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(三)分子模擬

利用大環構成相似的結晶產生其他不同取代基之大環配位子在不同質子化位置條 件之最佳化結構之模擬預測

我 們 觀 察 到 一 氧 二 氮 九 員 環 及 三 氮 九 員 環 的 結 果 , 可 以 發 現 有 pre-organization 現象,其中 NO2A 在 1,3 位置質子化的結構,推測是九員環中 與鑭系金屬配位效果較佳的大環配位子,因其環穴大小是九員環中較大的。另外,

我們也觀察到接有苯基的三氮九員環與其他九員環比較,會發生環翻轉的情況,

造成沒有 pre-organization 現象,因此與鑭系金屬配位的效果可能因為苯基及結 構上的立體阻礙,會使得較不易與與鑭系金屬形成錯合物。

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1. 一氧二氮九員環:兩個氮上接羧甲基,且 2,3 位置上有質子化 (1O2N_23)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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我們可以觀察到兩個氮上的氫是朝同一個方向 (朝上),而且氧上面的 lone pairs 位置跟兩個氮上的氫一樣,朝同一個方向 (朝上),有 pre-organization 現象。

2. 三氮九員環:

(1) NO2A:兩個氮上接羧甲基,且 1,2 位置上有質子化 (NO2A_12)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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我們可以觀察到三個氮上的質子化氫皆是朝同一個方向 (朝上),有 pre-organization 現象,且發現可能會形成兩組距離皆為 1.79 Å 的氫鍵,此兩組 氫鍵也是讓整個結構穩定的原因之一。

(2) NO2A:兩個氮上接羧甲基,且 1,3 位置上有質子化 (NO2A_13)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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我們可以觀察到兩個氮上的質子化氫不是朝同一個方向,一個朝上,一 個朝下,而另一個氮上的 lone pair 是朝下,表示沒有 pre-organization 現象,且 發現可能會形成兩組距離分為別 1.61 Å 及 2.02 Å 的氫鍵,此兩組氫鍵也是讓整 個結構穩定的原因之一。

(3) NOTA:三個氮上皆接羧甲基,且 1,2 位置上有質子化 (NOTA_12)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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(4) 在 NO2A 一個氮上接苯基,其他兩個氮上接有羧甲基,且 1,2 位置上 有質子化 (NO2A_ph_12)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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我們可以觀察到兩個氮上的質子化氫是朝不同一個方向,一個朝上一個 朝下,而另一個氮上的 lone pair 是朝上,表示沒有 pre-organization 現象,且發 現可能會形成距離為 1.71 Å 的氫鍵。因為此結構其氮上的質子化氫及 lone pair 方位不一樣,沒有 pre-organization 的現象,故推斷再與鑭系金屬形成錯合物的 過程是不易進行的。

(5) 在 NO2A 一個氮上接苯基,其他兩個氮上接有羧甲基,且 1,3 位置上 有質子化 (NO2A_ph_13)

用 CHARMm 做完 minimize 跟 dynamics 後的結構如下

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我們可以觀察到兩個氮上的質子化氫是朝不同一個方向,一個朝上,一 個朝下,而另一個氮上的 lone pair 是朝上,表示沒有 pre-organization 現象,且 發現可能會形成兩組距離分別為 1.71 Å 及 1.73 Å 的氫鍵。因為此結構其氮上的 質子化氫及 line pair 方位不一樣,沒有 pre-organization 的現象,故推斷在與鑭 系金屬形成錯合物的過程是比較不易進行的。

由 NO2A_ph_12 和 NO2A_ph_13 結構得知,氮上的質子化氫對於羧甲 基 的方位有很大的影響,並且也影響到大環結構的變化。

至於 NO2A 及 DO2A dimer 之合成已幾近完成但相關資料尚未齊備,故未能附 上,本人之相關研究已投稿在 2006 J. Chem. Soc., Dalton Trans 上即將被刊出。

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