第四章 醫學詞彙字典的應用
4.1 結構化處理方法
根據醫生給定的檢驗項目，本論文提出的結構化處理方法針對檢驗報告摘要 式 段 落 及 特 殊 項 目 段 落 分 別 進 行 結 構 化 。 摘 要 式 段 落 要 將 分 為 主 要 診 斷 (Diagnosis) 、 電 子 顯 微鏡 檢 查 的 狀 況 描 述 (Comment / Narrative) 、 報 告 結 論 (Summary)等三個段落；特殊項目段落分為電子顯微鏡檢查(EM)、切片樣本的大 小及狀況(Specimen type)、切片樣本的描述(Gross description)、光學顯微鏡檢查 (LM)、染色體檢查(DIF)等五個段落。本小節將詳細說明其結構化過程。
<1> 比對字典抽取出關鍵字詞清單
首先將一篇檢驗報告之一摘要式段落輸入結構化模組中，與字典中的字詞依 照特定規則進行比對，並將檢驗報告中比對到的字詞依照順序取出，以建立此篇 檢驗報告的關鍵詞彙清單。比對規則順序如下:
(1)字典中字詞之長度小於 2 者不比對，
(2)字詞之單字組合個數較多者優先比對，
(3)字詞出現頻率較高者為次優先比對，
(4)否定字清單比對，其中否定字如表 8 所示之清單。
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表 8 否定字與對應字詞連接部份範例 否定字清單
no Neither Nor without negative 範例
句子 no significant immunodepostion of IgG, IgM, IgA, C3.
對應之關鍵字 關鍵字 1: no IgG
關鍵字 1: membranous lupus glomerulonephritis 關鍵字 2: stage 3 ( ins/rps class 5 )
連接: membranous lupus glomerulonephritis ( stage 3(ins/rps class 5) )
show
關鍵字 1: glomerular change show 關鍵字 2: sclerosing change
連接: glomerular change show sclerosing change
for
關鍵字 1: poor quality 關鍵字 2: for
關鍵字 3: sclerosing change
連接: poor quality for ultrastructure interpretation
of
關鍵字 1: thrombotic microangiopathy change 關鍵字 2: of
關鍵字 3: glomerulus
連接: thrombotic microangiopathy change of glomerulus
%
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比對完成後將特殊字詞進行前後連接，組合成較完整的敘述短句，合併樣式如表 9 所示，且若有否定字須將其加入對應的關鍵字詞前。完成上述之步驟，即可建 立一份關鍵詞彙清單所成的集合K。
<2> 摘要式段落結構化
摘要式段落需要將報告中取出的醫療詞彙分為檢驗程序(Procedure)、主診 斷(Primary diagnosis)、或額外特徵(additional features)。由於在我們建立 的詞彙字典中，已將結尾字相同的詞彙整理在一起，因此只要由專家給訂一些程 序/病名結尾關鍵字，便可自動從字典中比對出所有屬於該程序/病名的各種特定 程序及病名亞型。
進行摘要式檢驗報告結構化時，以𝑆𝐼表示摘要項目 I 對應的關鍵結尾字清單 (I 可為檢驗程序(Procedure)或病症診斷(diagnosis))。將關鍵字清單K中每個 關鍵字詞之結尾字與摘要項目關鍵結尾字清單𝑆𝐼進行比對(摘要項目關鍵字之字
尾清單如表 10 所示)，將比對到之關鍵字詞指定到對應的摘要項目，沒比對到的 關鍵字詞則列為額外特徵項目，將以範例 4-1 說明。
【範例 4-1】
假設檢驗報告之主要診斷(Diagnosis)段落(摘要式段落之一)如表 11 所示。首 先將內文與字典中的字詞進行比對，建立關鍵字清單K。接著再透過公式九將關 鍵字詞清單K中關鍵字詞𝑘1、𝑘2、𝑘3、𝑘4、𝑘5、𝑘6、𝑘7之結尾字與摘要項目關鍵
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結尾字清單𝑆Procedure和𝑆Diagnosis比對。𝑆Procedure清單中的 biopsy 和𝑘1的結尾字 比對相同，故將𝑘1加入摘要項目的檢驗程序(Procedure)中。𝑆Diagnosis清單中的 glomerulopathy、glomerulosclerosis、nephropathy、glomerulosclerosis 和 𝑘2、𝑘3、𝑘6、𝑘7的結尾字比對相同，故將這些關鍵字詞加入摘要項目的主診斷 (Primary diagnosis)中。其餘沒比對到的關鍵字詞𝑘4、𝑘5歸類於額外特徵項目 (Additional features)。
表 10 結構關鍵字之字尾清單部分範例
transplantation (移植法) nephrosclerosis
(腎硬化)
glomerulonephritis (腎小球腎炎) glomerulonephropathy
(腎小球腎病)
arteriolosclerosis (小動脈硬化) glomerulosclerosis
(腎小球硬化)
glomerulopathy (腎病) arteriosclerosis
(動脈硬化)
pyelonephritis (腎炎)
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表 11 檢驗報告之主要診斷(Diagnosis)段落與結構化之範例
主要診斷 (Diagnosis)
Kidney, left, echo-guided percutaneous needle core biopsy, focal mesangial proliferative and sclerotic glomerulopathy with focal segmental glomerulosclerosis (11 / 33), patchy tubular atrophy (up to 15% in area), and scattered to clustered interstitial
CD20-positive lymphocytic infiltration, c / w IgA nephropathy (class II) with focal segmental glomerulosclerosis.
關鍵字 清單
關鍵字詞𝑘1: echo-guided percutaneous needle core biopsy 關鍵字詞𝑘2: focal mesangial proliferative and sclerotic glomerulopathy
關鍵字詞𝑘3: focal segmental glomerulosclerosis ( 11/33 ) 關鍵字詞𝑘4: patchy tubular atrophy ( up to 15 % in area ) 關鍵字詞𝑘5: clustered interstitial cd20-positive lymphocytic infiltration
關鍵字詞𝑘6: c/w iga nephropathy ( class II ) 關鍵字詞𝑘7: focal segmental glomerulosclerosis
結構化
(1) 檢驗程序 (Procedure)
1. echo-guided percutaneous needle core biopsy (2) 主診斷 (Primary diagnosis)
1. focal mesangial proliferative and sclerotic glomerulopathy 2. focal segmental glomerulosclerosis ( 11/33 )
3. c/w iga nephropathy ( class II ) 4. focal segmental glomerulosclerosis (3) 額外特徵 (Additional features)
1. patchy tubular atrophy ( up to 15 % in area )
2. clustered interstitial cd20-positive lymphocytic infiltration
特殊項目段落結構化則須呈現檢查結果是否出現特定檢驗細項，由於特殊項 目段落敘述中有很多是單獨或連續的形容詞，亦屬於檢驗細項的結果資訊，如範 例中出現的“diffuse segmental coarse granular”，因此對特殊項目段落擷 取關鍵詞彙清單K時，除了採用名詞字典，還要採用形容詞字典。接下來根據醫 師給訂結構化報告偏重的特定檢驗細項關鍵字，將段落擷取出之關鍵詞彙清單K
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The DIF study demonstrates diffuse segmental coarse granular to lumpy depositions of IgA (grade 3-4/4) and C3 (grade 3/4) with focal Segmental grade 2-3/4 mesangial deposition of IgG and negative staining to IgM, C1q, C4, and fibrinogen.
關鍵字
關鍵字詞𝑘7: negative staining to IgM, C1q, C4, and fibrinogen
結構化
Staining pattern: ■granular □ linear Location: ■focal ■diffuse ■segmental
□global ■mesangial □glomerular capillary wall IgA deposition/expression □abscence ■present (grade 3-4/4) IgG deposition/expression □abscence ■present (grade 2-3/4) IgM deposition/expression ■abscence □present
C3 deposition/expression □abscence ■present(grade 3/4) C4 deposition/expression ■abscence □present
C1q deposition/expression ■abscence □present C4d deposition/expression □abscence □present Fibrinogen insignificant ■abscence □present
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