第五章 材料與方法
第二節 實驗方法
一、 Bee venom (BV)藥物配製:
BV 由 Sigma-aldrich. Inc 購得,一瓶為粉狀混合物藥物,重 100 mg。
本實驗加入 10 ml 1%DMSO 配成 10 mg/ml 為 stock solution。再分別加入 1%DMSO 配製成不同濃度,最後將蜂肽加入 Medium 中稀釋一百倍的濃 度為 2.5、5、7.5、10、20、30 μg/ml。
表 3-2-1 蜂肽濃度配製表
BV 濃度 (mg/ml) 0.25 0.5 0.75 1 2 3 10 mg/ml 5 10 15 20 40 60 1%DMSO 195 190 185 180 160 140 Final solution (μg/ml) 2.5 5 7.5 10 20 30
二、 人類膀胱癌細胞株 TSGH-8301 細胞培養
TSGH-8301 所使用的培養基為 RPMI-1640 medium modified,額外添 加胎牛血清 (FBS)、抗生素 (Penicillin-Streptomycin, PS)與 L-Glutamine,
使細胞培養基最終含有 10 %FBS、1 %PS 與 2 ml L-Glutamine。細胞培養
於 5% CO2及 37℃環境下的無菌細胞培養箱中,且約 2 至 3 天更換一次培 養基,當細胞長至八分滿時進行繼代培養或分盤供實驗用。
繼代或分盤時,先以磷酸緩衝溶液 (Phosphate buffer saline,PBS)清 洗細胞,再以 0.05 mg/ml Trypsin-EDTA 處理 3 至五分鐘,接著加入培養 基減緩 Trypsin-EDTA 的作用,並轉至離心管中離心 1500 rpm,五分鐘。
離心後,加入培養基稀釋並回種於新的培養瓶或培養品中進行繼代;分盤 則以少量培養基稀釋,利用血球計數東與 Trypan blue 計算細胞數 (死細 胞會被 Trypan blue 染上,在計數東上呈現藍色、活細胞則否)、之後接種 需要的細胞數至培養品或培養盤內以備實驗用。
三、 TSGH-8301 cells 細胞冷凍保存與活化
細胞經大量培養後需給予保存,以維持最正常的狀態,避免影響日後 實驗結果。因此,細胞經數次繼代後,以 Trypsin 收下,經血球計數東計 算細胞數,將細胞數調為 2-5105 cell/mL,再以含有 7 %DMSO (在此做 為抗凍劑)支 FBS 混勻,並分裝置冷凍小管中。分別於 4℃存放 30 分鐘,
-20℃存放 60 分鐘,最後於-80℃存放隔夜,翌日再轉放於液態氮桶中以 備日後使用。
活化細胞時,以快速解凍為最佳,如此可避免冰晶生成影響細胞存 活。故自液態氮桶取出細胞後,以 37℃恆溫水浴槽快速回溫,待其溶解 後以培養基稀釋凍液中 DMSO 濃度,並離心除去抗凍劑。移去上清液後 加入新鮮的培養基,並接種於培養瓶中進行活化。
四、 細胞存活率 (Viability)分析
(100)PI 染劑的配製
先配製出濃度為 2 mg PI/100 ml PBS 作為 PI stock,於要進行實驗時再利用 PBS 將 PI stock 稀釋五倍,最後是以 0.4 mg PI/100 ml PBS 作為使用濃度。
Phosphate Buffer Saline (PBS)的配製
1PBS(一倍的磷酸鹽緩衝鹽溶液)其成分組成為 (1) NaCl︰8.0 g (2) KCl︰0.2 g
(3) Na2HPO4︰1.44 g (4) KH2PO4︰0.24 g
(5)最後以 DDW (distilled, deionized water;去離子水)將定量至 1000 ml。
圖 5-1 流式細胞儀存活率分析圖。
五、 細胞週期 (Cell cycle)之分析
(101)(1)
實驗原理:本實驗利用 PI 染劑標定 DNA,當細胞膜完整時 PI 是無法與細胞 內核酸做鍵結,故利用酒精固定 (Fixed)細胞與增加膜的通透性,利用 PI 與細胞內核酸鍵結一起後,於流式細胞儀進行分析,經由 DNA 之狀 態進行細胞週期之分析。
圖 5-2 流式細胞儀細胞週期分析圖。
表 3-5-1 Cell Cycle PI 染劑配製 (2)Cell Cycle PI 染劑:配法如下
20 mg/100 ml PBS CAT PI stock 1 ml 5 %Triton X-100 10 ml RNase(10 mg/ml in PBS) 2 ml
1 X PBS 加至 50 ml
(3)步驟:將人類膀胱癌細胞 TSGH-8301 細胞,接種於 12-well 培養盤 中,其每 well 所含細胞數為 2105 cell/ml/well,細胞培養於 37℃、5 % CO2培養箱中,再分別給予不同濃度之蜂肽 (2.5、5、7.5、10、20 μg/ml),
及不同的培養時間為 24、48、72 小時後將細胞收集於離心管中,用 1 X PBS 清洗一次,離心 1500 rpm 五分鐘,倒掉上清液、再用 1 X PBS 清 洗兩次,離心 1500 rpm 五分鐘,倒掉上清液後,將細胞打散,於震盪 器上以 shake 3 速度震盪,緩緩加入 4℃的 70%酒精,已進行細胞固定,
細胞固定後至於-20℃隔夜。隔天將細胞取出,離心 1500 rpm 五分鐘,
以 1 X PBS 清洗,再離心 1500 rpm 五分鐘,倒掉上清液後加入 500 μl PI solution,避光反應 30 分鐘後, 再以流式細胞儀來進行偵測、分析,
每秒的細胞數目不超過 200 顆,每個數據收集 10000 顆細胞,且以低流 速來進行分析,數據以 Modfit LT®軟體來進行分析,紀錄 G0/G1、S、
G2/M phase 及 sub-G1 比例。
六、
Caspase-3, -8, -9 活性分析
(102) (1) 實驗原理:利 用 Caspase-3 substrate (PhiPhiLux-G1D2
) 、 Caspase-8 substrate
(CaspaLux-L1D2)、caspase-9 substrate (CaspaLux-M1D2)來監測凋亡細胞相關蛋白 caspase-3, -8, -9 之產生,PhiPhiLux kit 基質是種含有螢光物質之胺基酸序列,而 活化之 caspase-3, -8, -9 可以裂解胺基酸序列之特定位置,史的含有螢光物質釋放 出來,產生綠色螢光,再經由流式細胞儀 (Flow Cytometry) FL-1 detector 偵測後,CellQuest® 分析、統計後可得知若螢光產量越多則產生 caspase-3, -8, -9 活性亦越 多。
(2) 實驗步驟:
將 人 類 膀 胱 癌 細 胞 (TSGH-8301) 種 植 於 12-well 中 , 細 胞 依 照 2105cell/well 於培養皿中之後加入蜂肽 10 μg/ml,經過 24、48、72 小時處理後,
收細胞,取 10 μM subsrate (for caspase-3, -8, -9),每管加入 25 μl,再至於 37℃水 浴避光培養 1 小時,後加入 1 ml PBS 洗一次,離心 5 min,倒掉上清液,每管加 入 500 μl Flow Cytometer Buffer,再 transfer 至 FACS 管中,以流式細胞儀進行樣 品 caspase-3, -8, -9 活性分析 (綠色 peak 往右為 caspase-3, -8, -9 產生)。
圖 5-3 流式細胞儀 Caspase-3 分析圖。
七、 人類膀胱癌細胞之細胞核質濃縮現象觀察 DAPI (4-6-diamidine-2-phenylindole)螢光染色
(103)1. 實驗原理:
DAPI 是一種核酸螢光染劑,其會專一性的結合再 DNA minor groove 上 AT 區,此染劑利用紫外光波長的光線激發,當 DAPI 與雙股 DNA 結合時,最大吸收波長為 358 nm,最大發射波長為 461 nm;當細 胞產生凋亡時,會出現染色質凝結 (chromosomes condensation)、DNA 斷裂(DNA fragmentation)等情形,若細胞凋亡越嚴重,則 DNA 斷裂越多;
相對的 minor groove 上的裸露出來的 AT 區也越來越多,進而使的染上 的 DAPI 染劑越多,其在螢光顯微鏡下觀察,可發現凋亡細胞會發出比 正常細胞高達 20 倍的螢光強度。
2. 實驗步驟:
將人類膀胱癌細胞 (TSGH-8301)分盤並重於 6-well plate 當中,每
well 種 2106cell/well,再分別給予不同濃度之蜂肽 (2.5、5、7.5、10、
20 μg/ml)與對照組,培養 24、48 小時後,將上清液抽掉,用 1 X PBS 清 洗兩次,再加入 3 %福馬林/in PBS (蓋過細胞及可)固定 10-15 分鐘,抽 掉福馬林,再以 PBS 清洗數次,再加入 0.1 % Trition X-100/PBS (蓋過細 胞即可)15 分鐘,之後再用 PBS 洗兩次,最後加入已裝 DAPI 染劑溶液 (1 μl/ml)300 μl,至於 37℃培養箱避光反應 30 分鐘後,用 PBS 洗三次後,
於螢光顯微鏡 F200 X 照相。DAPI 結構式:
八、 DNA 彗星拖尾詴驗(Comet assay)
(104) 1. 實驗原理:單細胞電泳分析 (Single cell gel electrophoresis assay)即是所謂的彗 星詴驗,可用來分析及定量 DNA damage 程度,是一個簡單、快速以及 敏感度高的技術。利用電泳的原理將斷裂成大小不同片段的 DNA 分 開,之後加以染色,DNA 受損越嚴重,斷裂也尌越多,拖尾也尌越明 顯,其外觀形似彗星狀而命名之,由此可藉由拖尾的長短,觀察 DNA 的損傷程度。
2. 詴劑配製:
A. Lysis buffer (需新鮮配製,pH=8~10;配方如下):其可破壞細胞膜的 結構,以方便之後的 DNA 電泳。
表 3-8-1 Lysis buffer 之配製
組成 體積(ml)
5 M NaCl 100 ml
1 M Tris-HCl 2 ml
0.5 M EDTA 40 ml
Trition X-100 2 ml
DDW 56 ml
Total 200 ml
B. Alkaline buffer (pH=13):其可將 DNA 雙股螺旋解開成單股 DNA,
當跑電泳時,即可區分出不同片段大小的 DNA。
表 3-8-2 Alkaline buffer 之配製
2105cell/well/2 ml,之後加入不同濃度的蜂肽 (2.5、5、7.5、10、20 μg/ml),另外還需準備 positive control (H2O2)培養 24、48 小時後,將細 胞吸至 15 ml 離心管,以 1000 rpm 離心五分鐘,去上清液,加入 1 X PBS 約 1 ml,將細胞 transfer 到 1.5 ml eppendorf,經高速離心後去上清液,
打散 pellet 加入 1 X PBS 100 μl (體積依細胞量調整);此時,將上、下層 下蓋玻片,之後配製 lysis buffer。將做好的膠至於 lysis buffer 中反應一
小時,後將膠移至 alkaline buffer 中反應 20 分鐘,將電泳槽置於冰上,
以 alkaline buffer 為電泳液跑 30 分鐘 (25 V;300 mA)。電泳後,將膠 移至 0.4 M Tris buffer 作用 5 分鐘,使其 pH 值回到中性,再將膠置於 methanol 脫水五分鐘,最後加入 40 μl PI (2.5 μg/ml)以螢光顯微鏡觀察,
評估細胞拖尾現象,判定細胞受損的情況。
九、
粒線體膜電位 (Mitochondria membrane potential; ΔΨ
m)
(105)(1)實驗原理:細胞膜電位探針,DiOC6 (3)(3,3’-Dihexyloxacarbocyanine iodide)是一種可穿透細胞膜,可專一性結合並累積在細胞粒線體中,其在
(2)MMP (ΔΨm)詴劑:1 μl DiOC6。(3)stock sol’n+50 μl PBS diluted;DiOC6
(3)stock sol’n:20 mM;working sol’n:1 mM。(3)實驗步驟:將人類膀胱 癌細胞 (TSGH-8301)種植於 12-well 中,每 well 種 2105cell/well/2 ml,
再加入 1 mg/ml 的蜂肽,以 20 μl/2 ml medium/well 到 12-well plate 當中(最 終濃度為 10 μg/ml),加藥時間後經不同時間培養(0、1、3、6、12、24 小 時),即可收取不同時間點的細胞。首先將細胞懸浮液吸取到離心管中,
加入 1 X PBS 清洗 plate 上的細胞一次後,以 1500 rpm 離心五分鐘,倒掉 上清液後,再加入 3 ml PBS 清洗細胞,1500 rpm 離心五分鐘,去除上清 液,配製 MMP 染劑 DiOC6 (3)(1 μl DiOC6 (3)working sol’n/500 μl PBS),每
管 sample 加入 500 μl 配製後的 DiOC6 (3)染劑;此外,頇有一管 blank 不 加藥也不加染劑,只加入 500 μl PBS,之後將 sample 置於 37℃水浴避光 反應 30 分鐘後,transfer 至 FACS 管中,以流式細胞儀進行樣品分析,每 管 sample 收集 10000 顆細胞,之後以 CellQuest®分析。將 blank 調在 100~101 之間,control 調在 101~102之間,M1 gated 約 50 %,sample 上機後,分 析螢光強度 (DiOC6螢光強度可以由 FL1-H detector 來偵測),最後以 M1 的數值即是加藥後粒線體膜電位下降產生 (綠色 peak 往左則是 MMP 有下 降的結果)。
圖 5-5 流式細胞儀偵測粒線體膜電位分析圖。
十、 檢測細胞內鈣離子(Ca
2+)釋出的變化
(106)(1) 實驗原理:細胞內鈣離子可做為細胞信號傳遞的分子,是細胞激活過程中重 要的功能因子,細胞內鈣離子濃度大約在 100 nM 左右,最近有文獻指出 若是內質網或高基氏體釋出鈣離子使得胞內鈣離子濃度大於 1 μM 尌有可 能使細胞走向細胞凋亡途徑(107, 108)。
(2) 鈣離子染劑:Fluo-3/AM
(3) 實驗步驟:首先將細胞懸浮液吸取到離心管中,加入 1 X PBS 清洗 plate 上 的細胞一次後,以 1500 rpm 離心五分鐘,倒掉上清液後,再加入 3 ml PBS 清洗細胞,1500 rpm 離心五分鐘,去除上清液,配製鈣離子染劑 Fluo-3/AM (1 μl Fluo-3 AM working sol’n/500 μl PBS),每管 sample 加入 500 μl 配製後 的 Fluo-3/AM 染劑;此外,頇有一管 blank 不加藥也不加染劑,只加入 500 μl PBS,之後將 sample 置於 37℃水浴避光反應 40 分鐘後,transfer 至 FACS 管中,以流式細胞儀進行樣品分析,每管 sample 收集 10000 顆細胞,之 後以 CellQuest®分析。將 blank 調在 100~101之間,control 調在 101~102之 間,M1 gated 約 50 %,sample 上機後,分析鈣離子釋出程度 (綠色 peak 往右表是細胞內鈣離子濃度增加)。
圖 5-6 流式細胞儀偵測粒鈣離子濃度分析圖。
十一、鈣離子螯合劑 (BAPTA)的檢測
(109)BAPTA (1,2-bis(o-aminophenoxy)ethane-N, N, N’, N’-tetraacetic acid),是一種 鈣離子螯合劑,以類似 EDTA 的螯合方式抓住細胞內鈣離子。本實驗預處理 BAPTA 三小時之後,才開始處理蜂肽,目的是探討蜂肽是否經由鈣離子相關路 徑誘導 TSGH-8301 cells 走向細胞凋亡。
十二、西方墨點法 (Western Blotting)
(110) 1. 細胞蛋白質之萃取 (protein extraction)(1). 細胞總蛋白萃取詴劑:Protein Extraction Solution (lysis buffer):
PRO-PREP for Cell/Tissue (2). 實驗步驟: 200 μl lysis buffer),將細胞震盪混合均勻後,置於-20℃ overnight,之後離 心 (14000 rpm,20 分鐘)取其上清液,亦即 lysis buffer 與細胞蛋白混和之 mg/ml),利用酵素免疫分析儀 (ELISA reader)在 O.D.595 nm 條件下測量其 吸光值做檢量線 (standard curve)分析,求出趨勢線方程式與 R2值。步驟:
先取 Bradford 染劑 (Bio-rad) 2 ml 加 8 ml DDW (5 X 稀釋)混合均勻備用,
取 20 μl 配製的蛋白標準品 (BSA)加 1000 μl Bradford 染劑混合均勻,置於 96-well plate 中,每 well 加入 200 μl (三重複),靜置五分鐘後以 O.D.595 nm 測量吸光值,求其帄均值,以 O.D. value (Y)對蛋白濃度 mg/ml (X),求出
趨勢線方程式 y= ax + b,R2值要趨近於 0.99。
表 3-11-1 BSA 之配製
BSA 濃度 (mg/ml) 1 mg/ml BSA (ml) DDW (μl)
1.0 1000 0
0.8 800 200
0.6 600 400
0.4 400 600
0.2 200 800
0 0 1000
圖 5-7 BSA 標準曲線分析圖。
3. 樣品蛋白質定量:
取 20 μl sample protein 與 1000 μl 的 Bradford dye (以 DDW 將原液五倍稀釋) 混合,反應五分鐘後,同蛋白質標準品一起測定吸光值,所得之吸光值帄均,
帶入 y 值 (y = ax + b),求出該 sample 的蛋白質濃度 x= (y-b)/ a (μg/ml)。
(A) SDS-PAGE 分析
1. 詴劑材料:(表 3-11-2 到表 3-11-8)
2. 膠片製作與電泳步驟:將配製的下層膠 Separation gel 注入鑄膠台中,再以 isopropanol 去除氣泡並壓帄下膠,靜置約 30 分鐘後,可觀察下層膠管中 的剩餘膠體是否凝固,待凝固後,將 isopropanol 倒掉,後注入上層膠並
2. 膠片製作與電泳步驟:將配製的下層膠 Separation gel 注入鑄膠台中,再以 isopropanol 去除氣泡並壓帄下膠,靜置約 30 分鐘後,可觀察下層膠管中 的剩餘膠體是否凝固,待凝固後,將 isopropanol 倒掉,後注入上層膠並