(1)實驗前準備
在實驗進行前我們必須先尋找分子的相關文獻,瞭解全世界對於 這個分子的研究程度,並藉由文獻提供的資訊來幫助自己的實驗能夠 順利完成,實驗前亦需查詢樣品的相關特性,例如: 熔點、沸點、蒸 氣壓等,藉此研判實驗進行時需要進行加熱動作來提升分子束的品質,
本次實驗研究的分子對位乙炔基苯胺是向 Sigma-Aldrich 公司所購買
的,樣品純度達 97 %,熔點為 104 ℃ ,沸點尚無數據,在常溫常壓
下為固體,研判需要加熱,但因為沸點未知,所以加熱時須格外小心。
另外,分子從基態躍遷至第一電子激發態所需要的能量(EE)及游 離能(IE)也是實驗前必須查詢的重要資訊,因為這關係到染料的選擇,
因此分子在文獻中並沒有關於激發能量的訊息,我們可藉由類似分子 作為參考來預測分子的電子躍遷能量與游離能。比較對位乙基苯胺和 苯胺實驗結果,我們估計對位乙炔基苯胺的第一電子躍遷能分別為 33262 cm-1;游離能則 59959 cm-1,轉換成波長分別為 601,667 nm(倍 頻前),依據染料手冊選擇 R-610 和( R-610 + R-640 )作第一道雷射染 料,( DCM + LDS698)作第二道。
(2)實驗中
分子束產生的離子訊號累加300次所得到的,每變換一次雷射波長,
就會得到一張質譜,最後在質譜中選取我們所要偵測的分子,電腦便 會將這個飛行時間下,隨著不同雷射波長所產生的離子強度變化轉換 成光譜,如圖十五所示,雖然在MCS所開啟的時間窗內可以同時收集 到不同質量的離子訊號,但我們可以經由此功能只選擇我們的分子,
達到質量篩選的目的,圖十六上半部為質譜,中間為未除以雷射能量 的光譜,下半部為除以雷射能量的光譜。
圖十五、質譜轉光譜示意圖。(a)多光子游離質譜圖,是根據改變雷射 波長,取得不同波長下的各個質譜圖,可以在 MCS 所開啟 的時間窗內,收集到不同質量的離子訊號,具有質量篩選的 功能,(b)多光游離光譜,係將選定特定飛行時間的離子訊號 與雷射波長作圖,得此光譜圖。
圖十六、對位乙炔基苯胺之實驗紀錄包含參數條件、質譜、光譜及校 正後光譜
在利用2C-R2PI來探測粗略游離能時,我們利用第一電子激發態
較強者)進行MATI實驗時,因為若激發態與離子態的構形改變不大 時,通常在離子態時會以相同的振動模式運動,所以在同樣的範圍內
(本實驗為696~702 nm)亦會出現一很強的譜峰,進而再往短波長及 長波長掃描。
由於掃描程式的限制,實驗中一次最多只能掃描 20 nm 的光譜 (500 張質譜),因此無法藉由一次掃描得到完整的光譜,於是在實驗 完成後我們必須將分段掃描所得到的光譜銜接起來,並對雷射的波長 進行能量校正(雷射 1 及雷射 2 須分別加上 0.20 nm 及 0.34 nm),決定
游離能時須考慮史塔克效應造成的影響,加上 4F1/2 的數值,且取游
離臨界值(即 MATI 的 0+光譜峰)時,必須取高能量端得到分子準確的
絕熱游離能,最後再利用理論計算所得到的激發態、離子態各個振動 頻率與我們所得到的光譜比較,進行光譜指派工作。
六、理論計算與光譜分析 1. 概論
實驗得到分子精確的躍遷能量與絕熱游離能,譜峰對應分子振動 運動及頻率,進一步分析文獻與實驗結果,同時依據理論計算方法,
得到對位乙炔基苯胺的振動基本模式與對應頻率,三者交叉比對,有 助於光譜分析工作。計算結果給出分子於基態、第一電子激發態及游 離態零點能態(zero-point energy, ZPE level),即分子處於振轉動基態的 內能,相減可得躍遷能量、游離能等。
我們使用套裝的理論計算軟體 GAUSSIAN 09 [69],得到分子於各電 子態的最佳化結構、振動基本模式、以及對應的振動頻率。首先利用 GaussView 5.0 軟體產生分子初始構型,根據 IUPAC 定義原子順序,
如圖十七所示。
圖十七、對位乙炔基苯胺的原子標號順序
計算分幾部分[71]:
(1) 最穩定構型:系統能量隨結構改變,圖十八為分子位能曲面圖 (potential energy surface, PES),假設系統只有二個自由度,Z 軸表 示系統內能,我們於輸入檔定義相關參數,經計算可得到系統單 點能(single point energy calculations),再對結構參數如鍵長、鍵角 等進行微調,紀錄單點能變化,直到系統總能達最低者,即得到 系統的最小穩定能(global minimum energy),對應的分子構型即為 最佳化結構。我們於輸出檔的 SCF Done 區塊得到系統總能,檢查 各項參數是否收斂(Converged):
A、Maximum Force:低點能的一次微分對應到系統受力應為零,
須小於臨界值 0.000450;
B、RMS Force:系統受力方均根亦為零,須小於臨界值 0.000300;
C、Maximum Displacement:系統位移須小於臨界值 0.001800;
D、RMS Displacement:方均根位移須小於臨界值 0.001200。
圖十八、分子位能曲面圖(Potential energy surface,PES)
(2) 分子振動頻率:得到最佳化結構後,分別計算分子運動的振動頻 率、力常數、簡約質量等參數。基態與游離態的計算結果準確度 相對高,第一電子激發態計算結果與實驗值相比一般會高估 10 ~ 12 %,造成偏差的可能原因[24]:
A、基底函數組的不夠完整(imcompleteness of basis set);
B、假設系統振動形式呈簡諧(harmonic motion assumption);
C、Hartree-Fock 忽略電子之間關聯性(correlation consideration),於 是 我 們 在 數 據 分 析 時 分 別 將 計 算 結 果乘 以 一 最 佳 化 修 正 因 子 (scaling factor),以趨近實際的測量值。
圖十九、計算分子的零點能
(3) ZPL:多原子分子於絕對零度有振動零點能態,考慮零點能修正項 (zero-point correction, ZPC),我們於輸出檔可得到最穩定構型的系 統零點能。如圖十九所示。
計算完成後,我們於輸出檔檢查各項參數是否收斂(converged),
(3)密度泛函數理論(density functional theory, DFT):相對於 HF 只考慮
mixed-spin)與電子間交互作用力,並引入
E
XC( ρ ) = E
X( ρ ) + E
C( ρ )
關係,統的 Restricted 限制,游離態則選擇系統條件為 Unrestricted。
及先前版本無法計算第一電子激發態的振動頻率,我們於2011年年初
(primitive GTO)的線性組合,如:
= ∑
所使用的基底函數及初始函數分別如下:
27個及1 × 3 = 3個初始函數,使用STO-3G基底函數組來進行計算時,
圖二十 對位乙炔基苯胺的 121與 11振動模式,白點為碳,紅點代表 氮,藍點為氫,黑點表示位移。
苯環的振動基本模式可分為三類:
(1) tangential vibrations,屬平面運動,分別為 carbon-carbon stretching vibrations,包含 8a、8b、14、19a、19b,以及 C–H(X) in-plane bending vibrations (X 為環外第一個原子),有 3、9a、9b、15、18a、18b,
實際的系統常伴隨 C–C、C–H(X)運動同時出現,故觀察到的振動 運動隨分子系統而異。
(2) radial vibrations , 同 為 平 面 運 動 , 可 分 為 C–H(X) stretching vibrations,有 2、7a、7b、13、20a、20b;radial skeletal vibrations,
有 1、12、6a、6b,與 tangential 振動不同點於前者運動沿系統中 心與六角直線,而後者偏離這些直線。
(3) out-of-plane vibrations,意即非平面運動,有 out-of plane skeletal vibrations 如 4、16a、16b,碳與氫運動方向相同;另一為 C–H(X) out-of-plane vibrations,有 5、10a、10b、11、17a、17b,碳及氫 運動方向相反。
圖二十一、苯環的三十種振動基本模式
光譜判定主要分三個程序:
a. 在 本 實 驗 中 , 我 們 選 擇 對 位 乙 基 苯 胺 [53,76] 和 對 位
氨 基 苯 腈 (
p-Aminobenzylnitrile)[72]來作為光譜判定的主要參考(見表 1),並根據實驗結果與理論計算分析比對,檢驗判斷是否合理。
b. 我們參考 Varsanyi 等人著作: ”Assigments for Vibrational Spectra of Seven Hundred Benzene Derivatives” [73],根據配位位置及取代基 特性將系統區分,提供氣態的苯環及其相關衍生物於基態的振動 光譜(IR, Raman)與譜峰分析結果。對位乙炔基苯胺於書中分別被 定義為對位雙輕取代分子系統(p-di “light”),所謂的輕取代基指除
了–CF3 及–NSO 取代基外,與苯環相連的第一個原子其原子量 <
25;反之,當外接原子的原子量 > 25 者,定義為重取代基。屬同 一系統的分子振動頻率有特定區間,本書提供相關的光譜判定訊 息請參見表二和圖二十二,分別為此類衍生物的光譜分析統整,
與理論計算動畫結合,完成基態的振動基本模式判定。
c. 將基態結果與第一電子激發態、離子態計算結果比對,運動行為 於電子態間相似且振動頻率落在相同區間,分別得到第一電子激 發態、離子態判定結果與光譜進一步比對(見表三),完成譜峰判定 工作。
表一 對位乙炔基苯胺和類似分子在第一電子激發態的振動模式及
圖二十二 對位雙輕取代(p-di “light”)系統的振動樣式
表三 對位乙炔基苯胺於 S0、S1和 D0的譜峰頻率、理論計算數值、
a
ν, stretching, β, in-plane bending, γ, out-of-plane bending
七、 實驗結果 1. 質譜
不同質量的分子會有不同的振動模式,所以在進行R2PI和MATI 實驗的過程中,選擇特定質量的分子顯得相當重要。設定收集器時間 窗寬度40 ns,我們將雷射光波長固定(S1←S0 transition),於質譜可見 到一強一弱的雙峰訊號,如圖二十三所示。
根據校正結果,帶入公式T = A + B × M1/2 (A = 11.465,B = 1.8632,
T為離子訊號在MCS上顯示的時間,M為樣品分子的分子量)反推,得 到分子量為117.26和119.59,與物質安全資料表所提供的文獻值117.15 相當接近,所以我們選擇分子量117.26的分子進行光譜實驗。
圖二十三、對位乙炔基苯胺在雷射波長306.22 nm時所得到的質譜
2. 對位乙炔基苯胺之第一電子激發態振動光譜
C-(C2H)的伸縮;此外,相對於 S100位移 256 cm-1、682 cm-1之較微弱 譜峰皆與胺基反轉(Inversion)相關;110I11 (110及 I10運動模式之混頻) 以及 1106a10(110及 6a10運動模式之混頻),同樣會造成苯環之型變。且
由於位移 1200 cm-1以上所觀察到之振動模式多為混頻或倍頻出現,
故我們掃描至 1200 cm-1左右即可觀察到大部份常見之活性振動。詳
細分子運動描述參見圖二十五。
圖二十四、對位乙炔基苯胺的第一電子激發振動光譜
本次實驗結果顯示,由 Sigma-Aldrich 所購買的樣品中含有 3% 部
分不純物,我們將光譜資料對照實驗室數據發現 3% 不純物中含有部 分對位乙烯基苯胺,振動光譜參見圖二十六。
0 200 400 600 800 1000 1200 1400 Relative Energy / cm
-1Ion Intensity (arb. units)
9b
101
1012
10I
2010b
206a
1015
100
00, 31490 cm
-1圖二十五 對位乙炔基苯胺於第一電子激發態的振動模式
圖二十六 對位乙烯基苯胺的第一電子激發振動光譜
6a 12 1
13
4, γ(CCC) γΝΗ(wag)
表 4 對位乙炔基苯胺於第一電子激發態振動光譜觀察到的譜峰頻率、
2. 對位乙炔基苯胺之 PIE curve 光譜
生成,飛行時與加速電場作用形成離子。階梯上升初期,離子信號由
是略低於游離能的,因此我們選擇譜峰的高能量處作為游離能,一般 將游離能定在譜峰高度1/3到1/4的高能量處,根據此方法得到的游離 能為61270 ± 5 cm-1,換算成電子伏特為7.5963 ± 0.0006 eV。我們同時
是略低於游離能的,因此我們選擇譜峰的高能量處作為游離能,一般 將游離能定在譜峰高度1/3到1/4的高能量處,根據此方法得到的游離 能為61270 ± 5 cm-1,換算成電子伏特為7.5963 ± 0.0006 eV。我們同時