面對新興感染症不再擔心 面對新興感染症不再擔心
中榮感染症基因體中心守護您 中榮感染症基因體中心守護您
文/臺中榮總內科部感染科總醫師 葉庭光 文/臺中榮總內科部感染科總醫師 葉庭光
新興感染症與微生物抗藥性的 威脅
2019年末至2020年初,新冠肺炎 疫情爆發,新型冠狀病毒隨著高度國際 化的社會快速擴散至全球,延燒至今已 餘三年。事實上,隨著國際社會頻繁交 流與氣候變遷,除新冠肺炎外,各類新 興傳染病打破既有疆域散播至世界各 地,舊有的致病細菌也因抗生素大量於 臨床、畜牧養殖業使用,多重抗藥性細 菌於全世界各地之比例逐漸增加。新興 傳染病與抗微生物藥物抗藥性 (Anti- microbial resistance, AMR) 議 題 匯 流,對民眾的健康影響甚鉅。為此,本 院成立感染症基因體中心,希望從感染 症精準醫療的層面,守護民眾的健康。
感染症基因體中心的步伐
本院感染症基因體中心於甫成立之 初,團隊正在多個微生物臨床研究與診 斷方面大步前進,包括抗藥菌株基因資
料庫建立、新興感染症研究、噬菌體治 療與基因編輯、總體基因次世代定序
(mNGS)。
在 抗 藥 菌 株 基 因 資 料 庫 建 立 的 部 分,本院感染科團隊進行陰溝腸桿菌
(Enterobacter cloacae complex) 系統性文獻回顧,進一步對院內檢體培 養出的陰溝腸桿菌,以聚合酶連鎖反應
(Polymerase chain reaction, PCR) 進行切確菌種鑑定,建立臺中榮總陰溝 腸桿菌菌種資料庫,統計與監控院內菌 種變化,給予病人即時與精準的感染症 治療。
在新興感染症研究的部分,團隊於 新冠肺炎重症病人血液中分離出多重抗 藥性的產吲哚金黃桿菌(Chryseobac- terium indologenes),並以第三代定 序技術即時進行全基因體定序,在此多 重抗藥性菌株身上的三個 β-內醯胺酶 抗藥基因當中,發現未曾在此菌種上報 告過的blaCcrA 抗藥基因。
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醫療
醫療大百科
在噬菌體治療與基因編輯的部分,
感染科團隊表示,隨著近代抗藥性菌株 快速增加,新型抗生素的研發速度已逐 漸跟不上抗藥基因的傳播,然而近年有 許多研究將噬菌體應用於臨床感染症治 療,本院感染科團隊進行系統性文獻回 顧,了解目前全球噬菌體治療之進展與 臨床試驗並綜整藉由噬菌體為媒介之 CRISPR/Cas基因編輯治療。此系統性 回顧論文也於 2022年1月份發表於高 分國際期刊《International Journal of Antimicrobial Agents》
最後,在困難診斷與未知感染症的 威脅下,感染症基因體中心也同樣投入 分子診斷的領域,於臺中榮總感染症基
因體中心成立全臺灣第一家坐落於醫學 中心內的總體基因次世代定序(mNGS) 實驗室,將病人檢體內的核酸物質片段 定序後,過濾病人的背景基因片段,找 出可能致病的細菌、病毒、真菌或寄生 蟲。由於實驗室位於院區內,未來藉由 整合院內病歷資訊系統,能提供院內病 人更快速地送檢與記錄檢驗結果於電子 病歷查詢系統,提供患者全方位的醫療 照護。
臺中榮總感染症基因體中心將在新 興傳染病與抗藥性漸增的年代,扮演第 一線守護民眾健康的腳色,在感染科團 隊的努力之下,步伐不會停歇。
▲ 圖 (a)、圖 (b) 感染症基因體中心研究發表,基因定序臨床陰溝腸桿菌菌株,發現新型 CTX-M-236 抗藥基因。
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