第二章 實驗部分
第二節 配位基的合成與鑑定
本研究使用本實驗室江建緯學長所開發之含氮氧五牙基2,6-Bis (((S)-2-diphenylhydroxymethyl)-1-pyrolidinyl)methyl)pyridine (H2B DPP),以及有取代基修飾的2,6-Bis (((S)-2-(bis(4-methoxyphenyl)-hydroxymethyl)-1-pyrrolidinyl)methyl)pyridine (H2BDPOMeP)。11以上 兩個分子的合成路徑,如下圖2-1所示。
圖 2-1 配位基合成路徑
1. pyridine-2,6-diylbis(methylene)bis(4-methylbenzenesulfonate)之
合成
秤取2,6-pyridinedimethanol (4.2441 g, 30.5 mmol) 於含有磁石 的250 mL單頸圓底瓶中,接著加入試藥級四氫呋喃和40% KOH各
100 ml,於0 °C下反應半小時。之後將4-toluenesulfonyl chloride (11.6297 g, 61.0 mmol) 加入至溶液中,在低溫反應槽0 °C下反應12 小時。反應完畢後以試藥級二氯甲烷/去離子水萃取三次,有機相使 用減壓濃縮儀將溶劑移除,再以適量試藥級二氯甲烷溶解,使用去離 子水萃洗有機相三次,保留有機相,並用無水硫酸鎂除水乾燥後過濾,
將溶液收集並以減壓濃縮儀將溶劑移除。最後再以試藥級二氯甲烷於 室溫下再結晶,可得到透明柱狀晶體產物 (9.15 g, 67%),分子式 C21H21NO6S2 (F.W. = 447.52)。1H-NMR (400 MHz, CDCl3, ppm):δ 7.79 (d, J = 8.10 Hz, 4H),7.68 (t, J = 7.78 Hz, 1H),7.35-7.29 (m, 6H),5.04 (s, 4H),2.43 (s, 6H),詳細NMR光譜圖於附錄A-3。
第三節 鈷金屬錯合物的合成與鑑定
(0.2914g , 65%) , 並 以 x-ray 繞 射 解 析 鑑 定 得 其 分 子 式 為
真空系統將剩餘溶劑移除,加入二氯甲烷回溶並使用celite過濾鹽類
使用血清塞封住反應瓶口,完成後送出手套箱並加入20 mL丙酮到裝
= 843.64)。Anal. Calc.: C, 64.07; H, 6.09; N,4.98. Found: C, 63.617;
H, 6.048; N, 5.244. UV-Vis (MeCN): 380 (160 M-1 cm-1) nm, 494
重複此動作三次,另外取含有磁石的25 mL反應瓶送入手套箱,接著
第四節 鈷金屬錯合物與一氧化氮之反應
第三章 結果與討論
屬形成更強的鍵結,並穩定五配位系統。鍵長與鍵角數據列表3-1,
O(1)-Co(1)-O(2) 133.44(6) N(2)-Co(1)-N(1) 79.99(6) O(1)-Co(1)-N(2) 120.74(6) O(1)-Co(1)-N(3) 106.05(6) O(2)-Co(1)-N(2) 105.73(6) O(2)-Co(1)-N(3) 83.17(6) O(1)-Co(1)-N(1) 84.46(6) N(2)-Co(1)-N(3) 80.27(6) O(2)-Co(1)-N(1) 101.93(6) N(1)-Co(1)-N(3) 160.26(5)
二、 二價鈷錯合物 Co(BDPOMeP) (2) 合成與探討 錯合物 1 相同的現象,其原因皆是pyridyl為π-acceptor,可與中心金
屬形成更強的鍵結,並穩定五配位結構的錯合物。錯合物 2 的中心 O(2)-Co(1)-N(3) 83.77(13) N(2)-Co(1)-N(1) 79.25(16) O(1)-Co(1)-N(3) 104.57(13) N(3)-Co(1)-N(1) 159.06(14)
三、 三價鈷錯合物 [Co(BDPP)(H2O)](BF4) (3) 合成與探討
周圍配位鍵長較短於錯合物 1 的鍵長。鍵長與鍵角數據列表 3-3,完 整的晶體參數詳見附錄 B-6。
從此實驗結果發現,實驗過程中並無加入水分子,但經 X-ray 單
晶繞射解析後,得到第六配位為水分子的錯合物 3。計算中心金屬與 周圍配位基的電子數,共 18 電子,符合 18-electron rule,說明了錯 合物 3 的中心三價鈷離子傾向為電子低自旋系統 (S = 0)。利用錯合
N(2)-Co(1)-O(2) 92.66(17) O(1)-Co(1)-N(1) 86.84(15) N(2)-Co(1)-O(1) 94.95(17) O(3)-Co(1)-N(1) 93.89(16) O(2)-Co(1)-O(1) 172.32(15) N(2)-Co(1)-N(3) 84.60(16) N(2)-Co(1)-O(3) 178.95(15) O(2)-Co(1)-N(3) 87.15(15) O(2)-Co(1)-O(3) 87.64(16) O(1)-Co(1)-N(3) 94.60(15) O(1)-Co(1)-O(3) 84.73(16) O(3)-Co(1)-N(3) 96.42(15) N(2)-Co(1)-N(1) 85.09(17) N(1)-Co(1)-N(3) 169.68(17) O(2)-Co(1)-N(1) 92.78(16)
四、 三價鈷錯合物 [Co(BDPOMeP)(H2O)](BF4) (4) 合成與探討
中心金屬離子與氮原子及與氧原子間鍵結較強,故周圍配位鍵長較短
N(2)-Co(1)-O(2) 92.37(15) O(1)-Co(1)-N(3) 92.53(14) N(2)-Co(1)-O(1) 91.63(15) O(3)-Co(1)-N(3) 95.40(15) O(2)-Co(1)-O(1) 175.93(14) N(2)-Co(1)-N(1) 85.37(15) N(2)-Co(1)-O(3) 179.54(16) O(2)-Co(1)-N(1) 93.54(15) O(2)-Co(1)-O(3) 88.03(14) O(1)-Co(1)-N(1) 87.56(14) O(1)-Co(1)-O(3) 87.98(13) O(3)-Co(1)-N(1) 94.38(15) N(2)-Co(1)-N(3) 84.85(16) N(3)-Co(1)-N(1) 170.22(16) O(2)-Co(1)-N(3) 87.06(15)
第二節 二價鈷錯合物氧化還原電位之探討
錯合物 1 在在二氯甲烷中進行電化學測量,其掃描速率為25 mV s−1 (圖3-5),半電位E1/2 = -0.476 V vs. Fc/Fc+ in CH2Cl2 (Colll/Coll),
ΔE = 0.125 V,ipa/ipc = 0.996,可發現其具有可逆 (reversible) 的氧 化還原峰。
另一方面,錯合物 2 在二氯甲烷中進行電化學測量,其掃描速 率為50 mV s−1 (圖3-5),半電位E1/2 = -0.490 V vs. Fc/Fc+ in CH2Cl2 (Colll/Coll),ΔE = 0.110 V, ipa/ipc = 0.999,可發現其具有可逆 (reversible) 的氧化還原峰。
圖 3-5 錯合物 1, 2 的 cyclic voltammetry 比較圖譜
錯合物 2因為配位基上具有推電子基的官能基,而與錯合物 1 的半電位E1/2相差14 mV (圖3-5)。錯合物 2 的半電位E1/2數值較負,
在熱力學上ΔG = - nFE (G為自由能,n為莫耳數,F為法拉第常數,
E為還原電位),傾向於自發反應,表示錯合物與ferrocenium的反應 更容易進行。
第三節 鈷錯合物之紫外-可見光吸收光譜探討 一、 二價鈷錯合物的紫外-可見光光譜比較
以二氯甲烷配製濃度為 1.50 mM 的錯合物 1 溶液,經由 UV-vis 吸收光譜儀進行偵測,錯合物 1 在 380 nm (ε = 350 M-1 cm-1) 和 600 nm (ε = 35 M-1 cm-1)有特徵吸收峰 (圖 3-6),其特徵吸收峰皆為 d-d
transition。
以二氯甲烷配製濃度為 1.12 mM 的錯合物 2 溶液,經由 UV-vis 吸收光譜儀進行偵測,錯合物 2 也在 380 nm (ε = 360 M-1 cm-1) 和 600 nm (ε = 40 M-1 cm-1)有特徵吸收峰 (圖 3-7),其特徵吸收峰皆為
d-d transition。比較錯合物 1 與錯合物 2 的特徵吸收峰,可發現兩 錯合物的特徵吸收峰非常相似。
圖 3-6 錯合物 1 之 UV-vis 吸收光譜
圖 3-7 錯合物 2 之 UV-vis 吸收光譜
二、 三價鈷錯合物的紫外-可見光光譜比較
以乙腈配製濃度為 1.27 mM 的錯合物 3 溶液,經由 UV-vis 吸收 光譜儀進行偵測,錯合物 3 在 380 nm (ε = 160 M-1 cm-1) 、494 nm (ε = 135 M-1 cm-1) 和 600 nm (ε = 40 M-1 cm-1)有特徵吸收峰 (圖 3-8)
,特徵吸收峰皆為 d-d transition。與錯合物 1 相比,在 494 nm 有新 的特徵峰生成。
圖 3-8 錯合物 3 之 UV-vis 吸收光譜
以四氫呋喃配製濃度為1.17 mM的錯合物 4 溶液,經由 UV-vis 吸收光譜儀進行偵測,錯合物 4 在400 nm (ε = 250 M-1 cm-1) 、518 nm (ε = 200M-1 cm-1) 和620 nm (ε = 30 M-1 cm-1)有特徵吸收峰 (圖
3-9),特徵吸收峰皆為d-d transition。與錯合物 2 相比,在518 nm 有新的特徵峰生成。
圖 3-9 錯合物 4 之 UV-vis 吸收光譜
比較錯合物 3 與錯合物 4 的特徵吸收峰,發現特徵吸收峰的波 長有些改變,其原因有可能是溶劑所造成的;消光係數有所變化,推 測配位基的推電子修飾 (電子效應),對錯合物 4 的中心鈷三價離子 有一定的影響。
第四節 二價鈷錯合物與一氧化氮反應之探討
在一氧化氮分子與中心金屬配位鍵結(M-NO)後,其鍵結會擁 有極強的共價性。其因當NO鍵結至金屬上時,氮原子的σ orbital會先 提供電子密度至金屬,然後金屬藉由 M-L的π bond反贈予(back donating)給NO的π*軌域。因電子在M-NO鍵上有非定域性,無法準
確的判定中心金屬的氧化數,所以,Enemark和Feltham在1974年提 出一套簡單的表示方法,12即以{M(NO)}n 的寫法取代傳統定義金屬 價數及一氧化氮分子價數的表示法;在{M(NO)}n 的表示法中,M 代 表與一氧化氮分子鍵結的金屬離子,n 為金屬d 軌域電子再加上一氧 化氮π*軌域上未成對電子總合。
一、 Co(BDPP) (1) 與一氧化氮之反應
在氮氣下,以二氯甲烷配製濃度約為1 mM的錯合物 1 溶液,將 溶液導入UV石英槽中,將一氧化氮打入石英槽中的head space,經 由UV-vis吸收光譜儀隨時間進行偵測 (圖3-10)。光譜上的變化除了增 強原先起始物在380 nm處並獲得最大的吸收度之外,並且在525 nm 有一新的吸收峰生成,反應溶液則由淡綠色轉為粉紫色。
圖 3-10 錯合物 1 與 head space 一氧化氮擴散反應之 UV-vis 吸收光譜變化
錯合物 1 與head space一氧化氮的反應速率較慢,因此改變實 驗過程,以提升反應速率。在氮氣下,以二氯甲烷配製濃度約為1 mM 的錯合物 1 溶液,將溶液導入UV石英槽中,將一氧化氮打入石英槽 中溶液的液面下,經由UV-vis吸收光譜儀隨時間進行偵測 (圖3-11)。
在光譜上, 加入一氧化氮反應一分鐘與反應六十分鐘的光譜表現相 同,表示當錯合物 1 與一氧化氮反應時,其反應速率極快,短時間
內即反應完成。
圖 3-11 錯合物 1 與一氧化氮直接反應之 UV-vis 吸收光譜變化
自傅立葉轉換紅外光譜儀 (FT -IR),可觀測到錯合物 1 與一氧 化氮反應後,其光譜在1615 cm−1有吸收峰生成 (圖3-12中紅線)。初 步純化的粉末回溶,在光譜上1615 cm−1的吸收峰更加明顯 (圖3-12 中綠線),顯示錯合物 1 與一氧化氮反應後生成在氮氣下穩定的新化 合物 (錯合物 5,Co(BDPP)(NO), {Co(NO)}8)。
圖 3-12 錯合物 1 與一氧化氮反應之 FT-IR 光譜
經由理論計算的方式,可得到錯合物 5 之模擬結構,所使用的 計算軟體為Gaussian 09 (G09) program package,13計算方法為利 用B3LYP,14混合基底6-31G (d, p)(N, O) 和6-31G (p)(C, H) 與 modified LANL2DZ15來計算Co的部份。經計算的錯合物 5 模擬結果 如圖3-13,其中Co‒NO的夾角約為132°(彎曲型),表示此時的NO分 子傾向為nitroxide ion (NO−)。通常彎曲型NO分子的振動頻率大約在 1720-1400 cm-1之間,16計算後錯合物 5 的IR光譜在1621 cm-1 (圖 3-14)有NO分子的振動頻率吸收訊號與實驗值1615 cm-1相近。綜合 以上兩點,推論出錯合物 5 的中心金屬離子傾向正三價的鈷離子,
而NO配位後形成NO−的配位基。
圖 3-13 理論計算之錯合物 5 的示意圖
圖 3-14 錯合物 5 之理論計算 IR 光譜
二、 Co(BDPOMeP) (2) 與一氧化氮之反應
在氮氣下,以二氯甲烷配製濃度約為1 mM的錯合物 2 溶液,將 溶液導入UV石英槽中,將一氧化氮打入石英槽中的head space,經 由UV-vis吸收光譜儀隨時間進行偵測 (圖3-15),光譜上的變化除了增 強原先起始物在380 nm處並獲得最大的吸收度之外,並且在518 nm 有一新的吸收峰生成,反應溶液則由淡綠色轉為粉紫色。
圖 3-15 錯合物 2 與 headspace 一氧化氮擴散反應之 UV-vis 吸收光譜變化
錯合物 2 與head space一氧化氮的反應速率過於緩慢,無法判 定反應是否完全,因此改變實驗過程,以確認反應完全。在氮氣下,
以二氯甲烷配製濃度約為1 mM的錯合物 2 溶液於含有磁石的50 mL反應瓶中,將一氧化氮管線導入在反應溶液中,反應三小時,將 反應完成後的溶液導入UV石英槽中,經由UV-vis吸收光譜儀隨時間 進行偵測 (圖3-16)。在光譜上,偵測一分鐘與三十分鐘的光譜表現 相同,表示在反應瓶內,錯合物 2 與一氧化氮已全部反應完成,且 反應生成物在此時間內具有穩定性。
圖 3-16 錯合物 2 與一氧化氮反應生成物之穩定性測試
自傅立葉轉換紅外光譜儀 (FT-IR),可觀測到錯合物 2 與一氧 化氮反應後,其光譜上1720 cm−1有吸收峰生成 (圖3-17中紅線),推 測生成新化合物 (錯合物 6,Co(BDPOMeP)(NO), {Co(NO)}8)。
圖 3-17 錯合物 2 與一氧化氮反應之 FT-IR 光譜
與錯合物 5 相比,錯合物 6 上NO分子的振動頻率較大,表示
NO仍維持中性的分子鍵結在正二價鈷離子上。將初步純化的粉末回 溶,測其光譜,然而在光譜上1720 cm−1的吸收峰卻消失 (圖3-17中 綠線),顯示錯合物 6 的Co-NO鍵與錯合物 5 相比,其鍵能較弱。
第四章 結論與展望
經 X-ray 單晶繞射解析後,發現其第六配位接上水分子。經計算中心 金屬與周圍配位基的電子數,共 18 電子,符合 18-electron rule,說 明了錯合物 3 和 4 的中心三價鈷離子傾向為電子低自旋系統 (S =
參考文獻
1. Koshland, D. E. Science 1992, 258, 1861.
2. (a) Baek, S.-H.; Rajashekara, G.; Splitter, G. A.; Shapleigh, J.
P.J. Bacteriol. 2004,186, 6025. (b) Missall, T. A.; Lodge, J. K.;
McEwen, J. E. Eucaryot. Cell. 2004, 3, 835. (c) Sarti, P.; Fiori, P.
L.; Forte, E.; Rappelli, P.; Teixeira, M.; Mastronicola, D.; Sanciu, G.; Giuffré , A.; Brunori, M. Cell. Mol. Life Sci. 2004, 61, 618. (d)
Inorg.Chem. 2001, 40, 3774−3780.
8. Kozhukh, J.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 11120−11123.
9. Hayton, T. W.; Legzdins, P.; Sharp, W. B. Chem. Rev. 2002, 102, 935−991.
10. Zhang, Z.; Suwabe, T.; Ishikawa, M.; Funahashi, Y.; Inomata, T.; Ozawa, T.; Masuda, H. Dalton Trans. 2013, 42, 4470–4478.
11. 江建緯,國立台灣師範大學化學研究所博士論文,2012。
Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.;
Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.;
Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, J. A., Jr.; Peralta, J. E.;
Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.;
Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.;
Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.;
Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.;
Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.;
Daniels, A.D.; Far as, .; Fores an, . B.; rti , . .;
Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
14. (a) Lee, C. T.; Yang, W. T.; Parr, R. G. Phys. Rev. B. 1988, 37, 785−789. (b) Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648−5652.
15. (a) Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270.(b) Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 284.(c) Hay, P.
J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 299.
16. McCleverty, J. A. Chem. Rev. 2004, 104, 403−418.
17. 周彥甫,國立台灣師範大學化學研究所碩士論文,2013。
附錄 A NMR 光譜圖
2,6-Bis(((S)-2-diphenylhydroxymethyl)-1-pyrolidinyl)methyl)pyridine (H2BDPP) 的1 H-NMR (CDCl3) 光譜圖
2,6-Bis (((S)-2-(bis(4-methoxyphenyl)-hydroxymethyl)-1-pyrrolidinyl)methyl)pyridine (H2BDPOMe P) 的1 H-NMR (CDCl3) 光譜圖
2,6-Bis (((S)-2-(bis(4-methoxyphenyl)-hydroxymethyl)-1-pyrrolidinyl)methyl)pyridine (H2BDPOMe P) 的1 H-NMR (CDCl3) 光譜圖
附錄 B X-ray 單晶繞射解析結構及晶體常數
CoBDPP (1)的X-ray繞射結構
CoBDPP (1)的X-ray繞射結構 Table B-1 CoBDPP (1) 的晶體常數
Identification code a14836a
Empirical formula C41 H41 Co N3 O2
Formula weight 666.70
Temperature 200(2) K
Wavelength 0.71073 Å
Crystal system Monoclinic
Space group P 21
Unit cell dimensions a = 9.5520(5) Å = 90°.
b = 13.8878(7) Å = 109.318(2)°.
c = 13.1747(6) Å = 90°.
Volume 1649.31(14) Å3
Z 2
Density (calculated) 1.342 Mg/m3 Absorption coefficient 0.562 mm-1
F(000) 702
Crystal size 0.79 x 0.75 x 0.67 mm3
Theta range for data collection 2.74 to 25.03°.
Index ranges -8<=h<=11, -16<=k<=14, -15<=l<=14
Reflections collected 11672
Independent reflections 5140 [R(int) = 0.0208]
Completeness to theta = 25.03° 99.4 % Absorption correction multi-scan
Max. and min. transmission 0.7048 and 0.6653
Max. and min. transmission 0.7048 and 0.6653