4.欲進行中藥製劑中防己指紋圖譜比對，應先進行藥材之 MRM 預篩檢試 驗(MRM pre-screen macro-method)，檢視其中可能含防己種類後，再進 行防己藥材MRM 巨集指令(Fangchi herbal MRM screen macro-method)
或防己藥材鑑定試驗之巨集指令(Fangchi herbal identity macro-method) 分析，獲得之子代離子質譜圖，與LC/MS /MS 指紋質譜圖庫作比對，
將可獲致確切之結果。Fangchi herbal MRM screen macro-method 分析 為選擇性的監測親代及子代配對離子裂片，可屛除其他離子之干擾，
提升各channel 之靈敏度。同時可比對各管道波峰滯留時間(peak maxima retention time)與標準藥材是否相符，其鑑定結果均有數據之佐 證，因此可謂是最客觀之檢驗方法。
5 .藥材內成分常因採收季節、炮製方法、使用部位等之不同，其所含成分 均有些差異，不同批之藥材亦難完全相同，因此藥材鑑定結果以藥材 比對相似度(Herbal similarity)之百分比作表示較符合實際。
6.由本研究中發現 LC/MS/MS 指紋圖譜分析法應用之優勢如下：
6-1.中藥材內容成分複雜，未知成分尚多，又鮮能取得對照標準品，若以 HPLC 鑑定則需與標準品比對 retention time (RT)，甚至於需以標準添 加方式證實該波峰無誤，若無標準品之比對，兩個RT 相同之波峰，則 難判斷其是否為相同成分之波峰。但LC/MS/MS 指紋圖譜分析法，可 藉由標準藥材指紋質譜圖之建檔後，再進行鑑定藥材多種成分之子代 質譜圖分析，並與指紋質譜圖譜庫作比對，即可獲致確切之檢結果，
因此未必完全瞭解其中植物成分，亦無需對照標準品比對仍然可以鑑 定。
6-2.傳統中藥材之鑑定常以 HPLC 分析法進行藥材比對，其先決條件為：
6-2-1. LC 幫浦精密性及穩定性需維持最佳狀況，幫浦輸出移動相之流速 穩定，才能維持波峰滯留時間之一致性。
6-2-2.分析所用管柱之理論板數需維持一定，才能獲得前後一致之波型以 方便比對。但一般分離管柱常隨使用時間之累積而理論板數遞減，均
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比對機會，難以正確比對藥材。LC/MS/MS 指紋圖譜分析法主要比對 指紋質譜圖譜，因此較無上述之顧慮。
6-3.植物於代謝分化過程中，產生許多化學結構相近成分或類緣成分，其 UV 圖譜均極為相似，即使應用 PDA detector 亦難以分辨，且植物 於代謝分化時段不同，生成一次或二次代謝產物之濃度不同，均造 成HPLC 指紋圖譜波型大小起伏之變化，均影響比對之相似性。
6-4.天然植物成分複雜，欲分離其中成分常需使用含 Buffer 或 Ion pair 之 移動相以促進分離效果，因此分析時間常超過1 小時；然而 LC/
MS/MS 以監控離子裂片之質核比(m/z)方式分析，只要化學結構及 m/z 不同，則無相互干擾之虞，因此成分間無需很好之分離，既省 時又精確。本分析法中移動相為0.5mL/min，分析時間 20 分鐘內即 可完成，比一般HPLC 消耗溶媒大為減少，符合環保之要求。
6-5.LC/MS/MS 指紋圖譜分析，其比對圖譜為分子裂解後搜集所有之分子 裂片之集合圖譜，除鏡像異構物(enantiomorph)外，只要分子化學結 構不同者，均有不同之質譜圖，再配合LC 之分離，因此較無干擾 之虞。
7. 由上述市售中藥製劑之調查研究發現，當今藥廠之品管人員對於防己 藥材基源辨識能力應予加強，政府對廣防己既已禁用，藥品製造業 者，更應謹慎，別讓過去庫存之廣防己混雜於其它防己中，作好原 料把關，既可直接維護本身藥廠之商譽，亦可間接保護消費者之健 康。