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第二章 研究方法

2.1 從始計算

從始計算35是指從事量子計算時,除了使用基本的物理常數(例如:蒲朗克 常數、光速、電子或原子核的質量等)和薛丁格方程式(Schrödinger equation)外,

不加入任何假設,也不需要加入任何實驗上所獲得的參數來簡化步驟,因此在理 論上最為嚴謹,在學術上具有重要的地位,可用於預測分子的結構、能量和振動 頻率等物理量和分子特性。但因從始計算的計算量龐雜,所以只適用於計算較小 的分子系統,而本研究的 1,1-二氟乙烯分子只有六個原子,32 個電子,尚屬於 適用從始計算研究方法的範圍,因此本研究採用從始計算方法進行研究。

2.1.1 密度泛函數理論簡介(density function theory, DFT)

密度泛函數理論是由Hohenberg 和 Kohn 兩人所建立,他們證明了分子基態 的電子能量與其電子密度有關。DFT 理論與傳統的從始計算的不同之處,在於傳 統的從始計算中,一個系統只要知道其所含的原子核及電子數,就可以藉由薛丁 格方程式而知道這個系統的性質,但薛丁格方程式有 3 × N 個變數(N 為粒子 數),因此方程式就變得極為複雜;但 DFT 理論中的電子密度僅有三個變數,

與系統大小無關,問題因此簡單許多。

DFT 理論中,單一行列式的正確交換能量(exact exchange energy)是以交換

-相關泛函數的廣義公式代替,意即 DFT 模型的名稱是由交換和相關泛函數的 名稱組合而成,如LYP 是描述 Lee、Yang 和 Parr 泛函數,本研究所採用的 B3LYP

36則是指使用Becke’s 三參數交換泛函數與 LYP 相關泛函數法做計算。

2.1.2 基組(basis set)

進行從始計算時,必須先選定一基底函數組(basis set,簡稱基組)用來表達 分子軌域之波函數,基組是一個系統中所包含軌域的數學描述方式,可進一步結 合近似全部的電子波動函數以進行理論計算。基組必需符合每個電子不同的邊界 條件(亦即每個電子只能出現在空間中的特定區域)。較大的基組群對電子的空 間所在限制條件較少,更能符合量子理論中電子在空間中任何位置皆可能出現的 假設,因此,較大的基組群能得到更近似分子軌域性質的計算結果,但相對的所 需計算時間較長。

通常基組是利用高斯函數的線性組合(linear combination)來描述分子軌域,

基組是由一群基底函數(basis function)組合而成,而基底函數則由許多初始高 斯函數(primitive Gaussin)組合而成。本研究所使用到的基組有以下三類:

分離價殼層基組(split valence basis set)

這是用來擴大基組的一種方法,目的是藉由增加每個原子中的基底函數,以 改變分子軌域的大小。如本研究所採用的6-311++G(d,p) 37-39基組中的6-311G 就 是屬於分離價殼層基組,它是由Pople 40-41所提出的基組類型,其形式為 k-nlmG,

G 代表高斯函數,k 是指內殼層(inner shell)軌域使用了 k 個初始高斯函數組成 一個基底函數,而價殼層(valence shell)軌域則由三個(nlm)基底函數組成,

而這三個基底函數則分別由n、l 及 m 個初始高斯函數所組成。故 6-311G 基組表

示:內殼層軌域用6 個初始高斯函數組成一個基底函數,價殼層軌域包含三個基 底函數,每一個基底函數分別由3 個、1 個及 1 個初始高斯函數所組成。

極化基組(polarized basis set)

極化基組是將角動量加入所描述的軌域中,以改變分子軌域的形狀,而此角 動量為超越每一個原子在基態下所需的描述,加入極化基組目的在希望整個基組 能更近似真正的分子軌域性質。極化基組在第二列元素加 d 函數,在氫原子則加 p 函數,如 6-311++G(2d,p)表示在 6-311++G 外,對非氫的重原子加進兩組 d 函數,

對氫原子則加進一組p 函數。

擴散函數(diffuse function)

擴散函數與標準價殼層軌域的大小相較而言,為一個擁有s 軌域型態或 p 軌 域型態的放大函數,這些函數能使軌域擁有較大的空間以供電子佔據,因此擴散 函數對於描述電子距離原子核較遠的系統非常重要。擴散函數在基組中以「+」

號表示,如 6-311+G 是在 6-311G 分離價殼層基組中對非氫原子的重原子加入擴 散函數;6-311++G 則是除了將擴散函數加進非氫原子的重原子外,並針對氫原 子加入擴散函數。而本研究採用的 6-311++G(2d,p)’,是指在 6-311++G(2d,p)基組 上,針對碳原子的s p 軌域,再加入低指數(0.013193)的擴散函數。

2.2 1,1-二氟乙烯分子與正離子的計算

本研究選用Molpro 2002 42套裝軟體中含電子相關之DFT/B3LYP 方法並配合 6-311++G(d,p)、6-311++G(2d,p)及 6-311++G(2d,p)’三種基組進行 1,1-二氟乙烯 分子與正離子計算。首先進行1,1-二氟乙烯分子與正離子的幾何優選(geometry optimization),進行幾何優選過程中,分子的幾何形狀會持續調整,直到達成位

能曲面上的穩定點為止,而幾何優選可採用的策略區分為完全幾何優選(full optimization)及部分幾何優選(partial optimization)計算,本計算選擇以部分幾 何優選的策略進行計算,意即在計算中,只針對其中部分的變數進行優選計算以 找出能量最低的結構。由於 1,1-二氟乙烯為平面分子,在點群中屬 C2V對稱,因 此初始輸入時我們將二面角(dihedral angle)H4C1C2-C1C2F3及 F4C2C1-C2C1F3設 為180.0°,而二面角 H6C1C2-C1C2F3則設為0°(圖一),以簡化計算程序,其中 H4C1C2-C1C2F3代表的意義為 H4C1C2三個原子所構成的平面與 C1C2F3平面之間的 角度。鍵長、鍵角方面,由於輸入數值越接近實驗值或該分子的能量最低點,計 算越容易達到收斂,因此我們採用實驗值作為初始輸入數值。

我們也根據幾何優選的計算結果,計算其正規振動模式的頻率。計算中我們 可找到位能曲面上的極值,但是這些極值除了可能是區域中之最低能量點(local minimum),也可能是鞍點(saddle point),因此我們根據頻率值作為判斷的依據,

若頻率值為正值,則代表此種分子結構為位能曲面上的極小值,也就是分子的一 個平衡結構;若頻率值出現虛數(imaginary value),則代表這個幾何結構為位能 曲面上的鞍點。

2.3 1,1-二氟乙烯激發態的計算

1,1-二氟乙烯激發態的計算,我們仍利用國家高速網路與計算中心的 Molpro 2002 程式,選擇較高階的 6-311++G(2d,p)’基組,以多態平均的 CASSCF 及 MRCI

(multireference configuration interaction)方法進行計算。四個最低能量單重激發 態的幾何結構優選與振動頻率以多態平均方式處理,在此我們採用(4,13)的活 躍空間(active space)。激發態的垂直激發能(vertical excitation energy)與絕熱 激發能(adiabatic excitation energy)亦以 SA-CASSCF 及 MRCI 方法獲得。計算 中我們捨棄使用對稱性,在計算時設定使一個氟原子隆起分子平面0.1°,如此所

有的計算皆在C1點群(point group)下進行。

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