建議事項 ... 6
交通方面 ... 6
攜回資料名稱及內容 ... 7
與會照片 ... 8
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本文(包含目的、過程、心得及建議事項，其文字部分須佔三頁以上)
目的
這一次出國赴新加坡，是為參加計算生物學國際上最重要的會議之一的 GIW2013，並在這一 會議中發表與報告在酵母菌的基因調控上的研究成果。
過程
GIW2013 (第二十四屆國際基因體資訊學會議) 國際計算生物學研討會訂於 2013 年 12 月 16 日至 2013 年 12 月 18 日，於新加坡的國立新加坡大學(National University of Singapore)舉行，場 地在新加坡大學 Matrix, Biopolis 大樓進行。
飛行交通方面，由於 PAPER 在會議前的兩個月才確定被接受，直飛新加坡的飛機在此時已 經不容易訂到，為了能節省機票費用，最後訂了在香港轉機的國泰航空的班機。前往新加坡的轉 機時間有一點長，我們在 2013 年 12 月 15 日的一早就開始坐上飛機，接著轉機到香港。到了香 港之後，轉機飛至曼谷，在飛機上做了短暫的停留，最後才由曼谷航行至新加坡，去程的飛行時 間，估計約十個小時，遠大於台灣直飛新加坡的時間，但是為了能以較低的票價成行，只能做此 取捨。16-18 日，為會議進行的時間，2013 年 12 月 19 日早上，搭乘飛機，也是由香港轉機返台。
歸程的航程較短，但是回程遇到航班大誤點，在香港機場多停留了兩三個小時才坐上飛機。最後 約在 19 日的晚間七點返台。
在新加坡的交通方面，我們是以搭乘新加坡捷運為主。為了能節省住宿的費用，下塌的旅店 在芽龍區。此區距離新加坡大學有一小段車程，搭乘捷運加上步行的時間大約要一個小時左右的 時間，三天的研討會大約都是九點半開始，出發的時間其實都算充裕。三天的議程，主要的 workshop 都是在五點半左右結束，晚飯時間為自助餐點，讓與會者能相互交流。
計算生物學的應用範圍極為廣泛，此次的研討會的內容也十分的多樣，從基因體定序後的計 算應用，到基因空間上的分布，都有所涉極。跨領域的合作，在計算生物學上也是必要的，在這 一次的研討會上，也看出不同國家，生物基因體學家與計算科學家的合作關係，常見的還是以生
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物學家處理生物性問題，提出生物問題上所需要的生物計算，再由計算科學家將需求數學化以及 工程化，最後設計演算法或是分析流程，與生物學家共同處理以及解決生物上的問題。現場也有 研究成果海報的展示，不少的研究者和海報的作者在會議休息時間時，討論與分享不相關研究的 心得與想法。
我的口頭報告是在 2013 年 12 月 16 日，會議開始的第一場 workshop 內進行。報告的內容是 有關我們在基因轉錄調控上的研究。我們發展出演算法，利用異質資料做整合，將酵母菌細胞中 的轉錄因子功能性結合對取出。報告的時間不是很長，在有限的時間內，對演算法的內容做介紹 是一大挑戰，最後決定以大方向性的介紹來完成這次的口頭報告。報告結束後，有研究者提出問 題，詢問是否有考量到多重轉錄因子共同調控的問題。這一個問題，實驗室其他的學弟妹有在研 究並處理，所以在回答上面和這位研究者提出這是研究轉錄因子合作關係的問題，是接下來的研 究主題的重點之一。
心得
報告心得方面
與會人士有半數以上是亞洲面孔，分別來自馬來西亞、印尼、新加坡與中國，可以感受到在這些 經濟水平較台灣落後的國家，研究的能力也逐漸在提升當中，足以在世界的舞台上發聲。來自這 些國家的研究者的優勢在於，雖然英文發音帶有口音，但是英文水準相對較為熟練，敢發言也敢 提問，這是本國研究者缺少的部分，這個部分或許是台灣的學生與研究人員可以再加強的部分。
口頭報告的部分，可以發現有一些研究者，在報告的方面，雖然英文程度也不差，但整體報告的 呈現卻不太理想，或許同時這也是一個機會，學習別人不足的部分，讓自己的報告能力再進一步 上升。
研究方面心得
會議中，有許多在計算生物學上最新的議題，如 NGS 資料的處理，DNA 結構與轉錄的關係，
RNA 結構分析，CRM 的預測與分析，這些新的議題，都是目前十分重要的領域。比較可惜的事，
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在 oral presesntation 時，有很多的學生在報告時，對自己的報告主題背景了解的不夠深入，有不 少的學生在報告的時候，沒有對主題的重點著墨，且 Q&A 時，常常無法回覆到重點。這個部分 也值得我們注意，在未來的研究上，對背景知識的了解與認識一定要充足，且對研究主題一定要 花足夠的心思去思考。
生活心得
在參與會議的路途中，也欣賞到新加坡這個城市的很多細節。複雜的城市交通設施，平整與 乾淨的柏油路面及人行道，十分遵守交通法規的人民，明確的指示牌，宏偉的城市建設，噪音值 小於六十分貝的建築工地，隨處可見的導盲磚。來自國際都市諸多的衝擊與遭遇到的人事物，大 大的開展了我們的世界觀，對於新加坡於城市設計上的小細節更是感到敬佩。更值得注意的事，
新加坡這個城市，是由許許多多不同的人種所組成的，不同的人種之間以英文來溝通，顯然當地 對英文的推廣十分的成功。而且，在不同的區域，像是小印度區，或是芽龍區這種以印度人或是 印尼人所組成的區域，治安也十分的好，這顯示出新加坡政府對治安方面的用心。
此次國際會議扎扎實實的上了一課，未來要精進自己的英文程度，在研究上則要持續督促自 己，努力突破研究的瓶頸，讓研究更上一層樓。
建議事項
交通方面
此次會議令人印象深刻的部分在於會場周遭交通十分便利，在國內的會議若舉辦地不在都市 內，往往交通都是十分不便利的地區，若能改善現況，加強各個城市的大眾運輸工具的便利性，
必能吸引到更多國家的優秀研究者前來發表。
硬體方面
GIW2013 在新加坡大學的 MATRIX 這座現代化的建築內舉行，在參加完這一次的研討會後，
深深的覺得台灣以及成功大學在教學以及舉辦會議的硬體上需要加強，簡單的例舉如下：
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1. 會議室：新加坡大學 MATRIX 建築裡，每一層樓都有許多的大型討論室會議室。而 成大在這個方面就做的不太好，能提供討論的場地不多，且硬體設備也欠佳。
2. 電梯：新加坡大學 MATRIX 裡，每一層樓的連接是透過手扶梯和電梯。而在台灣的 各個大學裡，系館或是教學大樓，都只有電梯。以成大來說，電梯的數量十分的少，且硬體 狀況不好，常常會有夾人的問題，等待時間每一次也都超過十分鐘，這對建築內的使用人來 說是一大困擾。
3. 建築：新加坡大學的各個建築都是現代化的建築，外觀具有現代感以及藝術感。而 台灣很多的學校，提供出來的系館或是教學大樓，外表看起來都是老舊不堪，既無英美那邊 的古建築的美，也無現代化的先進感，這個對台灣的研究環境形象有非常大的殺傷力。建築 的命名上，新加坡大學都是直接以 genomics、nanos 這一類的直接命名，讓人一看就了解到這 是基因體中心，或是奈米製程中心。而台灣的校園命名，常使用一些不知所云的名稱，也不 採用中文既有的美感，甚至在學生投票後還不採用，這會讓台灣研究環境的國際名聲下降的。
4. 補助：生活費用的部分，對於學生補助的部分，只有口頭報告的當天以及前後一天，
或許可以考慮補助會議全程，減輕學生出國參加國際研討會的經濟負擔，讓更多的學生能出 國去接受最新的研究知識。畢竟通常出國一趟參加研討會，都會全程把所有議程參加完的，
只有前後一天的補助，或許對學生來說經濟壓力還是過大。
攜回資料名稱及內容
GIW2013 會議議程本以及新加坡大學生物資訊中心簡介。
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附錄(學生請附上其參加會議或活動之出席照片，相片解析度以低解析度處理為原則。)
與會照片
會場的照片
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口頭報告時的照片
海報 session 時的照片
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餐點時間的照片
