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計算多組比較的臨床試驗樣本數

第三章 利用連續時間型馬可夫鏈(continuous time Markov Chain)計算臨床試驗樣

3.3 計算多組比較的臨床試驗樣本數

2

1 2

2 Tr N PTr N P

d = × + × . (3.25)

其中P 、Tr1

Tr2

P ,可以由時間為T 時的兩組試驗組的狀態機率向量中,第一個元素

得知,符號為d1Tr,T1d1Tr,T2。所以取樣總數N,最後可由下列的式子算出,

N =2d

(

PTr1 +PTr2

)

. (3.26) 以上是如何用連續時間型馬可夫鏈,來計算兩組比較臨床試驗樣本數的所有過 程。我們將在第 5.1 節中,介紹用此方法的模擬計算結果。接下來要介紹的是,

用連續時間型馬可夫鏈建構臨床試驗下,計算多組比較的臨床試驗樣本數。

3.3 計算多組比較的臨床試驗樣本數

上一節中,介紹了兩組比較的樣本數計算方法,在本節中,我們將繼續介紹,

用連續型馬可夫鏈,計算多組比較的臨床試驗樣本數。計算的過程,可以拿第 2.2 節的內容,做一番對照。另外,如何以一單位時間的轉移機率矩陣,計算出 轉移率矩陣的方法,在第 3.2 節前半部,已經有詳細的介紹。差別只在於,比較 的組數增加,轉移率矩陣、轉移矩陣和狀態機率向量的維度增加。所以在本節中,

不再重覆相同的說明。我們先來了解試驗過程的說明,以及多組比較的 log rank 檢定統計量。雖然這一部份也在第 2.3 節裡介紹過,方便在這一節說明起見,我 們將重覆敘述。

考慮一個多組比較的臨床試驗,總共有N個病人,被隨機分配到k個不同的 組別

(

Tr1,Tr2,L,Trk

)

,接受不同的治療方式。假設在試驗期間,可以觀察到d個 在不同時間死亡的人數,而且d個不同時間的關係是t1<t2 <L<tdM 是組別jl

Tr 在時間j t ,發生死亡的個數。l N 是組別jl Tr 在時間j t 之前,面對死亡(at risk)l 的人數。N 是每一組在時間j t 之前,面對死亡的總人數。可以在每一個死亡發 l 生的時後,把人數的情況,可以整理成表格(3-1)的樣子,

表 3-1 在第l個死亡發生時,k組試驗組

(

Tr1,Tr2,L,Trk

)

的人數情況。

治療組別 Tr1 Tr2Tr k 總數

死亡數目 M1l M2lM kl 1 面對死亡數目 N1l N2lN kl N l

36

然後可以列出多維的 log-rank 統計量。在此,我們再一次列出統計量,以及統計 量的討論如下。

S 和j V 為, jp

= ⎟⎟

⎜⎜ ⎞

⎛ −

= d

l l

jl jl

j N

M N S

1

. (3.27)

⎟⎟

⎜⎜ ⎞

⎛ −

⎟⎟⎠

⎜⎜ ⎞

=

= l

ql jp d

l l

jl

jp N

N N

V N δ

1

. (3.28)

其中 j =2,3,L,k。如果 j≠ ,p δjp =0;如果 j= ,p δjp =1。還有下列的定義,

(

S S Sk

)

T

X = 2, 3,L, ,

⎥⎥

⎥⎥

⎢⎢

⎢⎢

=

kk k

k

k k

V V

V

V V

V

V V

V V

L M O M M

L L

3 2

3 33

32

2 23

22

.

為了要比較 K 組的生存函數,列出多維度的 log-rank 統計量如下,

LS = XTV1X. (3.29)

根據 Ahdersen(1993)和 Ahnn and Andeson(1998),我們知道多組比較的 log rank 統計 量在虛無假設和對立假設的漸近分配。在虛無假設下,log rank 統計量的漸近分 配是中心卡方分配,其自由度是k−1(也就是比較組數減一)。在對立假設下,log rank 統計量是自由度為k−1的非中心卡方分配,其非中心參數為τ 。Ahnn and Andeson(1998)指出,非中心參數τ ,為下列式子,

τ =E

( )

XT

[

E

( )

V

]

1E

( )

X . (3.30) 如何利用上述的知識,計算出多組比較的臨床試驗樣本數,原理在第 2.3 節介紹 有詳盡的說明,我們就其結論,繼續這一單元的介紹。接下來,所要進行的步驟 是,改用連續時間型馬可夫鏈的模型,計算 log-rank 統計量漸近分配的非中心參 數值,也就是計算式子(3.30)的近似值。

定義N 是第 j 個試驗組,在第 i 個期間,面對死亡的人數,ji λji是第 j 個試 驗組,在第 i 個期間風險(hazard)。另外還有φji、θji

37

38

39 (3.34)~~(3.38)得到)

給定α 、β和知道自由度是

(

k−1

)

,可以先利用軟體找出非中心卡方分佈

40

(non-central χ2)的參數τ 值,我們令找到的值為τα,β。所以,可以得到下列的關 係式,

Θ

Θ

= 1

,β d TV

τα . (3.44) 式子(3.42)等號右邊,除了d外,可以由任意時間 t 的狀態機率向量得到。因此我 們可以先解出符合假設檢定,顯著水準是α ,檢定力是

(

1−β

)

的條件下,所需要 看到的死亡總數d。最後,如果取樣總數是N,與臨床試驗到期的k組死亡率

Trk

Tr

Tr P P

P , , ,

2

1 L 和死亡總數d有下列的關係,

Trk

Tr

Tr P

k P N

k P N k

d = N × 1 + × 2 +L+ × . (3.45)

其中PTr,PTr , ,PTrk 2

1 L ,可以由時間為T 時的k組試驗組的狀態機率向量中,第一

個元素得知,符號為

d

1Tr,T1

, d

1Tr,T2

, L , d

1Tr,Tk 。所以取樣總數N,最後可由下列的

式子算出,

N = kd ( P

Tr1

+ P

Tr2

+ L + P

Trk

)

. (3.46) 以上是如何用連續時間型馬可夫鏈,來計算多組比較臨床試驗樣本數的所有過

程。下一章的內容中,我們將考慮臨床試驗發生有非獨立設限下,如何以條件連 續時間型馬可夫鏈,計算所需要的樣本數量。

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第四章 在發生不獨立設限情況下,用條件連續時間型馬可