一、廣泛抗藥性鮑氏不動桿菌簡介:
Acinetobacter baumannii (鮑氏不動桿菌,簡稱 A. baumannii)的抗藥性問題為
近年來在醫療照護相關感染防治上日益受到重視的主題。1991 年,美國首度出現 了Carbapenem-resistant A. baumannii (CRAB),自始,A. baumannii 的抗藥性問題開 始受到重視及研究。在國內則是在1998 年 5 月,臺大醫院首次於腫瘤科病房一位 白血病患者血液培養中分離出CRAB,同時亦發現此菌幾乎對所有的抗生素產生 抗藥性,當時稱之pandrug-resistant A. baumannii (PDRAB)。且在短短的 2 年間,
PDRAB 的比率由 0%驟升為 6.5%,其蔓延之迅速令人驚訝。此外,依據台灣 TNIS 統計資料顯示:醫學中心及區域醫院加護病房CRAB 的比率從 2003 年不到 20%,
逐年上升至2010 年第三季已達約 70%,可見抗藥性 A. baumannii 在台灣醫院內的 散佈問題已經十分廣泛且嚴重。於2000 年及 2002 年所發表、針對紐約布魯克林 區的研究中發現,imipenem-resistant A. baumannii(IMRAB)在所有臨床分離菌種中 高達53%,PDRAB 也高居 12%。由於在抗生素感受性測試中並無法全面將所有抗 生素納入檢測,所以近年來已將除了1~2 種抗生素以外都具抗藥性的 A. baumannii 改稱為extensively drug-resisitant A. baumannii(XDRAB)。由於人類面臨越來越嚴重 的抗藥性問題,也使得研究人員投入許多心血進行研究。而在微生物抗藥性的研 究過程中,約於1980 年代發現 Integron 的存在,此外國外有關醫療照護相關感染 的研究,也指向這類病人抗藥性細菌的散布可能跟Integron 有關。
shine 二、文獻回顧:
A. baumannii為存在於環境中革蘭氏陰性球桿菌,亦是人類皮膚上的正常菌叢
之一,由於可以在環境和醫護人員手部存活很長一段時間,近幾年已成為院內感 染的重要病原菌[1-4],由此菌所引起的常見院內感染包括呼吸器所致之呼吸道感 染、血流感染及泌尿道感染。此外,它對於燒傷的病人、具有免疫抑制疾病的病 人以及重病的患者而言是引起呼吸器相關感染肺炎、菌血症以及敗血症的主要原 因[5]。
在1970 年代早期認為此菌不具有致病性,且對gentamicin及cephalosporins均 呈敏感性,但1980 年中期發現A. baumannii開始對許多的藥物產生抗藥性,包括 aminoglycosides、cephalosporins、quinolones、imipenem等[6]。近十年內亦發現多 重抗藥性A. baumannii經常引起院內感染群突發,且多數發生於加護單位[7-9],1991 年於美國發現的CRAB,引起大家關切抗藥性問題[10]。也因其抗藥性越來越強,
多重抗藥性A. baumannii (Multidrug-resistant A. baumannii, MDRAB)已成最難以控 制及治療的革蘭氏陰性菌之一,並已經在世界各地被提出來討論[4]。Sunen 採用Matched univariate analysis分析發現:受MDRAB感染的病人比起感染抗生素敏 感性A. baumannii的病人或未感染的病人而言,具有較長的平均住院天數(27.5 天) 和ICU住院天數(13.3 天)。在住院死亡率方面,MDRAB感染的病人為 26%,抗生 素敏感性A. baumannii的病人為 18%,未受感染的病人則為 11%;且經過統計,感 染MDRAB與未感染的病人之院內死亡率具有統計上的差異[4]。由於受MDRAB感 染的病人會增加住院天數,因此必須執行適當的感染控制措施,以避免其在醫院 中傳播,甚至造成群突發。1998 年 5 月國內的臺大醫院於腫瘤科病房一位白血病 患者血液培養首次分離出CRAB,同時亦發現此菌幾乎對所有的抗生素產生抗藥 性,包括所有的cephalosporins、aztreonam、aminoglycosides、及quinolones,故稱 之PDRAB[11],這是國內PDRAB的首例。目前國內的A baumannii之抗藥性已相當 嚴重,就臺大醫院2000 年的統計中發現,在短短的 2 年間,PDRAB的比率就由
藥性
性
據文獻定義[14],多重抗藥性 (multidrug-resistant, MDR)乃指對三種類型以 上的
的抗藥性問題,也使得研究人員投入許多心血進行 0%驟升為 6.5%[11];於 2000 年發表的一份針對紐約布魯克林區的研究[12]中發現,
IMRAB在所有臨床分離菌中高達 53%,PDRAB也高居 12%,並確定了多重性抗藥 性A. baumannii已經造成該地區的流行。澳洲首次因抗藥性A. baumannii造成爆發院 內感染的事件則發生在1996 年;所發現的A. baumannii已經對gentamicin,
cephalosporins, 和ticarcillin具有抗藥性,其中有些甚至也對quinolones具有抗 [13] 。在 2002~2004 年間,由 48 間歐洲醫院所進行的研究報告industry-supported surveillance report顯示:分離出的A. baumannii菌株中只有 73.1%對meropenem具有 感受性(susceptibility),69.8%對imipenem具有感受性,但對其它抗生素的感受性則 非常的低,ceftazidime 為 32.4%、ciprofloxacin為 34.0%,gentamicin則為 47.6%[13],
而相信此數據到了2011 年會降得更低。在拉丁美洲的數據則指出:對於meropenem, imipenem, ceftazidime, piperacillin-tazobactam, ciprofloxacin, 和gentamicin的抗藥 比例則是全球最高的[13]。由以上眾多資料,可見A. baumannii的抗藥性已經成為 世界性的問題[9, 12, 13],而A. baumannii於全球急速地發展出對於所有β-lactams 類抗生素(包含carbapenems)的抗藥性也表示了此細菌對於選擇性環境壓力的改變 將先前被分類為PDR的菌株改稱為XDR (extensively drug-resisitance),指除了 1~2 種抗生素以外都具抗藥性者。因此近年來將具多重抗藥性的A. baumannii改稱為 XDRAB而取代PDRAB一詞。extreme drug-resistant (XXDR)則是對最新一代開發的 藥物就已發展出抗藥性者稱之。若是XDRGNB則表示該菌也對colistin和tigecycline 具有抗藥性[14]。
由於人類面臨越來越嚴重
這方
它會
-24 的結晶
也沒有明 MIC。
卡匣中的open reading frames裡的基因整合平台,一旦經 面的研究。在A. baumannii對β-lactam類藥物產生抗藥性的最主要機制為β -lactamases將藥物進行酵素性分解(enzymatic degradation)。而且這個酵素分解機制 相當複雜,它具有多重機制且通常都會一起作用以產生具有相同功能及表現 (phenotype) [15-17]。blaOXA-23 基因是一個存在於質體的基因且可以轉移,
產生具有carbapenemase活性的OXA23 酵素,在英國、愛爾蘭、歐洲、韓國、新加 坡、中國的研究都發現抗藥性A. baumannii帶有blaOXA-23,也因此它被認為與A.
baumannii對carbapenem產生的抗藥性有關[18-25]。另兩種具有carbapenemase活性
的OXA-type gene clusters則是blaOXA-24-like 和blaOXA-58-like carbapenemase基 因。其中,blaOXA-24-like 可表現OXA-24, -25, -26, 和-40[13]。而OXA
狀結構則被認為可以提供對此類型的carbapenemases提供未來治療藥物的發展 [26]。blaOXA-58 是最近於 2005 年新發現的一種β-lactamase,它則和blaOXA-23 較為相似,也常存在於質體[27],所以也較容易造成廣泛分布[23, 28]。
blaOXA-51-like 基因 (產生OXA-51, -64, -65, -66, -68, -69,-70, -71, -78, -79, -80, 和
-82)較獨特之處則是它為自然存在於A. baumannii的chromosome中[25]。它的功能和 ISAba 1 element有相關[29],當不存在ISAba 1 element時,一些轉殖的研究結果顯 示A. baumannii對於carbapenem 的感受性很低,即便在overexpressed multidrug efflux pump (AdeABC)的情況下,A. baumannii對於carbapenem 的感受性 顯改變[30]。而比起blaOXA-58,blaOXA-23 的存在會使imipenem產生較高的 含有blaOXA-23 和blaOXA-58 的質體,由臨床分離出的細菌質體會比實驗室經由 人工重組製成的質體對carbapenems產生較高的抗藥性,這可能是因為臨床分離出 的質體會帶有IS elements (insertion sequence element)的關係[31]。IS elements的重要 性為轉譯出轉位子酶(transposase),因此也具有移動性。此外,它也含有啟動子 (promoter)的區域,因此可以overexpression 下游的抗藥性基因[13]。
另外,在研究微生物抗藥性的過程中,約在1980 年代發現Integron的存在;
它是鑲埋在的外生性基因
過正 Kraniotaki 等發表,利用Integron的特性分析多重抗藥性的A. baumannii (MDRAB) 群突發時,發現Integron與該菌所造成的院內感染有相關[33],該篇文獻表示:於 希臘一家醫院內之加護病房(ICU)爆發了為期 3 個月的MDR A. baumannii之群突 發,有31 個病人數。在調查過程中,除病人外,另收集ICU環境表面和工作人員 手上的細菌來辨識可能的污染時,經由分子分型技術(molecular typing)在環境中找 到帶有Class 1 Integrons的MDR A. baumannii,其中並分別帶有 3.1kb、2.5kb 和 2.2kb大小之基因卡匣(gene cassettes),其 3.1kb大小的Integron更是首度在A.
baumannii中被發現帶有五個抗藥性基因卡匣。關於Integron與抗生素抗藥性與院內
感染(又稱:醫療照護相關感染)的關係之探討,除Eleni Kraniotaki的研究認為 Integron與A. baumannii院內感染具有關聯的文章以外,尚有印度的Abhishek Gaur 與Laura Rojas[34, 35]等。Abhishek Gaur的研究乃利用聚合酶鏈鎖反應(polymerase chain reaction, PCR)檢測 86 株A. baumannii的 integrase gene,發現 43.02% (37/86) 帶有Integrons,其中 81.1% 是Class1 Integrons。而 2005 年時A. baumannii含Integron 的比例則上升到63.6%;因此Abhishek Gaur認為Integron與鮑式不動桿菌的抗生素 抗藥性及院內感染也有關聯[34]。此外,在國內也有Hung和Chiu等人的研究都指 出:Integron和A. baumannii的多重抗藥性有關[36, 37]。2010 年發表,於台灣北部 某區域教學醫院[38]所執行的研究則發現,在所分離的 134 株carbapenem
susceptibility A. baumannii菌株中,54.5%(73 株)帶有class I Integrons,並且這 73 株 只攜帶有2 種基因卡匣,分別是aacA4-catB8-aadA1 和
aacC1-orfP-orfP-orfQ-aadA1。且在susceptibility data中顯示出,這些帶有Integrons 的菌株除了ampicillan/sulbactam, imipenem以外,對其他所有
15 萬台幣),因A. baumannii菌所造成的感染人數則分別為 18 人(8%)與 16 人(6%
三、研究目的
研究主要目的在偵測從實習單位臨床病人所收集XDRAB 院內感染菌株的 Integron 抗藥性基因及 OXA typing 的分布情形,以了解其所存在水解酵素的種類,
然後可得知其存在的抗藥性機制為何;並進而將收集到的菌株透過脈衝電泳分型
(Pulsed-Field Gel Electr )的方法分析 菌種之間的 病例組:
具有抗性。因此,Integron可能對於和aminoglycosides 及chloramphenicol 抗藥性基 因的水平轉移有關,且它也是A. baumannii菌是否具有多重抗藥性的一個指標[38]。
台灣發生醫療照護相關感染時的額外住院天數在醫學中心為20.1 天,區域醫
ophoresis Analysis, PFGE XDRAB 關係,以了解院內XDRAB 菌株的分佈與流行情形,並以病例對照方式(
=1 4 ) XDRAB
XDRAB 院內感染時,在相同時間、相同病房選取和病例年齡相差 XDRAB 院內感染的病人。本研究從 2008 11 2010 12 25 位符合 XDRAB 院內感染病例與 100
、 conditional logistic regression XDRAB
四、實習單位特色與簡介
三軍總醫院成立於民國三十五年,其前身為台灣陸軍八○一總醫院,組織由台 灣陸軍醫院,聯勤第五總醫院,陸海空軍第一總醫院,陸軍第一總醫院依序遞嬗
改組為「三軍總醫院」,由小南門遷建於水源地營區
(今台北市汀州路三段八號),為我國之軍醫醫療開新紀元。現今編制上屬國防 醫學院之教學醫院,負有臨床醫療、教學與研究之責,醫療服務對象為現役軍人、
健保民眾及一般民眾,為衛生署評定之醫學中心級教學醫院。為因應醫療環境快 速變遷與尋求軍醫教育及醫療作業整體之改進與發展,特將國防醫學院及三軍總 醫院,一併考量運用臺北市內湖區實施整建,稱為「國防醫學中心」。工程基地 面積約四十三公頃,自七十九年一月開工,八十九年四月完工,並於同年十一月 完成搬遷醫療作業移轉。
醫學、海底醫學及核輻射傷害防治等相關醫療作業,納
醫學、海底醫學及核輻射傷害防治等相關醫療作業,納