國立中興大學物理學研究所 碩士論文

『DNA序列』的統計分析及字串分佈圖象

國立中興大學物理學研究所 碩士論文

研究生：潘佳穎

指導教授：李秉政

中華民國八十七年七月

對於一個類似DNA序列的數據，我們首先需要將其以各 種方式呈現我們眼前，好能進一步地去分析它們，並且 把有用的統計特徵歸納整理出來，以便尋求生物學上可 能的解釋。

(A).

第一種方式是我們可以用不同的字串長度來作測 量，並且藉以計算

i i

i p

p H

n

ln

4

∑

=

−

=

⎟⎟⎠

⎜⎜ ⎞

⎝

⎛

= −

∑

=

n

i

q i

q p

H q

4

1

1 ln

1 Generalized entropy Rényi entropy

其中 n 為字串的長度

如果機率是平均的則

4

max nln H

H = =

(B).

構思如何呈現DNA序列數據的方式，需要運用到我們的 想像力，這裡提供一個具有創意的方式，是由中國國家 科學院的一位知名物理學者郝柏林教授首先提出。

依字串長度排佈成一個平面分佈圖，並以不同

的顏色區別不同的機率