[PDF] Top 20 利用共同結構元實作核醣核酸分群
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利用共同結構元實作核醣核酸分群
... 4.3 系統主架構 下圖為本系統的主要流程圖,整體架構大約可分成五個部份。一開始使用者 可以透過網頁介面設定程式執行參數、輸入核醣核酸序列。之後的前置處理部 份,會根據這些設定值,利用特定的資料結構來表示這些序列資訊;分析完這些 序列內容後,便可利用修改後的 GPRM ... See full document
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利用分群分析香菇菌種類源與多醣結構的特色及利用多樣統計分析香菇多醣結構與巨噬細胞活性關係之研究
... 子量分布在 1x10 2 至 3x10 3 kDa,並且各由不同比例的七種單醣所構成,包括了:葡萄 糖、甘露糖、木糖、半乳糖、黑藻糖、鼠李糖及阿拉伯糖。由於固態的多醣體具有不易 回溶水的特性,因此我們開發以超臨界流體系統之高壓水方式,在 10.1MPa、28°C、70 分鐘的條件下提升多醣體的回溶率可達 90%,而且此萃取方法依然能保α-(1→4)-glucan ... See full document
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利用分群演算法分析低密度奇偶檢查碼的結構
... 再來,感謝同組的力仁學長,很開心能有機會與學長討論;感謝 Martin 與 柏崴學長,感謝你們這段時間的鼓勵。感謝實驗室的戰友們游傑、志凱、鍾豪、 乙澔、恆源、Chatrpol,很開心能在同實驗室一起奮鬥。還要感謝學弟妹們郁善、 智宇、正吉、文豪,感謝你們口試當天幫我舒緩緊張的情緒,非常感謝你們口試 當天還幫我到系辦申請表格資料,我才能完成口試。 ... See full document
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利用核醣核酸的二級結構及基因規劃法找尋其共同結構元
... 義系統參數,包含設定莖幹及環狀結構的範圍,以及莖幹內所允許的內部環狀結 構大小等等。完全使用系統預設的參數,也能達到一定效果。若使用者對於欲預 測的資料有所了解,能提供更嚴謹的系統參數,還可大幅增進預測的正確性。此 外,基因規劃法有本身系統執行時所需的參數,例如族群數量(population size) ... See full document
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利用圖形表示的基因規劃法找尋核醣核酸的共同結構元
... 而在本系統的測試中,當α設定為 0.7 時,可以滿足絕大部份的資料。 3.4.3 母代挑選機制 產生新一代個體時,我們先保留一定比例適應分數高的個體到下一代,剩餘 的個體則透過挑選機制選出母代,執行演化運算後產生新一代的個體。本系統採 用的挑選機制為競賽法(tournament),競賽法可以保留隨機的機制,也符合適者生 存的原理,是目前最普遍採用的選取方法。其挑選的方法為:自母代群體中隨機 ... See full document
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運送去氧核醣核酸之融合蛋白及運送方法
... 審查人員:顏逸瑜 [57]申請專利範圍 1. 一種融合蛋白,其包含:一蛋白質傳遞部分,其包含具有序列辨識編號 2 胺基酸序列之 胜肽片段;及一去氧核醣核酸結合部分,其包含拓樸異構酶之胺基端 200 個胺基酸序列 中具有核配置訊號區域之胜肽片段,其中該去氧核醣核酸結合部分具有選自由序列辨識 編號 ... See full document
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利用演化式計算找尋蛋白質結構之相似結構元
... 目前為止還沒有真正可以徹底解決的好方法,也一直深深困擾著此領域的研究 學者。本研究在不同的模型階段中,提供了一個可以解決了上述傳統老問題的 方法。 多重結構比對時會因為比對順序不同而有不同的比對結果。本研究後置作 業的「產生代表性相似結構元」步驟中,從數個相似但不同的結構元所包含的 ... See full document
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國中生二元一次聯立方程式之概念結構與分群探討
... 年級為範圍,進行詮釋結構模式及 結構化學習法的實證研究,並利用電腦軟體程式輔助數學運算過程,重新編排 學習項目的順序,建立起更科學化的學習路徑與學習地圖,同時建構一個更有 效益的教學構造圖,可讓教師檢視自己的知識體系,幫助學習者在進入新的學 習領域時,可以快速獲取新知,以減輕教師的負擔,達到有意義學習,避免記 ... See full document
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多元計分試題關聯結構與模糊集群在國小學生代數概念之探討
... 綜合以上看法,代數是建立在「數」和「運算」的基礎上,利用符號表 徵來進行運算,也是可以將算式簡化的數學語言。 貳、九年一貫課程之代數概念 數學之所以被納入國民教育的基礎課程,有三個重要的原因:(1)數學是 人類最重要的資產之一。(2)數學是一種語言。(3)數學是人類天賦本能的延 伸。九年一貫課程強調以學習者為主體,以知識的完整面為教育的主軸,以 終身學習為教育的目標,除了數學知識外,演算能力、抽象能力及推論能力 ... See full document
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陰陽子-1/多蜂房蛋白群/去氧核醣核酸甲基轉化酶之複合體透過表基因默化方式抑制CCAAT/促進子結合蛋白結合蛋白-δ基因表現
... 分人類CCAAT/促進子結合蛋白δ如何 受到調控及參與在細胞發炎及脂肪生 合成的重要性及分子機轉(1, 2, 3)。又 如上述所言CCAAT/促進子結合蛋白δ 的增加可以引發細胞休止及凋亡,一 旦其大量表現之後容易對癌症的產生 及形成有不利的作用,因此CCAAT/ ... See full document
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核醣核酸二級結構預測與分群分析
... 一、中文摘要 核醣核酸在後轉譯調控上扮演重要的 角色,然而與去氧核醣核酸不同的是,去 氧核醣核酸的 motif 大多可在序列間發掘 其保留區,而核醣核酸的 motif 則必須在 結構間找尋。目前已有部分分析系統工具 ... See full document
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預測蛋白質上去氧核醣核酸鍵結位置
... 在本研究中,我們針對蛋白質上去氧核醣核酸鍵結位置的預測問題設計一較精確之 分類器,我們分別使用模糊化最近k個鄰居法與向量支持機器法兩種分類器來預測蛋白 質上去氧核醣核酸鍵結位置。最後我們提出一效能較佳之方法,使用向量支持機器法結 ... See full document
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利用次世代定序技術系統化分析微小非編碼核醣核酸
... iii 致謝 關於這個研究首先要感謝中研院植物暨生物學研究所林納生博士於 2008 年提供 第一份 NGS data 開啟我投入這個研究。在當時台灣很少有 NGS data 或是相關研 究,透過和實驗室林豐茂學長合作研究了解如何處理 NGS data,接著發表第一 篇論文。透過處理 NGS data 以及我們 lab 研究 miRNA 的專長,陸續和 UCR 的史 允中以及 Hailing Jin 教授合作分析 NGS ... See full document
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電腦化預測宿主微小核醣核酸在病毒基因組的靶位點以及預測病毒微小核醣核酸
... 注意的是,微小核醣核酸不僅在真核生物中存在,病毒亦能產生微小核醣 核酸,且病毒感染宿主後,宿主細胞中的微小核醣核酸也具有調控病毒的 功能。因此,我們建置 ViTa 和 VirMiR 兩個資料庫來收集病毒產生的微小 ... See full document
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以功能基團計分矩陣預測蛋白質與去氧核醣核酸交互作用之結合模式
... CRP 實驗上給 予我很多幫助。生活上則是要謝謝怡馨對大家有著許多的細心與體貼,帶給 BioXGEM 的我們這群阿宅不一樣光譜的溫暖。在實驗室裡最常跟我一起出去瘋的董花,是個好揪 出遊散心的咖;當壓力很大的時候,他給我的連結總是讓我振奮不已。阿甫總是個美食 的好夥伴,愛攝影的他,也常常帶一些好玩的小東西來實驗室給我們嘗鮮。而我也在跟 ... See full document
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探討兒童急性淋巴性白血病相關之微核醣核酸-181A及微核醣核酸-151的功能
... 感謝給予我契機,讓我有幸踏入小兒血液腫瘤領域的林淑華老師及林東燦醫 師,並且感謝林淑華老師及林淑容老師的細心教導,充分滋養了我的學術基礎及 關於基因剔除小鼠的諸般知識與經驗,在撰寫期刊論文的同時,也習得了諸多寶 貴的經驗與技巧,讓我得以茁壯成長。謝謝所有擔任口試委員的老師們,俞松良 老師的精闢見解、楊性芳老師及曾慶平老師循循善導我的思路、以及陳淑惠醫師 提供的臨床意見,使得我的論文更臻完整。還要感謝 ALL 團隊的所有成員,特別 ... See full document
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應用特徵選取於跨實驗室前列腺癌核醣核酸序列資料
... 因此鮮少研究將各個實驗室的資料去整合成一個更大的資料庫。此研 究主要探討跨實驗室資料的特徵選取議題。實驗使用四組來自不同實 驗室的前列腺癌資料,並應用排名正規化方法去減少來自不同實驗室 的差異。首先我們將三組資料結合成一組作為訓練組,再將剩下的一 組資料做為測試組。並且使用隨機森林演算法去找出在訓練組中有顯 ... See full document
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建置人類核醣核酸編輯點資料庫
... C-to-U 核糖核酸編 輯機制是目前已經被了解和研究的,但是,目前為止沒有任何的資料庫是關於哺 乳類核糖核酸編輯。因此,本研究建立ㄧ個儲存核糖核酸編輯相關資訊的資料庫 系統。這個資料庫系統所儲存的資料包含不同的核糖核酸編輯類型,以及其詳細 ... See full document
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抗雙股去氧核醣核酸抗體的重組
... 全身性紅斑性狼瘡 (Systemic Lupus Erythematosus,SLE) 是一種具有各式各樣臨 床症狀的自體免疫疾病,患者最特別的地方在於血清中有各種自體抗體的產生, 其中最常見到的自體抗體是抗雙股去氧核醣核酸抗體 (anti-dsDNA antibodies), 它也被認為是導致 SLE 最主要的自體抗體,尤其是和狼瘡性腎炎 (lupus nephritis) ... See full document
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干擾病毒複製的小型干擾性核醣核酸分子
... 審查人員:黃教威 [57]申請專利範圍 1. 一種小型干擾性核醣核酸(small interfering ribonucleic acid;siRNA)分子,其具有一第一 序列或一第二序列,該第一序列係如序列辨識編號 1 所示,該第二序列係如序列辨識編 號 2 所示,且該小型干擾性核醣核酸分子係用以干擾石斑魚背鰭細胞株 GF1(寄存編號為 BCRC ... See full document
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