沉澱是傳統的固液分離技術，經有效的混凝及膠凝所產生沉降性 佳之膠羽可在沉澱過程中被移除。因為藻類細胞密度(cell density)相 當低，僅約 1.02 gcm-3(Piterse and Cloot, 1997)，故在混凝及膠凝過程 中，藻類要生成大且密實的膠羽相當困難，此結果可能是造成沉澱效 率不佳的主要原因。藻類的表面形態並不會影響藻類沉澱的效率，一 般使用鋁鹽(aluminium sulphate, AS)混凝後藻類的沉澱移除效率約 70~80%(Jiang et al., 1993; Liu et al., 1999; Drikas et al., 2001)。
除了硫酸鋁混凝劑外，各式各樣的化學混凝藥劑如硫酸鐵(ferric sulphate, FS)、氯化鐵(ferric chloride, FC)、聚氯化鋁(polyaluminum chloride, PAC)及聚硫酸鐵(polyferric sulphate, FS)等均已被用在混凝 程序中處理藻類。使用硫酸鋁混凝對於改變藻類的特性較不明顯。然 而，使用聚硫酸鐵則可增加 21~27%藻類的移除(Jiang, 1993)。另一方 面，若改採陽離子聚合物則可提升藻類的移除率到達 99%，並有助於 過濾。在使用陽離子聚合物混凝及膠凝程序中，藻類的移除率與藻類 的特性並無相關性存在。使用陽離子聚合物主要能強化電性中和及架 橋作用以更有效的促進藻類膠羽的生成，並產生尺寸較大、密實且強 度較強的可沉澱膠羽。因此，使用適當的混凝劑對沉澱過程中移除藻 類是相當重要的，混凝效率若不佳，大量的藻類可能會單獨存在於水 中而無法形成可沉澱的膠羽，不利於後續處理單元的操作(Jun et al., 2001)。
(2)浮除
近十年來，溶解空氣浮除法(dissolved air flotation, DAF)對於去除
低密度藻類的優勢已經被證實(Edzwald, 1993)，而且利用浮除法可有 效的縮短藻類於膠凝過程中所需的時間。許多研究已證實浮除法可將 球形藍綠菌 M. aeruginosa 及桿狀的矽藻 Cyclotella 移除率提升至 94~99.8%之間。整體而言，以 DAF 移除藻類大約較重力沉澱多 15~20%的去除率，此現象之主要原因為 DAF 可去除 30 µm 或更大粒 徑的顆粒，當膠凝效果不佳時，小的膠羽及大的藻類亦可藉由浮除程 序移除。
然而，以 DAF 處理具有鞭毛的藻類時，浮除效果將會降至最低。
如以浮除處理運動能力強的 Chlamydomonas，因其具有鞭毛可脫離膠 羽並游離淨水程序。因此，在混凝及膠凝程序中形成大且強度強的膠 羽對於浮除程序的藻類移除效率亦相當重要。
(3)過濾
過濾是去除沉澱或浮除後殘餘物的後續處理程序。藻類直接過濾 會受到藻類種類及表面官能基變化而影響過濾效率。如大尺寸的 Stephanodiscus hantzschii 可被雙層濾料直接過濾而去除 97%的數量；
而鞭毛狀的 Rhodomonas minuta 僅被去除 5%的數量(Petruševski et al., 1993)。此外，有些物種如微小的藍綠菌會穿透濾池，無法在過濾程 序中被去除。絲狀及針狀的矽澡(Melosira 及 S. acus)均會堵塞濾池而 導致濾池的濾程縮短，如 S. acus 堵塞濾池會導致濾池的濾程由原先 的 35 小時縮短至 3.5 小時(Jun et al., 2001)。藻類直接過濾的過濾性取 決於藻類的表面積及濃度。
由上述可知，影響水處理效能的藻類特性包括表面形態、粒徑、
及葉綠素 a 可作為最適處理程序的評估參數。此外，藻類細胞密度的 大小順序為矽藻(具有硬且富含矽的細胞)＞綠藻＞藍綠菌(具有液 泡)。影響水處理中各單元程序之藻類特性如下：
前氧化：與藻類特性無明顯的相關性
混凝/膠凝：表面形態、活動力、EOM 及表面電位 沉澱：表面形態、活動力及細胞密度
浮除：表面形態、活動力 過濾：表面形態、活動力
整體而言，淨水程序中移除藻類的關鍵在於混凝，許多研究已證 實不同種藻類所需添加的最適混凝劑量有所差異。藻類細胞表面積與 混凝劑量存在極高的相關性，此結果已被認為可用在預測混凝過程中 藻類去穩定所需之最適加藥量。然而，EOM 的組成及濃度亦會對去 除藻類所需的混凝劑量造成影響，不同的藻種，胞外物特性及釋出量 也不同，因此不同藻類所釋放出的 EOM 可能會藉由影響藻類的表面 電荷及與混凝劑產生錯合作用或空間阻隔影響混凝的成效 Tenney et al.(1969)以實驗室規模培養綠藻進行藻類混凝試驗，結果顯示在對數 生長期(Log growth)及生長減緩期(Declining growth)藻類胞外物具有 長鏈分子可提供助凝及架橋功能，所需混凝劑量較少，而內呼吸期時 藻類外部累積胞外物消耗部吩混凝劑，因此需較高混凝劑量。但 Konno(1993)以細長型矽藻(Synedra acus 及 Nitzschia linearis)進行藻 類混沉試驗時發現此類型藻類對數生成期時，藻體細胞表面界達電位 為負值且絕對值大於內呼吸期之電位值，因此所需混凝劑量較多。有 別於一般處理原水中的無機顆粒，對於使用不同混凝劑處理藻類時，
了解藻類表面形態與最適混凝劑量間的關係是淨水處理程序移除藻 類的關鍵。