第三章、 實驗材料與方法
三、 實驗方法
(一) 大白鼠初代肝細胞之分離與培養
1、 肝細胞之分離 (Hepatocyte isolation)
大白鼠肝細胞分離係依據Berry 與 Friend (1969)和 Bonney (1974)等人所發 表,再經Lii 與 Hendrich (1993)加以適度修正之方法,採用兩階段膠原蛋白酶灌 流法(two-step collagenase perfusion)分離肝細胞。
方法如下:大白鼠以腹腔注射(i.p.) sodium pentobarbital (80 mg/kg body weight),麻醉後,剪開腹腔,使用頭皮針經由肝門靜脈灌流。第一階段灌流,先 以 150 ml 灌流液Ⅰ (含 EBSS、0.75 mM EGTA、100,000 unit/L penicillin、100,000 μg/L streptomycin, pH 7.38),在 25 ml/min 流速下,將肝臟中的血液灌洗出;接 著,進入第二階段灌流,使用 200 ml 灌流液Ⅱ (含 EBSS、10 mM HEPES、1.8 mM CaCl2.2H2O、0.8 mM MgCl2.6H2O、100,000 unit/L penicillin、100,000 μg/L streptomycin 與 50 mg 膠原蛋白酶(Collagenase typeⅠ,pH 7.38),並將灌流的速 度降至20 ml/min,約 10 分鐘灌流消化後,肝臟變軟且失去彈性,細胞間隔也會 放大,外觀顏色上則逐漸變淡,此時小心將肝臟剪下,移出體外並置放於過濾尼 龍網上(200 μm, Tetko),以 suspension solution (含 10 mM HEPES、2.6 mM sodium bicarbonate、1μM dexamethasone、1% ITS+、100,000 unit/L penicillin、100,000 μg/L streptomycin 之 RPMI-1640, pH 7.37)輕柔攪拌,將肝細胞洗下。
收集之肝細胞懸浮液先以低速離心(150 xg,3 分鐘)分離出細胞後,再將細 胞懸浮於washing solution (不含 ITS+之RPMI-1640 suspension solution)中,低速 離心(150 xg,3 分鐘/次)清洗細胞二次。接著,細胞懸浮液中加入等量 percoll 溶 液(10X Hank’s buffer:Percoll=1:9),進行等密度梯度離心(250 xg,10 分鐘),
進一步區分肝實質細胞(parenchymal cells)與受傷、死亡細胞或非肝實質細胞 (non-parenchymal cells)。最後,所得肝實質細胞再於 washing solution 中以低速 離心(150 xg,3 分鐘/次)清洗細胞二次,洗去殘餘的 Percoll 溶液。完成清洗程序
後,將所得肝細胞懸浮於細胞培養液(含 10 mM HEPES、2.6 mM sodium bicarbonate、1 μM dexamethasone、100,000 unit/L penicillin、100,000 μg/L streptomycin、2.5% FBS、5 mg/L insulin、5 mg/L transferrin、5 μg/L Na2SeO3之 RPMI-1640, pH7.37)中。分殖到細胞培養皿前,先取 0.1ml 細胞懸浮液加入 1.5ml 細胞培養液及0.4ml trypan blue,混勻後,以血球計數板估計存活總細胞數(total viable cells),最後將細胞密度分別調整為 0.6 百萬/ml。
10X Hank’s buffer(pH 7.4)
Glucose
2、 細胞之培養(Hepatocyte culture)
將2 ml 及 5 ml 細胞懸浮液分別注入到直徑 3.5 公分及 6 公分以預先經膠原 蛋白(collagen)處理過的培養皿(Falcon, Frankin Lakes, NJ, USA)中,置於 37℃、5%
CO2培養箱中培養,4 小時後,先以 37℃磷酸鹽緩衝液(PBS,含 9 mM Na2HPO4、 140 mM NaCl、1 mM NaH2PO4、pH 7.4)清洗一次,並進行第一次培養液(含 10 mM HEPES、2.6 mM sodium bicarbonate、1 μM dexamethasone、100,000 unit/L penicillin、100,000 μg/L streptomycin、2.5% FBS、5 mg/L insulin、5 mg/L transferrin、5 μg/L Na2SeO3之RPMI-1640, pH 7.37)更換。
3、 肝細胞之處理 (Hepatocyte treatment)
大白鼠初代肝細胞分離且經24 小時培養後,分別加入含有不同濃度類黃酮
化合物(apigenin、butein、chrysin、luteolin、phlortin)之培養液,並以 0.1% DMSO 處理組作為控制組,經不同時間培養後,收取、製備樣本供下列分析。
(二) 生化分析
1、 細胞存活率分析(MTT assay)
【原理】
本分析參考Denizot 和 Lang 於 1986 年所發表的方法,MTT
(3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5-diphenyl tetrazolium bromide)為一種淡黃色水溶 性的tetrazolium salt,在活細胞內,可因粒腺體中的 succinate dehydrogenase 之作 用,將MTT 還原成藍紫色非水溶性 formazan,因此藉由藍紫色產物多寡即可作 為細胞毒性及細胞存活率的指標(Denizot and Lang, 1986)。
【步驟】
大鼠初代肝細胞(0.4 x 106 cell/well)種植於 12 孔細胞培養皿(Falcon, Frankin Lakes, NJ, USA)中,4 小時後,第一次更換培養液,再培養 20 小時,移除培養液,
分別加入含10 μM、25 μM 或 50 μM apigenin、butein、chrysin、luteolin 或 phloretin 的新鮮細胞培養液,繼續培養24 小時,移除培養液,以 37℃ phosphate buffered saline (PBS)清洗兩次,加入 1 ml 含 0.5 mg/ml MTT 的 RPMI-1640 培養液,放入 37℃、5% CO2之培養箱,3 小時後,移除培養液,加入 1 ml isopropanol,置於 迴轉式振盪器(waver shaker),以 25 rpm 速度均勻搖晃 10 分鐘,即可將藍紫色 formazan 溶出,吸取 isopropanol 溶液,移入 1.5 ml 離心管中,以 10,000 xg 離心 5 分鐘,取 200 μl 上層液,置於 96 孔盤中,利用酵素免疫分析儀(ELISA , Enzyme-Linked Immunosorbent Assay Model 680)以波長 595 nm 測量吸光值,所 得吸光值與控制組相比,即可求得細胞相對存活率。
2、 蛋白質表現分析-西方墨點法(Western blotting assay) (1) 細胞質液萃取
肝細胞經不同類黃酮化合物處理24 小時後,移除培養液,以 4℃ (冰的) PBS 清洗兩次,加入 300 μl 細胞均質液(含 7.4 mM K2HPO4、2.6 mM KH2PO4及 154.2 mM KCl, pH 7.4),刮取細胞至 1.5 ml 離心管中,以超音波震盪器(Micro Ultrasonic Cell Disrupter, KONTES, Vineland, NJ)震碎細胞,功率設定:750 瓦-
70%,時間設定:震 5 分鐘(間隔 2 秒/次),離心 30 分鐘(11,000 xg、4℃), 所得 上清液即為細胞質液(cytosolic fraction),冰存於 -80℃。
(2) 蛋白質定量
參照Coomassie Plus Protein Assay Kit 方法操作,簡述如下:各取 5 μl BSA 標準品與細胞質液樣本,分別置於96 孔盤內,加入 150 μl dye reagent (細胞原液:
dye reagent=1:30,v/v),置於迴轉式震盪器上,室溫中均勻搖晃 10 分鐘,試 劑將與樣本中蛋白質結合成藍色反應物質,以酵素免疫分析儀(ELISA ,
Enzyme-Linked Immunosorbent Assay Model 680, BD Biosciences)偵測波長 595 nm 吸光值,再與利用 BSA 所求得之蛋白質標準品濃度曲線比照後,即可計算 樣品蛋白質的濃度。
(3) 西方墨點法
蛋白質濃度定量後,以5X 濃度的 sample buffer (含 0.5 M Tris、20%
glycerol、10% SDS、0.1% bromophenol blue 及 5% β-mercaptoethanol)及 potassium phosphate buffer (PPB)將樣品蛋白質濃度調整為 0.4 μg/ul,95℃下加熱乾浴 5 分 鐘使蛋白質變性,取適量體積之樣品注入SDS-PAGE 樣品槽中,以 130 伏特電 壓進行電泳。
5X sample buffer (保存於 4℃) 0.5M Tris 10.0 ml
20% SDS 17.5 ml
β-Mercaptoethanol 2.5 ml Bromopherol blue (w/v) 0.05 ml
Glycerol 10.0 ml
H2O 8.0 ml
Polyacrylamide gel 配方
Separating gel 10% Stacking gel 4%
30% Acrylamide 3.74 ml 0.67 ml 1.5M Tris-HCl(pH8.8) 2.5 ml
0.5M Tris-HCL(pH8.8) 1.25 ml
電泳完成後,取下膠體,切除stacking gel,將 separating gel 浸泡於 transfer buffer (含 80% 25 mM Tris、192 mM glycine 及 20% methanol)中,同時截取一片 與separating gel 大小相同之 PVDF (polyvinylidene fluoride)轉漬膜,先將此膜浸 泡於99.5% ethanol 中 5 分鐘,再與膠片、濾紙及海綿一起浸泡於 transfer buffer
約5 分鐘,依序將海綿、濾紙、膠片、PVDF 膜、濾紙、海綿放置於三明治式塑
膠板中,固定後,放入轉漬槽中,以100 伏特於冰浴中進行轉漬 90 分鐘。
轉漬完成後,取出PVDF 膜,先以冰冷的 buffer A (25 mM Tris-HCl、150 mM NaCl、0.3% Tween 20,pH 7.4)清洗一次,加入 Ponceau S solution 染色並在確定 蛋白質分離之位置後,剪裁PVDF 膜,以冰冷的 buffer A 清洗三次,每次 5 分鐘,
隨後將PVDF 膜浸泡於含 5%脫脂奶粉(skim milk)的 buffer B (含 25 mM
Tris-HCl、150 mM NaCl,pH 7.4)中,置於 4℃下隔夜或於室溫下 2 小時,進行 blocking 反應。
取出PVDF 轉漬膜,以冰冷的 buffer A 清洗三次,每次 5 分鐘,接著依一級 抗體種類不同,於室溫反應60 分鐘或 4℃下反應 overnight,取出後,PVDF 膜 再次以冰冷的buffer A 清洗三次,每次 5 分鐘,隨後加入二級抗體,室溫下反應 40 分鐘後,以冰冷的 buffer A 清洗三次,每次 5 分鐘,最後加入 Enhanced Chemiluminescence Reagent (ECL kit)呈色,並以冷光數位分析儀(LAS-4000, FUJIFILM, Japan)顯像、存檔,待後續蛋白質表現定量分析。
3、 還原態及氧化態麩胱甘肽【GSH and oxidized GSH (GSSG)】含量之分析 本分析參考Yao 等人於 2003 年所發表的方法(Yao et al., 2003),肝細胞經不 同類黃酮化合物處理24 小時後,取 100 μl 細胞質液(cytosolic fraction)與 200 μl 10 mM Ellman’s reagen 震盪均勻後,加入 60 μl 20% 5-sulfosalicylic acid,混合均勻 使蛋白質酸沉澱,離心10 分鐘(10,000 xg、4℃),取 100 μl 上清液,注入高效液 相層析儀/質譜儀(HPLC/MS, High-Performance Liquid Chromatography-Mass Spectrophotometer, Hewlett Packard)中,分析樣本內 GSH 及 GSSG 含量。
4、 Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) (1) Total RNA 的抽取
肝細胞經不同類黃酮化合物處理不同時間後,移除培養液,以冰冷的PBS
清洗二次,加入0.5 ml Trizol reagent,靜置 5 分鐘後,刮取細胞,移入 1.5 ml 離 心管中,加入100 μl chloroform,均勻震盪 15 秒,室溫靜置 4 分鐘,離心 15 分 鐘(11,000 xg、4℃),吸取最上層含有 RNA 的上清液至另一乾淨的 1.5 ml 離心管 中,加入250 μl isopropanol,混合均勻,室溫靜置 10 分鐘使 RNA 沈澱,離心 20 分鐘(11,000 xg、4℃),移除上清液,加入 500 μl 冰的 70% ethanol 清洗殘餘 鹽類,離心5 分鐘(5,000 xg、4℃),最後加入 250 μl 冰的 70% ethanol,並貯存 於-20℃供後續 RNA 表現分析。
取出保存於70 % ethanol 的 RNA 樣品,離心 15 分鐘(11,000 xg、4℃), RNase inhibitor、50 units reverse transcriptase)於 1.5 ml 離心管中,再分別與 0.2 μg/μl RNA 樣品混合,並加入去離子水至總體積為 20 μl,混合均勻後進行逆轉錄 反應(MJ Mino Thermo Cycler, BD Biosciences),設定條件:42℃ 15 分鐘、99℃ 5 分鐘、4℃ 10 分鐘,製造 cDNA 產物。接著,製備 PCR mixture (含 PCR buffer、
Gene Primer Parameters mRNA
product
Cycle number HO-11 5'-AGCATGTCCCAGGATTTGTC-3' 94℃, 30sec 454 bp 25 5'-AAGGCGGTCTTAGCCTCTTC-3' 55℃, 45sec
72℃, 45sec
GCLC2 5'-CCTTCTGGCACAGCACGTTG-3' 94℃, 60sec 346 bp 25 5' -TAAGACGGCATCTCGCTCCT-3' 60℃, 60sec
72℃, 90sec
GAPDH 5’-CCATCACCATCTTCCAGGAG 94℃, 30sec 576 bp 25 3’-CCTGCTTCACCACCTTCTTG 55℃, 45sec
72℃,45sec
(4) DNA 電泳
由每管PCR 產物中取出 10 μl,加入 2 μl 6X loading dye,混合均勻後,注 入含有Ethidium bromide (EtBr)之 1% agarose (SeaKem® LE Agarose)膠中,於電泳 槽中以100 伏特進行電泳,再利用膠片影像分析系統(AlphaImager® EC, Alpha Innotech)照相分析 mRNA 表現。
5、 Transient transfection / Luciferase activity assay
將大鼠初代肝細胞(1.2 x 106)種植於 3 公分細胞培養皿(Falcon, Frankin Lakes, NJ, USA)中,4 小時後,更換培養液,再培養 24 小時,以 37℃ PBS 清洗 細胞一次,加入1ml OPTI-MEM (無血清培養基),1 小時後即可進行轉殖
(transfection)。步驟簡述如下:取 0.4 μg 3x ARE-Luc reporter plasmid (5-TGACTCAGCA-3’)、0.1 μg pCMV-β-galactosidase (β-Gal)plasmid、1 μl
NanofectinTM agent 及 100 μl OPTI-MEM,混合均勻,室溫下靜置 50 分鐘,再與 900 μl OPTI-MEM 混勻。將細胞培養皿中原先的 OPTI-MEM 移除後,加入含報 導基因的新鮮製備反應溶液,即可進行轉殖作用。8 小時後,先置換新鮮
RPMI-1640 培養液 2 小時,再開始給與不同類黃酮化合物處理, 24 小時後,移 除培養液,以冰冷的PBS 清洗二次,加入 100 μl lysis buffer,靜置 5 分鐘後,刮 取細胞,離心3 分鐘(11,000 xg、4℃),吸取上清液進行 luciferase 活性分析。
Luciferase 活性則利用 Luciferase reporter assay kit (BD Bioscience)分析,並以冷光 光譜儀測定冷光值,同時也取部分上清液測量β-galaxtosidase 活性,
β-galaxtosidase 活性係以 Ο-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside (ONPG)為反應受 質,並以酵素免疫分析儀(ELISA Model 680, BD Biosciences)於 415 nm 波長下測 定ONPG 產物濃度。將僅以 0.1% DMSO 處理的控制組細胞的 luciferase 活性及 β-galaxtosidase 活性比值視為 1,類黃酮處理組的活性再與之比較以求得相對比 值。
6、 Electrophoretic mobility shift assay (EMSA) (1) 核蛋白萃取
肝細胞經不同類黃酮化合物處理6 小時後,移除細胞培養液,以冰冷的 PBS
清洗兩次,加入1 ml PBS,刮下細胞,裝入 1.5 ml 離心管中,離心 5 分鐘(20,000 xg、4℃),去除上清液,加入 200 μl 低張溶液(含 10 mM HEPES、10 mM KCl、
1.0 mM EDTA、1.0 mM MgCl2、0.5 mM DTT、0.2 mM PMSF、4 μg/ml leupeptin、
20 μg/ml aprotinin、0.5% NP-40,pH 7.4),溫和地混合均勻,使細胞懸浮於低張 溶液中,冰浴15 分鐘後,離心 15 分鐘(6000 xg、4℃),去除上清液。加入 500 μl buffer B (含 10 mM HEPES、10 mM KCl、1.0 mM EDTA、1.0 mM MgCl2、0.5 mM DTT、0.2 mM PMSF、4 μg/ml leupeptin、20 μg/ml aprotinin)到離心後的細胞核沉 澱物,使細胞懸浮在buffer B 中,離心 15 分鐘(6000 xg、4℃),吸取上清液,離 心後的細胞沉澱物再加入50 μl 高張溶液(含 10 mM HEPES、1.0 mM MgCl2、0.5 mM DTT、0.2 mM PMSF、4 μg/ml leupeptin、20 μg/ml aprotinin、10% glycerol、
400 mM KCl、0.2 mM EDTA),室溫下溫和震盪 30 分鐘,離心 15 分鐘(10,000 xg、
4℃),所得上清液即為細胞核蛋白萃取液(nuclear protein extract)。細胞核蛋白萃 取液以Coomassie Plus Protein Assay Kit Coomassie Plus 定量,樣品保存於-80℃
超低溫冷凍櫃,供後續EMSA 分析使用。
(2) EMSA
製備反應溶液每管含[50 ng/μl poly (dIdC)、1X binding buffer、2.5% glycerol、
5 mM MgCl2、0.05% NP-40 以及 2 ng biotin 標定之 HO1-ARE 序列【forward:
5'-AACCATGACACAGCATAAAA-3' ; reverse: 5'-TTTTATGCTGTGTCATGGTT -3 '】],再分別與 4 μg 細胞核蛋白樣品混合,並加入去離子水至總體積 20 μl。混 合均勻後,室溫下反應30 分鐘,隨後每管加入 5 μl 5X loading dye,並使每管總 體積為25 μl,注入到 6% polyacrylamide gels (6% acrylamide solution、1X TBE buffer、1% APS 及 15 μl TEMED)樣品槽中,以 0.5X TBE buffer 為電泳液,在 32
mA 的冰水浴中進行電泳 90 分鐘,隨後以 100 伏特電壓於冰水浴中繼續轉漬 45 分鐘,將protein-DNA 結合物轉漬至 nylon membrane (HyBond N+)上。轉漬完成 後,取出膜置於紙巾上晾乾10 分鐘,再於紫外光燈下 cross-link 10 分鐘,以 1X wash buffer 清洗 5 分鐘,將膜放入含 10 ml blocking buffer 的容器內均勻搖晃 20 分鐘,隨後加入10 μl Streptavidin- Horseradish Peroxidase (HRP),均勻搖晃 20 分
mA 的冰水浴中進行電泳 90 分鐘,隨後以 100 伏特電壓於冰水浴中繼續轉漬 45 分鐘,將protein-DNA 結合物轉漬至 nylon membrane (HyBond N+)上。轉漬完成 後,取出膜置於紙巾上晾乾10 分鐘,再於紫外光燈下 cross-link 10 分鐘,以 1X wash buffer 清洗 5 分鐘,將膜放入含 10 ml blocking buffer 的容器內均勻搖晃 20 分鐘,隨後加入10 μl Streptavidin- Horseradish Peroxidase (HRP),均勻搖晃 20 分