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1011學期課程基本資料/Course Information 系所
系所 / 年級年級 生醫系博士班 1年級 課號課號 / 班別班別 I9D00479 / B 學分數
學分數 3學分 選選 / 必修必修 選修
科目中文名稱
科目中文名稱 微陣列資料分析 科目英文名稱科目英文名稱 Microarray Data Analysis 主要授課老師
主要授課老師 吳家樂 開課期間開課期間 一學年之上學期
人數上限
人數上限 20 人 已選人數已選人數 7人
起始週 / 結束週 / 上課地點 / 上課時間 第1週 / 第18週 / I528 / 星期4第02節 第1週 / 第18週 / I528 / 星期4第03節 第1週 / 第18週 / I528 / 星期4第04節 請各位同學遵守智慧財產權觀念；請勿非法影印。
Please observe Intellectual Property Rights (IPR), not to make illegal copies.
教學綱要/syllabus
第一部分/Part I(※依課程委員會審議之內容決議填入)
一、教學目標所 一、教學目標所 要達成之能力培 要達成之能力培 養項目 養項目: [依據課程委員會依據課程委員會 審議通過之課程 審議通過之課程 與基本素養 與基本素養/核心核心 能力關聯表填寫 能力關聯表填寫]
基本素養/核心能力 Core Literacy/Core Competencies 相關性 Relevance
高度相關 中度相關
敏銳思維與知識整合 生醫資訊
生醫資訊知識
二、教學目標 二、教學目標 (Objective)
1.認知面：[使學生理解、應用、分析、綜合、比較、推論、評估本課程之理論與概念]：
讓學生瞭解微陣列之進展及培養研究之能力。 讓學生對微陣列有初步瞭解，並且可充分利用Internet之資源解問題。
An in-depth understanding of microarray technology, and familiar with the internet resources.
2.技能面[使學生能獲得運用與實做本課程理論與概念之技巧]：
3.情意面[能引發學生對本課程之興趣，激發學生學習動機，增加觸類旁通與自主學習]：
三、符合教學目 三、符合教學目 標之課程內容設 標之課程內容設 計
計
介紹有關基因表達晶片、微陣列資料庫、微陣列資料分析分法、及基因調控網路。 Lectures on microarray technology, microarray datbases, statistical analysis of array data, and reconstruction of gene regulatory networks.
四、先修科目 四、先修科目 (Pre Course)
第二部分/Part II 一、多元教學方
一、多元教學方 法
法 (Teaching Method)
由學生自訂學習目標與抱負水準 案例或故事討論 講述
服務學習 學生課後書面報告 小組討論 參訪
學生上台報告 腦力激盪 學生實作 角色演練
習題練習 影片欣賞與討論 採訪 e化教學
審議式民主 觀察與資料收集 一分鐘回饋 其他
二、參考書目 二、參考書目 (Reference) [符合教學目標之符合教學目標之 參考書目 參考書目]
Microarray Gene Expression Data AnalysisCauston H, Quackenbush J. and Brazma A.Blackwell Publishing A biologist's guide to analysis of data microarray dataKnudsen S.John Wiley
三、教學進度 三、教學進度 (Syllabi) [符合教學目標之符合教學目標之 教學進度 教學進度]
2012/9/13 Introduction - RNA expression, chip technology 吳家樂 2012/9/20 Suffix tree, application of microarray 吳家樂 2012/9/27 Data normalization, filtering, Log transform 吳家樂 2012/10/4 Data Normalization, Lowess normalization, SMD 吳家樂 2012/10/11 Statistical analysis of gene expression data 吳家樂
2012/10/18 Midterm 吳家樂
2012/10/25 distance measure, Entropy 吳家樂
2012/11/1 Statistics, normal distribution 吳家樂 2012/11/8 Test of hypothesis, t-test of microarray data 吳家樂 2012/11/15 ArrayExpress - analysing of data 吳家樂
2012/11/22 Gene expression databases 吳家樂
2012/11/29 Gene regulation network prediction 吳家樂 2012/12/6 Microarray data analysis tools 吳家樂
2012/12/13 student presentation 吳家樂
2012/12/20 student presentation 吳家樂
2012/12/27 student presentation 吳家樂
2013/1/3 student presentation 吳家樂
2013/1/10 student presentation 吳家樂
四、多元評量方 四、多元評量方 法
法 (Evaluation) [所勾選評量方法所勾選評量方法 之評分加總 之評分加總 為 為100分分]
評量方式 分數 評量方式 分數
實作測驗 期中筆試
隨堂筆試測驗 期末筆試
小組作業 期中報告
服務日誌 期末報告
口試 專題報告
個人上台報告 實作作品與反思
小組上台報告 前後測比較進步與成長
出席狀況 課堂參與與表現
心得與反思報告 其他
五、講義位 五、講義位 址 址(http://)
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