第四章 結論與展望
Scheme 1- 5 NiSOD 於文獻上推測的反應機構
經由理論計算來解釋 NiSOD 活性中心的反應性,還原態 NiSOD 活性中心之氮及硫原子的 p 軌域與鎳離子的 d 軌域進行 π interacction 的 鍵 結 , 使 得 π* 軌 域 填 入 成 對 電 子 , 藉 由 氮 及 硫 原 子 之 π interacction,造成 π*軌域能量較高而不穩定。因此當 O2−進入時,π*
軌域的電子會轉移至 O2−,配合 2 個質子,使 O2−還原成 H2O2,鎳離
子中心則氧化成正三價,形成氧化態 NiSOD。在氧化態 NiSOD 的情 況下,則是當軸位 His 的氮配位後,以其 p 軌域與鎳離子中心的 d 軌 域進行σ interaction 鍵結,使 1 個未成對電子填入 σ*軌域。當 O2−進 入後會提供一個電子還原三價的鎳離子中心,且軸位的 His 則會離開 鎳離子中心,而成為還原態 NiSOD,而 O2−氧化成 O2。
Fig. 1.5 Ni-SOD 於理論計算的氧化態與還原態鍵結軌域11
第三節 含鎳超氧化物歧化酶擬態化合物的相關文獻探討
由目前文獻發表的蛋白質結構可知,還原態 NiSOD 的鎳離子中 心較為穩定且傾向以平面四邊形的構型存在,在合成擬態化合物上相 對比較穩定,因此在過去的文獻上大多著重於還原態 NiSOD 擬態化 合物的探討,而氧化態 NiSOD 的探討相對較少。接著分別就過去的 文獻,針對結構性還原態 NiSOD 擬態化合物、功能性還原態 NiSOD 擬態化合物以及結構性氧化態 NiSOD 擬態化合物作介紹:
一、結構性還原態 NiSOD 擬態化合物
關於還原態 NiSOD 的擬態化合物,大多是以 N2S2的配位基,與二價 鎳配位形成平面四邊形的錯合物,來做為還原態 NiSOD 的結構模擬 及光譜性質的探討。
Fig. 1-6 結構性還原態 Ni-SOD 擬態化合物之一12, 13
由 Krüger及 Holm 等 人 於 西 元 1987年 12 及 1998年 13 發 表 [Ni(phmi)]2- 及[Ni(ema)]2-、[Ni(phma)]2- 與[Ni(emi)]2- (Fig.1-6 )的文獻 中可知,將N2S2配位基與鎳二價金屬離子鍵結,其中兩amidate的N 配位分別模擬還原態 Ni-SOD活性中心之His1 上末端amine的N及 backbone上amide的N;兩S則分別模擬兩個Cys2與Cys6 上thiolate 之S,形成平面四方的構形,結構上與還原態Ni-SOD活性中心之結 構皆具有一定程度的相似度,且因這類型配位基的硫與氮上的氫有機 會被去質子化使配位基為負三、四價,有機會迫使鎳金屬中心氧化,
形成高價氧化態的錯合物。
Fig. 1-7 結構性還原態
Ni-SOD 擬態化合物之二
142010年由Shearer 設計兩個二價鎳結構性還原態 NiSOD 擬態錯合 物(Fig.1-7)14,並藉由光譜及理論計算的研究,進行與酵素活性中心 間的比較及探討。其配位方式與還原態 NiSOD 相當相似,僅一個 amidate與amine的差別,較能符合NiSOD於氧氣下穩定存在之性質。
Fig. 1-8 結構性還原態 Ni-SOD 擬態化合物左至右分別
為 Tp
Ph,MeNiS
2CNPh
2、Tp
Ph,MeNiS
2CNEt
2與 Tp
Ph,MeNiS
2COEt
15在 2008 年 由 Jensen 利 用 hydrotris(3-phenyl-5-methylpyrazoyl)- boratonickel(II)分別與 organoxanthate 及 dithiocarbamate 配位形成含氮 硫五牙基的二價鎳錯合物(Fig.1-8)15,並從氧化還原電位探討還原態 Ni-SOD氧化成氧化態Ni-SOD時可能經歷之中間態 18。但在此階段仍 未能得到NiIIIN3S2的結構性氧化態Ni-SOD擬態化合物。
Harrop 在 2011 年發表的擬態化合物(Fig. 1-9)16,同樣是以 N2S2
為基本架構,再修飾配位基成 N3S2,將其與鎳離子配位形成一 N2S2
平面四邊形構形的錯合物。此錯合物在結構及電性上都與 NiSOD 活 性中心相似,然而當加入氧化劑 FcPF6後,卻得到 N3S 配位至二價鎳 而另一個硫原子與另一分子的硫形成 disufide 而形成雙核錯合物。雖 然反應過程中,可以利用 EPR 在 4 K 環境下,短暫偵測到同時具有 NiIII及 radial 的混合訊號,但未能直接分離出五配位之三價鎳的氧化 態擬態化合物。
Fig. 1-9 結構性還原態 Ni-SOD 擬態化合物之四16
二、結構性氧化態 NiSOD 擬態化合物
有部分研究發現,若使用如 salen-type 或前述 N2S2的配位基,因 具有高負電性,在與二價鎳離子配位後,若使用氧化劑將其氧化,將 會使配位基上的一個電子被移除形成 ligand radial。但若額外添加吡 啶或咪唑等分子,有機會使得鎳金屬中心由二價氧化成三價,可用 EPR 光譜佐證此現象。
Fig. 1-10 由 EPR 光譜測定結構性氧化態 Ni-SOD 擬態化合物之一17
如Krüger及Holm於1987年及1998年所發表的一系列二價鎳錯 合物[Ni(phmi)]2-及[Ni(ema)]2-、[Ni(phma)]2-與[Ni(emi)]2-,於溶液中 加入pyridine後進行Electron paramagnetic resonance (EPR) 的測量,
得到自旋量子數為1/2的NiIII訊號,並且因為 pyridine 的氮原子與鎳 中心未成對電子偶合(coupling)的關係,使其具有 triplet 的超精細結構 (super-hyperfine coupling) (Fig.1-10)17。顯示此NiIII可做為結構性氧化 態NiSOD擬態化合物,因其配位方式與氧化態NiSOD 皆為NiIIIN3S2。
Fig. 1-11 由 EPR 光譜測定結構性氧化態 Ni-SOD 擬態化合物之二18
2010 年由 Duboc 所合成的二價鎳錯合物(Fig. 1-11)18,也可以得到 相似的結果,其中兩個氮是由配位基上 bipyridine 提供,當含錯合物 的溶液加入咪唑後,經由電化學方式將其氧化,從 EPR 光譜上即可 偵測 NiIII之訊號。並藉由 CV 光譜說明其 NiSOD 擬態化合物在外加 適當電壓下,其氧化態與還原態可進行可逆的轉換。
三、還原態 NiSOD 之活性擬態化合物
由於 NiSOD 被發現的時間較晚,對此酵素進行擬態化合物相關 研究亦較少,且多以結構模擬為主。Darensbourg 及 Laurence 所發表 的研究結果是目前少數可消耗超氧化物,並展現活性的結果。Shearer 則是將酵素蛋白質片段進行修飾,探討胜肽鏈所形成的化合物的活性 與酵素間做比較。
Fig. 1-12 功能性還原態 Ni-SOD 擬態化合物之一19
由 Darensbourg 在 2009 年發表的正二價鎳錯合物[(mmp-mdach)- Ni(Im)]Cl (Fig.1-12)19,藉由 nitroblue tetrazolium (NBT) assay 得知,
此擬態化合物確實可消耗超氧化物 KO2,但是經由紅外線光譜儀及質
譜的偵測,發現反應後得到的新物種並非是期望得到的鎳三價錯合 物,而是配位基上硫原子被氧化形成 sufenato 及 sulfinato 錯合物。
Fig. 1-13 功能性還原態 Ni-SOD 擬態化合物之二20
Laurence 在 2010 年發表的擬態化合物,是利用三個胺基酸 asparagine-cysteine-cysteine (NCC)組合成的胜肽化合物做為配位基,
與鎳離子配位形成的 NiSOD 擬態化合物(Fig. 1-13)20。因其配位環境 與 NiSOD 活性中心相似,在利用 SOD activity assay 的活性測試上,
表現出具有對超氧化物的反應性,所得到的半抑制濃度(half maximal inhibitory concentration,IC50)為 4.1 × 10-5 M。
將上述研究與 Shearer 所發表擷取 NiSOD 前 12 個胺基酸片段組 成的[Ni(SOD)M1]做比較21,發現活性上以[Ni(SOD)M1]較佳,IC50為 2
× 10-7 M。與從牛肝紅血球取得到 SOD (一般為 Cu/ZuSOD)做比較22, IC50則為 2 × 10-7,表示生物體中 SOD 酵素歧化超氧離子的效果最佳。
本實驗室江建緯學長所進行的研究 23,利用含氮氧五牙配位基 H2BDPP,配位基在沒去質子化的情況下與鎳離子形成的二價錯合 物,能夠將 O2−還原成 H2O2,此時二價鎳錯合物則氧化成三價鎳錯合
物,並且可以得到此三價鎳錯合物的晶體結構,成功地模擬氧化態 NiSOD。此三價鎳錯合物又可與 O2−反應產生 O2,本身還原成二價鎳 錯合物,成功的模擬了 NiSOD 的催化循環。