綠島周遭測站採樣時間為 2008 年 10 月，並且根據採樣地點，
可劃分兩部分以觀察色素濃度分布的概況。以測站 W1、W3 及 W5 為一討論據點且歸類為 A；測站 N1~N5 為另一討論據點歸類為 B。
兩分類區域並無發現 neo 及 lutein 存在。從分類 A 三個測站觀察，其 Chl. a 最大值出現於 W3 測站水深 50 公尺處，其濃度為 0.384μg/L。
在藻類色素表現上，整體趨勢以 Chl. b 為主要色素體，其次為 hex、
fuco、but 及 zea。其餘色素於此測站區域平均濃度皆低於 0.001μg/L(圖
8)。
分類 B 五個測站其色素隨深度分布，其 Chl. a 最大值出現於 N3 測站，水深 50 公尺處，濃度為 0.566μg/L。綜觀五個測站，其色素表
現整體仍以 Chl. b 為主要色素體，其次為 hex、fuco、but 及 zeax。其 餘色素於此測站區域平均濃度皆低於 0.003μg/L(圖 9)。
3.4.2 藻類族群結構
分類 A 三個測站(W1、W3 及 W5)，其藻類族群結構於水體垂 直分布並無發現 Euglenoids 存在。以 Prymnesiophytes 及
Prochlorococcus 為主要優勢，且兩者所貢獻之生物量最大值，皆出現
於水深 100 公尺處。其次為 Chrysophytes
、
Chlorophytes、
Dinoflagellates
、
Cyanobacteria 及 Diatom。其他藻種如 Prasinophytes 及 Cryptophytes 所貢獻平均生物量低於 0.002μg/L(圖 10)。分類 B 五個測站(N1~N5)其藻類族群結構於水體垂直分布也並 無發現 Euglenoids 存在。而以 Prymnesiophytes 及 Prochlorococcus 為 主要優勢，其次為 Chrysophytes
、
Chlorophytes、Dinoflagellates、Cyanobacteria 及 Diatom。其他藻種如 Prasinophytes 及 Cryptophytes 所貢獻平均生物量低於 0.003μg/L (圖 11)。
3.5 西菲律賓海 3.5.1 色素分布
3.5.1.1 西菲律賓海測站 30 短時間序列觀察
於此測站做短期時間序列觀察，時間分布為 2009 年 3 月 20，
晚間 10 點 30 分；3 月 21，下午 1 點 30 分；3 月 22，凌晨 2 點；3 月 23，早上 8 點 30 分及 3 月 23 下午 2 點 30 分。Chl. a 於上述時間 點最大值出現在水深 80 或 100 公尺深。指紋色素在不同時間點的表 現，並無發現 neo 及 lutein 存在。再者，以 Chl. b、hex
、
zea 與 but 為主要色素體，次要色素為 fuco。
其他色素於此測站區域平均濃度皆 低於 0.003μg/L(圖 12)。3.5.1.2 西菲律賓海測站 7、4、2 及 1a
西菲律賓海測站 7、4、2 及 1a， Chl. a 最大值出現深度以測站 1a 為水深 10 公尺，測站 4 為水深 40 公尺相異於其他兩個測站。而 色素在不同測站之分布，並無發現 neo 及 lutein 存在。而以 Chl. b 為 主要色素體，其分布深度以 80~120 公尺為主；次要色素體為 zea
、
hex
、
but 及 fuco。其他色素於此測站區域平均濃度皆低於 0.004μg/L。色素於空間分布，隨測站越靠近台灣沿岸， Chl. a 最大值出現在水深 80 至 100 公尺提升至水深 10~20 公尺；Chl. b 主要分布水深也從原本 的 80 至 120 公尺提升至 10~20 公尺，同時 hex、but 及 fuco 也有此一 情形發現(圖 13)。
3.5.2 藻類族群分布
3.5.2.1 西菲律賓海測站 30 短時間序列觀察
測站 30 於不同時間觀測藻種隨深度變化之族群分布，並無發現
Cryptophytes 及 Euglenoids 存在。其優勢藻種以 Prymnesiophytes 為
主，其次為 Prochlorococcus
、
Cyanobacteria 及 Chrysophytes。
其他藻 種如 Diatom、Chlorophytes、
Prasinophytes 及 Cryptophytes 所貢獻的 平均生物量低於 0.004μg/L。然而從不同時間周期觀察其藻種分布並 無明顯差異(圖 14)。3.5.2.2 測站 7、4、2 及 1a
藻種隨深度變化之族群分布也無發現 Cryptophytes 及 Euglenoids 存在。其優勢藻種以 Prymnesiophytes 為主，其次為 Prochlorococcus
、
Cyanobacteria 及 Chrysophytes。其他藻種如 Diatom、Chlorophytes、
Prasinophytes 及 Cryptophytes 所貢獻的平均生物量低於 0.008μg/L。然而隨測站地點越靠近台灣沿岸，發現 Cyanobacteria
、
Prymnesiophy- tes、
Prochlorococcus、
Chrysophytes 及 Diatom 其主要分布深度相對變 淺，於測站 1a 可以明顯發現(圖 15)。4.討論
4.1 色素隨深度的變化
浮游性植物體內色素含量易受到光照、溫度或營養鹽條件不同 而改變。前人研究發現，於水體垂直剖 vio、diad、lutein 及 zea 色素 體隨深度越深，在單細胞藻類體內的含量相對於 Chl. a 減少；反之 but、hex、neo 及 chlorophyll b 色素體在單細胞藻類體內隨著深度加 深，相對 Chl. a 含量越高(Mackey et al.,1998；Wright et al.,2000)。上 述現象於本研究經由 CHEMTAX 程式所運算出的色素比值，大部分 符合此一現象，同時於樣品的色素分布也是具有一致性。再者所輸入 的初始色素比值帶入 CHEMTAX 計算所得結果並不是唯一解，故於 資料分類後，同批資料進行重覆運算所得的色素比值，於 60 公尺深 淺兩種深度分類有些微不同。然而，從 CHEMTAX 西菲律賓海四個 測站(7、4、2 及 1a)發現其水深 60 公尺以下 but、hex、neo 及 Chl. b 四種色素體在生物體內相對 Chl. a 含量比值與六十公尺以上相對 Chl.
a 比值卻沒有明顯差異，推測為一開始樣品資料的分類是將此四測站 為一類，然而測站 1a 因為較靠近台灣沿岸且各色素主要分布深度較 淺，故而影響色素體於生物體內之含量比值，使色素隨深度變化不具 有明顯性。此外，本研究以 CHEMTAX 重複運算西菲律賓海測站 30
之過程，所得最終運算結果，Prochlorococcus 的 Chl. b 相對 Chl. a 比 值為 6. 9(w/w)，與前人文獻資料所獲得之比值範圍高出許多
(0.125~1.074，Burger-Wiersma et al., 1986；Stauber and Jeffrey et al., 1989)，導致此測站計算 Prochlorococcus 生物貢獻量會有低估的現 象，類似問題亦於相關研究中發現(Miki et al., 2008；Eker-Deveil et al., 2008)。此問題日後可利用流式細胞儀計算 Prochlorococcus 之相對數 量作為比對，或是建立當地海域純株藻種的色素比值使 CHEMTAX 所運算出的藻種豐度更具有可性度。
4.2 不同海域其藻類族群結構