第二章 材料與方法
三、 質體
1. pcDNA3-FLAG
帶有FLAG 標籤之載體。
2. pFLGA-hLRH-1
由巨細胞病毒 (cytomegalovirus,CMV) 啟動子驅動,表現帶有 FLAG 標籤之 人類LRH-1 全長蛋白 [43]。
3. pFLAG-mLRH-1
由巨細胞病毒 (cytomegalovirus,CMV) 啟動子驅動,表現帶有 FLAG 標籤之 小鼠LRH-1 全長蛋白 [80]。
4. pGL3[Luc+]-Basic
帶有螢火蟲冷光酶 (Photinus pyralis) 標籤之載體。
5. pGL4.10[Luc2]-Basic
帶有螢火蟲冷光酶 (Photinus pyralis) 標籤之載體,由國立台灣大學醫學院第 一共同研究室生醫資源中心提供。
6. phLRH-1pI 2.7k-Luc
取人類NR5A2 基因前方約 2700 個鹼基序列作為啟動子,構築於 pGL3[Luc+ ]-Basic 上,由本實驗室楊豐名學長建構。
7. phLRH-1pII 2.7k-Luc
此質體委託國立台灣大學醫學院第一共同研究室生醫資源中心建構。擷取人類 NR5A2 基因之 intron 1 上約 2700 個鹼基序列,以 NheI-HindIII 嵌入
pGL4.10[Luc2]-Basic 中。
8. phLRH-1pII 1k-Luc
以 phLRH-1pII 2.7k-Luc 為模板,藉由聚合酶連鎖反應 (Polymerase chain reaction,PCR) 放大 NR5A2 基因之 intron 1 約 1000 個鹼基序列,將此 PCR 產物和 TA 載體 (RBC Bioscience) 連接。經過定序確認序列後,以 NheI-HindIII 切下並接 合於pGL4.10[Luc2]-Basic 之 NheI-HindIII 位置。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’-TTCCgctagcTCTATGAGTGAG-3’ * Reverse 5’-GATTGCCaagcttATCCGTG-3’ #
*小寫字母為 NheI 的辨認序列。
#小寫字母為HindIII 的辨認序列。
9. phLRH-1pII 0.5k-Luc
以phLRH-1pII 2.7k-Luc 為模板,由 PCR 反應放大 NR5A2 基因之 intron 1 約 500 個鹼基序列,將此 PCR 產物和 TA 載體連接。經過定序確認序列後,以 NheI-HindIII 切下並接合於 pGL4.10[Luc2]-Basic 之 NheI-NheI-HindIII 位置。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’- ATGGgctagcTTACCTCCTTCT-3’ * Reverse 5’-GATTGCCaagcttATCCGTG-3’ #
*小寫字母為 NheI 的辨認序列。
#小寫字母為HindIII 的辨認序列。
10. phLRH-1pII 0.2k-Luc
以phLRH-1pII 2.7k-Luc 為模板,由 PCR 反應放大 NR5A2 基因之 intron 1 約 200 個鹼基序列,將此 PCR 產物和 TA 載體連接。經過定序確認序列後,以 NheI-HindIII 切下並接合於 pGL4.10[Luc2]-Basic 之 NheI-NheI-HindIII 位置。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’- TACTAgctagcGGCAATAGCAG-3’ * Reverse 5’-GATTGCCaagcttATCCGTG-3’ #
*小寫字母為 NheI 的辨認序列。
#小寫字母為HindIII 的辨認序列。
11. phLRH-1pII mNR-Luc
以phLRH-1pII 0.5k-Luc 為模板,將啟動子 II 上 nuclear receptor (NR) 結合序列
AGGTCA 進行突變。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’-CCTCCTTTTTTAACCCcGAaaTCCTCCTCGCAGCTTGG-3’
Reverse 5’-CCAAGCTGCGAGGAGGAttTCgGGGTTAAAAAAGGAGG-3’
12. phLRH-1pII mSp1-Luc
以phLRH-1pII 0.5k-Luc 為模板,將啟動子 II 上 specificity protein 1 (Sp1) 的關 鍵序列進行突變。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’-CTCCTCGCAGCTTGGGaatGGCTCCGGAGCTGCGAGAC-3’
Reverse 5’-GTCTCGCAGCTCCGGAGCCattCCCAAGCTGCGAGGAG-3’
13. phLRH-1pII mSp3-Luc
以phLRH-1pII 0.5k-Luc 為模板,將啟動子 II 上 specificity protein 3 (Sp3) 的關 鍵序列進行突變。
PCR 使用之配對引子:
Primer Sequence
Forward 5’-CAGAGGTCCTGCCCGGCAattCCGAGGAGGCGGAGGCAC-3’
Reverse 5’-GTGCCTCCGCCTCCTCGGaatTGCCGGGCAGGACCTCTG-3’
14. phLRH-1pII mNR+Sp1-Luc
以phLRH-1pII mSp1-Luc 為模板,將啟動子 II 上 NR 結合序列 AGGTCA 進行 突變;使用之PCR 配對引子同 phLRH-1pII mNR-Luc。
15. phLRH-1pII mNR+Sp3-Luc
以phLRH-1pII mSp3-Luc 為模板,將啟動子 II 上 NR 結合序列 AGGTCA 進行
突變;使用之PCR 配對引子同 phLRH-1pII mNR-Luc。
16. phLRH-1pII mSp1+Sp3-Luc
以phLRH-1pII mSp3-Luc 為模板,將啟動子 II 上 Sp1 的關鍵序列進行突變;
使用之PCR 配對引子同 phLRH-1pII mSp1-Luc。
17. phLRH-1pII mN+1+3-Luc
以phLRH-1pII mSp1+Sp3-Luc 為模板,將啟動子 II 上 NR 結合序列 AGGTCA 進行突變;使用之PCR 配對引子同 phLRH-1pII mNR-Luc。
18. pGL4.74[hRLuc/TK]
啟動子為皰疹病毒胸腺嘧啶激酶 (herpes simplex virus thymidine kinase,HSV-TK),表現水母冷光酶 (Renilla reniformis) (Promega)。