GS115、 KM71 pPIC9K
BEVS
sf9
pTriEX-EK/LICpENTR/SD/D-TOPO (一)、大腸桿菌表達系統質體
pET23a 質體大小為 3666 bps,並帶有 T7 promoter、 T7
terminator、 bla 基因 (Ampicillin 的抗性基因)、 6 個 Histidine-tag。
12
transfection kit 和 BaculoDirect Baculovirus expression system 來生產 病毒,用以感染 sf9 細胞表達蛋白。
BacVector3000 transfection kit(購自 Novagen)
在昆蟲細胞以共轉染的方式將帶有目標基因的 pTriEX-EK/LIC 換置到修飾過的三切病毒質體上,可得到重組昆蟲桿狀病毒。
pTriEX-EK/LIC 質體大小為 5124 bps,並帶有 T7 promoter、 p10 promoter、 CMV promoter、分泌性訊號序列 IgG、 bla 基因
(Ampicillin 的抗性基因)、 10 個 Histidine-tag。因為具有 T7、 p10、
CMV 依序為大腸桿菌、昆蟲細胞、哺乳細胞等系統的啟動子,因此 可在這三種表達系統中使用。
BaculoDirect Baculovirus expression system (購自 Invitrogen)
另外,我們也使用 BaculoDirect Baculovirus expression system,利 用 Phage λ recombinant in E.coli 的特異性重組位點做為設計,將帶 有目標基因的 Entry clone (pENTR/SD/D-TOPO) 置換到 expression clone 中 (附錄十、附錄十一), expression clone 帶有 polyhedri promoter,可生產重組昆蟲桿狀病毒,再將重組昆蟲桿狀病毒感染 sf9 細胞,收集含蛋白的細胞 (此套系統為胞內分泌)。
pENTR/SD/D-TOPO 質體大小為 2601 bps,並帶有特異性重組位 點 attL1、 attL2、 Tn903 基因 (Kanamycin 的抗性基因)。
pTriEX-EK/LIC T7、p10、CMV SFM-900II pENTR/SD/D-TOPO 置換後為 polyhedrin SFM-900II 四、質體 DNA 製備
將帶有 pGEMT-hTreH1 以及 pGAPZαC-hTreH2 的 DH5α 分別 接種到 3 ml LB (含有 100 μg/ml Ampicillin) medium 以及 3 ml LLB (含有 25 μg/ml Zeocin) medium 中,隔夜培養,離心 3000 rpm 10 分 鐘,除去上清液留下沉澱菌體,操作 Mini Plus TM Plasmid DNA Extraction System Kit (VIOGENE),以抽取質體 DNA。
14
表二 A)。接著以說明書上的建議進行第一次的 PCR (流程參考表三
16
Components Volume (μL)
PCR product 2
dATP (25 mM) 1
DTT (100 mM) 0.5
T4 DNA polymerase (2.5 U/μL)
0.2T4 DNA Polymerase 10X buffer
1ddH2O 5.3 expression clone 中,才可生產出重組昆蟲桿狀病毒。Expression clone C 端上有 6 個 Histidine-tag 方便之後使用陰離子交換樹脂 Ni2+
resin 進行基因表達後的蛋白質純化。
pENTR/SD/D-TOPO-hTreH1 和 pENTR/SD/D-TOPO-hTreH2 質
體的構築是利用拓譜酶的作用來完成的 (附錄十二) ,整個質體大小
為 4212 bps 和 4119 bps。
首先將李桂禎老師實驗室的林志信學長所建構之
pGEMT-hTreH1 以及 pGAPZαC-hTreH2 以 PCR 的方式放大,
primer 設計 (表一 C) 參考了 pENTR/SD/D-TOPO 說明書中的方
18
抽取大量 pENTR/SD/D-TOPO-hTreH1 和
pENTR/SD/D-TOPO-hTreH2 質體,以 TE buffer, pH=8.0 回溶成濃度 約 125 ng/μL,將此建構好的質體稱為 Entry clone。
Components Sample Positive control BaculoDirect linear DNA (a vial) 10 10 pENTR-CAT control (100 ng/μL) -- 1
七、 DNA 定序分析
20
phenol/chloroform 法去除雜蛋白,利用酒精沉澱得到高濃度之 linear
DNA,保存於 -20℃ 備用。 pGAPZαC 以限制酵素 AvrII 切成 linear 管,隨後藉由酒精沉澱法收集高濃度之 DNA。經由 phenol/chloroform 法去除蛋白之樣本,加入樣本體積 1/10 的 3 M 醋酸鈉,與 2.5 倍
22
Bacvector3000:共轉染 co-transfection 的方法如下:
取 2 ml 約為 2.5 × 105 cell/ml 健康的 sf9 cell 於 T25 flask,放置 1~2 小時待細胞貼到盤上。根據操作說明修改共轉染時各溶液的體 積,以下為修改後加入的體積:
solution A Volume (μL)
pTriEX-EK/LIC-hTreH1/pTriEX-EK/LIC-hTreH2 2 Triple cut virus DNA BacVecor3000 2
SFM-900II medium 6
Final volume 10
solution B Volume (μL)
Nuclease-free Water 8
Insect GeneJuice® Transfection Reagent 2 養液換置成 Grace's Insect Medium, Unsupplemented(without
supplements, FBS, or antibiotics),放置 15 分鐘待細胞貼到盤上。並將 A、B 兩試劑輕拍混和,在室溫下靜置 25~35 分鐘。
solution A Volume (μL)
Cellfectin ® II Reagent 8
Grace's Insect Medium, Unsupplemented (without supplements, FBS, or antibiotics)
100
solution B Volume (μL)
LR recombination reaction 10
Grace's Insect Medium, Unsupplemented (without supplements, FBS, or antibiotics)
100
將反應好的試劑滴加到 6-well 盤中,置於 27℃ 培養箱 3 小時,
移除轉染的培養液,加入 2 ml 新鮮的 SFM-900II 培養液並加入
24
Lysis buffer
Lysis buffer(10 mM Tris-HCl, pH=8.3, 0.45 % tritonX-100, 0.45 % tween-20, 50 mM KCl)
89
High titer virus stock 10
Proteinase K (6 mg / ml in water) 1 N-lauroyl sarcosine 0.2 % 回溶內聚體,可以使某些原本被不可溶的蛋 白質包覆的可溶蛋白,慢慢的回溶出來且具有活性 (Peternel et al., 2008)。
因此我們將昆蟲桿狀病毒表達載體系統表達出來的蛋白以
26 液直接利用固定化金屬親和性層析法 (Immobilized Metal Affinity Chromatography,IMAC) 純化;大腸桿菌表達系統和 BaculoDirect 則 需要先破細胞,再將上清過固定化金屬純化管柱。
其條件如下: 1 ml His-tag resin (GE Healthcare Ni Sepharose 6 Fast Flow),先以 10 ml binding buffer (20 mM sodium phosphate buffer pH=7.0、 0.5M NaCl) 平衡管住,加入蛋白質粗萃取液 5 ml,再以 10 ml binding buffer 洗去雜蛋白,最後加入 10 ml Elution buffer (20 mM sodium phosphate buffer、 0.5 M NaCl、 0.5 mM imidazole、 pH=7.0),
將目標蛋白從管柱沖離下來,並收集具有目標蛋白的部分,利用濃縮
1.高效能 96 孔盤型式蛋白質的純化
phosphate buffer、 0.5 M NaCl、 20 mM imidazole、 pH=7.0) 2 ml,
流洗 1 分鐘後,離心 2,000 rpm、 15 秒來移除 binding buffer,將 filtration Plate 置於 collection plate (Promega) 上,並加入 elution buffer (20 mM sodium phosphate buffer、 0.5 M NaCl、 0.5 mM
imidazole、 pH=7.0) 100 μL 於 filtration Plate 的孔內,放在搖晃台上
28
十一、 hTreHs 蛋白質分析 (一)、蛋白質電泳
1.蛋白質電泳試劑:
(a) 40 % (w/v) acrylamide:ACRYL/BIS=37.5:1 solution (Bioshop)。 (b) Ammonium persulphate (APS):10 % (w/v) 溶液。
(c) SDS solution:配置 10 % (w/v) 溶液保存於室溫。
(d) Stacking gel buffer:配置 0.5 M Tris-HCl 溶液 pH=6.8。
(e) Resolving gel buffer:配置 1.5 M Tris-HCl 溶液 pH=8.8。
(f) Tris-glycine electrophoresis buffer:含 0.025 M Tris、0.192 M glycine 與 0.1 % SDS,pH=8.3。
Stacking gel 倒滿並插齒梳,待膠凝固後拔除齒梳,並將玻璃片組從 製膠器上拿出。
4. 5X SDS sample buffer 製備與電泳條件:
(a) 40 % (w/v) acrylamide:ACRYL/BIS=37.5:1 solution (Bioshop) (b) 25.6 % β-mercaptoethanol
30
品 BSA (10 μL) 於 96 孔盤內反應 10 分鐘,使用 ELISA
(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) reader 測定波長 595 nm 吸 光值,製作出標準曲線,再使用同樣的條件測定樣品,代入標準曲線 公式中即可求出蛋白質濃度。
十二、 hTreHs 酵素活性分析
(一)、 HPLC (High-performance liquid chromatography)
於 50 μL 的反應體積中,加入 25 μL hTreHs,添加於 25 μL 8 % 的海藻糖中 (終濃度為 4 %),於 37℃ 反應實驗所需要的時間。反 應後,以聚合酶連鎖反應器於 95℃ 反應 10 分鐘終止酵素反應。
而後將樣品以 13 mm NYLON 0.22 μm syringe filter (membrane solutions) 過濾,取 20 μL 的樣品以 HPLC;管柱: SUGAR SZ5532;
管柱恆溫箱: 60℃;流速: 1 ml /min;偵測器: RI2000 Refractive index detector;幫浦: SFD 2100 Quaternary gradient pump;溶劑為 acetonitriled : ddH2O : formicacid=75 : 25 : 1;分析時間: 15
與標準品相同滯留時間下之訊號峰面積帶入上述之標準曲線後,即可
32
trehalose、maltose、sucrose、lactose,於 37℃ 反應 60 分鐘,經先 前的實驗中已確定反應時間為此酵素量下的線性範圍內。 別為 0、0.02、0.2、2、20、200、2000、20000 nM Validamycin A (VA),
於 37℃ 反應 3 小時。經先前的實驗中已確定反應時間為此酵素量 下的線性範圍內。
反應後,以聚合酶連鎖反應器於 95℃ 反應 10 分鐘終止酵素反 應,以 HPLC 分析結果,依照以下公式計算出抑制百分比 (Inhibition,
%) 後,帶入 SigmaPlot 繪圖軟體來計算出 50% 抑制濃度 (IC50, concentration of 50 % inhibition)。
肆、研究結果
一、 hTreHs 基因的分析
hTreH1 和 hTreH2 這兩型的基因在序列上只有 93 個鹼基對不 一樣,經過比對的結果發現這兩型基因是由於 Alternative splicing 的 作用,使得 hTreH2 基因少了一組外顯子,而造成這 93 個鹼基對的
34