• 沒有找到結果。

第五章 理論計算與光譜分析

5.1 概論

由實驗我們可以得知分子精確的第一電子激發態躍遷能以及絕 熱游離能,每個譜峰分別代表不同的振動頻率,進一步分析文獻上類 似分子與實驗結果,但我們並不清楚分子是怎麼振動的,因此我們還 必需透過理論計算的方法,得到其每個振動模式所對應的頻率為何,

三者交叉比對,完成光譜分析的工作。計算結果算出分子於基底態、

第一電子激發態及游離態零點能態(zero-point energy, ZPE level),即分 子處於振動轉動基態(v = 0)的內能,相減即可得知躍遷能及游離能等 資訊。

我們使用套裝的理論計算軟體 GAUUSIAN 09[56],得到分子於各電 子態的最佳化結構、振動基本模式及其對應之頻率。首先利用 Gauss View 5.0 軟體產生分子初始構型,4-氯-3-氟苯胺及 4-氯-3-氟苯甲醚原 子順序如下圖三十三所示。

圖三十三 4-氯-3-氟苯胺與 4-氯-3-氟苯甲醚的原子標號順序

計算分為三個部分:

(1) 最穩定構型:系統能量會隨結構改變,圖三十四為分子位能曲面 圖(potential energy surface, PES),假設分子只有兩個自由度,Z 軸 表示系統內能,每一個點代表不同結構時分子具有之能量,我們 於輸入檔定義相關參數,進行系統單點能計算(single point energy caculations),再對結構參數如鍵長、鍵角等進行微調,紀錄單點能 變化,直到系統總能達最低時,即得到系統的最小穩定能(global minimum energy),此時的結構為最佳化結構。我們輸出檔的 SCF Done 區塊得到系統總能,此外,還需檢查下列四項參數是否收斂 以判斷分子是否已達最佳化結構如圖三十五:

(a) Maximum Force:在最低點時,位能的一次微分為零,故系統 受力應為零,此數值需小於臨界值 0.000450

(b) RMS Force:系統受力的方均根亦為零,此數值需小於臨界值 0.000300

(c) Maximum Displacement:每一步計算間的位移需小於臨界值 0.001800

(d) RMS Displacement:位移的方均根需小於臨界值 0.001200 除此之外,我們於輸出檔還可得到最佳化結構每個原子的座標、

化學鍵長(R)、鍵角(A)、雙面角(D)及每個原子的電荷分佈值。

圖三十四 分子位能曲面圖

圖三十五 四項參數

(2) 分子振動頻率:得到最佳化結構後,分別計算分子運動的振動頻 率、力常數、簡約質量等參數。第一電子激發態的計算結果準確 度相對於基底態與游離態低,與實驗值相比一般會高估 10~12 %,

故我們需乘以一個修正係數(scaling factor),而造成這種偏差的原 因可能有:

(a) 基 底 函 數 無 法 正 確 且 完 整 的 描 述 電 子 位 置 波 函 數 (imcompleteness of basis set)

(b) 假設系統振動形式呈簡諧(harmonic motion assumption),但並 非所有振動皆為簡諧

(c) Hartree-Fock 忽略電子之間的關聯性(correlation consideration) (3) 零點能階(zero-point level, E0, ZPL):多原子分子即使在絕對零度仍

會振動,故 ZPL 為電子能量(Eelec)加上零點能(zero-point correction, 必須再利用 Gauss View 開啟輸出檔,查看最佳化選單(optimazation) 可看見系統總能於運算過程中之變化情形,此時我們根據各參數收斂

*R/UHF (restricted / unrestricted Hartree-Fock)

*B3LYP (Becke style three-parameter density functional theory with Lee-Yang-Parr correlation functional )

*B3PW91 (Becke styple three-parameter density functional theory with Perdew-Wang 1991 correlation functional)

*CIS (Configuration Interaction Singles)

電子結構方法(Electronic structure methods)是以量子力學為基礎 來計算薛丁格方程式,得到系統總波函數、能態分佈與結構等相關參 數,主要可分為三大類:

(1) 半經驗式法(semi-empirical methods):結合實驗參數簡化計算 (2) 從頭計演算法(ab initio calculation):僅利用量子力學基礎配合適當

假 設 來 計 算 , 這 也 是 從 頭 計 演 算 法 這 個 名 字 的 來 源 , 例 :

(3) 密度泛函理論(density functional theory, DFT):近幾年來 DFT 逐漸 取代 HF,因其考慮了成對電子間的排斥力及電子關聯性,計算的 結果較為準確。

Hartree-Fock 是最常見的從頭計演算法(ab initio calculation),利 用變分法(Variation method) 計算多電子系統的總波函數,首先以一組 基底函數(basis function)的線性組合(linear combination)產生初始系統 的分子軌域波函數(trial function):ɸ𝑖 = ∑N C𝜇𝑖𝑥𝜇

𝜇=1 ,其中Φi表示分

子軌域 (MO),𝑥𝜇為歸一化的基底函數,Cμ 為分子軌域擴散係數 (molecular orbital expansion coefficients),其中基底函數又為初始函數 (primitive function) 的線性組合,故ɸ𝑖 = ∑N C𝜇𝑖(∑N𝜇=1d𝜇𝑝g𝑝)

𝜇=1 ,其

中 gp 為 初 始 函 數 ,d𝜇𝑝為 比 例 函 數 , 系 統 斯 萊 特 行 列 式 (Slater determinant)表示多電子波函數,並配合自洽場法(self-consistence field

method, SCF)解出係數,當能量達到最低點且收斂時,可得到一系列 correlation functional 結合 3 個參數的 Becke 形式密度泛函數理論為基 礎的計算方法,而 B3PW91 則是將 Perdew-Wang correlation functional 結合 3 個參數的 Becke 形式泛函數作計算基礎。 DFT 所計算出的游 離能與實驗值相近,僅有約 1~4 %的差距,對我們解釋實驗數據時有 很大的幫助,與其提出的物理模型趨近於真實系統有關。

DFT 方法可應用在基態(ground state, S0)和離子基態(ionic state, D0),但在某些方面的設定不太相同,系統中包含幾個重要選項:

(1) 在高斯計算中,電子自旋有兩種模型,一種為 closed shell model,

即 restricted calculation,表示不同自旋的兩個電子被限制在同一軌 域;另一種為 open shell mode,即 unrestricted calculation,指不同 自旋的兩個電子可以分別處於不同的軌域中,於游離態可視為其 1(Singlet);在游離態時有孤對電子,s = 1/2,S = 2(Doublet)。

我們利用 CIS 及 TD(time dependent)-DFT 計算第一電子激發態。

組態交互作用法 (configuration interaction, CI) 是以 HF 為基礎,透過 將電子由填滿的軌域提升至未填滿的軌域來建立新的行列式,也就是 指將電子激發至較高能量的軌域。

CI 的預測結果準確卻相對耗時,以激發的電子數目做分類,如:

單電子躍遷稱為 configuration interaction single-excitation (CIS),CIS 的計算可提供分子激發態的近似值,但對基態的能量卻沒有任何改變;

若考慮單電子及雙電子同時激發則稱為 Single and double excitation (CISD),CISD 所計算出的基態能量則較 HF 來的準確;另外還有 Triple-excitation (CISDT) 和 quadruple-excitation (CISDTQ)的計算只 有在要求非常精準的計算結果時才會用到;若考慮所有可能的激發狀

況則稱為 full CI,這種計算方式可提供最精確的量子力學結果,但相 對的,所需要的電腦資源與耗時也越多,考量以上條件,我們採用 CIS 計算 4-氯-3-氟苯胺及 4-氯-3-氟苯甲醚的第一電子激發態之最穩 定構形與其振動頻率。

第一電子激發態之生命期與時間有關,由於 TD-DFT 考慮了時間,

使其與真實的物理系統接近,計算結果與實驗值的誤差也較小,

TD-DFT 方法於 GAUUSIAN 03[57]版本(含)之前,只能計算能量,無法提 供振動頻率的資訊,直至 2011 年使用 GAUUSIAN 09 進行理論計算,可 得到第一電子激發態之振動資訊。

相關文件