• 沒有找到結果。

Colo 205 細胞培養於 RPMI-1640 培養基中(含 10% fetal bovine serum、100 units/mL penicillin、100 µg/mL streptomycin、2 mM L-glutamine),置於 37 ℃、

5% CO2的培養箱中培養,並控制細胞的數目,使其細胞密度維持在 2-5×105 cells/mL。

二. 血球計數器評估存活細胞數

計數 Colo 205 細胞,接種於 12 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時分別為 2mL,72 小時為 3mL,每 well 細胞總 數為 1.5×105 cells,培養 24 小時使貼壁後,分別給不同濃度藥物,加等藥物體 積的 DMSO 為 control 組,分別持續和藥物培養 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時、72 小時後,收集全部細胞,trypsin 使細胞游離瓶底,1X PBS 清洗 2 次 後,加入 500 µL 的等量 1X PBS,每個給藥濃度取 50 mL 細胞懸浮液與 50 mL trypan blue ( 0.4% w/v trypan blue)等體積混合均勻於 1.5 mL 小離心管中(每個濃 度取 3 次)。取少許混合液﹙約 10 mL﹚自血球計數盤 chamber 上方凹槽加入,

蓋上蓋玻片,於 100 倍倒立顯微鏡下觀察。計數四個大方格之細胞總數,再除 4,乘以稀釋倍數,最後乘以 104,即為每 mL 中細胞懸浮液之細胞數。

三. 利用流式細胞計數儀計數存活的細胞數

計數 Colo 205 細胞,接種於 12 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時為 2 mL,72 小時為 3 mL,每 well 細胞總數 為 1.5×105 cells,於 37 ℃、5% CO2的培養箱(incubator)進行培養 24 小時,

使貼壁後,分別給不同濃度藥物,加等藥物體積的 DMSO 為 control 組,分別 持續和藥物培養 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時、72 小時後,收集全部細

胞,加 2 drops trypsin 使細胞游離瓶底,離心 1500 轉 5 分鐘,1X PBS 清洗 2 次後,再離心 1500 轉 5 分鐘,倒掉上清液,加 400 µL propidium iodine( 0.004 mg/mL PBS )上流式細胞計數儀,計算存活細胞數,流式細胞計數儀條件為固定 低流速(35 µL/min),抓取 20 秒(escape time),計錄 R2 events 當作相對的存活 細胞數,不同濃度之間比較差異。計錄 R2 gated percentage 當作細胞存活率指 標,不同濃度之間比較差異。並且以 0 時間(給藥同時收細胞上流式細胞計數儀 計數存活率)的存活細胞數目為初始給藥點細胞基準線,如果給藥後細胞存活數 目低於初始給藥點細胞基準線,表示藥物對於細胞具有毒殺作用,若給藥後細 胞存活數目介於控制組的細胞數,表示藥物具有抑制細胞增殖作用。

四. 利用流式細胞計數儀評估細胞週期及 sub-G

1

的影響

計數 Colo 205 細胞,接種於 12 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時為 2 mL,72 小時為 3 mL,每 well 細胞總數 為 1.5×105 cells,於 37 ℃、5% CO2的培養箱(incubator)進行培養 24 小時,

使貼壁後,分別給不同濃度藥物,加等藥物體積的 DMSO 為 control 組,分別 持續和藥物培養 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時、72 小時後,收集全部細 胞,加 2 drops trypsin 使細胞游離瓶底,離心 1500 轉 5 分鐘,1X PBS 清洗 2 次後,再離心 1500 轉 5 分鐘,倒掉上清液,將細胞完全打散後,置於震盪器上 以 shake 3 速度震盪,4 ℃的 70% 乙醇一滴一滴緩慢滴入,進行細胞固定,固 定後置於-20 ℃冰箱隔夜存放。隔天,將樣品取出後離心 1500 轉 5 分鐘,以除 去乙醇,將細胞完全打散,加入 2 mL 的 1X PBS ( 1X phosphate buffer saline (PBS):NaCl 8.0 g、KCl 0.2 g、Na2HPO4 1.44 g、KH2PO4 0.2 g 加二次水到總體 積 1000 mL。pH=7.4 ) 緩衝液清洗 1 次後將細胞完全打散。最後在每個試管中 加入 300

µ

L 的 PI stain 染劑( 0.002 % propidium iodide 5 mL,5 % triton 5 mL,2 mg/mL RNase A 1.25 mL,1X PBS 13.75 mL )其量可視細胞數目增減,避光反應 30 分鐘。最後以流式細胞計數儀進行樣品分析,一秒細胞數不超過 300 顆細胞,

每個數據收集 12000 顆細胞,數據以 Modfit LT軟體進行處理分析。記錄 G1, S,G2/M phase,sub-G1比率。

五. 利用倒立式位像差顯微鏡評估細胞形態

計數 Colo 205 細胞,接種於 12 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 2 mL,每 well 細胞總數為 1.5×105 cells,於 37 ℃、5 % CO2的培養箱( incubator)

進行培養 24 小時,使貼壁後,分別給不同濃度藥物,加等藥物體積的 DMSO 為 control 組,分別持續和藥物培養 6 小時、12 小時、24 小時後於 200 倍倒立 式位像差顯微鏡下照相。

六. DNA 的萃取(DNA extraction)

計數 Colo 205 細胞,接種於 6 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 6 小時、12 小時、24 小時、48 小時為 3 mL,每 well 細胞總數為 2×106 cells,於 37℃、5% CO2的培養箱(incubator)進行培養 24 小時,使貼壁後,分別給不 同濃度藥物,加等藥物體積的 DMSO 為 control 組,分別持續和藥物培養 6 小 時、12 小時、24 小時、48 小時後,無菌吸管吸出培養盤中細胞懸浮液至 15 mL 離心管收集全部細胞,無菌的 1X PBS 清洗 1 次後,加 3 滴 trypsin 使細胞游 離瓶底,離心 1500 轉 5 分鐘,1X PBS 清洗 2 次後,再離心 1500 轉 5 分鐘,

倒掉上清液,將細胞完全打散後,加 1X PBS 使細胞懸浮液為 200 µL,加 20 µL QIGEN Protease (or proteinase K) 到離心管底部,加 200 µL buffer AL 到 sample 內,混合均勻震盪 15 秒,置於 56 ℃ 水浴鍋 10 分鐘,離心 1500 轉 5 分鐘,

加 200 µL absolute ethanol (無水) 震盪 15 秒,然後離心 1500 轉 10 秒,取混 合液 600 µL 進入 the QIAamp spin column 內,於 10000 轉離心 1 分鐘,更 換乾淨的 2 mL collection tube,加 500 µl buffer AW1 solution,於 10000 轉離心 1 分鐘,更換乾淨的 2 mL collection tube,加 500 µl Buffer AW 2,於 13000 轉離 心 3 分鐘(離心到乾),更換 QIAamp spin column 成新的 2 mL collection tube,

於 13000 轉離心 1 分鐘,更換 QIAamp spin column 成新的 2 mL 無菌的 collection tube,加 50 µL buffer AE 置於室溫 1 分鐘,10000 轉離心 1 分鐘,收 集濾液即為 DNA。

七. Total RNA 分離抽取 ( Isolation of total RNA )

計數 Colo 205 細胞,接種於 6 well 培養盤中,每 well 含培養液總體積 4 小時、8 小時、12 小時、24 小時為 3 mL,每 well 細胞總數為 2×106 cells,於 37 ℃、5% CO2的培養箱(incubator)進行培養 24 小時,使貼壁後,分別給不 同濃度藥物,加等體積藥物的 DMSO 為 control 組,分別持續和藥物培養 4 小 時、8 小時、12 小時、24 小時後,無菌吸管吸出培養盤中細胞懸浮液至 15 mL 離心管收集全部細胞,滅菌 PBS 清洗 1 次後,加 3 drops trypsin 使細胞游離瓶 底,離心 1500 轉 5 分鐘,滅菌 PBS 清洗 2 次後,再離心 1500 轉 5 分鐘,倒掉 上清液,不打散細胞,用 pipet 吸掉多餘的 PBS,吸乾後打散細胞,加 600 µL buffer RLT 上下混合均勻呈澄清黏稠均質狀態 (每 1 mL buffer RLT 預先加 10 µL 2-mecaptoethanol ),加 600 µL 70% ethanol 固定,使用 pipet 混合均勻,total 700 µL 吸到 RNeazy mini QIAshredder column,然後離心 13000 轉 15 秒,倒掉收集 管濾液,剩餘 600 µL 再吸到 RNeazy mini QIAshredder column,離心 13000 轉 15 秒,倒掉收集管濾液,加 700 µL Buffer RW1,離心 13000 轉 15 秒,倒掉 下層濾液,加 500 µL buffer RPE,離心 13000 轉 15 秒,倒掉下層濾液,加 500 µL buffer RPE,離心 13000 轉 2 分鐘,上層濾膜管柱移到另一新 1.5 mL 離心管,

加 40 µL RNase-free water,靜置 1 分鐘,離心 13000 轉 1 分鐘,得到 total RNA 40 µL。

取已滅菌 1.5 mL eppendorff tube,先取 198 µL DEPC-H2O,再取 2 µL sample,上下輕柔混合均勻,置冰上,於 285 nm 測 OD value。OD value=1 相當 RNA=40 ng/µL,sample RNA 濃度=O.D. value × 100( 稀釋 100 倍 ) × 40 ng/µL,每個 sample 取 3000 ng RNA 量做

Reverse Transcription

八. First-strand cDNA synthesis (Reverse Transcription)

取 0.5 mL sterilized-eppendorf tube 置於冰上,加入適量滅菌過的二次水,

二次水量由 10-(3000/RNA 濃度) µL,sample RNA 量 (µL)= 3000/RNA 濃度,加 dNTP mix 1 µL、oligo dT 1 µL,輕揉的上下混合完全,置於 PCR 機器 well 上,

加熱 65℃ 5mins,取出離心 2000 rpm×4 秒,加入 5× first-strand buffer 4 µL、0.1 M DDT 2 µL、RNAase out recombinant ribonuclease inhibitor(可用二次水代替)

1 µL,輕柔混合,total 19 µL 加熱 42℃ 2mins,加入 superscript Ⅱ transferase 1 µL,加熱 42℃ 50 mins 接著加熱 70℃ 15 mins,得 cDNA first strand 4℃冰箱保 存。

九. Polymerase Chain Reaction (PCR)

取滅菌過的 0.5 mL eppendorf tube 置於冰上,加已滅菌的二次水 38.1 µL、10×

PCR buffer 5 µL、50 mM MgCl2 1.5 µL、10 mM dNTP mixture 1 µL、10 mM amplifica- tion primer 3’end 1 µL、10 mM amplification primer 5’end 1µL,加 2 µL cDNA sample,

輕柔均勻混合,離心 2000 轉 1 分鐘,加 Tag DNA polymerase 0.4 µL(加 Tag polymerase 時直接加到底部,不必混合),總量 50 µL 離心 2000 轉 15 秒,跑 PCR。PCR 條 件為為預熱 95℃ 5 分鐘, denaturation 溫度 95℃ 1 分鐘, annealing 溫度 55℃ 1 分 鐘, extension 溫度 72℃ 1 分鐘 35-40 cycles,最後以 72℃ 10 分鐘退火。

Agarose Gel Electrophoresis

取 25 µL PCR 產物,加入 5 µL 的6X loading buffer 混合均勻,總量30 µL 注入 2 % agarose gel (溶於0.5X TBE buffer PH=7.4) 電壓設定50 voltage跑60分 鐘,取出 agarose 以 5 µg/mL ethidium bromide 染色 30 分鐘。

十. 蛋白質之定性及定量分析

相關文件