• 沒有找到結果。

Voronoi 分析是一種空間分割的演算法,其概念是在一個 N 維空間中,若有 k 個粒子分佈在其中,我們可以將這個空間分割成 k 個 Voronoi 單位晶胞(Voronoi unit cell),每個 Voronoi 單位晶胞內部只有一個粒子。對空間內所有的 Voronoi 單位晶 胞,在晶胞內部的任意一點與該點距離最相近的粒子,即為該晶胞內的粒子。

水分子是由三個原子所組成,因此我們將這個概念應用在水分子的質心或水 分子的氧原子上。在本文中,我們選擇對氧原子作分析。

Voronoi 分析是在水分子跟相鄰水分子的氧原子連線上作一中垂面,將所有的 分子對都依照上述的方式作分割,然後連結這些中垂面,則每一個水分子都可以 得到一個多面體。對每一個多面體,我們定義 Asphericity  :

2 3

36 V A

  (2 - 22)

A

V

分別代表多面體的總表面積跟體積 [9]。不同的

,水分子的局部結構也會 不同。當多面體為球體時,

為最小值 1;當多面體為正四面體,

值為2.25。隨 著

值逐漸變大,多面體的幾何性質會逐漸趨向非球型化(Aspherical)。

在圖(一)中,展示我們的三種水分子模型的 Asphericity 分佈曲線。我們將 Asphericity 分佈劃分為四個區間,每一區間表示為一 Voronoi group (VG)。表(四)、

表(五)分別列出非剛性水分子模型 I 跟模型 II 四個 VG 所對應的區間以及該區間所 佔的平均分子數目的百分率。由表(四)、表(五)四個 VG 的分佈情形,在我們的模

擬中,大多數水分子分佈在 VG II 和 III,而 VG I 和 IV 所佔比例很少。

圖(一) 水在 300K 的 asphericity 分佈曲線,三種模型模擬的條件皆為 1.0gcm3&T300K, solid, dash, dot-dash line 分別表示非剛性水模型 I, 非剛性水模型 II, 剛性水模型的 Asphericity 分 佈曲線。

VG I VG II VG III VG IV

η below-1.46 1.46-1.72 1.72-1.98 1.98-above

L 0.005948 0.505424 0.444793 0.043835

表(四) 非剛性模型 I 四種 VG 所對應的 Asphericity 區間

L是 VG L 的 averaged number fraction, N N

L /

L

NL 是 VG L 的平均分子數,

N

是分子 的總數。

VG I VG II VG III VG IV

η below-1.46 1.46-1.72 1.72-1.98 1.98-above

L 0.006531 0.502044 0.447872 0.043553

表(五) 非剛性模型 II 四種 VG 所對應的 asphericity 區間

接著我們定義一個選擇算符(selection operator)

k

  L

 





otherwise

L of region the in

is k molecules of

y asphericit the

if

k L

0

VG

1

在此,L 代表四種 VG 的標記,。

選擇算符有下列的恆等式:

 

  L

k k L

k

N L

L

1

(2 - 23)

NL是在某一系統狀態時, VG L 區間的水分子的數目。

由選擇算符,我們可以得到每一個 VG 的氧─氧、氧─氫、氫─氫的徑向分 佈函數,由下式求得:

     

L

k k

k L ab

ab N

L r d r

g

 (2 - 24)

在此,上標 L 代表 VG 的標記, a 跟b可是氫原子或氧原子,  為系統在空間中水 的平均密度。

同樣的,我們對不同的 VG L 定義次系綜投影算符(Subensemble projection operator)

p

 ,L

   

N

k xyz

k k

L

U L

p

1 , ,

2 , ,



(2 - 25)



U

 k, 是 Hessian matrix 對角化之轉換矩陣。

不同 VG L 的次系綜投影算符

p

 ,L滿足以下的關係式,p,pI,pII,pIII,pIV,在某一系統狀態時,VG L 的分子數目,可由

  

N

k k

L L

N

1

求得。因為每一個 VG 次系綜(VG subensemble)的平均分子數目不相同,對 INM 頻譜上的貢獻也會有差 異。為了方便比較四個 VG 次系綜之間的關係,我們對 VG L 定義一個

原子的歸 一化 INM 狀態密度(Normalized

atom INM density of state)

D

INM(L)

  w

     

N

L L

L

INM w w Z P

w N D

9

1

, 0 )

( 1

(2 - 26)

  w

D

INM(L) 的物理意義即在

原子的 INM 頻譜

D

INM

  w

中,VG L 內每一個水分子的

原子之平均貢獻。

相關文件