第 3 章 實驗方法
3.2 單載波寬頻擴散磁振造影
3.2.1 單載波寬頻磁振造影技術提升空間解析度
此項實驗我們所使用的是 Sprague Dawley 大鼠 (雌性, 250~350g)。在做大鼠實 驗時,要維持大鼠生理狀況的穩定度,盡可能避免大鼠鼠腦 motion 假影的產生。
在實驗之前,會使用 3% isoflurane (ISO) 混合純氧 (O2),麻醉老鼠。7 分鐘後,將 大鼠移至掃描室並固定在大鼠專用拖架上,並用齒咬棒(bite-bar)、固定耳朵的支架 (ear-bar)和面罩來三點固定大鼠鼠腦。 托架內設有 49oC 的溫水循環系統,可以保 持大鼠的體溫。
圖[3-2] 為此項實驗切面位置,涵蓋大鼠鼠腦海馬迴。傳統 DWI、較高解析度 和增加為兩倍張數的 SCWB DWI 分別所使用的參數為 FOV:3.0 x 3.0 cm2、3.0 x 3.0 cm2、3.0 x 3.0 cm2;Matrix size:220 x 220、330 x 330、220 x 220;解析度:136 x 136 um2、91 x 91 um2、136 x 136 um2;掃描時間:2 h 34 m、2 h 53 m 15 s、2 h 34 m;頻寬:15kHz、20kHz、15kHz;厚度:1 mm、1 mm、0.5 mm;切面張數:6 張、6 張、12 張;平均次數:4 次、6 次、4 次;TR/TE:1500/42.385 ms、1500/46.652 ms、3000/42.385 ms;分離梯度強度:0 G/cm、-29.3545 G/cm、-29.6703 G/cm;分 離梯度的重新聚焦梯度:0 G/cm、1.5635 G/cm、1.1727 G/cm。其他相同的參數為 b-value:1000 s/mm2;𝛿:3 ms 和∆:8.258 ms;模糊指標:2 pixel。擴散梯度則是 沿著七個方向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、(0,-y,+z)、(+x, 0,+z) 以及(-x, 0,+z),總共是一張無擴散權重影像和六張不同擴散梯度方向的擴散權重影 像。
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圖[3-2]此項實驗,切面位置要選擇大鼠鼠腦的海馬迴,對照圖譜位置為 Bregma -4.3 至 -2.3 mm。
3.2.2 應用在大鼠的海馬迴
架設老鼠的步驟和第一項實驗相同,圖[3-3]為此項實驗切面位置,在大鼠鼠 腦海馬迴的附近。傳統低解析度和 SCWB 高解析度 DWI 分別所使用的參數為 FOV:
3.6 x 3.6 cm2、3.6 x 3.6 cm2;Matrix size:200 x 200、300 x 300;解析度:180 x 180 um2、120 x 120 um2;掃描時間:1 h 10 m 0 s、1 h 18 m 45 s;頻寬:15 kHz、20 kHz;
平均次數:2 次、3 次;TR/TE:1500/38.72 ms、1500/42.05 ms;分離梯度強度:0 G/cm、1.3029G/cm;分離梯度的重新聚焦梯度:0 G/cm、-33.7631G/cm;其他相 同的參數為厚度:1 mm;切面張數:6 張;b-value:1000 s/mm2;∆:3 ms 和𝛿:8 ms;模糊指標:2 pixel。擴散梯度則是延著七個方向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、
(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、(0,-y,+z)、(+x, 0,+z)以及(-x, 0,+z),總共是一張不開擴散梯度 和六張不同擴散梯度方向的擴散權重影像。如圖[3-4]對照大鼠鼠腦的圖譜,紅色 圈選的部位為大鼠的海馬迴,實驗將以海馬迴的神經纖維走向為研究對象。
圖[3-3]此項實驗,切面位置要選擇大鼠鼠腦的海馬迴,對照圖譜位置為 Bregma -4.3
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~ -2.3 mm。
圖[3-4]為大鼠鼠腦的解剖圖譜對照圖,紅色圈選的部位即為左邊的海馬迴,此項 實驗主要是看海馬迴的神經纖維追蹤圖差異。(參考來源 https://gaidi.ca/rat-brain-atlas/)
3.2.3 應用在大鼠的胼胝體
架設老鼠的步驟和第一項實驗相同,圖[3-5] 為此項實驗的切面位置,涵蓋大 鼠鼠腦整個胼胝體的附近。傳統 3D DWI 和更高解析度的 SCWB 3D DWI 分別所 使用的參數為 FOV:2.42 x 1.51 x 2.42 cm3、2.4 x 1.51 x 2.4 cm3;Matrix size:96 x 60 x 96、264 x 83 x 66;解析度:252 x 252 x 252 um3、182 x 182 x 182 um3;掃描 時間:3 h 51 m 50 s、3 h 40 m 30 s; slab 厚度:2.42 mm、1.2 mm;總共切面張數:
96 張、66 張; TR/TE:600/19.79 ms、600/21.4 ms;分離梯度強度:0 G/cm、0.2272 G/cm;分離梯度的重新聚焦梯度:0 G/cm、-4.8932G/cm;其他相同的參數為頻寬:
50 kHz;平均次數:1 次; B-value:1000 s/mm2;∆:5 ms 和𝛿:10 ms;模糊指標:
2 pixel。擴散梯度則是延著七個方向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、
(0,-y,+z)、(+x, 0,+z)以及(-x, 0,+z),總共是一張不開擴散梯度和六張不同擴散梯度 方向的擴散權重影像。主要是將整個胼胝體的重建結果來定性比較較高解析度 3D SCWB DTI 和傳統低解析度 3D DTI 的差異。
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圖[3-5]此項實驗,主要是選擇大鼠鼠腦,但不包含大鼠嗅球和部分的小腦,對照 圖譜位置為 Bregma -6.0 ~ 1.0 mm。
3.2.4 應用在小鼠的脊椎神經
此項實驗我們所使用的是 C57BL/6 小鼠 (雄性, 4 week),在做小鼠實驗時,
要維持小鼠生理狀況的穩定度,盡可能避免小鼠身體 motion 假影的產生。在實驗 之前,會先在小壓克力盒裏頭麻醉老鼠,所使用的氣體是 3% isoflurane (ISO) 和純 氧 (O2),麻醉 7 分鐘後,將小鼠移至掃描室並固定在大鼠掃脊椎的線圈及托架上,
ISO 和 O2將可以由齒咬棒(bite-bar)內的小孔洞導入。圖[3-6]為此項實驗切面位置,
實驗研究區域為小鼠的脊椎,包含胸椎的 T11~T13、腰椎的 L1~L5 以及薦椎的 S1~S2。傳統 2D DWI 和更高解析度的 SCWB 3D DWI 分別所使用的參數為 FOV:
6.0 x 1.95 cm2、3.0 x 2.0 x 6.0 cm3;Matrix size:300 x 97、150 x 100 x 300;解析度:
200 x 200 um2、200 x 200 x 200 um3;掃描時間:1 h 7 m 54 s、 2 h 53 m 16 s;頻 寬:150 kHz、150 kHz:slice 厚度:1 mm、slab 厚度:15 mm;切面張數:6 張、
75 張;平均次數:4 次、1 次;TR/TE:1500/ 32.05ms、300/22.25 ms;分離梯度強 度:0 G/cm、0.0908 G/cm;分離梯度的重新聚焦梯度:0 G/cm、-2.3267G/cm;SCWB 模糊指標:2 pixel;其他相同的參數為 b-value:1000 s/mm2;∆:3 ms 和𝛿:8 ms。
擴散梯度則是延著七個方向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、
(0,-y,+z)、(+x, 0,+z)以及(-x, 0,+z),總共是一張不開擴散梯度和六張不同擴散梯度 方向的擴散權重影像。
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圖[3-6]此項實驗,切面位置要選擇小鼠的脊椎,包含胸椎的 T11~T13、腰椎的 L1~L5 以及薦椎的 S1~S2。
3.2.5 應用在大鼠的脊椎神經
此項實驗第一個部分,我們所使用的是 Sprague Dawley 大鼠 (雌性, 8 week),
在做大鼠實驗時,要維持大鼠生理狀況的穩定度,盡可能避免大鼠身體 motion 假 影的產生。在實驗之前,會先在小壓克力盒裏頭麻醉老鼠,所使用的氣體是 3%
isoflurane (ISO) 和純氧 (O2),麻醉 7 分鐘後,將大鼠移至掃描室並固定在大鼠掃 脊椎的線圈及托架上,ISO 和 O2將可以由齒咬棒(bite-bar)內的小孔洞導入。此項 實驗切面位置,實驗研究區域為大鼠的脊椎,包含腰椎的 L3~L6 以及薦椎的 S1~S2。
SCWB 3D DWI 所使用的參數為 FOV:2.0 x 1.5 x 6.0 cm3;Matrix size:100 x 75 x 300;
解析度:200 x 200 x 200 um3;掃描時間:4 h 28 m;頻寬:75 kHz; slab 厚度:
12 mm;切面張數:60 張;平均次數:1 次;TR/TE:750/ 21.43 ms;分離梯度強 度:0.1124 G/cm;分離梯度的重新聚焦梯度:-3.2231 G/cm;SCWB 模糊指標:
1.67 pixel;b-value:1200 s/mm2;∆:5 ms 和𝛿:10 ms。擴散梯度則是延著七個方 向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、(0,-y,+z)、(+x, 0,+z)以及(-x, 0,+z),
總共是一張不開擴散梯度和六張不同擴散梯度方向的擴散權重影像。第二個部分,
在第一部分的實驗準備和架設是一樣的,但我們希望收到一組訊雜比達 100 左右
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的影像,目的是得到更好影像對比的大鼠脊椎切面。此項實驗切面位置,實驗研 究區域為大鼠的脊椎,包含腰椎的 L3~L6、薦椎的 S1~S2。SCWB 3D DWI 所使用 的參數為 FOV: 2.0 x 1.5 x 6.0 cm3;Matrix size:100 x 75 x 300;解析度: 200 x 200 x 200 um3;掃描時間:9 h 10 m 37 s;頻寬:75 kHz;slab 厚度:12 mm;切 面張數:60 張;平均次數:1 次;TR/TE:1800/ 21.768 ms;分離梯度強度:0.1124 G/cm;分離梯度的重新聚焦梯度:-3.2231 G/cm;SCWB 模糊指標:1.67 pixel;
B-value:1200 s/mm2;∆:5 ms 和𝛿:10 ms。擴散梯度則是延著七個方向分別為( 0, 0, 0)、(+x,+y, 0)、(+x,-y, 0)、( 0,+y,+z)、(0,-y,+z)、(+x, 0,+z)以及(-x, 0,+z),總共是 一張不開擴散梯度和六張不同擴散梯度方向的擴散權重影像。