第三章 研究結果
第二節 血管內皮生長因子基因之多型性與 AMD 患者及對照組個體之關連性 19
subjects)
VEGF 四個單核酸多型性( single nucleotide polymorphisms, SNPs ),promoter -2578 C/A;-1498 T/C、5'-UTR -634 C/G、3'-UTR 936 C/T 進行分析,圖十一呈現出三 個VEGF SNP 基因型的電泳分析圖,我們發現-2578 C/A,具有 A allele 的個體,多 18 個核苷酸嵌入,而 CC homozygous 的個體則無此 18 個核苷酸嵌入,與之前的研究 報告相同52。AMD 患者與對照組個體間,genotype 與 allele 的機率分佈呈現於表三及 表四,-2578 C/A、-1498 T/C、-634 C/G、936 C/T genotype 在 AMD 患者與對照組個 體間並無顯著的差異(-2578 C/A, p=0.189;-1498 T/C, p=0.926;-634 C/G, p=0.345;936 C/T, p=0.137),但 936 C/T 在 dominant genetic analysis (CC vs CT+TT)中,發現AMD 患者有攜帶T allele 的傾向(p=0.072;OR=0.561;95% CI=0.299~1.055),而在 allele 分析中,-2578 C/A、-1498 T/C、-634 C/G 在 AMD 患者與對照組個體中並無顯著的差 異(-2578 C/A, p=0.104;-1498 T/C, p=0.574;-634 C/G, p=0.367),936 C/T 在 AMD 患 者與對照組個體間具有顯著的差異,AMD 患者比較於對照組個體,有較多的比例帶 有VEGF 936 T allele (22.3% vs 14.0%,OR=1.761,95% CI=1.02~3.04,p=0.038)。
A. promoter -2578 C/A B.5'-UTR -634 C/G
C. 3'-UTR 936 C/T
圖十一. VEGF polymorphisms.(A) promoter -2578 C/A:CC genotype 產生一個 439 bp 片段,AA genotype 產生 231 bp 及 208 bp 兩個片段,CA genotype 產生 439 bp,
231 bp 及 208 bp 三個片段,A allele 的個體,具有多 18 個核苷酸嵌入。(B) 5'-UTR -634 C/G:CC genotype 產生一個 304 bp 片段,GG genotype 產生 193 bp 及111 bp 兩個片段,CG genotype 產生 304 bp,193 bp 及 111 bp 三個片段。(C) 3'-UTR 936 C/T:CC genotype 產生一個 208 bp 片段,TT genotype 產生 122 bp 及86 bp 兩個片段,CT genotype 產生 208 bp,122 bp 及 86 bp 三個片段。
CC CA CA CA CC CC AA CC
100 400
CC CG CG CG CG CG GG
CC CT TT CC CC CT CC
表三. AMD 患者與對照組個體間 VEGF SNP genotypes 的機率分佈
VEGF-2578 AMD(n=94) Control(n=90) p value OR (95% CI) CC 47(50.0%) 57(63.3%) CC vs AA:0.66 0.550(0.088-3.428) CA 44(46.8%) 31(34.4%) CA vs AA:1.0 0.946(0.149-6.002) AA 3(3.2%) 2(2.2%) AA vs CC,CA:0.189
VEGF -1498 AMD(n=86) Control(n=89) p value OR (95% CI) TT 53(59.6%) 58(62.4%) TT vs CC:0.882 0.914(0.278-3.008) TC 30(33.7%) 29(31.2%) TC vs CC:0.957 1.034(0.299-3.580) CC 6(6.7%) 2(6.5%) CC vs TT,TC:0.926
VEGF -634 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) CC 9(9.5%) 15(16.7%) CC vs GG:0.21 0.510(0.179-1.456) CG 66(69.5%) 58(64.4%) CG vs GG:0.93 0.967(0.463-2.020) GG 20(21.0%) 17(18.9%) GG vs CC,CG:0.345
VEGF 936 AMD(n=94) Control(n=89) p value OR (95% CI) CC 58(61.7%) 66(74.2%) CC vs TT:0.16 0.293(0.057-1.508) CT 30(31.9%) 21(23.6%) CT vs TT:0.47 0.476(0.087-2.593) TT 6(6.4%) 2(2.2%) GG vs CC,CG:0.137
VEGF -2578 C/A、-1498 T/C、-634 C/G、936 C/T SNP 進行 haplotype 的分析,
在我們研究的族群中,以CTCC haplotype 佔最多數,其次為 CTGC,ACGC(表五),
在 AMD 患者與對照組個體間相比較並無顯著的差異(表六),然而 AMD 患者帶有較 高比率 ATGT haplotype 的傾向(0.6% vs 3.7%,OR=0.146,95% CI=0.018~1.199,
p=0.068),但進行 haplotypes/genotypes 的分析,我們發現 AMD 患者與對照組個體間
有顯著的差異,對照組個體有較高比率帶有CTCC/CTGC genotype (33.3% vs 20%,
OR=2.0,95% CI=1.027~3.897,p=0.040)(表七)。
表五.VEGF -2578,-1498,-634,936 polymorphisms,所組成可能的 haplotypes 結構 及在台灣族群的比例(n=185)
Haplotype -2578 -1498 -634 +936 Frequencies
CTCC 0.331422 CTCT 0.052040 CTGC 0.316102 CTGT 0.065679 CCCC 0.001042 CCCT 0.001975 CCGC 0.000910 CCGT 0.001086 ATCC 0.013856 ATCT 0.001980 ATGC 0.008022 ATGT 0.009818 ACCC 0.054175 ACCT 0.005671 ACGC 0.096077 ACGT 0.040144
表六. AMD 患者與對照組個體間,VEGF -2578,-1498,-634,936 polymorphisms,
haplotypes 的分佈 -2578/-1498/-634/+963
Haplotypes
Control n=180
AMD n=190
p value Odds ratio (95% CI) A C C C 1(0.6%) 1(0.5%) 1.0 1.056(0.066-17.008) A C G C 22(12.2%) 23(12.1%) 0.973 1.011(0.542-1.886) A C G T 11(6.1%) 14(7.4%) 0.630 0.818(0.361-1.853) A T G T 1(0.6%) 7(3.7%) 0.068 0.146(0.018-1.199) C T C C 83(46.1%) 74(38.9%) 0.163 1.341(0.887-2.028) C T C T 4(2.2%) 6(3.2%) 0.751 0.697(0.193-2.512) C T G C 50(27.8%) 42(22.1%) 0.207 1.355(0.844-2.175) C T G T 8(4.4%) 16(8.4%) 0.121 0.506(0.211-1.213) A T C C 0(0.0%) 2(1.1%) 0.499 -
A T G C 0(0.0%) 4(2.1%) 0.124 -
C C G C 0(0.0%) 1(0.5%) 1.0 -
表七. AMD 患者與對照組個體間 VEGF -2578,-1498,-634,936 polymorphisms, CTCC / ACGC 13(14.4%) 14(14.7%) 0.955 0.977(0.432-2.211) CTCC / ACGT 6(6.7%) 7(7.4%) 0.852 0.898(0.290-2.782)
(Association of TNF-α gene polymorphisms with AMD patients and control subjects)
六個 TNF-α 單核酸多型性( single nucleotide polymorphisms, SNPs ),五個位於 promoter 區域 -1031 T/C,-863 C/A,-857 C/T,-308 G/A,-238 G/A,1 個位於 intron 區域489 G/A 進行分析,圖十二呈現出六個 TNF-α SNP 基因型的電泳分析圖,AMD 患者與對照組個體間,genotype 與 allele 的機率分佈呈現於表八及表九,-1031 T/C,
-863 C/A,-857 C/T,-308 G/A,-238 G/A,489 G/A genotype 在 AMD 患者與對照組
% vs 6.7%,p=0.026),但在 allele 分析中,AMD 患者與對照組個體間並無顯著的差異 (-1031 T/C, p=0.516;-863 C/A,p=0.163;-857 C/T,p=0.347;-308 G/A,p=0.716;
-238 G/A,p=1.0;489 G/A,p=0.322)。
A. TNF-α -1031 T/C B. TNF-α -863 C/A
C. TNF-α -857 C/T D. TNF-α -308 G/A
E. TNF-α -238 G/A F. TNF-α 489 G/A
圖十二. TNF-α polymorphisms.(A) -1031 T/C:TT genotype 產生一個 250 bp 片段,CC genotype 產生 194 bp 及 56 bp 兩個片段,TC genotype 產生 250 bp,194 bp 及 56 bp 三個片段。(B) -863 C/A:CC genotype 產生一個 126 bp 片段,AA genotype 產生101 bp 及 25 bp 兩個片段,CA genotype 產生 126 bp,101 bp 及 25 bp 三 個片段。(C) -857 C/T:TT genotype 產生一個 129 bp 片段,CC genotype 產生 107 bp 及 22 bp 兩個片段,TC genotype 產生 129 bp,107 bp 及 22 bp 三個片 段。(D) -308 G/A:AA genotype 產生一個 117 bp 片段,GG genotype 產生 97 bp 及20 bp 兩個片段,AG genotype 產生 117 bp,97 bp 及 20 bp 三個片段。(E) -238 G/A : AA genotype 產生一個 155 bp 片段,GG genotype 產生 130 bp 及 25 bp 兩個片段,AG genotype 產生 155 bp,130 bp 及 25 bp 三個片段。(F) 489 G/A:
AA genotype 產生 392 bp 及 159 bp 兩個片段,GG genotype 產生 281 bp,159 bp 及111 bp 三個片段,AG genotype 產生 392 bp,281 bp,159 bp 及 111 bp 四個 片段。
TC TT CC TT TC TT TT CC CC CA CC CA CC CC AA
CC CC CC TC TT CC CC
GG AAGGAG GG
GG GG GG GG GG GG AG GG AG GG GG GG AG AA GG
表八.AMD 患者與對照組個體間 TNF-α SNP genotypes 的機率分佈
TNF-α -1031 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) TT 61(64.2%) 59(65.6%) TT vs CC:0.028 0.492(0.410-0.590) TC 34(35.8%) 25(27.8%) TC vs CC:0.009 0.424(0.315-0.571) CC 0(0%) 6(6.7%) TT vs TC,CC:0.026
TNF-α -863 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) CC 65(68.4%) 50(55.6%) CC vsAA:0.815 1.138(0.387-3.347) CA 22(23.2%) 33(36.7%) CA vs AA:0.355 0.583(0.185-1.840) AA 8( 8.4%) 7(7.8%) AA vs CA,CC:0.129
TNF-α -857 AMD(n=94) Control(n=90) p value OR(95% CI) TT 1(1.1%) 1(1.1%) TT vs CC:1.0 1.045(0.064-17.060)
TC 27(28.7%) 20(22.2%) TC vs CC:0.312 1.411(0.723-2.757) CC 66(70.2%) 69(76.7% CC vs TT,TC:0.6
TNF-α -308 AMD(n=83) Control(n=88) p value OR (95% CI) AA 2(2.4%) 0(0.0%) AA vs GG:0.24 2.062(1.732-2.454) AG 16(19.3%) 19(21.6%) AG vs GG:0.768 0.894(0.424-1.886) GG 65(78.3%) 69(78.4%) GG vs AA,AG:0.328
TNF-α -238 AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) AA 0(0.0%) 0(0.0%)
AG 4(4.3%) 3(3.3%)
GG 89(95.7%) 87(96.7%) 1.0 1.303(0.283-5.994)
TNF-α 489 AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) GG 62(66.7%) 66(73.3%) GG vs AA:0.676 0.626(0.101-3.875) AG 28(30.1%) 22(24.4%) AG vs AA:1.0 0.848(0.130-5.529) AA 3(3.2%) 2(2.2%) AA vs AG ,CG:0.608
表九.AMD 患者與對照組個體間 TNF-α SNP Allele 的機率分佈
TNF-α -1031 C/T AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) T 156(82.1%) 143(79.4%)
C 34(17.9%) 37(20.6%) 0.516 0.84(0.50-1.41)
TNF-α -863 A/C AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) C 152(80.0%) 133(73.9%)
A 38(20.0%) 47(26.1%) 0.163 0.71(0.44-1.15)
TNF-α -857 C/T AMD(n=94) Control(n=90) p value OR(95% CI) T 29(15.4%) 22(12.2%)
C 159(84.6%) 158(87.8%) 0.347 0.76(0.42-1.39)
TNF-α -308 G/A AMD(n=83) Control(n=88) p value OR (95% CI) A 20(12.0%) 19(10.8%)
G 146(88.0%) 157(89.2%) 0.716 0.88(0.45-1.72)
TNF-α -238 A/G AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) G 182(97.8%) 177(98.3%)
A 4(2.2%) 3(1.7%) 1.0 1.297(0.286-5.877)
TNF-α 489 A/G AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) G 152(81.7%) 154(85.6%)
A 34(18.3%) 26(14.4%) 0.322 1.33(0.76-2.31)
TNF-α promoter 區域 -1031 T/C,-863 C/A,-857 C/T,-308 G/A,-238 G/A SNP 進行haplotypes 的分析,在我們研究的族群中,以 TCCGG haplotype 佔最多數,其次 為CACGG,TCTGG(表十),在 AMD 患者與對照組個體間相比較有顯著的差異(表十 一),對照組個體帶有較高比率的 TACGG haplotype(6.7% vs 1.1%,OR=6.714,95%
CI=1.481~30.435,p=0.011),而在 haplotypes/genotypes 的分析,我們發現 AMD 患者 缺乏 TCCGG/TACGG genotype,與對照組個體具有顯著的差異(0.0% vs 8.9%,
p=0.003),此外 CACGG/TCCAG genotype 與對照組個體間有較弱的關連性(7.8% vs 1.1%,OR=7.928,95% CI=0.955~65.782,p=0.031),且對照組個體也有較高比率帶
有CACGG/CACGG genotype 的傾向(4.4 % vs 0.0%,p=0.054)(表十二)。
表十.TNF-α promoter region:-1031,-863,-857,-308,-238 SNP,所可能組成 haplotypes 的結構及在台灣族群的比例(n=185)
Haplotype -1031 -863 -857 -308 -238 Frequencies T C C G G 0.538462 C C C G G 0.016988 T A C G G 0.049174 C A C G G 0.132110 T C T G G 0.112429 T A T G G 0.010296 C A T G G 0.014038 T C C A G 0.084705 C C C A G 0.002704 T A C A G 0.005458 C A C A G 0.013613 T C T A G 0.001087 T C C G A 0.008271 C C C G A 0.005622 T A C G A 0.003631 C A C G A 0.001409
表十一. AMD 患者與對照組個體間 TNF-α gene -1031,-863,-857,-308,-238 polymorphisms,haplotypes 的分佈
-1031/-863/-857/-308/-238 haplotypes
Control n=180
AMD n=190
p value
Odds ratio (95% CI) CACGA 1(0.6%) 1(0.5%) 1.0 1.056(0.066-17.008)
TACGA 1(0.6%) 0(0.0%) 1.0 -
CCCGA 1(0.6%) 2(1.1%) 1.0 0.525(0.047-5.842) TCCAG 19(10.6%) 20(10.5%) 1.0 1.003(0.516-1.948) CACGG 30(16.7%) 28(14.7%) 0.713 1.157(0.660-2.028) TACGG 12(6.7%) 2(1.1%) 0.011 6.714(1.481-30.435) CCCGG 1(0.6%) 1(0.5%) 1.0 1.056(0.066-17.008) TCCGG 92(51.1%) 102(53.7%) 0.696 0.902(0.6000-1.357) CATGG 1(0.6%) 1(0.5%) 1.0 1.056(0.066-17.008) TATGG 1(0.6%) 4(2.1%) 0.373 0.260(0.029-2.347) TCTGG 19(10.6%) 24(12.6%) 0.645 0.816(0.431-1.548)
CCCGG 1(0.6%) 0(0.0%) 1.0 -
TATGG 1(0.6%) 1(0.5%) 1.0 1.056(0.066-17.008)
TCCGA 0(0.0%) 2(1.1%) 0.499 -
TACAG 0(0.0%) 1(0.5%) 1.0 -
CCCAG 0(0.0%) 1(0.5%) 1.0 -
表十二. AMD 患者與對照組個體間 TNF-α gene -1031,-863,-857,-308,-238 CACGG/TCCAG 7(7.8%) 1(1.1%) 0.031 7.928(0.955-65.782)
CACGG/CACGG 4(4.4%) 0(0.0%) 0.054 -
CACGG/TATGG 1(1.1%) 5(5.3%) 0.212 0.202(0.023-1.766)
TACGG/TCCAG 2(2.2%) 0(0.0%) 0.235 -
TACGG/CACGG 1(1.1%) 1(1.1%) 1.0 1.056(0.065-17.143) TACGG/CATGG 1(1.1%) 1(1.1%) 1.0 1.056(0.065-17.143)
CCCGG/CACGG 1(1.1%) 0(0.0%) 0.486 -
CCCGG/TCTGG 1(1.1%) 0(0.0%) 0.486 -
TCCGG/CACGA 1(1.1%) 0(0.0%) 0.486 -
TCCGG/TACGA 1(1.1%) 0(0.0%) 0.486 -
TCCGG/CCCGA 1(1.1%) 2(2.1%) 1.0 0.522(0.047-5.864) TCCGG/TCCAG 9(10.0%) 11(11.6%) 0.913 0.848(0.334-2.155) TCCGG/TACGG 12(13.3%) 16(16.8%) 0.645 0.760(0.338-1.710)
TCCGG/TACGG 8(8.9%) 0(0.0%) 0.003 -
TCCGG/TCCGG 22(24.4%) 28(29.5%) 0.546 0.774(0.403-1.487) TCCGG/TCTGG 15(16.7%) 15(15.8%) 1.0 1.067(0.488-2.331)
TCCGG/TATGG 1(1.1%) 0(0.0%) 0.486 2.067(1.781-2.4) TCTGG/TCCAG 1(1.1%) 4(4.2%) 0.369 0.256(0.028-2.332)
TCTGG/TCTGG 1(1.1%) 1(1.1%) 1.0 1.056(0.065-17.143)
TCCAG/CCCAG 0(0.0%) 1(1.1%) 1.0 -
第四節 腫瘤壞死因子基因結合血管內皮生長因子基因之多型性與AMD 患者及對照 組個體之關連性(Association of TNF-α gene polymorphisms combine with VEGF gene polymorphisms in AMD patients and control subjects)
因 VEGF 可 誘 發 retinal vascular endothelium 表 現 intercellular adhesion molecular-1(ICAM-1)及調節白血球附著到內皮細胞35,引起leukostasis 及發炎反應,
而TNF-α 是一個多功能的 proinflammatory cytokine,會活化發炎性白血球,這些白血 球則會釋放出內皮生長因子(endothelial growth factors)引發血管新生,所以加以評估 VEGF 與 TNF-α gene 相 互 影 響 對 於 AMD 的 相 關 連 性 , 我 們 結 合 了 TNF-α haplotypes/genotypes 及 VEGF haplotypes/genotypes 的資料,發現在 55 個預測的 haplotypes 中,TNF-α haplotype:CACGG 與 VEGF haplotypes:CTGC 的結合缺乏於 AMD 患者身上,而與對照組個體有顯著的差異(0.0% vs 3.3%,p=0.013),另外 TNF-α haplotype:TACGG 與 VEGF haplotype:CTGC 的結合,對照組個體則有較高比例的 傾向(2.2% vs 0.0%,p=0.055)。在 92 個預測的 genotypes 中 TNF-α:TCCGG/TACGG 與VEGF:CTCC/CTGC genotype 的結合,缺乏於 AMD 患者身上,而與對照組個體 有顯著的差異(0.0% vs 5.6%,p=0.026),而 TNF-α:TCCGG/CACGG 與 VEGF:
CTCC/CTGC genotyp 的結合,對照組個體則有較高比例的傾向(4.4% vs 0.0%,p=0.054) (表十三) 。
表十三. TNF-α haplotypes/genotypes 與 VEGF haplotypes/genotypes 的結合,在 55 個預 測的haplotypes 及 92 個預測的 genotypes 中,這裡只列出與 AMD 患者及對照 組個體間比較有關係的組合。
TNF-α haplotype + VEGF haplotype Control(n=180) AMD(n=190) p value
CACGG CTGC 6(3.3%) 0(0.0%) 0.013 TACGG CTGC 4(2.2%) 0(0.0%) 0.055
TNF-α genotype + VEGF genotype Control(n=90) AMD(n=95) p value
TCCGG/CACGG CTCC/CTGC 4(4.4%) 0(0.0%) 0.054 TCCGG/TACGG CTCC/CTGC 5(5.6%) 0(0.0%) 0.026
第五節 抗發炎基因,間白素-10 之基因多型性與AMD 患者及對照組個體之關連性 (Anti-inflammatory gene:interleukin-10 gene polymorphisms are associated with AMD patients and control subjects)
IL-10 promoter polymorphisms -1082 A/G;-819 T/C;-592 A/C 基因型的電泳分析 圖呈現於圖十三。AMD 患者與對照組個體間,genotype 與 allele 的機率分佈在兩族群 中並無顯著差異(表十四;表十五),haplotypes 的分析,在我們研究的族群中,以 ATA;
ACC;GCC 佔絕多數(表十六),在 haplotypes/genotypes 的分析中,AMD 患者與對照 組個體間,仍無差異存在(表十七;表十八) 。
A. IL-10 -1082 A/G
B. IL-10 -819 T/C C. IL-10 -592 A/C
圖十三. IL-10 promoter polymorphisms.(A) -1082 A/G:AA genotype 產生一個 139 bp 片段,GG genotype 產生 106 bp 及 33 bp 兩個片段,AG genotype 產生 139 bp,
106 bp 及 33 bp 三個片段,我們研究的族群中,並沒有發現 GG genotype。(B) -819 T/C:TT genotype 產生一個 209 bp 片段,CC genotype 產生 125 bp 及 84 bp 兩個片段,TC genotype 產生 209 bp,125 bp 及 84 bp 三個片段。(C) -592 A/C:
CC genotype 產生一個 412 bp 片段,AA genotype 產生 236 bp 及 176 bp 兩個 片段,CA genotype 產生 412 bp,236 bp 及 176 bp 三個片段。
AG AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AA AG AA AA
TT TC TC CC TT TT
CA CA CA AA AA CA AA CA CA AA CACCCA CA
表十四. AMD 患者與對照組個體間 IL-10 promoter SNP genotypes 的機率分佈
IL-10 -1082 AMD(n=92) Control(n=90) p value OR (95% CI) AA 82(89.1%) 80(88.9%)
AG 10(10.9%) 10(11.1%)
GG 0(0.0%) 0(0.0%) 0.958 0.976(0.385-2.470)
IL-10 -592 AMD(n=94) Control(n=90) p value OR(95% CI) CC 5(5.3%) 5(5.6%) CC vs AA:1.0 0.953(0.257-3.539)
CA 46(48.9%) 44(48.9%) CA vs AA:0.992 0.997(0.550-1.807) AA 43(45.7%) 41(45.6%) AA vs CC,CA:0.997
IL-10 -819 AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) TT 48(51.6%) 41(45.6%) TT vs CC:0.469 0.650(0.202-2.096) TC 36(38.7%) 44(48.9%) TC vs CC:0.183 0.455(0.140-1.477) CC 9( 9.7%) 5(5.6%) CC vs TT,TC:0.295
表十五.AMD 患者與對照組個體間 IL-10 promoter SNP allele 的機率分佈
IL-10 -1082 A/G AMD(n=92) Control(n=90) p value OR (95% CI) G 10(5.4%) 10(5.6 %)
A 174(94.6 %) 170(94.4 %) 0.960 0.977(0.397-2.407)
IL-10 -592 A/C AMD(n=94) Control(n=90) p value OR(95% CI) C 56(29.8%) 54(30.0%)
A 132(70.2%) 126(70.0%) 0.964 1.01(0.65-1.58)
IL-10 -819 T/C AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) T 132(71.0%) 126(70.0%)
C 54(29.0%) 54(30.0%) 0.839 1.048(0.668-1.642)
表十六.IL-10 promoter region:-1082,-819,-592 SNP,所組成 haplotypes 的結構及在 台灣族群的比例(n=185)
Haplotype -1082 -819 -592 Frequencies
ATC 0.022375 ATA 0.678569 ACC 0.225906 ACA 0.019096 GTA 0.003751 GCC 0.050292
表十七. AMD 患者與對照組個體間 IL-10 promoter -1082,-819,-592 polymorphisms,
haplotypes 的分佈 -1082/-819/-592
haplotype
Control n=180
AMD n=190
p value Odds ratio (95% CI)
A C A 1(0.6%) 5(2.6%) 0.216 0.207(0.024-1.787) A C C 43(23.9%) 40(21.1%) 0.513 1.177(0.722-1.919) A T A 125(69.4%) 129(67.9%) 0.748 1.075(0.692-1.668) A T C 1(0.6%) 6(3.2%) 0.122 0.171(0.020-1.437) G C C 10(5.6%) 9(4.7%) 0.721 1.183(0.469-2.982)
G T C 0(0.0%) 1(0.5%) 1.0 -
表十八.AMD 患者與對照組個體間,IL-10 gene -1082,-819,-592 polymorphism,
ACC/ACC 2(2.2%) 4(4.2%) 0.683 0.517(0.092-2.895) ACC/GCC 3(3.3%) 1(1.1%) 0.358 3.241(0.331-31.749) ATA /ACA 1(1.1%) 1(1.1%) 0.212 0.202(0.023-1.766) ATA /ACC 36(40.0%) 29(30.5%) 0.177 1.517(0.827-2.784) ATA /ATA 40(44.4%) 43(45.3%) 0.911 0.967(0.542-1.727) ATA /GCC 7(7.8%) 6(6.3%) 0.697 1.251(0.404-3.875) ATC/ATA 1(1.1%) 6(6.3%) 0.119 0.167(0.020-1.413)
ACA/GCC 0(0.0%) 2(2.1%) 0.498 -
ACC/ACA 0(0.0%) 2(2.1%) 0.498 -
ATA/GTC 0(0.0%) 1(1.1%) 1.0 -
第六節 IL-6,IL-8,IL-1β,TGF-β1,HTRA 1,LOC387715 之基因多型性與 AMD 患 者及對照組個體之關連性(IL-6,IL-8,IL-1β,TGF-β1,HTRA 1,LOC387715 gene polymorphisms are associated with AMD patients and control subjects)
我們分析了IL-6 promoter -572 G/C;IL-8 promoter -251 A/T,IL-1β promoter -511 T/C,TGF-β1 promoter -509 C/T,HTRA1 promoter G/A(rs11200638),LOC387715 exon 1 T/G (rs10490924) SNP 之基因多型性,其電泳分析圖呈現於圖十四。AMD 患者 與對照組個體間的比較,IL-6 -572 G/C,IL-8 -251 A/T,IL-1β -511 T/C,TGF-β1 -509 C/T genotype 的機率分佈在兩族群中並無顯著差異,但 HTRA1 G/A (rs11200638)與 LOC387715 T/G (rs10490924)基因型在 AMD 患者與對照組個體間相比較有非常顯著
的差異存在,AMD 患者有非常高的比率具有 HTRA1 AA 基因型(55.9% vs 25.0%,p
<0.001)及 LOC387715 TT 基因型(61.2 % vs 32.1%,p <0.001) (表十九);同樣地,IL-6 -572 G/C,IL-8 -251 A/T,IL-1β -511 T/C,TGF-β1 -509 C/T allele 的機率分佈在兩族 群中也無顯著的差異存在,HTRA1 G/A (rs11200638)與 LOC387715 T/G (rs10490924) allele 在 AMD 患者與對照組個體間相比較有非常顯著的差異存在(表二十),此外,我 們也結合 HTRA1 與 LOC387715 基因型在 AMD 患者與對照組個體間相比較,同樣地,
帶有 HTRA1 AA 基因型 AMD 的患者也帶有非常高比例的 LOC387715 TT 基因型與對 照組個體仍有顯著的差異(55.3% vs 19.2%,OR=0.177,95% CI=0.051~0.612,
p=0.008),我們也發現 HTRA1 A allele 與 LOC387715 T allele 具有高度的連鎖性 (linkage)(表二十一)。
A. IL-6 -572 G/C B. IL-8 -251 A/T
C. IL-1β -511 T/C D. TGF-β1 -509 C/T TT TG GG TG TT GG
E. HTRA1 G/A (rs1120638) F. LOC387715 T/G (rs10490924) 圖十四.(A) IL-6 -572 G/C SNP:CC genotype 產生一個 296 bp 片段,GG genotype 產
生201 bp 及 95 bp 兩個片段,CG genotype 產生 296 bp,201 bp 及 95 bp 三 個片段。(B) IL-8 -251 A/T SNP:TT genotype 產生一個 542 bp 片段,AA genotype 產生 449 bp 及 92 bp 兩個片段,TA genotype 產生 542 bp,449 bp 及92 bp 三個片段。(C) IL-1β -511 T/C SNP:TT genotype 產生一個 304 bp 片段,CC genotype 產生 190 bp 及 114 bp 兩個片段,TC genotype 產生 304 bp,190 bp 及 114 bp 三個片段。(D) TGF-β1 -509 C/T SNP:CC genotype 產 生一個 400 bp 片段,TT genotype 產生 202 bp 及 198 bp 兩個片段,CT genotype 產生 400 bp,202 bp 及 198 bp 三個片段(E) HTRA1 G/A (rs11200638) SNP:AA genotype 產生一個 383 bp 片段,GG genotype 產生 203 bp 及 180 bp 兩個片段;AG genotype 產生 383 bp,203 bp 及 180 bp 三個片段。LOC387715 T/G (rs10490924) SNP:TT genotype 產生 261 bp 及 37 bp 兩個片段,GG genotype 產生 190 bp,71 bp 及 37 bp 三個片段;TG genotype 產生 261 bp,
190 bp,71 bp 及 37 bp 四個片段。
CC CG CC CG CG CC GG
AA TA TA TT TA TA TA TA
TT TT CC CC TT TC TC
CT TT CC CT CT CT CC
AG GG AG AG AG AA AA
表十九.AMD 患者與對照組個體間 IL-6 -572 G/C,IL-8 -251 A/T,IL-1β -511 T/C,
TGF-β1 -509 C/T, HTRA 1 A/G,LOC387715 T/G SNP genotype 的機率分佈
IL-6 -572 AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI) CC 52(55.9%) 47(52.2%) CC vs GG:0.656 1.328(0.380-4.637) CG 36(38.7%) 37(41.1%) CG vs GG:0.811 1.168(0.327-4.168) GG 5( 5.4%) 6 (6.7%) GG vs CC,CG:0.857
IL-8 -251 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) TT 27(28.4%) 35(38.9%) TT vs AA:0.579 0.771(0.308-1.932) TA 55(57.9%) 42(46.7%) TA vs AA:0.542 1.310(0.550-3.117) AA 13(13.7%) 13(14.4%) TT vs TA,AA:0.267
TGF-β1 -509 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) CC 32(33.7%) 40(44.4%) CC vs TT:0.101 0.471(0.190-1.168) CT 46(48.4%) 40(44.4%) CT vs TT:0.387 0.676(0.278-1.645) TT 17(17.9%) 10 ( 11.1%) TT vs CC,CT:0.224
IL-1β -511 AMD(n=95) Control(n=90) p value OR (95% CI) TT 22(23.2%) 14(15.6%) TT vs CC:0.062 2.316(0.953-5.627) TC 54(56.8%) 48(53.3%) TC vs CC:0.156 1.658(0.823-3.340) CC 19(20.0%) 28(31.1%) CC vs TT,TC:0.267
HTRA1 (rs11200638)
AMD(n=93) Control(n=81) p value OR (95% CI)
AA 52(55.9%) 17(25.0%) AA vs GG:0.036 3.059(1.045-8.953) AG 32(34.4%) 42(61.8%) AG vs GG:0.605 0.762(0.271-2.139) GG 9(9.7%) 9(13.2%) GG vs AA,AG:<0.001
LOC387715 (rs10490924)
AMD(n=85) Control(n=84) p value OR (95% CI)
TT 52(61.2%) 27(32.1%) TT vs GG:<0.001 4.727(2.038-10.963) TG 22(25.9%) 30(35.7%) TG vs GG:0.194 1.800(0.738-4.388) GG 11(12.9%) 27(32.1%) GG vs TT,TC:<0.001
表二十.AMD 患者與對照組個體間 IL-6 -572 G/C,IL-8 -251 A/T,IL-1β -511 T/C,
TGF-β1 -509 C/T,HTRA 1 A/G,LOC387715 T/G SNP allele 的機率分佈
IL-6 -572 G/C AMD(n=93) Control(n=90) p value OR (95% CI)
AMD(n=93) Control(n=81) p value OR (95% CI)
A 136(73.1%) 76(46.9%)
G 50(26.9%) 86(53.1%) <0.001 3.078(1.967-4.815)
LOC387715 (rs10490924)
AMD(n=85) Control(n=84) p value OR (95% CI)
T 126(74.1%) 84(50.0%)
G 44(25.9%) 84(50.0%) <0.001 2.864(1.812-4.525)
表二十一.HTRA1-LOC387715 genotype 在 78 位對照組個體與 85 位 AMD 患者的分佈
HTRA1 (rs11200683)
LOC387715 (rs10490924)
Controls(%) AMD(%) p value; Odds ratio(95% CI)
TT TG GG TT TG GG TT TG GG
AA 15(19.2) 1(1.3) 0 47(55.3) 2(2.4) 0 0.008 0.571 0.343
AG 9(11.5) 28(35.9) 3(3.8) 5(5.9) 20(23.5) 3(3.5) 0.177(0.051-0.612) 0.357(0.030-4.214) 0.364(0.061-2.185)
GG 0 0 22(28.2) 0 0 8(9.4)
第四章 討論
AMD 是一個多因素的疾病,它的危險因子則涵蓋了年齡;性別;種族;環境因 子,如:抽煙,飲食,高血壓,高血脂等等,另外一個就是基因層面,在我們所研究 的實驗組與對照組族群中,已盡可能地排除年齡、性別、種族與環境因子上的差異,
抽煙狀況、BMI、血壓、高血壓、醣尿病、心血管疾病、高血脂在實驗組與對照組族
抽煙狀況、BMI、血壓、高血壓、醣尿病、心血管疾病、高血脂在實驗組與對照組族