第二章 研究方法
第二節 研究設計
八、 相關蛋白活性的表現
(一)西方墨點法(Western blot)
1. 細胞蛋白抽取
1)J5(2×105 cells /well)種於 6 well-plate 上,每 well medium 總 量為 3 ml,放入細胞培養箱,待細胞貼附完全貼附後,更換新鮮的 pipetman 吸掉剩餘水分(盡量吸乾避免影響 lysis),加入 lysis buffer 200 μl,用 pipetman 抽吸 10 次後且 votex 1 分鐘,放入-20 ℃冰箱。
先取Bradford 染劑 2 ml 加 8 ml 二次水(5 X 稀釋)混合均勻備 用,將上述不同濃度的蛋白質標準品(BSA)取 15 µl 加入 735 µl Bradford 染劑混合均勻,分別取 200 μl 移入 96 well-plate,做六重複 試驗,靜置5 min 後,利用酵素免疫分析儀(ELISA reader)在 O.D.595 nm 的波長下測定各蛋白質標準品之吸光值。將每個濃度所測的之吸 光值取平均與相對濃度畫出標主檢量線,並求出趨勢線方程式及 R2 值。(R2必須≧0.99 以上的準確度方可接受。)
2)樣品蛋白質定量
先取 10 µl 蛋白質與 90 µl-DDW 混和(10 X 稀釋),從稀釋蛋 白中取15 µl 加入 735 µl Bradford 染劑混合均勻,分別取 200 µl 移入 96well-plate,做六重複試驗,靜置 5 min 後,利用酵素免疫分析儀
(ELISA reader)在 O.D.595 nm 的波長下測定各蛋白質標準品之吸光 值。將每個濃度所測的之吸光值取平均帶入趨勢線方程式中,再乘以 稀釋倍數,則可求得檢體蛋白質之實際濃度。
3.電泳膠片的製作
下層膠注入鑄膠台後,緩緩加滿 isopropanol 去除氣泡並壓平下 層膠之上緣,約 30 分鐘後待膠片凝固,移去 isopropanol。隨即,注 入上層膠並小心地插入電永梳(comb),避免氣泡出現在 well 的下 緣。待上層膠凝固後拔出電泳梳,並以二次水小心沖洗 well 內,避 免雜質殘留。將鑄好的膠片移至電泳槽中,加入running buffer。
表2-10. 下層膠及上層膠的配製
分鐘)即可停止電泳,接著進行蛋白質樣本轉印。
5.蛋白質樣本轉印(Immunoblotting)
1)轉印步驟:
先將 PVDF membrane 裁剪好,再以 methanol 短暫濕潤後,再浸 入轉印緩衝液(transfer buffer;表 2-12)中,接著將裁好的 3 M 濾紙 先浸泡在transfer buffer 中備用,將轉漬夾打開後白色一面朝上,黑色 2%FBS(溶於 0.05 %Tween 20/1X PBS 中)進行 blocking 步驟,以室 溫1 小時為條件進行,目的在於 blocking non-specific sites。取出轉印 膜後再以0.05 %Tween 20/1X PBS 清洗 5 分鐘共 6 次。緊接著進行免 疫反應,以一級抗體(溶於新鮮配製之blocking solution 中,不同品牌 的抗體有不同的稀釋倍數),4 ℃隔夜進行搖盪。隔天取出,回收一 級抗體,以 0.05%Tween 20/1X PBS 清洗轉印膜 5 分鐘共 6 次。加入 稀釋5000 倍的 goat anti IgG(HRP)horseradish peroxidaseconjugated antibody 二級抗體(溶於含 2% FBS 的 0.05%Tween 20/1X PBS 中),
於室溫下搖盪進行 1 小時,最後取出轉印膜後以洗清洗 5 分鐘共 6 次。
清洗完後,浸漬於 0.05%Tween 20/1X PBS 中,等待壓片。
6.壓片製作(暗房操作):
將轉漬膜以濾紙吸乾後,浸泡於 ECL 試劑之混和液(每瓶各 取 1mL 等比例混和)中反應 1 分鐘;以兩張投影片平整包覆轉漬膜,
正面朝上放置於壓片卡夾(cassette)內,再用膠帶固定投影片;以 Hyperfilm 軟片置於上層投影片上,對準轉印膜進行壓片,感光時間 依轉印膜上螢光亮度決定時間長短,約 5 秒至 1 小時不等。取出放 入顯影劑中進行顯影步驟(所需時間依實際觀察而定)並輕微搖晃,
以自來水沖使 30 秒後放入定影劑中,約 1 分鐘後即可取出,再以自 來水沖洗乾淨,晾乾後即可看見 signal 於感光底片上呈現。
7.軟體分析:
將成色完成之底片,以 Tatal-lab 軟體對每一個 band 的密度 加以比較分析。
表2-11. 電泳緩衝液(running buffer)之組成
表2-12. 轉印緩衝液(Transfer buffer)之組成
圖 2-3. 轉漬夾的三明治結構
組成 體積(ml)
10 X SDS buffer(25 mM Tris、
192 mM glycine、0.1% SDS) 200 加H2O2到 2000 ml
組成 重量(g)
Tris 6 Glycine 28.8 100% Methanol 400 ml
加 H2O2到總體積2000 ml