行政院國家科學委員會補助國內研究生出席國際學術會議報告
103 年 08 月 13 日
報告人姓名 洪柏丞 就讀校院
(科系所)
□博士班研究生 國立成功大學 電機所
■碩士班研究生 時間
會議 地點
2014/07/31~2014/08/02 澳洲雪梨
本會核定 補助文號
MOST-103-2922-I-006-257
會議 名稱
(中文) 第十三屆國際生物資訊學會議
(英文) The 13th International Conference on Bioinformatics 發表
論文 題目
(中文) YNA 資料庫:整合性基因探勘功能以探索酵母菌染色質調控資訊之平台 (英文) The Yeast Nucleosome Atlas (YNA) database: An integrative gene mining platform for studying chromatin structure and its regulation in yeast
報告內容應包括下列各項:
一、參加會議經過
如下頁。
二、與會心得
如下頁。
三、考察參觀活動(無是項活動者省略)
無。
四、建議
如下頁。
五、攜回資料名稱及內容
如下頁。
六、其他
如下頁。
一、 參加會議經過
InCoB2014 (第十三屆國際生物資訊學會議,The 13th International Conference on Bioinformatics) 國際計算生物學研討會訂於 2014 年 7 月 31 日至 2014 年 8 月 2 日,由澳洲雪梨的麥覺理大學 (Macquarie University)主辦,並於 Novotel Sydney Brighton Beach 大飯店進行。
在交通方面,由於期刊論文在會議前幾個禮拜才確定被接受,直飛澳洲的飛機在此時已經不容 易訂到,為了能節省機票費用,最後訂了在香港轉機的國泰航空的班機。先由桃園機場起飛至香港 赤鱲角國際機場,再轉機飛至澳洲雪梨,全程轉機加上飛行時間約為 12 小時。雖然辛苦,但是為 了能以較低的票價成行,只能做此取捨。在回程航班上,在香港近海及台灣均剛好遭遇惡劣的天候 狀況,在強烈亂流下所幸還是平安回到國內。
在雪梨交通方面,拜便捷的大眾運輸系統所賜,我們主要是購買週票並搭乘公車及地鐵為主,
雪梨城市及郊區大多能透過大眾運輸抵達。另外為了節省住宿費用,居住處是透過 Airbnb 網站來 聯絡當地房東,進而能以極便宜的價格取得住宿地點。住處位於 Maroubra 郊區,前往研討會地點 Novotel Sydney Brighton Beach 搭乘公車加上轉車及步行時間約需要一個半小時,三天的研討會大 約都是九點半開始,出發的時間起其實都算充裕。三天的議程主要的 workshop 都是在五點半左右 結束,晚飯時間為自助餐點,讓與會者能相互交流。
計算生物學的應用範圍極為廣泛,此次的研討會的內容也十分的豐富,從基因體定序後的計算 應用,到基因空間立體結構,甚至針對計算機科學領域的效能增進等技術,都有所涉略。跨領域的 合作在計算生物學上也是必要的,在這一次的研討會上,也看出不同國家,生物基因體學家與計算 科學家的合作關係,提出生物問題上所需要的生物計算,再由計算科學家將需求數學化以及工程 化,最後設計演算法或是分析流程,與生物學家共同處理以及解決生物上的問題。現場也有研究成 果海報的展示,不少的研究者和海報的作者在會議休息時間時,討論與分享不相關研究的心得與想 法。
我的口頭報告是在 2014 年 7 月 31 日,研討會的第一天下午的第一場 program 內進行。報告內 容為發表的期刊論文,是關於我們開發的一個線上平台 YNA 資料庫。YNA 收集了豐富的酵母菌 染色質調控資訊,提供一個全面的工具以協助此領域的生物學家們,取得研究目標及得到可實驗性 的假設,使往後深入的研究更加順利。報告的時間不是很長,在有限的時間內要完整介紹出 YNA 這個平台的強大功能及創新處是一大挑戰,最後決定以大方向性的介紹及案例分析來完成這次的口
頭報告。報告結束後,有研究者提出問題,詢問資料整合上處理標準化碰到的難題,以及是否能夠 延伸至不同物種等。前者我們在此篇研究已有論述,而後者將會是實驗室學弟妹們將來研究主題的 重點之一。
二、 與會心得
在此次研討會中,有許多在計算生物學上最新的議題,如 NGS 資料的處理,DNA 結構與轉錄 的關係,RNA 結構分析等,這些新的議題都是目前十分重要的領域。而且這些題目都牽涉到計算 上的效能議題,甚至線在當紅的大資料(Big Data)等技術。除了生物資訊,也對自己將來就業有更 開闊的認識。此外,這次口頭報告中,也有許多來自其他國家知名大學的研究生,報告著自己的研 究成果,且大多都表現優異,不但清楚地表達出題目的精隨,對發問者的提問也能精確回答。這讓 我們意識到人外有人,天外有天,勉勵自我要持續努力,在未來的研究上能有更好的表現。
在參與會議的路途中,也對澳洲這個國家有更深入的認識。在雪梨,宏偉的城市建設,複雜但 便利的城市交通設施,包括公車、地鐵、輕軌列車及船運等;高樓林立且充滿綠化的漂亮市容,都 市開發之餘也兼顧環境的保護;平整與乾淨的人行道,明確的指示牌,十分遵守交通法規的人民等。
這些來自國際都市諸多的衝擊與遭遇到的人事物,讓我們對於澳洲都市設計及高度發展深感敬佩,
也大大的開展了我們的世界觀。且值得注意的是,不像其他英屬國家如英國本土及加拿大等國家,
澳洲城市是由許多不同的人種所組成的,不同的人種之間以英文來溝通,顯然當地對英文的推廣十 分的成功。
三、 考察參觀活動(無是項活動者省略)
無
四、 建議
此次會議令人印象深刻的部分在於會場硬體設備舒適,餐點準備豐盛充沛,且最重要的是交通 便利。此次研討會地點雖然在郊區,但能夠透過多種交通工具及班次到達。在國內的會議若舉辦地 不在都市內,往往交通都是十分不便利的地區,若能改善現況,加強各個城市的大眾運輸工具的便 利性,必能吸引到更多國家的優秀研究者前來發表。
InCoB 2014 在 Novotel Sydney Brighton Beach 大飯店舉行,為一舒適豪華且現代化的建築物。
在參加完這一次的研討會後,深深的覺得台灣以及成功大學在教學以及舉辦會議的硬體上需要加 強,讓會議參與者能夠不受外務所擾,專注在研究本身。
五、 攜回資料名稱及內容
InCoB 2014 會議議程本。
六、 其他
會場的照片
口頭報告時的照片
海報區的照片