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YWp09 、 YWp10 PCR 增 幅 出 包 含 asr 及 其 啟 動 子 區 域 的 片 段 接 入 pRK415質體中,再轉型至大腸桿菌S17-1λpir,利用接合作用送入突變株 中。

生長曲線測試

取隔夜培養的菌液 200 微毫升加至新鮮的 4 毫升 M9、LB 或 LPM 中,

每隔一段時間測OD600的吸光值直到生長趨於靜止生長期。

IPTG誘導RstA或Asr蛋白質的表現

取200微毫升隔夜培養的菌液,加入4毫升新鮮LB或LPM培養液,在37℃

培養2小時後,將IPTG 加入培養液中至濃度為0.5 mM,經37℃培養6小時 後,以2,800 xg離心10分鐘取得菌體,進一步以SDS-PAGE分析並作為蛋白質

純化的來源。

抗生素抗性試驗

隔夜培養的菌液取200微毫升至新鮮4毫升LB中,於37℃培養箱中培養 2~3小時後,加入IPTG至0.5 mM作用3小時後,同時進行SDS-PAGE分析蛋白 質的表現,並且將菌液三重複用棉花棒塗抹於LB盤,待10~20分,將含抗生 素的濾紙錠放於盤中央,放入37℃培養箱中培養12~16小時後觀察抑菌圈大 小。

啟動子活性試驗

抽 取pLacZ15 的 質 體 並 將 目 標 基 因 ( asr : YWp01 、 YWp02 ; rstB : YWp27、YWp28)啟動子區域用PCR增幅出來之後切酵素,再與pLacZ15接 合在一起,接著利用轉型作用送入大腸桿菌S17-1λpir。取隔夜培養的菌液 200微毫升至新鮮的4毫升M9、LB或LPM中,置於37℃培養箱至OD600 = 0.7,

取1毫升菌液於1.5毫升的離心管中,用Z buffer(取16.1克 Na2HPO4·7H2O、

4.78克NaH2PO4、0.75克KCl、0.246克MgSO4·7H2O配製成一升且pH為7.0,滅 菌完後使用前加入2.7毫升2-mercaptoentanol)洗兩次菌塊並將細菌刮破後,

加入1毫升的Z buffer使之懸浮,取100微毫升至試管中(已加入35微毫升 chloroform,17微毫升0.1% SDS,900微毫升Z buffer)使混合均勻,將試管 放入37℃,10分鐘後,加入4毫克/毫升ONPG溶液(加入102.5毫升0.2 M

Na2HPO4·2H2O、22.5毫升0.2 M NaH2PO4·2H2O、一克ONPG,補水至250毫 升)200微毫升使之反應開始,待達作用完成之時間點加入1 M Na2CO3 500微 毫升使之停止反應。測量OD420之吸光值並記錄之 (24)。

酸逆境下菌存活試驗

將隔夜培養的菌液取 200 微毫升至新鮮 pH 7.0 LPM 培養液中,至 OD600=0.6 塗盤,並分兩部分;第一部分,直接給予酸逆境,pH 3.0 作用兩 小時後塗盤,隔夜計數菌落數除以初始反應菌數為存活率;第二部分,先在 弱酸pH 4.6 適應 2 小時後,再給予酸逆境 pH 3.0 作用兩小時,再塗盤,隔夜 培養將酸逆境後塗盤菌數除以初始反應菌數為存活率 (38)。

十二酯硫酸鈉- 聚丙烯醯氨膠體電泳(SDS-PAGE)

首先先將玻璃擦拭乾淨架好之後,迅速倒入Running gel(12.5%):

deionized water 3.7毫升;Running buffer 1毫升(3 M Tris-HCl,pH 8.0); 10%

SDS 80微毫升;40%(w/v)acrylamide solution(acrylamide:bis-acrylamide

= 37.5:1)3毫升;TEMED 9微毫升,10% APS 100微毫升)至適當高度,以 酒精輕輕加至電泳膠上方,等待電泳膠凝固後,倒掉上層水並以紙吸乾,再 加入stacking gel(Deionized Water 1.9毫升;Stacking buffer(1.0 M Tris-HCl pH 6.8 ) , 83 毫 升 ; 10% SDS 33 微 毫 升 ; 40% (w/v) acrylamide solution

(acrylamide:bis-acrylamide = 37.5:1)0.4毫升;TEMED,5微毫升;10%

APS,60微毫升)至溢出,隨即插入樣品梳,凝固之後移去樣品梳,並置於 電泳槽內,倒入 running buffer(35 mM Tris-base,250 mM glycine,0.1%

SDS)待用,將欲分析的蛋白質加入2X loading dye [ 2X SDS gel-loading buffer:100 mM Tris-HCl pH 6.8;4% SDS;20% glycerol;0.2% bromophenol blue(3’,3”,5’,5”-tetrabromophenol Sulfonphtalein);200 mM dithio-threitol ],

並於100℃加熱十分鐘後加至電泳膠well中,以100伏特數電泳分析15分鐘 後,再以90伏特電泳2小時,最後由玻璃夾層中取出電泳膠。將經電泳後的 SDS-PAGE切掉stacking-gel後,浸於staining buffer(0.25克Coomassie Brilliant Blue R250;45毫升deionized water;45毫升methanol;10毫升glacial acetic acid)室溫搖晃30分鐘,再浸於Destain buffer(30% methanol;10% acetic acid)中退染至可清楚的看見蛋白質為止。

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