第二章 理論背景
2.1 低同調干涉術與系統解析度
2.1.4 橫向解析度
光學同調斷層攝影術是以 2.1.2 節所提到的低同調干涉術為基礎 作縱向的掃描,再搭配橫向掃描而得到二維的斷層影像,縱向的解析 度在2.1.3 節已作說明,而橫向解析度的部份將在本節作介紹。
當進行掃描時,通常會將樣品端的光束已物鏡聚焦,使其成為一 個光學探頭,才能對樣品做探測及解析。
假設一道平行光,光場在空間中的強度分佈為高斯分佈,直徑為 D,當經過一個焦距為f的透鏡時,平行光會在焦點聚焦,而聚焦點的 光斑(Airy disk)大小為w0,則:
D f w
02
π
= λ
(2.14)若是使用此光束的系統,其空間上的解析力就是光斑的直徑2w0。
圖2.5 高斯光場分佈聚焦點大小以及景深示意圖
由高斯分佈的光場強度去推導,可以得到光場在空間中的強度分佈以
低數值孔徑的透鏡,雖然在橫向解析力較差,但可減少影像失真的程 度,若要得到高橫向解析力,又不想讓影像失真的情況太嚴重,在掃 描的時候可使用高倍率物鏡但需要讓光束的聚焦點隨著掃瞄的深度 一起移動,也就是動態聚焦的原理[22]。本論文中,由於以斷層影像 為研究重點,因此在樣品前使用低倍率(10 倍)或低數值孔徑(N.A.
=0.25) 的物鏡將雷射光束聚焦以減少影像失真的程度。
2.2 頻域光學同調斷層攝影術(Spectral domain OCT)
頻域光學同調斷層攝影術(Spectral domain OCT,SD-OCT)的實驗 架構與時域光學同調斷層攝影術(Time domain OCT,TD-OCT)的實驗 架構很相似,主要有兩項差別,第一項是SD-OCT 參考端的反射鏡是 不動的,因為SD-OCT 不需要有掃瞄機制來改變參考端與樣品端的光 程差以取得樣品軸向深度的訊號,而 TD-OCT 需要有掃瞄機制,第 二項是 SD-OCT 的接收端是光譜儀,而 TD-OCT 的接收端是光偵測 器,圖2.6 與圖 2.7 分別為 TD-OCT 與 SD-OCT 基本架構。
圖2.6 TD-OCT 系統架構
圖2.7 SD-OCT 系統架構
如圖 2.7 所示,頻域光學同調斷層攝影術(SD-OCT)主要是利用 寬頻光源,搭配十字型麥克森干涉儀(Michelson interferometer),和頻 譜儀(Spectrometer)加上 CCD 偵測器陣列量測干涉頻譜的技術,在圖 2.7 中所使用的低同調(Low coherence)的寬頻雷射光源為超亮發光二 極體(SLD),寬頻光經由分光鏡(Beam spliter,BS)被分成兩道光,一 道光到達參考端(reference arm),並且由參考端靜止的反射鏡反射參 考光回接收端,一端到達樣品端(sample arm),樣品裡在不同深度有 不同反射光或散射光最後回到接收端,接收端同時接收到樣品端與參 考端的反射光而產生干涉訊號,頻譜儀(Spectrometer)是主要由光柵組 成,干涉訊號經由光柵分光打到不同的偵測器上,就可得到不同波段 的干涉訊號強度,即干涉頻譜,樣品不同深度的反射光與參考光干涉
會產生不同頻率的震盪(Oscillations),震盪的頻率與光程差成正比,
即在樣品裡軸向深度越深的反射光震盪的頻率越大,所以將這些頻域 的干涉訊號經過傅利葉反轉換後,就可得到時域上的干涉訊號,因此 就可得到樣品軸向的深度資訊。
2.3 掃瞄式光源之光學同調斷層攝影術(Swept Source OCT)
頻域光學同調斷層攝影術(Spectral domain OCT,SD-OCT)提供在 低散射器官接近理想的功效,例如眼睛(eye),但在某些組織上的應用 還是會被限制,例如在上皮組織(epithelial tissues)的研究。上皮組織 的研究是大部分人很感興趣的,因為人類有大多數的癌症都發生在表 面的組織層,例如線狀的中空臟器(lines hollow organs)和上皮組織 (epithelial tissues),線狀的中空臟器有結腸(colon)、食道(esophagus)、
乳腺(breast ducts)等,在上皮組織(epithelial tissues)有高密度的細胞器 (cellular organelles),例如線粒體(mitochondria)、細胞核(nuclei)、細胞 膜(cellular membranes)等,這些高散射介質會限制短波長光的穿透深 度,而頻域光學同調斷層攝影術(Spectral domain OCT,SD-OCT)使用 的是短波長範圍(小於 1000nm)的光源,因為 SD-OCT 偵測端是使用 矽(silicon-based)的 CCD 偵測器,這些偵測器無法操作在波長高於 1000nm 的範圍,因此 SD-OCT 在某些組織上的應用會被限制。要使 用OCT 成像於上皮組織(epithelial tissues)或一些非生物樣品,就需要 將 波 長 操 作 在 1000~ 1300nm 才能得到我們想要的高穿透深度 1~3mm。
另一種使用傅利葉偵測(Fourier domain detection)方式的掃瞄式
光源之光學同調斷層攝影系統(Swept source OCT systems),使用的光 源為快速頻率掃瞄的雷射光源(rapid frequency-swept laser source),偵 測端使用的是 GaAs 光偵測器,光源波長操作在 1000~1300nm,因 此掃瞄式光源之光學同調斷層攝影系統(Swept source OCT systems) 能成像在SD-OCT 不能成像的上皮組織(epithelial tissues)或一些非生 物樣品,且達到1~3mm 的高穿透深度。
掃 瞄 式 光 源 之 光 學 同 調 斷 層 攝 影 系 統 (Swept source OCT systems,SS-OCT)的架構與頻域光學同調斷層攝影術(SD-OCT)的架 構相似,主要的不同處有兩個地方,第一在於光源的不同,SS-OCT 使用的的是掃瞄式的雷射光源(Swept Laser Source),光源波長會隨著 時間變化,第二在於接收端偵測器的不同,SS-OCT 使用的是單一個 光偵測器,其架構如圖2.8 所示。
Computer : - Fourier transform - Image generation
A/D converter
BS Swept Laser Source
Mirror (static)
sample Z X
Photo-detector
A B C
A B C sample arm
reference arm
Z=0
Z=0
Fourier transform
圖2.8 SS-OCT 系統架構
第三章 實驗架構、原理與方法
本章將介紹實驗中所使用到的儀器、並簡介SS-OCT 系統,另外 說明實驗方法,如:量測生物樣品時所需要之準備。
3.1 實驗儀器與系統架構 3.1.1 光源
本實驗所使用的是掃瞄式光源之光學同調斷層攝影系統(Swept Source Optical Coherence Tomography,SS-OCT),而此系統使用的光 源為寬頻掃瞄式光源(Broadband Swept Laser Source),其規格如表3.1 所示。
表3.1 光源規格
此寬頻掃瞄式光源(Broadband Swept Laser Source)是用很快的速 度掃出一個很寬的波長範圍,其波長掃瞄速率大約為 20kHz,掃瞄寬 度為100nm,這使得 SS-OCT 系統有著 12μm(在空氣裡)的高縱向解 析度,其光源功率頻譜如圖3.1 所示。
Output spectrum of the laser.
The Broadband Swept Laser Source supports 20 kHz
wavelength sweeping rate with a 3 dB spectral bandwidth up to 100 nm, centered at 1325nm.
100nm
圖3.1 寬頻掃瞄式光源(Broadband Swept Laser Source)頻譜圖
3.1.2 SS-OCT 系統架構
本實驗所使用的是掃瞄式光源之光學同調斷層攝影系統(Swept Source Optical Coherence Tomography,SS-OCT),實驗架構大部分為 光纖結構,光源(Swept Laser Source,SLS)出來之後由光纖分光器 (Fiber coupler)分成兩條光纖(Fiber),光源有一小部分從其中一條光纖 進入到馬赫-詹德干涉儀記錄器(Mach-Zehnder Interferometer clock,
MZI clock),此部分最後會得到 MZI clock signal(MZI SIG.)進入平衡 式偵測器(balanced detector,BD)再進入 DAQ 的 CH1。光源的主要部
分則進入另外一條光纖到一個光纖式的麥克森干涉儀(Michelson interferometer),由其中分光比為 50/50 的寬頻光纖分光器(Fiber coupler)將光源分為兩部分,一部份進入到參考端(Reference arm),參 考端的光源先進到自由空間(free space)再打到靜止的反射鏡,再將光 源打回接收端的平衡式偵測器(balanced detector,BD),另一部份進 入到樣品端(Sample arm),樣品端的光源進到自由空間(free space)之 後經由雙軸 XY galvo 掃瞄鏡子打在樣品(Sample)上,最後將樣品的 反射光打回接收端的平衡式偵測器(balanced detector,BD),參考端 與樣品端的光源會在接收端產生干涉訊號,即 OCT signal(OCT SIG.),此主要 OCT 訊號進入 DAQ 的 CH2,因為光源為掃瞄式光源 (Swept Laser Source,SLS)所掃瞄的光源頻譜會有間距不一樣的情 形,所以最後得到的OCT signal(OCT SIG.)必須在頻譜上作校正,這 裡即是利用CH2 接收到的 MZI clock signal(MZI SIG.)來對 CH1 接收 到的OCT signal(OCT SIG.)進行頻譜的校正,將校正後的干涉頻譜作 傅利葉轉換(fast Fourier transform,FFT)即可得到樣品軸向深度的反 射訊號。
由表3.1可知,此係統的軸向掃瞄速度(Axial scan rate)為16kHz,
此即為一維(1D)訊號的掃瞄速率,而樣品經由雙軸XY galvo 掃瞄鏡 子的掃瞄之後,可以產生二維(2D)與三維(3D)的圖形,其二維的成像 速率在像素(pixels)為512×512時為每秒25張,其詳細規格如表3.2所 示。
表3.2 成像規格
3.2 樣品處理與量測 3.2.1 果蠅身體結構簡介
果蠅心臟(或稱背血管)位於背中線,被表皮所包覆著,如圖 3.3 所示,其位置由胸節(T2)到腹節(A7),主要功能為提供營養、循環、
過濾血淋巴液,果蠅心臟共由 104 個不同類群及功能的心臟細胞所組 成,是一條會規律跳動的管狀構造,前端不會收縮,功能較類似血管,
故稱為主動脈(aorta);後端具有規則收縮功能以及類似瓣膜構造稱為 ostiae 的結構,故後端稱為心臟(heart),如圖 3.4 所示。在心臟每一次 收縮(跳動)中,血淋巴液(即果蠅的血液)從組織中經由 ostiae 流進心 臟(heart)的部位,前端則有血淋巴液自主動脈(aorta)流出背管進到組 織中,完成在果蠅開放式循環系統的功能。幼年之果蠅表皮呈半透 明,成年果蠅個體大約 2~3 釐米且表皮變成不透明,而其背血管(即 主動脈與心臟)位置由胸節到腹節,被表皮所包覆著,需要在具有高
度散射特性生物體內仍能取得觀測影像的斷層掃描技術。
Heart Heart aorta
aorta
(a) (b)
圖3.3 果蠅身體透視結構圖,(a)側視圖、(b)上視圖,紅色箭頭所指為果 蠅的心臟(heart),藍色箭頭所指為果蠅的主動脈(aorta),圖片修改自文獻
[27]。
圖3.4 果蠅心臟透視圖,A..為將果蠅切開後使用 green fluorescent protein (GFP) (1029-Ga4/UASGFP)的方法來觀察果蠅的心臟型態
、B.為示意圖,圖中左半部為皆為果蠅主動脈(aorta),右半部皆為果蠅心 臟(heart),圖片修改自文獻[28]。
3.2.2 果蠅培養
在試管底部放置食物,再將果蠅放進試管,試管口用棉花塞住,
如此讓空氣能夠進出,如此將試管放在25℃的恆溫環境下培養果蠅,
果蠅的生命週期大約為七到九週,我們採用隔週量測,每個種類,公 的跟母的各量測 1、3、5、7 週,每次量測 20 隻果蠅,每隻量測 30 秒,按照如此計算,一個種類總大約共需要量測160 隻果蠅。
3.2.3 果蠅處理與活體量測
果蠅只要接觸到二氧化碳(CO2)就會昏迷大概 5 到 10 分鐘,所以 先將果蠅用二氧化碳(CO2)迷昏,然後再將果蠅放在載波片上並且用 果凍膠固定,如用此法量測,量測時因為果蠅呈半昏迷狀態,所以身 體還是會一直動,如此便會造成在處理data時很多的不便,所以將果 蠅用二氧化碳(CO2)迷昏之後,先用麻醉劑將果蠅麻痺,我們採用的 麻醉劑為Fly Nap,從文獻[29]中知道,此麻醉劑幾乎不會影響果蠅心 臟的跳動,它可以使果蠅的身體不會動,麻醉劑Fly Nap是用氣體的 形式麻醉果蠅,只要讓果蠅接觸Fly Nap大約 5 到 10 分鐘,果蠅就能 被麻醉半小時左右,此時果蠅心臟會正常跳動,但身體卻不會動,這 時再將果蠅放在載波片(slide)上並且用果凍膠(Jelly glue)固定住果蠅 (Drosophila)的翅膀,如圖 3.5(b)所示。
將果蠅如圖 3.5(b)所示固定好之後,將此樣品放在掃瞄式光源之 光 學 同 調 斷 層 攝 影 系 統 (Swept Source Optical Coherence
Tomography,SS-OCT)的樣品端即可開始量測,如圖 3.5(a)所示。
slide
Jelly glue Drosophila
Fiber
C-scanning
translation stage slideslide
Jelly glue Drosophila
Fiber
C-scanning translation stage
slide
Jelly glue Drosophila
slide
Jelly glue Drosophila
(a) (b)
圖3.5 (a)果蠅量測示意圖,(b)果蠅固定結構圖,將果蠅放在載波片(slide) 上並且用果凍膠(Jelly glue)固定住果蠅(Drosophila)的翅膀。