在常溫下 6~9 DAF 有最大 ATP 濃度，之後隨發育階段而下降；高溫下則在 6 DAF 有最高 ATP 濃度，9 DAF 時還可以維持與常溫的水平，至 15 DAF 濃度急速下降。兩試驗材料比較下，SA1739 較 TNG67 有較高之 ATP 濃度。
She 等人 (2010) 研究發現耐高溫之品種 Kinmaze，高溫下粒重減少程度 低，且穀粒大小及粒型變化小，其發育階段穎果內部 ATP 含量常溫下 10 DAF 達最高峰，而在高溫 10 DAF 亦可維持常溫下之表現量，反觀在 flo2 mutant EM37 在高溫下粒重減少嚴重，其高溫下雖 ATP 下降緩慢，但於高溫下 7DAF 的 ATP 含量無法維持常溫下之狀態，可見 ATP 含量之維持與耐高溫有關。
而在本試驗材料的 SA1739 粒重變化與 ATP 表現模式，可符合 She 等人 (2010)的結果。
另在 She 等人 (2012)的試驗材料其大部分發育中水稻穎果 ATP 濃度有 2 個高峰期，而高溫下會使第 2 個高峰提前表現像皆較常溫低，且高溫與常 溫第 2 高峰之 ATP 濃度比與高溫下完整米粒有正相關。在本試驗材料中，
皆只有一個高峰期，且高溫下亦有提前表現之現象。比較高溫下與常溫高峰
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期 ATP 濃度之比例，TNG67 僅 79 %而 SA1739 則為 107 %，對應高溫下完 整米粒比率，TNG67 高溫下無完整米粒，而 SA1739 尚有 2.6 %之完整米粒。
若以完整米粒加 Chalky < 25 %之比例，高溫下 TNG67 為 0 %，而 SA1739 有 80%。
另由圖 2C 已得知 TNG67 高溫下 6~9 DAF 為乾物重累積速率最快時 期，但此時其穎果內 ATP 濃度已下降，至 20 DAF 有最大乾物重，此時 ATP 已達最低濃度。SA1739 高溫下 6~9 DAF 為乾重累積最快時期，穎果內部有 最高之 ATP 濃度，至 15DAF 有最大乾物重，ATP 濃度也已迅速下降。
由以上結果顯示，SA1739 不僅在高溫下可以維持 ATP 濃度高峰期之時 間點亦可減少與常溫 ATP 高峰之濃度差異，並且能在穎果有最大 ATP 濃度 時大量累積乾物質，顯示 SA1739 可以有效地利用能量，避免能量之浪費。
穀粒內大分子物質之合成皆需消耗能量，澱粉合成相關基因 SSⅡa 及 GBSS，在 TNG67 及 SA1739 兩個試驗材料中，常溫下隨發育階段表現量逐
漸增加，於 15 DAF 大量表現，但 SA1739 表現量在 15 DAF 達高峰後下降(圖 12)。由先前兩試驗材料之 ATP 含量(圖 9)及乾物重累積(圖 2A)可發現，澱
粉合成大量表現與乾物重持續累積，但此時穎果內部 ATP 濃度皆處於較低 之狀態，表示常溫下此生育時期之澱粉合成所需之能量消耗較低。
觀察兩試驗材料高溫下澱粉合成與儲藏性蛋白質基因表現(圖 13)，在高 溫下皆受到抑制，由其以 TNG67 抑制較嚴重。TNG67 及 SA1739 在高溫下 Porlamine 7、Glutaline、19kD Globulin 在穀粒充實早期表現量提升，但在 15 DAF 之後表現量下降，其中以 SA1739 高溫下抑制量較多。水稻穎果有 80%以上組成分為澱粉，故澱粉為影響粒重主要之因素，對照基因表現與成 熟穀粒重(圖 2C)之結果，推測 TNG67 高溫下粒重下降之主要原因來自於澱 粉合成基因抑制所導致。
在 Micorarray 的結果裡(圖 25)，針對澱粉合成途徑中，高溫下誘導
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SA1739 的 sucrose synthase(Os04g0309600 及 Os030g401300)、ADP-glucose transporter(Os05g0171300)、ADPase(Os05g0580000 及 Os07g0243200)、starch branching enzyme(Os06g0726400)、soluble starch synthase(Os06g0160700)。
在澱粉降解層面，前人研究裡發現高溫逆境誘導水稻穎果內 Amy1A, Amy1C, Amy3A, Amy3D 及 Amy3E 的表現(Hakata et al., 2012)。而在本試驗結果裡高
溫下也誘導了兩試驗材料的 Amy3D 及 Amy3E，但 TNG67 在 9 DAF 誘導 Amy3D；SA1739 則到 12 DAF 才誘導 Amy3D 表現。兩試驗材料的 Amy3E
在高溫下 6、9 DAF 皆被誘導，但 SA1739 到 12 DAF 其表現量受到抑制。
綜觀澱粉之合成代謝表現，SA1739 在高溫下較 TNG67 有利於進行澱粉合 成。
生物的能量代可由(1)有氧呼吸：糖解作用進入檸檬酸循環再由粒線體 之 oxidative phosporylation 產生 ATP；(2)無氧呼吸：由糖解作用最後之產物 pyruvate 走向酒精發酵途徑產生較少量之 ATP。
TNG67 常溫下參與糖解作用之 PFK 在 6~15 DAF 表現量上升隨後下 降，而 G3PDH 則是隨發育天數持續上升，PK 在 6~9 DAF 下降隨後又上升 (圖 14)。但在檸檬酸循環之 IDH 在 6~9 DAF 下降隨後上升，而 SUSB 與 MDH 則隨發育天數表現量下降(圖 15)，參與 oxidative phosphorylation 之 ATPSB 在 15 DAF 有些微上升，但整體趨勢是隨發育天數下降，而參與無氧呼吸之 ADH 則是自 9 DAF~15 DAF 表現量上升(圖 16)。由以上現象可發現，雖然
糖解作用在發育中後期還持續表現，但由 PK 所產生之 pyruvate 在穎果發育 中並無法走進檸檬循環進而走向 oxidative phosphorylation，取而代之是走入 無氧呼吸之途徑，表示 TNG67 常溫下穎果發育過程是走向低氧之過程，與 前人研究結果是相同(Xu et al., 2008)。
SA1739 常溫下參與糖解作用之 PFK 在 6~9 DAF 表現量些微下降，自 15DAF 表現量達最高峰，隨後下降，而 G3PDH 與 PK 則是 6~15 DAF 持續
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上升隨後下降(圖 14)。在檸檬酸循環之 IDH 隨發育天數持續上升，而 SUSB 與 MDH 則在 15DAF 表現量下降(圖 15)，參與 oxidative phosphorylation 之 ATPSB 在 15 DAF 後下降，而參與無氧呼吸之 ADH 則是自 9 DAF~15 DAF
表現量上升(圖 16)。由以上現象可知 SA1739 常溫下自 15 DAF 以前可藉由 糖解作用、檸檬酸循環與 oxidative phosphorylayion 產生能量，15 DAF 以後 則是藉由無氧呼吸維持後續之能量。
由於在大麥、玉米種子內發現氧濃度越靠近種子內部，氧濃度逐漸下降 (Rolletschek et al., 2004; Rolletschek et al., 2005)。常溫下兩試驗材料能量之走 向可推測，SA1739 比起 TNG67 可維持穎果內發育前 15 天有較多之氧含量，
可能因 SA1739 有較細長之粒型以利氧氣之擴散有關，但還需進一步的驗證 使得知。另對照先前澱粉合成基因表現、ATP 濃度與乾物重累積結果，澱粉 合成除可需較少之能量也能適應低氧之環境。
TNG67 高溫下參與糖解作用之 PFK 趨勢與常溫同，但在發育早期表現 量較常溫提升，到 15、20 DAF 表現量受抑制。而高溫下 G3PDH 表現量都 受到抑制，PK 則只在 9 DAF 表現量較常溫高，但趨勢是 6~15 DAF 隨發育 而提升，到 20 DAF 開始下降。而參與檸檬酸循環之 IDH、SUSB 及 MDH 高溫下的表現量接受到抑制，而 ATPSB 亦是受到抑制，反觀在參與無氧呼 吸的 ADH 高溫下表現量提升，且隨發育階段上昇，這表示糖解作用最後的 產物 pyruvate 在高溫下趨向走入無氧呼吸，表示 TNG67 高溫下穎果內部有 缺氧之現象。
SA1739 高溫下參與糖解作用之 PFK、G3PDH 及 PK 接受受到抑制，而 檸檬酸循環中的 IDH、SUSB 及 MDH 亦受到抑制，而 ATPSB 亦受到抑制，
但 ADH 卻大量表現，表示高溫下 SA1739 穎果內部亦是缺氧之現象，且依 靠無氧呼吸維持穎果內部所需之能量。
值得注意的是，PK 是將 PEP 轉為 pyruvate，pyruvate 經由 pyruvate
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decarboxylase 轉為 acetoaldehyde 再經由 ADH 轉為 ethenol。但 SA1739 高溫 下的 PK 相較常溫下之表現受到抑制，進入無氧呼吸所需 pyruvate 由此推定 應不是透過 PK 所提供。PPDK (pyruvate phosphate dikinase)是可以扮演 PK 之功能將 PEP 轉為 pyruvate，產生 ATP；亦可將 pyruvate 轉為 PEP，消耗 ATP 和 Pi 產生 AMP 及 PPi。隨著水稻穎果發育，PPDK 表現量下降(Chastain et al., 2006; Xu et al., 2008)，在穎果發育早期的調控是傾向將 PEP 轉為 PK(Chastain et al., 2006)。水稻有 3 種類型之 PPDK 基因，分別為在細胞質 內(cytosolic type)的 OsPPDKA 和 cyOsPPDKB，在葉綠體內之 chOsPPDKB。
在 T-DNA 插入造成 OsPPDKB 缺陷之水稻突變株，穀粒外觀呈現心白之現 象(Kang et al., 2005)，表示 PPDK 扮演著胚乳內物質累積之調控角色。細胞 質內之 PPDK 調控代謝合成途徑：(1)將 pyruvate 轉為 PEP，在細胞質中產 生之 PPi 為誘導澱粉合成中之 sucrose sythase 之訊號，有利澱粉之合成；(2) 由於 pyruvate 為碳、氮代謝與脂肪合成之轉折點，PPDK 若將 PEP 轉為 pyruvate 增加細胞質內之 pyruvte 含量，有利於使之轉為有機酸之合成，如 Ala 及 Glu，或是走向於脂肪酸之合成。(3)PPDK 會由低氧所誘導(Moons et al., 1998)，種子發育過程中是低氧之環境(Rolletschek et al., 2004)，PPDK 若走 向將 PEP 轉為 pyruvate 之途徑可以產生 ATP，將使缺氧之組織有利產生能 量。
在 DNA microarray 的結果發現，高溫下誘導 SA1739 在 6 DAF 的 OsPPDKB 表現(圖 25)。在水稻 OsPPDKB 突變體裡，沒有 OsPPDKB 轉譯
及 OsPPDKB 蛋白質，但伴隨有外觀呈現心白、粒重下降、蛋白質及脂肪含 量提高之現象，表示 OsPPDKB 的缺失使 pruvate 走向脂肪的合成(Kang et al., 2005)。在不耐熱的水稻品種裡，高溫下抑制 OsPPDKB 的表現，外觀有白 堊質 現象(Yamakawa et al., 2007)。而本試驗中高溫下誘導 SA1739 的 OsPPDKB 表現，推測此現象將有利於 pruvate 走向 PEP，產生 PPi 做為誘導
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sucorse synthase 之訊號進而促高溫早期的進澱粉合成。
TNG67 和 SA1739 常溫下 PPDKA 之表現隨穎果發育而提升，符合 PPDK 由低氧所誘導之現象(圖 16)。而高溫下 PPDKA 之表現被提昇，尤其以 SA1739 在 9DAF 大量表現，推測在高溫下有氧呼吸被抑制之情況下，PPDKA 將 PEP 轉為 pyruvate，產生 ATP 並使 pyruvate 得以進入無氧呼吸產生能量。
此外，生物體內之糖解作用、檸檬酸循環及 oxidative phosphorylation 皆 會受到 ATP、NADH、ADP 及 AMP 之調控。當 ATP、NADH 足夠時時會抑 制有氧呼吸途徑；而高 ADP 及 AMP 則會促進有氧呼吸之途徑產生能量。
依本研究上述結果推論，高溫下穎果內之糖解作用在 SA1739 受到抑制較嚴 重，對照穎果 ATP 濃度結果，可能對於 SA1739 而言細胞內所含之能量已足 夠，而對於 TNG67 而言是有能量不足之現象。SA1739 在高溫 6 DAF 能量 尚處最高值時藉由 OsPPDKB 的表現促進早期之澱粉合成，到 9 DAF 之後仍 可透過提升 PPDKA 和 ADH 供應高溫下穎果發育所需之能量。
(四)TNG67 與 SA1739 穎果 MDA 含量與濃度差異及脂肪過氧化相關基因表 現
MDA(malondialdehyde)是不飽和脂肪酸氧化之二次產物，被做為脂肪過 氧化之指標。TNG67 常溫下之 MDA 含量 6~15 DAF 持續上升，隨後下降；
高溫下 6~9 DAF 含量提升，隨後下降。SA1739 常溫下 6~9 DAF 含量上升，
隨後下降；高溫下 6DAF 含量最高，9DAF 含量下降，隨後又略上升。就濃 度(n mole/FW)而言，TNG67 常溫下 6~9 DAF 濃度高，隨後下降；高溫下 MDA 濃度隨發育而下降，且濃度皆較常溫低。SA1739 亦有相同之趨勢，
但其 MDA 濃度皆較 TNG67 低(圖 17)。以上顯示高溫下會加速 TNG67 脂肪 過氧化現象，使穎果早期 MDA 含量提高，進而導致穎果內部氧化逆境之產 生，使 TNG67 在高溫下細胞死亡現象較為嚴重。
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在苔鮮的抗旱研究裡，具耐旱性的苔鮮其 SOD 與 catalase 的活性較 高，且 superoxide dismutase (SOD)與 catalase (CAT)的提升有助於 MDA 含量 之下降(Dhindsa and Matowe, 1981)。脂質過氧化反應表示細胞需要更多之氧
在苔鮮的抗旱研究裡，具耐旱性的苔鮮其 SOD 與 catalase 的活性較 高，且 superoxide dismutase (SOD)與 catalase (CAT)的提升有助於 MDA 含量 之下降(Dhindsa and Matowe, 1981)。脂質過氧化反應表示細胞需要更多之氧