3.腸病毒模擬模型與實驗設計
3.1. 模型基本架構
本研究主要建立腸病毒疾病傳染動態模型,將整個模型世界視為社會的縮小 版,設定真實人數縮小比率初始化後,模型便會依照改良的二分關聯網絡及日常 生活接觸網絡模式,來模擬我們設定的規則與參數,人類個體及群體就可以在模 型中表現出接觸、移動等行為,進而在染病進程SEIR Model裡,每個個體會表現 出健康狀況,而這些現象將反應模型世界的模擬結果。我們的模型分為三層,分 別為底層、人類個體層及個體染病進程,其架構如圖所示,以下將依序介紹其元 件、項目及功能。
圖 19 模型架構圖
3.1.1 場所與地理區域(底層)
底層也就是場所與地理區域,如圖中的二維細胞自動機,代表真實世界中的 區域,每一晶格規模以人為單位,相鄰的格子被視為其他人的個體或分身單位,
在單或多個單位內可以形成一個場所,鄰近晶格上的個體們,存在同一個空間場 所中,會因為近距離接觸或因密閉空間而感染疾病。在腸病毒模擬程式中,我們 以這樣的二維晶格來做為實際的地理區域,以上的概念轉換成程式,在模擬實驗 前可以設定預計模擬的區域大小,隨機場所及固定場所都有容納人數的數量,讓 我們主要探討的目標場所可以個別分離出來,如家庭(平均有3 人)、辦公室(平 均有10~15 人)、學校教室(平均 30~40 人)[11]。
圖 20 具分身點的細胞自動機
3.1.2 人類個體層與日常生活接觸網絡
本研究應用2004 年 Huang 等人提出的模式(Cellular automata with mirror identity model CAMIM)[7],使用代理人系統與分身點概念,將個體分為上下兩層,
並有二維細胞自動機做為區域底層,可以產生三維空間及展現個體的異質性,如 圖所示每個代理人都有所屬的分身點,依據代理人分身點於各場所內,模擬程式 產生與其他人的接觸率與隨機亂數,可以表現個體的活動與生活接觸網絡,除了 利用分身點概念來表現日常定點活動與長距離移動外,套用新改良的二分關聯網 如圖,將只有編碼的場所,改善後可以討論更真實的代表目標場所,設定固定場 所的感染率,可以探討該場所感染率上升或下降對各年齡層的影響。
圖 21 改良後的二分關聯圖
3.1.3 染病進程
若一個分身點所屬代理人已感染腸病毒,而與此有鄰居關係的其他分身點所 屬代理人,就有機會感染疾病,每次的接觸是否得病,則由傳染參數
(sickInfectRate)來決定之,而人類個體的染病進程,將可以視為個體的健康狀 態,我們應用Compartmental model 中 SIR Model 的概念,建立腸病毒疾病發展 模型,透過各種不同的疾病狀態,來表示個體的染病過程。
3.1.3.1 腸病毒疾病發展模型
第二章已探討過腸病毒重症的特性,我們根據疾病管制局等疾病文獻資料,
設計腸病毒疾病發展模型,其中傳染力部分分為I 1及I 2,主要是因為有50~80%的 人沒有症狀產生,但仍具有傳染力。
圖 22 腸病毒疾病發展模型
表 2 狀態定義表
3.1.3.2 疾病參數設定
本程式系統修改自Tsai提出的流感模擬系統,將第二章節的腸病毒疾病特性,
及Philip[29]作為模型設計裡疾病參數設定的來源,設定出傳染參數傳染天數,並 依據不同的年齡層,設定不同的傳染率、自行就醫率、字體隔離率及死亡率等相 關疾病參數。
圖 23 疾病發展細項參數
表 4 代理人個體疾病特性參數表
名稱 型態 說明 設定值
PeopleReduceMI 整數 個體活動地點減少後,分身點之比例
0.6-1
(隨機)
PreInfectRate 浮點數 1-4 歲傳染率 0.4368
YouthInfectRate 浮點數 5-14 歲傳染率 0.4368
AdultInfectRate 浮點數 15-64 歲傳染率 0.2188
SeniorInfectRate 浮點數 64 歲以上傳染率 0.2188
PreDeadRate 浮點數 1-4 歲死亡率 0.02
YouthDeadRate 浮點數 5-14 歲死亡率 0.01
AdultDeadRate 浮點數 15-64 歲死亡率 0.001
SeniorDeadRate 浮點數 64 歲以上死亡率 0.001
PreSeeDoctorRate(1) 浮點數 1-4 歲自行就醫機率 0.8
PreSeeDoctorRate(2) 浮點數 5-9 歲自行就醫機率 0.8
YouthSeeDoctorRate 浮點數 10-14 歲自行就醫機率 0.5
AdultSeeDoctorRate 浮點數 14 歲以上自行就醫機率 0.1
PreSelfIsolating(1) 浮點數 1-4 歲自體隔離機率 0.8
PreSelfIsolating(2) 5-9 歲自體隔離機率 0.75
YouthSelfIsolating 10-14 歲自體隔離機率 0.75
AdultSelfIsolating 14 歲以上自體隔離機率 0.1