第一節 超氧化物歧化酶之相關文獻探討
超氧化物歧化酶(Superoxide dismutases, SOD) 1,為一種生物體自 行產生抗氧化的酵素,並廣泛地存在於各類動物、植物、微生物中,
此酵素能使細胞免於因自由基攻擊所造成的毀損或突變,是生物體中 極為重要的抗氧化劑。SOD 可催化超氧離子(superoxide, O2
․‒
)2發生自 身氧化還原反應,生成氧氣及過氧化氫:
超氧離子為生物體在進行新陳代謝時所產生之副產物,為一具有 高活性之物質。當其在生物體內時,易與水分子或其他含氧物質產生 活性氧化物(reactive oxygen species, ROS)。ROS 為具有高度氧化力之 物質,當細胞內 ROS 過量時會攻擊生物體內的 DNA、蛋白質與細胞 膜脂質,將造成無法修復之傷害。如脂質被 ROS 攻擊時,會使未飽 和脂肪酸被氧化及破壞,導致脂質過氧化物(lipid peroxide)的生成,
而當血清中脂質過氧化物濃度過高則容易誘發烏腳病與動脈硬化等 心血管疾病3。此外,超氧離子在生物體中還會與一氧化氮(NO)反應,
當在新陳代謝過程中產生超氧離子時,SOD 即能發揮重要的保 護作用。在細胞內的 SOD 存在能減少氧化反應,是緩和老化的關鍵 角色。因此,SOD 被用作抗氧化治療劑。其他醫療應用包括治療關 節炎和預防癌症治療及器官移植的副作用,也可用於阻止由於基因突 變所造成的家族型肌萎縮側索硬化症 (familiar amyotrophic lateral sclerosis, FALS) 5這種麻痺疾病的發展。
圖 1.1 三類型 SOD 的活性中心
在此,我們將針對目前己被發現的三類超氧化物歧化酶分別做介紹:
一、 銅/鋅超氧化物歧化酶,Cu/ZnSOD7
Cu/ZnSODs 是所有超氧化物歧化酶中數量最豐富的,被廣泛地 發現在真核生物和許多原核生物中。大多數從真核細胞分離出的 Cu/ZnSOD 酵素呈淡藍色,分子量約為 32k Da。其具有兩個相同次單 元體(subunit),每個次單元體都有一個活性中心,且有皆一個銅離子 和一個鋅離子存在於其中。
二、含錳及含鐵超氧化物歧化酶,MnSOD and FeSOD8
Keele 等人首先在 1970 年於大腸桿菌中分離出 MnSOD,此酵素 呈淡紅色,主要存在於原核細胞與真核細胞的粒線體中,是粒線體中 主要的抗氧化酵素,負責轉化粒線體中產生的超氧離子。MnSOD 每 個單元體分子量約 19~24k Da,每個單元體中含有一個錳離子。錳離 子與三個 His 及 Asp 鍵結。
FeSOD 也是由大腸桿菌中被分離出來,此酵素呈淡黃色。其分 布於藻類、原核細菌細胞基質中。FeSOD 的氨基酸序列與 MnSOD 相 當相似,此酵素是由兩個蛋白質單元體組成,活性中心則是以三個 His 及 Asp 與鐵離子鍵結,分子量約為 8.5~22k Da。
圖 1.3 MnSOD(或 FeSOD)的蛋白質結構與活性中心
三、含鎳超氧化物歧化酶,NiSOD9
1996 年 , Youn 等 人 於 鏈 黴 菌 (Steptomyces) 及 藍 綠 藻
可知其為四個蛋白質單元體構成,分子量約為 53.7 kDa,而其活中心 為鎳離子做為中心金屬,且周圍由 His1、Cys2、Cys6 等胺基酸殘基 配位而成10(圖 1.5)。
圖 1.4 鏈黴菌 Streptomyces 及藍綠藻 Cyanobacteria
圖 1.5 NiSOD 的蛋白質結構與活性中心
還原態 NiSOD 活性中心的配位環境如圖 1.6 左所示,在鎳離子 中心赤道面的平行四邊形上,配位著 His 上末端 amine 的 N 及
上 thiolate 的 S,形成 NiIIN2S2平面四角形結構;在氧化態 NiSOD 的
O2釋出,而鎳離子還原成正二價(61),完成 NiSOD 催化 O2
․‒分別 轉化成 O2與 H2O2釋出的循環反應。
圖 1.7 NiSOD 於文獻上利用理論計算得到的反應機構10
最新的研究中 11,Jason Shearer 合成出具有與 NiSOD 活性中心 周圍胺基酸相同胜肽鍵的 NiSOD 的仿生化合物,{Ni(SODM1H(1)HMe)}
(NiM1; SODM1H(1)HMe = H2N-HMeCDLPCGVYDPA; HMe =
1.8),在 pH = 8 時具有催化超氧化物自身氧化還原的能力,(k = 6×106M-1s-1)。
圖 1.8 NiSOD (R=H)及仿生化合物 NiM1 (R=CH3)活性中心
為了研究 NiSOD 將超氧離子還原成過氧化氫之反應機制,
Shearer 利用 stopped-flow techniques 偵測超氧化物催化反應之動力學 實驗(圖 1.9),在室溫(25 °C)不同溶劑(H2O 及 D2O)下可測得,KIE (kinetic isotope effect)數值為 20(4),為一相當大的數值。此 KIE 值支 持此反應為一 PCET (proton-coupled electron-transfer)過程。
圖 1.9 NiM1於室溫下不同溶劑中之動力學實驗11
從以上動力學實驗得知,仿生化合物 Ni(II)M1藉由 PCET 過程將 O2
․‒還原成 H2O2,自身則氧化成 Ni(III)M1,接著 Shearer 利用具有提 供氫原子能力的化合物,如 ascorbate (BDFE = 73.6 kcalmole‒1)及 1-hydroxy-2,2,6,6-tetramethylpiperidine (TEMPO-H; BDFE = 71.0 kcalmole‒1)與氧化態 Ni(III)M1反應,發現 TEMPO-H 可將氫原子轉移 胺基酸殘基 Cys2 上的硫原子,並將 Ni(III)M1還原至 Ni(II)M1(圖 1.10),
在室溫(25 °C)下,平衡常數 k 為 26.5(8)。
圖 1.10 Ni(III)M1
+ TEMPO-H 在室溫(25 °C)的平衡反應
11經由上述利用 NiSOD 仿生化合物的動力學實驗,Shearer 認為生 物體中的 NiSOD 應具有類似之反應機制,當還原超氧離子時,會經 由配位環境中的硫醇提供質子並經過一 PCET 反應,並且為此反應中 的速率決定步驟(圖 1.11)。
圖 1.11 Shearer 提出的超氧離子與 NiM1之反應機制11