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BaculoDirect - pENTR/SD/D-TOPO

將 hTreH1 基因從 pGEMT 以及 hTreH2 基因從 pGAPZαC 以 PCR 的方式放大。得到 pENTR/SD/D-TOPO-hTreH1 (請參考圖十五) 和 pENTR-SD-D/TOPO-hTreH2 (請參考圖十六) 兩種質體。並轉型至 one shot TOP10 E.coli 細胞內,做為保存。昆蟲細胞表達出來的

transfection control plasmid 共轉染到 sf9 細胞中當成實驗的控制組 Gbiosciences Insect Cell –PE LB 破菌緩衝液處理細胞,跑 SDS-PAGE 分析,不管是 hTreH1 還是 hTreH2 都以不可溶的形式表達在細胞 pellet 中 (圖二十二 A、 B、 C)。

38

0.05 % N-lauroyl sarcosine 的 20 mM sodium phosphate buffer 回溶內 聚體中被不可溶蛋白包覆住的可溶蛋白,在添加 0.2 % 的 N-lauroyl

四、 hTreH1 酵素受質專一性與 Validamycin A 的抑制實驗 (一)、 hTreH1 酵素受質專一性

依據方法十三、(一) 進行 hTreH1 酵素受質專一性,人類海藻糖 水解酶在不同的受質反應 60 分鐘下,海藻糖在反應後全部消耗完,

轉成葡萄糖,而其他雙糖包括麥芽糖、蔗糖和乳糖,反應後葡萄糖生 成量明顯少於受質海藻糖所生成的葡萄糖量 (圖二十七)。

(二)、 hTreH1 與 Validamycin A 的反應

依據方法十三、(二) 進行 Validamycin A 對人類海藻糖水解酶活 性的抑制影響,結果顯示隨著 Validamycin A 的濃度增加,其人類海 藻糖水解酶活性逐漸下降,當 Validamycin A 濃度從 20 nM 提升至 20000 nM 時,其抑制率由 17.60 % 上升至 100 % (圖二十八),其 IC50 為 105.41 nM。

40

們的目標蛋白,因此我們希望可以藉由換置不同 P. pastoris 的 宿主

42

sarcosine 中可溶蛋白的量有提昇,但是活性測試上顯示其為不具功

Deoxynojirimycin、 Validamycins、 Validoxylamines、 Trehazolin、

Salbostatin、 Calystegin B4 目前已經被證實對真菌、昆蟲、線蟲海藻 糖水解酶是有效的抑制劑。而本實驗室黃胤榮學長曾進行

Validamycin A 對豬腎海藻糖水解酶活性的抑制影響,其實驗發現隨 著 Validamycin A 的濃度增加,其豬腎海藻糖水解酶活性亦逐漸下 降,其 IC50 為 62.74 nM (酵素量為 435 ng)。因此我們以此已知的 海藻糖水解酶抑制劑 Validamycin A 進行抑制劑實驗,結果發現隨著

44

Validamycin A 的濃度增加,其人類海藻糖水解酶活性逐漸下降,當 Validamycin A 由 20 nM 增加至 20000 nM 時,其抑制率由 17.60 % 上升至 100 %,其 IC50 為 105.41 nM (酵素量為 20 ng),由於本實 驗所使用的酵素量為豬腎海藻糖水解酶 1/20 以下,因此顯示 Validamycin A 對人類海藻糖水解酶的抑制活性高於對豬腎的海藻糖 水解酶抑制活性。

陸、參考文獻

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50

表一、 Primer 設計 (A) E. coli

Forward primer: AAGAAGGAGATATACATATGCTACCCCCACCC TGTGAGAG

Reverse primer: TTGTCGACCCGGGAATTCTTTGAGGTCAGCCG GTCACCAT

(B) BEVS- Bacvector3000

Forward primer: gacgacgacaagATGCTACCCCCACCCTGTGAGAGT G

Reverse primer: CTATGGTGACCGGCTGACCTCAccgggcttctcctc

(C) BEVS- BaculoDirect

Forward primer: ccaccatgCTACCCCCACCCTGTGAGAGTG Reverse primer: GACGTCGACTGAGGTCAGCCGGTCACC

(A). 為了在 E. coli 表達 hTreH1 隨機突變所設計的 primer。底線的 是限制酶切位。

(B). 大寫的部分為目標基因,小寫的部分為欲黏合的位置。

(C). 大寫的部分為目標基因,小寫的部分為 entry clone 上拓譜酶辨識 的位置,底線的是限制酶切位。

表二、 PCR 加入的成分

Taq DNA polymerase 10X buffer with MgSO

4 1

ddH2O 6.4

Taq DNA polymerase 10X buffer with MgSO

4 5

ddH2O 36.5

Final volume 50

52

表三、 PCR 條件 (A) E.coli- 第一次 PCR

No. of Cycles Reaction Temperature (℃) Time (mins)

1 Hot-start 92 3

12

Denature 92 1

Annealing 55 1.5

Extension 72 5

1 Elongation 72 10

1 Save 4 ∞

(B) E.coli- 第二次 PCR

No. of Cycles Reaction Temperature (℃) Time (mins)

1 Hot-start 95 3

30

Denature 95 0.3

Annealing 62 0.5

Extension 72 2

1 Elongation 72 10

1 Save 4 ∞

54

(C) BEVS- Bacvector3000

No. of Cycles Reaction Temperature (℃) Time (mins)

1 Hot-start 94 5

40

Denature 94 0.5

Annealing 54~64 0.5

Extension 72 2

1 Elongation 72 5

1 Save 4 ∞

(D) BEVS- BaculoDirect

No. of Cycles Reaction Temperature (℃) Time (mins)

1 Hot-start 94 5

30

Denature 94 0.5

Annealing 62 0.5

Extension 72 2

1 Elongation 72 5

1 Save 4 ∞

圖一、 hTreH1 and hTreH2 alternative sequences

把兩種 isoforms 的序列仔細的檢查後發現, hTreH gene 表達出 pre-mRNA 發現 alternative splicing,造成 hTreH2 少了一組 exon6,

並使其中一個胺基酸 W 並成了 C。

56

(A)

(B)

圖二、以 glucose assay 分析在大腸桿菌表達隨機突變 hTreH1 活性 以 1 % 隨機突變 hTreH1 基因,接到 pET23a 上在 BL21 (DE3) 表達,取純化後的蛋白反應 2 小時的活性測試。

(A). 突變株 1~40 號的活性。

(B). 突變株 41~80 號的活性。

(WT: wild type; NC: negative control)

圖三、 pGAPZαC-hTreH1 重組質體圖

pGAP 為驅動外源基因轉錄的啟動子, α factor 為一分泌性訊 號序列, hTreH1 為本研究所選用之重組蛋白, Sh ble 為 Zeocin 的 抗性基因, pUC ori 片段為保存於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質 體自行複製的起點。

58

圖四、 pGAPZαC-hTreH2 重組質體圖

pGAP 為驅動外源基因轉錄的啟動子, α factor 為一分泌性訊 號序列, hTreH2 為本研究所選用之重組蛋白, Sh ble 為 Zeocin 的 抗性基因, pUC ori 片段為保存於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質 體自行複製的起點。此為本實驗室永資陵學姊所構築的質體。

圖五、 pPIC9K-hTreH1 重組質體圖

pAOX 為驅動外源基因轉錄的啟動子, α factor 為一分泌性訊號 序列, hTreH1 為本研究所選用之重組蛋白, bla 為 Amp 的抗性 基因, Tn903 為 Kan 的抗性基因, HIS4 可做為轉型株的篩選。

60

(A)

(B)

圖六、以 SDS-PAGE 分析 SMD1168/pGAPZαC-hTreH2 表達 hTreH2 蛋白的結果

(A). 於 P. pastoris SMD1168 中表達 3 天和 7 天。

(B). 於 P. pastoris SMD1168 中表達 3 天和 4 天。圖為濃縮 20 倍 的結果

(Lane M: maker; Lane NC: negative control; Lane SMD1168:

host)

(A)

(B)

圖七、以 SDS-PAGE 分析 X33/pGAPZαC-hTreH2、

GS115/pGAPZαC-hTreH2、 KM71/pGAPZαC-hTreH2 表達 hTreH2 蛋白的結果

(A). 於 P. pastoris 的 X33、 GS115、 KM71 表達 3 天,圖為濃縮 20 倍的結果。

(B). 於 P. pastoris 的 X33、 GS115、 KM71 表達 4 天,圖為濃縮 20 倍的結果。

(Lane M: maker; Lane h2: hTreH2; Lane NC: negative control;

Lane X33: host; Lane GS115: host; Lane KM71: host)

62

圖八、以 SDS-PAGE 分析 SMD1168/pGAPZαC-hTreH1 純化 hTreH1 蛋白的結果

以硫酸銨沉澱方式濃縮蛋白,經透析後純化跑 SDS-PAGE 的結 果。

(Lane M: marker; Lane S: 濃縮後的 medium; Lane F: flow through; Lane W: wash; Lane R: eluted resin)

圖九、以 SDS-PAGE 分析 GS115/pPIC9K-hTreH1 和 KM71/pPIC9K-hTreH1 表達 hTreH1 蛋白的結果

pPIC9K-hTreH1 於 P. pastoris 的 GS115、 KM71 表達 3 天 (Lane M: maker; Lane 1: clone1; Lane 2: clone2; Lane 3:

clone3; Lane NC: host)

64

(A)

(B)

圖十、以 SDS-PAGE 分析 GS115/pPIC9K-hTreH1 和

KM71/pPIC9K-hTreH1 表達 hTreH 後,檢測細胞 pellet 的結果 (A). 於 P. pastoris GS115 表達 hTreH1 3 天,取 pellet 破菌以

SDS-PAGE 分析

(B). 於 P. pastoris KM71 表達 hTreH1 3 天,取 pellet 破菌以 SDS-PAGE 分析

(Lane M: marker; Lane S: supernatant; Lane P: pellet)

圖十一、以 glucose assay 分析 SMD1168/pGAPZαC-hTreH2 的活性 以 glucose assay 分析 hTreH2 於 P. pastoris SMD1168 中表達 3 天後的活性。培養液加入受質,反應總體積為 50 μL 受質海藻糖 終濃度為 4 % ,作用 0、 2、 6 小時後測活性。圖為濃縮 20 倍的 結果。

(SMD1168: host; NC: negative control)

66

(A)

(B)

(C)

圖十二、以 HPLC 分析 SMD1168/pGAPZαC-hTreH2 的活性 培養液加入受質,反應總體積為 50 μL 受質海藻糖終濃度為 4

% ,作用 0、 2、 6 和 12 小時後測活性。圖為濃縮 20 倍的結果。

(A). 分析 hTreH2 於 P. pastoris SMD1168 中表達 3 天後的活性。

(B). 分析 hTreH2 於 P. pastoris SMD1168 中表達 4 天後的活性。

(SMD1168: host; NC: negative control) (C). 圖 A 於 HPLC 的圖譜。

68

圖十三、 pTriEX-EK/LIC-hTreH1 重組質體圖

CMV、T7、p10 為驅動外源基因轉錄的啟動子, IgM 為一分泌 性訊號序列, hTreH1 為本研究所選用之重組蛋白,bla 為 Amp 的 抗性基因, pUC ori 片段為保存於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質 體自行複製的起點。

圖十四、 pTriEX-EK/LIC-hTreH2 重組質體圖

CMV、T7、p10 為驅動外源基因轉錄的啟動子, IgM 為一分泌 性訊號序列, hTreH2 為本研究所選用之重組蛋白, bla 為 Amp 的 抗性基因, pUC ori 片段為保存於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質 體自行複製的起點。

70

圖十五、 pENTR/SD/D-TOPO-hTreH1 重組質體圖

attL1 和 attL2 為重組基因的特異位點, hTreH1 為本研究所選 用之重組蛋白, Tn903 為 Kan 的抗性基因, pUC ori 片段為保存 於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質體自行複製的起點。

圖十六、 pENTR/SD/D-TOPO-hTreH2 重組質體圖

attL1 和 attL2 為重組基因的特異位點, hTreH2 為本研究所選 用之重組蛋白, Tn903 為 Kan 的抗性基因, pUC ori 片段為保存 於 E.coli DH5α 細胞內,能使其質體自行複製的起點。

72

(A)

(B)

(C)

圖十七、以 SDS-PAGE 分析 Bacvector3000 生產目標蛋白的結果。

分析 Bacvector3000 生產的病毒液感染 sf9 在 27℃ 下表達 hTreH1 3 天的結果。

(A). 取培養液、破細胞的上清及 pellet。

(B). 以 Ni column 純化 PC 蛋白之結果。

(C). 以 Ni column 純化 hTreH1 之結果。

(Lane M: maker;Lane PC: plasmid control; Lane m: SFM-900II medium; Lane S: supernatant; Lane P: pellet; Lane F: flow through; Lane W: wash; Lane E: elution; Lane R0: before purify;

Lane R: eluted resin)

74

圖十八、檢測 Bacvector3000 生產的 Baculovirus 病毒顆粒含量 Bacvector3000 生產的 Baculovirus 病毒液以 PCR 方式放大 hTreHs 的基因。hTreH1: 1599 bp; hTreH2: 1506 bp

(Lane M: maker; Lane m: SFM-900II medium; Lane PC:

plasmid control; Lane host: sf9 cell line; Lane C: positive control;

Lane h1: hTreH1; Lane h2: hTreH2)

(A)

(B)

圖十九、以 SDS-PAGE 分析在 27℃ 下 sf9 生產 Baculodirect P1~P3 病毒液的結果

(A). 生產 P1~ P2 virus 5 天,取 pellet 破細胞以 SDS-PAGE 分析。

(B). 生產 P3 virus 5 天,取 pellet 破細胞以 SDS-PAGE 分析。

hTreH1: 64 KD; hTreH2: 61 KD

(Lane M: maker; Lane PC: plasmid control; Lane NC: negative control; Lane S: supernatant; Lane P: pellet)

76

圖二十、以 SDS-PAGE 分析 Baculodirect P3 代的病毒液純化後的結 果

將 plasmid control (PC)、 hTreH1、 hTreH2 之 P3 代病毒液通 過 Ni column 進行純化。hTreH1: 64 KD; hTreH2: 61 KD

(Lane M: maker;Lane PC: plasmid control; Lane S:

supernatant; Lane F: flow through; Lane W: wash; Lane R0: before purify; Lane R: eluted resin)

(A)

(B)

圖二十一、以 SDS-PAGE 分析不同破菌方式破細胞的差異

以 M.O.I= 2.5 於 sf9 在 27℃ 下表達 hTreHs 3 天,以病毒 DNA 當成破菌緩衝液,並用不同破菌方式破細胞以 SDS-PAGE 分 析。hTreH1: 64 KD; hTreH2: 61 KD

(A). 用超音波震破細胞。

(B). 放在冰上 30 分鐘破細胞

(Lane M: maker; Lane PC: plasmid control; Lane h1:

hTreH1;Lane h2: hTreH2; Lane S: supernatant; Lane P: pellet)

78

(A)

(B)

(C)

圖二十二、以 SDS-PAGE 分析不同時間下 BaculoDirect P3 桿狀病

圖二十二、以 SDS-PAGE 分析不同時間下 BaculoDirect P3 桿狀病

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