第三章 系統流程
3.4 白血球細胞核影像處理與特徵抽取
3.4.4 擷取白血球細胞核特徵
白血球細胞核特徵可以分成兩部分來探討:形狀以及紋理,本小節先介紹本 論文所使用的形狀特徵,再介紹本論文所使用的紋理特徵。
1. 與紅血球面積的相對比例:在本論文中,面積的單位為像素,計算白血球細 胞核範圍內所占面積,並且與紅血球面積相比較,最後可以得知白血球細胞 核所占面積相對於紅血球細胞所占面積的倍數。
2. 邊界曲率均方差:邊界曲率變化是評估白血球輪廓變化程度的依據,但是如 果將整個白血球細胞核邊界都納入考量,那麼特徵向量的大小將會非常驚人,
因此,根據最初的想法,使用此特徵的目的在於求得輪廓變化程度,所以只 取邊界曲率均方差,均方差越大,則邊界曲率變化越大,均方差越小,則邊 界曲率變化越小。
3. 邊界到中心的帄均距離與均方差:因為邊界曲率很容易受到擾動,還需要一 個更為穩固的特徵來協助描述邊界,本論文採用的特徵為邊界到中心的帄均 距離以及均方差;作法則是將邊界到中心距離作為高斯混合模型擬合的目標,
以三個高斯模型來近似,這三個高斯模型分別代表遠、中、近距離模型,最 後再以最遠距離模型的均值,將所有數據作正規化處理(normalization),透過 這三個高斯模型的帄均值以及均方差,可以得到描述邊界的另一種看法,雖 然無法完全取代邊界曲率對於整個邊界描述的重要性,但也能在邊界曲率受
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到干擾的時候提供一個較為穩定的邊界描述。
4. 正圓度(roundness):用來描述細胞核邊界近似圓形的程度,因為淋巴細胞與 單核細胞之細胞核形狀變化較少,基本上很接近圓形,相較起淋巴細胞與單 核細胞,其他三類粒細胞之細胞核變化就非常不規則,因此,用正圓度作為 特徵,可以很清楚地分別出淋巴細胞、單核細胞與粒細胞,對於初期的粗分 類是非常有幫助的;正圓度的定義如下:
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Perimeter
Roundness Area (2)
5. 堅實度(solidity):堅實度的定義如下:
Area Hull Convex
Solidity Area (3)
堅實度代表著在目標區塊凸殼(Convex Hull )內的像素同時也在目標區塊中的 比例;若白血球細胞核區塊其扭曲程度或者是正圓度太低,通常會導致其凸 殼面積遠大於細胞核區塊面積,因此堅實度會大幅下降;堅實度的高低也可 以做為判斷淋巴細胞、單核細胞以及粒細胞的一個依據。
6. 分葉數(lobes):細胞核分葉,對於判斷細胞核為哪種類別是很重要的特徵,
例如:嗜中性粒細胞通常有 3 到 4 分葉左右,而嗜酸性粒細胞則為 2 分葉,
嗜鹼性粒細胞其分葉數不明顯,淋巴細胞與單核細胞之分葉數皆為 1 分葉。
在白血球細胞核分類特徵中,分葉數應可以說是最重要的特徵,本論文在此 嘗詴用帄均值移動演算法(mean-shift)來找出白血球細胞核的分葉數目,流程 如圖 3.27,而分葉特徵抽取流程請見圖 3.28。
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圖 3.27 分葉數計算流程圖
(a)
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(b)
(c)
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(d)臨界值為 0.4 (e)臨界值 0.45
(f)臨界值 0.5 (g)臨界值 0.55
(h)臨界值 0.6 (i)臨界值 0.65
(j)臨界值 0.7 (k)臨界值 0.75
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(l)臨界值 0.8
(l)白血球細胞核分葉數量
圖 3.28 細胞核分葉特徵抽取。 (a)為經過區域成長及結合邊界資訊之後的白血 球細胞核影像;(b) 白血球細胞核像素距離邊緣最近距離影像;(c) 距離影像以 三維模型表示;(d)~(l) 距離影像以多重臨界值切割的結果;
(l) 白血球細胞核分葉數量。
由圖 3.28(b)可以看出透過計算細胞核影像距離最近的背景像素距離,可 以得到白血球細胞核每個區段的寬窄資訊,通常在判斷分葉的時候,所依據
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的是扭曲程度,以及寬窄;在細胞核分葉區,寬度通常會比分葉與分葉連接 處的寬度要寬,根據這個線索,可以先把圖 3.28(a)距離影像中每個細胞核區 像素值除以每個細胞核裡面最高距離值,把每個細胞核的距離影像進行正規 化(normalization),因此距離影像中每個細胞核核區的像素都呈現出和該核最 大寬度相對比例;如此一來,將可以進一步分析分葉。
從多重臨界值切割以及圖 3.28(b),可以知道在距離影像的所提供的相對 距離資訊,裡面含有許多的區域極值,隨著臨界值變動可以看出這現象,因 此為了不讓分葉計算受到區域極值影響,本論文在此以多重臨界值切割來累 積數據,每一次臨界值切割所產生的區塊中心將被保留下來,當多重臨界值 完成的時候,已經累積了足夠的資訊來分析分葉數。
由於我們並不知道一個白血球細胞應該分葉成幾葉,得要由累積下來的 細胞核各區塊的中心,以帄均值移動演算法來找出分葉數,結果如圖 3.28(l)。
7. 紋理特徵:詳細資訊請參考第 2.4 節灰度共生矩陣,以灰度共生矩陣提取出 細 胞 核 區 塊 的 凸 殼 範 圍 內 的 能 量 (energy) 、 對 比 度 (contract) 、 相 關 度 (correlation)、熵(entropy)、以及同質性(homogeneity),可以用這些特徵分析凸 殼區塊內的亮度分佈特性,藉此描述細胞核凸殼範圍內的染色情形,一般來 說,嗜中性粒細胞與嗜酸性粒細胞除了在細胞核分葉上有些差別之外,另一 個差異在於嗜酸性粒細胞內含嗜酸性顆粒,因此相較之下,兩者在細胞質的 區域之飽和度比較,嗜酸性粒細胞會比嗜中性粒細胞來得高,因此,透過灰 階共生矩陣,可以將這個特性描述出來。