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2.2、實驗方法

將細胞平均培養於有蓋玻片放置的 6- well plate 槽內,隔天吸去 培養液,用 PBS 洗滌兩次去除殘留的培養液,以福馬林固定(fixing),

3.1 日本腦炎抵抗干擾素反應即訊息傳遞的機制

3.1.1 日本腦炎病毒感染後,可以抑制第一型干擾素反應 將 BHK-21 細胞單層平鋪培養在 6-well 盤中,再共同轉染 pISRE-luc 及 pRunilla-luc(9:1) ,以 Runilla 作為 internal control,,隔天分盤於 24-well 盤。將細胞分為先感染病毒後治療 干擾素,以及先治療干擾素後感染病毒兩組。先感染病毒:感染病毒 一小時後,再治療第一型干擾素四小時,再測冷光值。結果顯示,無 論是以α-干擾素或是β干擾素來治療 BHK-21 細胞,在先感染日本腦 炎病毒後治療干擾素的實驗中,可以明顯發現細胞受到日本腦炎病毒 的感染,可以抵抗第一型干擾素的治療。其 ISRE 活性所表現的冷光 值被抑制(Fig. 1B);而在先治療第一型干擾素而後再感染病毒的實 驗中,可以發現第ㄧ型干擾素受到日本腦炎病毒感染,卻沒有十分明 顯的抑制現象(Fig. 1A)。

3.1.2 日本腦炎病毒 NS4a、NS4b DNA 重組的質體構築

第一步先將日本腦炎 T1P1 病毒株進行病毒增殖放大,再用病毒 蝕斑試驗測試病毒濃度效價(Fig.2),從病毒液中抽取出日本腦炎病

毒的 RNA,進行反轉錄進而得到病毒的 cDNA。利用反轉錄所得的 cDNA 進行聚合酶連鎖反應(PCR),用 NS4a-forward、NS4a-Reverse 及 NS4b-forward、NS4b-Reverse 的引子(primer)進行 PCR。將 PCR2 的產物進行 DNA 純化後,利用

EcoR

I 和

Xho

I 的限制酵素作用切位 處理,再接到同樣切位的 pcDNA3.1-HisB 的載體上,進行質體選殖。

選殖到的質體轉型到大腸桿菌(Top 10)中,大量增殖細菌表現 DNA。

抽取大量細菌的質體,進行質體 DNA 的純化。

3.1.3 細胞內表現日本腦炎病毒 NS4a、NS4b 蛋白

將質體 DNA pcDNA3.1,pcDNA3.1-NS4a,pcDNA3.1-NS4b 分別轉 染近 BHK-21 細胞與 TE671 細胞。載體上有 neomycin resistance 基 因,因此可以利用 G418 加入細胞培養液中篩選細胞。經過約 20 天的 篩選,將細胞培養於含玻片的 6-well 盤,進行細胞免疫染色,以抗 日本腦炎的老鼠血清作為第一級抗體,所得細胞免疫染色法的結果 為,有轉染 pcDNA3.1-NS4a,pcDNA3.1-NS4b 的 BHK-21 與 TE671 細 胞經過免疫染色法後,於螢光顯微鏡下觀察可見到強烈的綠色螢光 (Fig. 3)。接下來再將細胞收取下來,進行免疫沉澱的實驗來濃縮細 胞中質體表現的蛋白。利用 cell lysis buffer(含蛋白酶抑制劑)溶 解細胞,加入 anti-Xpress(1:100)於 4OC 隔夜,而以 protein A 作用

後的沉澱物進行西方墨點法檢測蛋白,可發現 BHK-21 細胞(Fig. 4A) 及 TE671 細胞(Fig. 4B)中日本腦炎病毒非結構蛋白 NS4A 及 NS4B 蛋 白的表現。

3.1.4 JEV-NS4A 與 JEV-NS4B 降低 ISRE 啟動子的活性

將穩定表現日本腦炎病毒非結構蛋白 NS4A 及 NS4B 的 BHK-21 及 TE671 細胞,培養於 6-well 盤中。將 pISRE-luc 及 pRunilla-luc 以 9:1 的比例轉染進入細胞中,而 Runilla 作為 internal control。

可以發現在 BHK-21 細胞中,穩定表現 NS4A 蛋白的細胞,加入 3000 U/ml 的α-干擾素後其 ISRE 啟動子的活性抑制的比例高達約 105%,

而加入 3000 U/mlβ-干擾素後其 ISRE 抑制比例約 60%;但穩定表現 NS4B 蛋白的細胞,再加入α/β-干擾素後,其 ISRE 活性抑制程度約 10~20%(Fig. 5A)。在 TE671 細胞中,穩定表現 NS4A 蛋白其抑制 ISRE 活性的程度約 30~40%;而 NS4B 蛋白抑制α-干擾素程度約 30%,β-干擾素受到的抑制程度大約 45%(Fig. 5B)。

利用 VSV 病毒可誘發細胞產生第一型干擾素的特性,將表現日本 腦炎病毒非結構蛋白 NS4A 及 NS4B 的 BHK-21 細胞以 pISRE-luc 及 pRunilla-luc 以 9:1 的比例轉染進入細胞中,而後再感染 VSV 病毒

(MOI=5)36 小時。可以發現在 BHK-21 細胞中,穩定表現 NS4A 及 NS4B 蛋白的細胞可以有效抑制 VSV 病毒感染時,所誘發的干擾素(Fig.

5C)。

3.1.5 JEV-NS4A 與 JEV-NS4B 藉由降低 STAT2 磷酸化來阻撓干擾素 的訊息傳遞

將穩定表現日本腦炎病毒非結構蛋白 NS4A 及 NS4B 的 TE671 細 胞培養於 75T-flask,培養至 7 分滿時再加入 3000 U/ml 的干擾素-α/β ,反應半小時後刮取細胞,離心後將沉殿的細胞加入 lysis buffer,再以西方墨點法檢測 stat2 磷酸化的情形。結果發現,TE671 細胞內穩定表現 NS4A 及 NS4B 蛋白,Stat2 磷酸化的程度明顯降低許 多(Fig. 6)。因此,日本腦炎病毒的 NS4A 及 NS4B 蛋白可以藉由降低 Stat2 的磷酸化,來阻饒第一型干擾素的訊息傳遞。