(Chamberlain et al., 2000；Donald et al., 2001)。農田是一種最大的「人為生態系」（artificial ecosystem），並被認為是不穩定的生態系，農田沒有自己自足的養分循環，通常為一大 面積之單種作物而缺乏自我保護機制，必須仰賴人類照顧和給予外來的能源，其實是不 同於多元化的自然生態系統而必須妥善經營 (陳宜清等，2005)。
造成生物物種數下降，最常見的情況是造成棲地消失以及棲地隔離 (Collinge, 1996；
Pearson et al., 1999；Skole et al., 1994)。地貌上的改變，多數直接影響到鳥類群聚的組 成 (Collinge, 1996；Stouffer & Bierregaard, 1995)，造成這類轉變的主要原因大多是都市 化以及農業活動所造成 (Chamberlain et al., 2000；Freemark & Kirk, 2001；Robinson et al., 2002)。
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由於兩棲類具滲透性的皮膚 (Alford & Richards, 1999；Blaustein & Kiesecker, 2002；
Wilbur et al., 1990)、易快速流失水份 (Kam & Chen, 2000)，因此對濕度變化十分敏度，
陸棲階段的兩棲類，經由皮膚以及呼吸系統產生較高的水份喪失速率，加上缺乏製造濃 縮尿液的能力，使其特別容易為乾旱所害，當環境缺乏適當的濕度會限制活動周期、遷 徙、躲避掠食者與食物的供給，使生存率降低 (Carey & Alexander, 2003)。水份的供給 影響其分布、活動及移動 (Kam & Chen, 2000)。相關研究指出，兩棲類移動時會朝著水 源定向，而在不熟悉的棲地時，可能會把無遮蔽的林地與水連結在一起 (Sinsch, 1992)，
或是先選擇較無阻力的路徑，以利快速通過 (Birchfield & Deters, 2005)。
前人研究指出正常使用化學除草劑對棲息於農田間的脊椎動物成體，如鳥類、蜥蜴、 會影響脊椎動物的發育和繁殖 (Benton et al., 2003；Wilson et al., 1999)。殺蟲劑主要的 作用對象是兩生及爬行動物主要食物的昆蟲及節肢動物，此外殺蟲劑流進水中更毒害了 兩生類的幼體 (呂光洋，1999)。
對於移動性較小的動物而言，一條小溪流或一條新修築的道路，都是行動上極大的 障礙，一條公路可以使原來一個連續性的大棲地分成兩塊不相連的棲地；兩條路則可以
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使原來的一個族群分成不連續的四個小族群 (呂光洋，1999)。許多探討環境差異對於 兩棲爬蟲類影響的研究中發現，棲地改變 (Lüddecke, 2003)、環境中植被變化 (Parris &
McCarthy, 1999；Lemckert & Brassil, 2000；Stoddard & Hayens, 2005)，均對於兩棲爬蟲 類的族群數量有嚴重影響，甚至會改變其物種組成與微棲地選擇 (Pineda & Halffter, 1981; 1991)，以水生昆蟲污染耐受程度所發展之科級生物指標 (Family-Level Biotic Index, FBI) Hilsenhoff, 1988)、以大型無脊椎生物所發展之快速生物評估法 III (Rapid Bioassessment Protocol III, RBP III) (Plafkin et al., 1989; Barbour et al.,1999) 及考量到溪 流棲地狀態的定性棲地評價指數 (Qualitative Habitat Evaluation Index, QHEI) (Rankin, 1989) 等。
國內在這方面的投資和相關的研究並不多，雖然環保署也建立了許多的監測系統，
但大多以水質與空氣品質為主要對象，運用生物作為環境指標的例子也不少，但是少有 長程的執行與資料庫的建立 (李培芬等，2002)。
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