第三章 實驗結果
第三節 SRM 及 SRM-HtrM 之移植
嗜鹽古生菌 (H. salinarum) 僅具有 SRI 及 SRII 兩種 SR,因此我們將可感受 綠光波段的 SRM 及 SRM-HtrM 移植入其中,使其成為功能獲得型菌株。由於 H. salinarum 的質體基因轉殖方法相對較成熟,加上目前對於嗜鹽古生菌的基因 體編輯的研究較少,並且較難執行,我們以 Polyethylene glycol 添加的方式,將 HmSRM 及 HmSRM-HtrM 複合體之基因放於 bop promoter 後 (vector: pJS005),
並接上六個His 的標記,轉入嗜鹽古生菌 (H. salinarum) 中。再以嗜鹽古生菌的 生長抑制劑 4 µg/ml mevinolin ,篩選出候選轉形株。此篇章確認 SRM 及 SRM-HtrM 在 H. salinarum 轉形株細胞上的表現及功能。
III-2.1 DNA 之確認
為了確認篩選出來的Hs 轉形株是否帶有送入的 SRM 及 SRM-HtrM 基因,
首先以兩段基因頭尾之引子 (forward and reverse primer) 進行菌落 PCR。結果顯 示,我們所篩選並保存之轉形菌株帶有送入的質體基因 (圖 27)。
III-2.2 蛋白質表現確認
由Anti-His 抗體所做的西方墨點法,確認轉形株表現了 SRM 及 SRM-HtrM 蛋白質(圖 28)。然而, SRM 在 Hs 上的表現量相較於 SRM-HtrM 少很多,猜 測為缺乏 HtrM 的伴護下, SRM 在細胞膜上的穩定性會下降。
圖 27、 H s 轉形株的菌落 培養至stationary phase 後,細胞膜 fraction 的染色結果。由於,訊號的片段過於
III-2.3 SRM 功能性測試
膜蛋白質在界面活性劑 (detergent, e.g. DDM) 及磷脂 (phospholipid) 等不 同環境下,其物理及生物化學特性往往會有一些差異。因此,我們將表現 SRM 及 SRM-HtrM 的 H. salinarum 之細胞膜純化出來,並做紫外光/可見光波譜的分 析 (圖 29)。相較於 H. salinarum 的細胞膜溶液,HsSRM及HsSRM-HtrM的細胞膜於 大約480 及 500 nm 部分的吸收有相對明顯的上升 (視該吸收峰與~550 nm 的吸 收峰之比值)。並且,在 300-400 nm 的波段,兩者的吸收峰,相較於 H. salinarum_wt,
都有顯著的上升,可能跟SRs 在光照環境下培養,導致的 M-state 累積有關。
圖29、H. salinarum 野生株及轉形株細胞膜的可見光吸收波譜。a 每個樣品的吸 收波譜藉由H. salinarum_wt 750 nm 的吸收值 (視為細胞膜的定量) normalized,
位於550 nm 的波峰,推測為 HsBR 的吸收峰。b 將標準化後的可見光波譜扣除 H. salinarum_wt,可以得到各波段吸收值之消長。
另外, SRM 在有無傳導元結合的條件下,光週期動力學對 pH 值敏感度差 異之現象,同樣可以在 Hs 轉形株的細胞膜上觀測到 (圖 30)。不論在界面活性 劑形成的 bicelle,或者 Hs 的細胞膜上,都可以觀測到 SRM-HtrM 在弱酸及弱 鹼性下,光週期動力學的高穩定度。同時,再次確認 SRM 在 Hs 轉形株中的表 現,並且傳導元 HtrM 與其有作用。
圖30、SRM 及 SRM-HtrM 於不同條件之光週期分析。測量 503 nm 的吸收值在 飛秒雷射 (532 nm; 2 ns pulse) 刺激後的變化,分析 SRM 及 SRM-HtrM 在 Bicelle 環境及H. salinarum 細胞膜上的光週期。 a, b SRM 及 SRM-HtrM 在由界面活 性劑 DDM 所形成的 bicelle 環境中,其光週期動力學在不同 pH 值下之差異。
c, d SRM 及 SRM-HtrM 在 Hs 細胞膜上,其光週期動力學在不同 pH 值下之差 異。