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我們在個案1、2、3、5、7、8的KAL-1基因之exon 11與exon 12,均發現具有 兩個共同的點突變,exon 11(c.1600G>A)與exon 12(c.1833C>T)。其中exon 11 的c.1600突變點位置造成胺基酸的改變為Val534Ile。另一點位於exon 12的c.1833則 並未改變原本該位置上之胺基酸,Isoleucine(Ile,異白胺酸),乃是屬於silent mutation的synonymous mutation。參見表3。

表 3 個案 1~8 在 KAL-1 基因上 14 exons 的突變情形

突變點位置於cDNA位置的計數,參見附錄表8。

比較特殊的是個案3因為是女性,在exon 11(c.1600)的突變屬兩不同X染色 體對偶基因上各為鹼基G或A的Heterozygosity現象,參見圖13、14。c.1600與c.1833 此兩點即SNP rs808119、rs809446(參見表6)。

圖 13 個案 3 在 exon 11 上突變點(c.1600)之正股序列

圖 14 個案 3 在 exon 11 上突變點(c.1600)之反股序列

個案4則14個exon均未找到任何一突變的序列。

個案5除具有前述exon 11(c.1600G>A)與exon 12(c.1833C>T)此兩突變點外,

還有exon 14上的四個突變點,c.1997A>T(Lys666Met)、c.2003G>A(Arg668His),

以及在3’端超過exon 14的第59個鹼基位置的中止密碼(termination code),往下游

(downstream)方向19個鹼基位置,即第78個鹼基位置上亦有突變點*19G>T,與 第80個鹼基位置上(往下游(downstream)方向21個鹼基位置)亦有突變點*21G>A,

個案5之exon 14上的定序圖譜,詳見圖15。預測因突變而改變胺基酸之對照情形,

參見表4。

表 4 個案 5 的突變點位置與造成胺基酸改變的情形

Exon Nucleotide mutation Predicted amino-acid change

11 c.1600G>A Val534Ile

12 c.1833C>T Ile611 synonymous

14 c.1997A>T Lys666Met

c.2003G>A Arg668His

*19G>T at 78th nucleotide position of exon14, already beyond the 59th nucleotide(termination code).

*21G>A at 80th nucleotide position of exon14, already beyond the 59th nucleotide(termination code).

圖 15 個案 5 其 KAL-1 基因的 exon 14 之定序圖譜

15 個案5KAL-1基因的exon 14之定序圖譜

個案6的KAL-1基因突變位置主要發生在從intron 10與exon 11交界處開始,至exon 14共37處突變,其intron 10與exon 11之突變點位置共有10處,參見其定序圖譜,圖 16。

圖 16 個案 6 其 KAL-1 基因的 exon 11 之正股定序圖譜

16 個案6KAL-1基因的exon 11之正股定序圖譜

個案6的exon 12則共有突變點5處,參見其exon 12定序圖譜,圖17。

圖 17 個案 6 其 KAL-1 基因的 exon 12 之正股定序圖譜

17 個案6KAL-1基因的exon 12之正股定序圖譜

個案6的exon 13(包含intron 12與exon 13交界處)則共有突變點18處,參見其exon 13 定序圖18、19。(g.IVS12-23G>C不在圖18此正股定序圖範圍內;包含於反股定序圖中)

圖 18 個案 6 其 KAL-1 基因的 exon 13 之正股定序圖譜

18 個案6KAL-1基因的exon 13之正股定序圖譜

圖 19 個案 6 其 KAL-1 基因的 exon 13 之股定序圖譜

19個案6KAL-1基因的exon 13之反股定序圖譜

個案6的exon 14(含3’端UTR區域)則共有突變點4處,參見其exon 14定序圖譜,圖20。

圖 20 個案 6 其 KAL-1 基因的 exon 14 之正股定序圖譜

20 個案6KAL-1基因的exon 14之正股定序圖譜

而個案6其突變點預測可能造成胺基酸之改變,參見表5。

表 5 個案 6 KAL-1 基因的所有 exon 之突變情形

Exon Nucleotide mutation Predicted amino-acid change Intron10 g.IVS10-30G>C -

g.IVS10-1G>C -

11 c.1454A>G Asn485Ser

c.1458C>T Tyr486 synonymous

c.1464T>G Ile488Met

c.1471G>C Asp491His

c.1474C>G Leu492Val

c.1516C>T Arg506Trp

c.1525delA Frame shift

c.1587G>C Lys529Asn

12 c.1678G>T Val560Phe

c.1694T>C Ile565Thr

c.1699G>A Gly567Ser

c.1708T>A Ser570Thr

c.1825T>C Phe609Pro

Intron12 g.IVS12-23G>C -

g.IVS12-16T>C -

g.IVS12-13G>A -

13 c.1848T>C His616 synonymous

c.1856T>C Leu619Pro

c.1871T>G Leu624Arg

c.1890C>T Tyr630 synonymous

c.1891C>T Arg631X

c.1908G>A Val636 synonymous

c.1932G>T Pro644 synonymous

c.1939A>C Ile647Leu

Exon Nucleotide mutation Predicted amino-acid change

c.1946C>T Thr649Ile

c.1947G>A Thr649Ile

c.1952G>A Arg651Gln

c.1955C>T Thr652Met

c.1957delC Pro653Trp

c.1958C>T Glu654Lys

c.1960_1961insA Leu655 synonymous

14 c.1997A>T Lys666Met

c.2003G>A Arg668His

*19G>T

at 78th nucleotide position of exon14, already beyond the 59th nucleotide(termination code).

*21G>A

at 80th nucleotide position of exon14, already beyond the 59th nucleotide(termination code).

此外,個案6的PCR反應產物,一直未見exon 10的band(見圖21、22與23),

由兩位有經驗的不同實驗操作者,總共PCR反應4次,有三次絲毫不產生exon 10的 band,僅有一次有微弱的band,而且僅是一點點少許螢光,很可能是PCR反應擴增 到Y染色體上的pseudogene KALP的同源homologous exon。很可能個案6在exon 10 就整個丟失(deletion)了。

圖 21 個案 6 在 KAL-1 基因上 14 個 exon 的 PCR 反應產物於 2% agarose 電泳圖

圖 22 個案 5 與 6 在 KAL-1 基因 exon 10 的 PCR 產物電泳圖

圖 23 個案 5 與 6 在 KAL-1 基因 exon 10 的 PCR 產物電泳圖(repeat 重作第二次)

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