shRNA 名稱 Clone ID 目標序列
shElk1-1 TRCN0000237872 CCCTGCTTCCTACGCATACAT shElk1-2 TRCN0000237873 GAGAGGGTTTGTGCCAGAAAC shElk1-3 TRCN0000237874 GTGAGTAGAAGAGTTAGTTTG shElk1-4 TRCN0000237875 CCAAGCTCTCCTTCCAGTTTC shElk1-5 TRCN0000237876 TGAAATCGGAAGAGCTTAATG
附錄
附錄一、探查 EB 病毒感染 CD19+初級 B 細胞後 cDNA 微陣列分析 DUSPs 基因 表現之變化情形 自捐贈者之白血球濃厚液利用 CD19+磁珠分離出 CD19+初級 B 細胞,以 B95.8 strain 之 EB 病毒感染初級 B 細胞,收取細胞於感染後第三天 及第七天,以及感染後第二十八天不朽化 B 細胞而成之 LCLs。萃取其 RNA 進 行 cDNA 微陣列分析,並將數據已 CD19+初級 B 細胞所得之相對數據為 1 進行 量化。Primary B cell I 為混合自第一位至第五位捐贈者所純化出之 CD19+B 細胞。
Primary B cell II 為混合第六位至第十位捐贈者所純化出之 CD19+B 細胞。此實驗 由本實驗致蔡淑君學姊完成。表格內「P」代表 present、「A」為 absent、「M」
為 marginal。
附錄二、探查 EB 病毒感染後 B 細胞內 DUSPs mRNA 表現量之影響
自兩位捐贈者(DonorA 與 Donor B)所得之白血球濃厚液,利用 CD19+磁珠純化 出 CD19+初級 B 細胞(primary B0),以 B95.8 strain EB 病毒感染細胞,於感染後 二十八天收取 EB 病毒不朽化初級 B 細胞之 LCLs 細胞,萃取 RNA 進行 RT-Q-PCR,
分析 DUSP1、DUSP2、DUSP6、DUSP8 mRNA 表現情形,並以-actin 作為內控 制組。將數據以 primary B0 所得之相對數據為 1 進行量化。此實驗由本實驗室董 姿巡學姊完成。
附錄三、探查 EB 病毒感染後於不同時間點 B 細胞內 DUSPs mRNA 表現量之影 響
利用 CD19+磁珠純化白血球濃厚液中 CD19+初級 B 細胞,以 B95.8 strain EB 病 毒感染細胞,收取感染後第 0、4、8、12、16、20、24、48、72 小時之細胞,以 及 EB 病毒感染 28 天後使 B 細胞不朽化之 LCL 細胞,萃取 RNA 進行 RT-PCR,
分析 DUSP1、DUSP2、DUSP4V1、DUSP4V2、DUSP5、DUSP6、DUSP7、DUSP8、
DUSP14、DUSP16、DUSP19、DUSP22 之 mRNA 表現情形,並以-actin 作為內 控制組。此實驗由本實驗之林君翰學長完成。
附錄四、探查 EB 病毒基因位於 B 細胞內 DUSPs mRNA 表現之影響
於六孔細胞培養盤中放置 1x106/ml 之 Akata 或 BJAB 細胞,以帶有 pSIN、
pSIN-LMP1、pSIN-LMP2A、pSIN-Zta 質體之慢病毒(MOI=1)感染 Akata 或 BJAB 細胞株,轉導 EB 病毒基因 LMP1、LMP2A、Zta,於感染五天後收取細胞萃取 RNA 進行 RT-PCR,分析 DUSP1、DUSP2、DUSP6、DUSP8、LMP1、LMP2A、
Zta mRNA 表現情形。並以-actin 作為內控制組。此實驗由本實驗室林君翰學長 完成。
附錄五、
探查 EB 病毒基因位於 B 細胞內 DUSPs mRNA 表現之影響於 六 孔 細 胞 培 養 盤 中 放 置 1x106/ml 之 Akata 或 BJAB 細 胞 , 利 用 帶 有 pCMV-neo.Bam 、 pCMV-neo.Bam-EBNA2 、 pCDNA3.1 、 pCDNA3.1-EBNA1 、 pCDNA3.1-EBNA3C 以電脈衝穿孔法(electroporation) 送入 Akata 或 BJAB 細胞株,
轉導 EB 病毒基因 EBNA1、EBNA2、EBNA3C,以 20%FBS/RPMI 培養液培養 48 小時後,於 EBNA1 組別加入含有 200ug/ml hygromycin 之 10%FBS/RPMI 培 養液;於 EBNA2、EBNA3C 組別加入含有 500ug/ml G418 之 10%FBS/RPMI 培 養液進行篩選。篩選 48 小時候收取細胞萃取 RNA 進行 RT-PCR,分析 DUSP1、
DUSP2、DUSP6、DUSP8、EBNA1、EBNA2、EBNA3C mRNA 表現情形。並以
-actin 作為內控制組。本實驗之 cDNA 來自於陳奐勻學姊。
附錄六、pCMV.Tag2B-DUSP8 表現質體
人類 DUSP8 基因位於人類基因體第十一對染色體 GRCh37.p5 (NCBI RefSeq:
NC_000011.9)之 1575281 至 1593150 核苷酸序列。pCMV.Tag2B-DUSP8 為以 CMV 啟動子表現 N 端帶有 flag 標籤之人類 DUSP8 基因的表現質體。