• 沒有找到結果。

第二章 研究方法…

2.2. 泛函數、基組說明

2.2.2 基組

進行密度泛函理論計算時,必須選定一個基底函數組(basis set,簡稱基組)

用來表達分子軌域的波函數。所謂的基組,是利用數學的方式來描述一個系統中 所包含的軌域,更可進一步結合電子波動函數以進行理論計算,同時必需符合每

個電子不同的邊界條件(亦即每個電子只能出現在空間中的特定區域)。我們通

常是利用高斯函數的線性組合(linear combination)來描述分子軌域。一般而言,

較大的基組群對電子的空間所在限制條件較少,也比較能符合量子理論中電子在 任何空間位置皆可能出現的假設。因此,較大的基組群能得到更接近分子軌域性 質的計算結果,但相對的所需要算時間較長。

在本研究中,我們使用 Pople66-77等人為代表所提的基底函數組,我們選用

6-311+G(d,p)、6-311++G(d,p) 74-76、6-311++G(2d,p)、6-311++G(2d,2p) 74-77。 我們以本研究使用的 6-311++G(d,p)為例來說明。6-311++G(d,p),是計算選擇以 擴大基組的一種方法,目的是藉由增加每個原子中的基底函數,以改變分子軌域 的大小。本研究所使用到的基組有以下三類:

(1111))))分離價殼層基組分離價殼層基組分離價殼層基組分離價殼層基組(((split valence basis set(split valence basis setsplit valence basis setsplit valence basis set))))

這是擴大基組的一種方法,目的是藉由增加每個原子中的基底函數,以改變 分子軌域的大小。如本研究所採用的 6-311++G(d,p)73-75-76基組中的 6-311G 就 是屬於分離價殼層基組,它是由 Pople75,78所提出的基組類型,其形式為 k-nlmG,

G 代表高斯函數,k 是指內殼層(inner shell)軌域使用了 k 個初始高斯函數 (primitive Gaussian)組成內殼層軌域(inner shell orbital),而價殼層(valence shell)

軌域則由三個基底函數組成,而這三個基底函數則分別由 n、l 及 m 個初始高斯 函數所組成。故 6-311G 基組表示:內殼層軌域用 6 個初始高斯函數組成一個基 底函數,價殼層軌域包含三個基底函數,每一個基底函數分別由 3 個、1 個和 1 個初始函數(primitives)所組成。

((

((2222))))擴散函數擴散函數擴散函數擴散函數((((diffuse function)

擴散函數與標準價殼層軌域的大小相較而言,為一個擁有 s 軌域型態或 p 軌 域型態的放大函數,這些函數能使軌域擁有較大的空間以供電子佔據,因此擴散 函數對於描述電子距離原子核較遠的系統非常重要,尤其是距離原子核較遠處有 明顯電子密度時。擴散函數在基組中以「+」號表示,如 6-311+G 是在 6-311G 分離價殼層基組中對非氫原子的重原子加入擴散函數,6-311++G 則是除了將擴 散函數加進非氫原子的重原子外,並針對氫原子加入擴散函數。

(3333))))極化基組極化基組極化基組極化基組((((polarized basis set))))

極化基組是將高角動量(angular momentum)的軌域加入所描述的軌域中,

以改變分子的形狀,而此角動量超越了每一個原子在基態所佔據的軌域,加入極

化基組的目的,在於希望整個基組能更近似真正的分子軌域性質。以本研究HBCl2 所使用6-311++G(d,p)為例,6-311++G(d,p)中的「d,p」表示加入極化函數,第 一個d號表示對「非氫」原子中加入更高階的角動量函數,在HBCl2分子中,「非 氫」原子為硼與氯原子,因此對其加入一組d形式的極化函數。第二個p號代表對 每一個氫原子中加入一組p形式的極化函數。另外,本研究使用了6-311++G(2d,p) 基組,其中的(2d,p)裡的「2d」表示硼與氯原子加入兩組d形式的極化函數。

另外,我們也使用以 Dunning79-88等人所提的 VDZ、AVDZ、VTZ、

AVTZ 基底函數組,也就是 cc-pVDZ79-88、cc-pVTZ79-85,89,90、aug-cc-pVDZ

79-82,84,85,87,88

、aug-cc-pVTZ79-80,82,85,87,88

這四個基底函數組的簡稱。cc-pVDZ

(VDZ)和 cc-pVTZ(VTZ)這兩個基底函數組是已經刪除重複的函數,以便增 加計算效率,而且這兩個基底函數組已經包含極化函數。在 cc-pV*Z 基底函數關 鍵字之前,加上 aug-前置字串,表示增加擴散函數80,86。也就是說,在

aug-cc-pVDZ(AVDZ)和 aug-cc-pVTZ(AVTZ)中,除了極化函數,還加上擴 散函數。

2.3 2.3 2.3

2.3 二氯硼烷分子與正離子的計算 分子與正離子的計算 分子與正離子的計算 分子與正離子的計算

二氯硼烷分子及正離子在基態之平衡結構(equilibrium structure)與正規振 動模式(vibrational normal modes)之頻率,我們利用 Molpro(54)套裝軟體,使用 B3LYP(56)的方法,以分裂價層基組中的 6-311+G(d,p)、6-311++G(d,p)、

6-311++G(2d,p)、6-311++G(2d,2p)、VDZ、AVDZ、VTZ、AVTZ 進行計算。首先 進行二氯硼烷分子及正離子的幾何優選(geometry optimization),幾何優選之目 的在尋找具有穩定能量的分子結構,或者說找尋分子位能曲面(potential surface)

上的穩定點(stationary point)。在進行分子幾何優選計算的過程中,分子的幾何 形狀如鍵長、鍵角、二面角等會持續調整,直到計算收斂為止。

幾何優選過程有完全幾何優選(Full optimization)和部分幾何優選(Partial

optimization)兩種。在進行完全幾何優選時,是對所有指定的變數進行優選計算 以找出能量最低的結構;而部分優選則只針對其中的一些變數進行優選計算,換 句話說,我們需要在幾何優選過程中固定一些幾何參數,來找出在能量最低點的 結構。而本研究採用完全幾何優選的計算策略,原因在於二氯硼烷為平面分子,

硼原子(1s22s22p1)的一個2s軌域和兩個2p軌域混成而得到三個sp2軌域,理論上 其夾角為120°,再與氫、氯原子鍵結形成平面三角形的結構,屬於點群中的C2v

對稱。但在文獻上所查出資料顯示,事實上和理論並不是如此相符,因此我們輸 入鍵長、鍵角,讓其自由變化。

而在二氯硼烷正離子的計算上,因為目前仍未找到相關文獻資料,所以我們 也採用完全幾何優選的計算策略,亦即鍵長、鍵角皆可以自由變化。

此外,我們也依據幾何優選的結果,計算二氯硼烷分子和正離子其振動正規 模式的頻率。振動正規模式頻率有另一個重要的意義是幾何優選的計算結果,只 代表找到位能曲面上的穩定點,除了可能是區域中之極小值(Local minimum),也

有可能為區域中的最大值(Local maximum)。因此可以利用振動頻率計算之結果來 判斷,如果振動正規模式的頻率值皆為正值,則代表此種分子結構為位能曲面上 的極小值,此結構為分子的一個平衡結構。若有一個頻率為虛數(imaginary

value),則代表這個幾何結構為位能曲面上的過渡態。

在本研究裡,關於幾何優選以及振動頻率的計算上,都是透過國家高速計算 中心的高速電腦進行數值計算。另外,透過能量的計算,我們可以得到這些分子 的游離能,及這些分子在分解反應時所需要的能量,並藉這些數值與實驗數據做 比對。

2.4 2.4 2.4

2.4 法蘭克 法蘭克 法蘭克 法蘭克- -- -康登因子 康登因子 康登因子( 康登因子 ( (Franck ( Franck Franck Franck- -- -Condon factor Condon factor Condon factor) Condon factor ) ) )

為了模擬二氯硼烷分子的光電子光譜,我們需要計算兩電子態間的法蘭克-康登因子。在法蘭克-康登因子(91-93)的計算上,我們採用Chang(94)於2005年所推 導出來的公式。Chang使用的計算方法考慮了電子被激發時,位能面可能發生位 移和扭曲的情況。我們使用從始計算,設定幾何優選所得到的結構和頻率,計算 兩電子態間的幾何結構的改變(∆Q),以∆Q 和振動頻率來計算法蘭克-康登因 子。

為了簡化法蘭克-康登因子的計算,我們做了以下兩個假設:

(1)基態和激發態的位能面都是諧和振子(harmonic oscillators)。

(2)各振動模式皆互相獨立,忽略振動模式混合(mode-mixinging),亦即忽略

達斯親斯基效應(Duschinsky effect)。

其中,qqqq為質量加權之直角座標(mass-weighted Cartesian coordinate)矩陣,L’為 位移矩陣(displacement matrix)。



(Plancks constant)

(polyatomic molecules)的光譜,是一個很好的工具。

2.5 2.5

2.5 2.5 光譜模擬 光譜模擬 光譜模擬 光譜模擬

在計算出兩電子態間的法蘭克-康登因子之後,我們使用Lorentzian

line-shape function 來進行光譜模擬。我們假設每一個躍遷的譜線,都可以用

一個羅倫茲函數g (ν)(Lorentzian function)(95)來表示,其公式如下:

第三章 結果與討論

本章分三節來呈現二氯硼烷分子、正離子和法蘭克-康登因子的計算結果,

以及模擬光譜與實驗光譜的比對,並探討二氯硼烷的游離能及它的可能反應途 徑。第一節探討二氯硼烷分子與正離子的平衡結構、振動頻率及轉動常數。第二 節探討二氯硼烷分子和二氯硼烷分解產物的法蘭克-康登因子計算結果,及模擬 的光電子光譜。第三節為二氯硼烷分子電離成離子基態的模擬光譜與實驗之光電 子光譜的比對。第四節探討二氯硼烷與二氯硼烷分解產物的游離能。第五節則是 探討二氯硼烷分子及二氯硼烷的分解產物之反應途徑和能量。

3.1 二氯硼烷分子與正離子的計算

3.1.1 3.1.1 3.1.1

3.1.1 二氯硼烷分子平衡結構分子平衡結構分子平衡結構分子平衡結構

表一列出二氯硼烷分子鍵長、鍵角的計算值與實驗值。從表一的資料裡,我 們得知實驗測得 B-H 鍵的鍵長為 118.9 pm,B-Cl 鍵的鍵長為 172.8 pm。比較理 論計算與實驗的差異,發現 B-H 鍵鍵長在不同基組與實驗值的誤差大約是在-0.79

%~+0.56%,以 AVDZ 基組的結果最接近實驗值;B-Cl 鍵鍵長在不同基組與實 驗值的誤差大約是在+1.0%~+1.6%,以 VTZ 基組的結果最接近實驗值。

表一 HBCl2分子幾何結構在不同計算基組與實驗值的差異a 基組 B1H2 B1Cl3 B1Cl4 ∠H2B1Cl3 ∠H2B1Cl4 實驗值b 118.9 172.8 172.8 120.0∘∘∘ 120.0∘∘∘ 6-311+G

(d,p) 118.10 174.96 174.93 119.62 119.64 6-311++G

(d,p) 118.10 174.96 174.93 119.61 119.63 6-311++G

(2d,p) 118.09 174.69 174.65 119.56 119.59 6-311++G

(2d,2p) 117.96 174.70 174.66 119.56 119.59 VDZ 119.56 175.58 175.55 119.68 119.70 AVDZ 119.07 175.57 175.54 119.70 119.71 VTZ 118.05 174.56 174.53 119.53 119.55 AVTZ 118.04 174.58 174.55 119.54 119.56

a鍵長單位為 pm,鍵角單位為度,計算方法為 DFT 之 B3LYP

b參考文獻 12

在表二,我們列出二氯硼烷正離子在不同計算基組的計算結果。關於二氯硼 烷正離子的實驗資料甚少,但與二氯硼烷分子比較,我們可以發現HBCl2

的BCl 鍵長變短,BH鍵則變長,∠HBCl會縮小 ,而∠ClBCl會擴大(如圖一)。

表二 HBCl2

幾何結構在不同計算基組之幾何優選之比較a

參數 B1H2 B1Cl3 B1Cl4 ∠H2B1Cl3 ∠H2B1Cl4 6-311+G

(d,p) 126.77 168.74 168.78 108.33 108.20 6-311++G

(d,p) 126.68 168.78 168.79 108.33 108.25 6-311++G

(2d,p) 126.97 168.50 168.52 107.94 107.86 6-311++G

(2d,2p) 126.72 168.53 168.55 107.99 107.90 VDZ 128.05 169.54 169.56 108.45 108.35 AVDZ 127.93 169.56 169.59 108.29 108.20 VTZ 126.89 168.43 168.46 107.97 107.88 AVTZ 126.91 168.44 168.46 107.95 107.86

a鍵長單位為 pm,鍵角單位為度,計算方法為 DFT 之 B3LYP

HBCl2分子結構

HBCl2正離子結構

圖一 HBCl2分子與正離子結構

在表三,我們列出HBCl和HBCl在不同基組的計算結果。在這部分,我們缺 乏HBCl和HBCl的實驗數據做佐證,但從不同基組的計算結果,我們可以發現:

當HBCl游離成HBCl時,BH鍵長會稍稍變短1~2 pm,BCl鍵長會縮短12~14

pm,而∠HBCl會從原本的123∘擴大為180∘,成為線型結構。(如圖二)。其造成 的原因,應該是HBCl形成HBCl時,HBCl由sp2的混成軌域轉變成sp的混成軌域 所致。

表三 HBCl 和 HBCl+幾何結構在不同計算基組計算結果與實驗值的比較a

表三 HBCl 和 HBCl+幾何結構在不同計算基組計算結果與實驗值的比較a

相關文件