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第三章 材料與方法

第二節 實驗方法

四、 西方墨點法(western blot analysis)

(ㄧ)、蛋白質之製備

將 HT-29 細胞以 1×106cells/10 ml/dish 的細胞密度種於 10 cm dish,以含有 1%FBS 的 DMEM 培養 24 小時,給予溶於含有 10% FBS 的 DMEM 之化合物處理,再置於 5% CO2、37℃恆溫培養箱中培養。

將細胞刮下並收至離心管,於 4℃下以 3000 rpm 離心 10 分鐘,去除 上清液,加入 0.5 ml PBS 清洗細胞 3 次,於室溫下以 3000 rpm 離心 10 分鐘,去除上清液,加入 Lysis buffer 放冰上,每隔五分鐘 vortex 一次,重覆 6 次共 30 分鐘後,於 4℃下以 12000 rpm 離心 5 分鐘,

收集細胞上清液,將上清液置於-80 度冰箱備用。

Lysis buffer 配製

M-PER@ Mammalian Protein Extraction Reagent 250 μl phosphate inhibitor 1 μl

protease inhibitor 1 μl

(二)、蛋白質定量

使用 Bio-Rad protein assay kit 進行蛋白質含量之分析,以牛血清 蛋白(bovine serum albumin,BSA)作為標準品並製作標準曲線,利 用酵素免疫分析儀(ELISA reader)在波長 590 nm 下測吸光值,並求 出趨勢線方程式及 r2值(r2值需> 0.95)。將蛋白質標準品稀釋成濃度 0、0.25、0.5、0.75、1、1.25 mg/ml,分別取 10 μl 後,加入 490 μl Bradford 染劑(需 5 倍稀釋)混合均勻,每 well 加入 100 μl 染劑(四重複)

呈色,反應 10 分鐘。

蛋白質標準品配製

10 mg/ml BSA(l) 1X PBS Buffer(l) 最終濃度(mg/ml)

0 150 0

3.8 146.2 0.25

7.5 142.5 0.5

11 139 0.75

15 135 1

19 131 1.25

5X 稀釋 Protein assay dye 配製

Bradford 染劑 2 ml

D.D. water 8 ml

(三)、樣品蛋白質的定量

取出3 μl 蛋白質樣品與 27 μl 的 PBS 稀釋 10 倍,於 96 well plate 中,每 well 加入稀釋好的 10 μl 蛋白質樣品,再加入 490 μl 染劑(四 重複)呈色。根據標準曲線的回歸公式,計算細胞蛋白質樣品液中蛋 白質含量。

(四)、聚丙烯醯胺膠體電泳(SDS-PAGE eletrophoresis)

1. 下層膠(separating gel):根據蛋白質分子量大小與各蛋白質之間 分離效果,選擇適當濃度之膠體,故 acrylamide/Bis 最終濃度可為 12 和 15%。

separating gel 配製

Separation gel(10 ml) 12% 15%

Acrylamide(30 %) 4 ml 5 ml Tris(1.5 M,pH 8.8) 2.5 ml 2.5 ml SDS(10%) 0.1 ml 0.1 ml APS(10%) 0.1 ml 0.1 ml TEMED 0.004 ml 0.004 ml M.Q. water 3.3 ml 2.3 ml

2. 上層膠(stacking gel):膠體中 acrylamide/Bis 最終濃度為 5%。

stacking gel 配製

stacking gel(3 ml) 5%

Acrylamide(30 %) 0.5 ml Tris(1.0 M,pH 6.8) 0.38 ml SDS(10%) 0.03 ml APS(10%) 0.03 ml

TEMED 0.003 ml

M.Q. water 2.1 ml

3. 蛋白質樣品製備:取適當之細胞蛋白質樣品液與 6 倍的 Loading dye 混和後置於 100℃水中煮沸 10 分鐘,置於冰上備用。

6X SDS gel loading dye 配製

2-mercaptoethanol 0.6 ml

SDS 1 g

Bromphenol Blue 1.2 mg 100% glycerol 3 ml

M.Q. water 2.9 ml

將以上成分混合溶解後,取 1 ml 出來再加入 1 M 的 DTT 1.5ml

4. 電泳條件:於電泳槽中倒入 1X running buffer(以水將 10X 稀釋成 1X running buffer),再將等量樣品與標準分子量 marker 分別注入各樣 品槽中,固定電流為 60 mA,固定電壓為 100 V,電泳時間約為 2 小 時。

10X running buffer 配製:

Glycine 187.7 g 過)、濾紙,類似三明治夾層,置於轉印緩衝液(1X transfer buffer),

使蛋白質由膠片(負極)往 PVDF 膜(正極)方向移動。固定電流為 400 mA,轉印時間為 1.5 至 2 小時。

1X transfer buffer 配製:

Tris-base 3.03 g

Glycine 14.4 g

100% methanol 200 ml

M.Q. water 加 800 ml 並調 pH 值 pH8.1-8.4

6. 免疫螢光之偵測:PVDF 膜置於含 5% non-fat milk 之 TBST 緩衝 液中,於室溫進行 blocking 2 小時。經 blocking 過的 PVDF 膜以 TBST 清洗 5 分鐘,重複 3~5 次。加入稀釋之一級抗體,於 4℃下反應過夜

(至少 16 小時),以 TBST 清洗 5 分鐘,重複 3~5 次。再加入適當稀 釋之二級抗體,並於室溫下反應 1 小時後,以 TBST 清洗 5 分鐘,重 複 3~5 次,最後將 HRP substrate 與 HRP substrate peroxidase soluation 以 1:1 比例混合,使樣本發出螢光後,利用 X-ray film 進行感光成 像,並利用 Image J 影像軟體(USA National Institutes of Health,NIH)

進行分析。

TBST buffer 配製:

NaCl 43.875 g

Tris-base 12.114 g

Tween 20 5 ml

M.Q. water 加至 5 liters 並調 pH 值 7.4