第七章、 參考文獻
附圖 4、 生合成 HBGA 之路徑
Type-1 和 type-2 之 HBGA 前驅物，會被 α(1,2)-fucosyltransferase 2 (FUT2)修飾 產生H 型抗原，此 H 型抗原會進一步被 A 和 B transferases 修飾產生 A 和 B 抗原。而Lewis 抗原，會經由 α(3,4)-fucosyltransferase (FUT3；也稱為
galactoside 3(4)-l-fucosyltransferase)修飾產生。當個體缺乏功能性 FUT2 被歸類 為非分泌型，因在身體體液中不存有A、B 或 H 抗原；當個體具有功能性 FUT2 則被歸為分泌型。Fuc: fucose, Gal: galactose, GalNAc:
N-acetylgalactosamine, GlcNAc: N-acetyleglucosamine。
附圖5 ABH、Lewis 及相關抗原生合成路徑圖 [38]
五種不同類型之雙醣(disaccharides)前驅物(precursor)如圖所示，Type 1 前驅物為 Gal β 1-3 GlcNac β，type 2 為 Gal β 1-4 GlcNAc β，由於這二種前驅物後續之修 飾路徑平行，因此分為一組並以斜線3/4 區分二者，衍生的抗原以框形標示，
Type 1/2, Le a/x 以及 Le b/y分別表示types 1 或 2，Lea或Lex和Leb或Ley，每個 步驟所需的催化酵素，酵素名稱皆以縮寫的斜體顯示。α3GT: α 1,3 galactosyl transferase, α 3/4FT: α1,3 或 α 1,4fucosyltransferase, α2FT: α 1,2 fucosyltransferase, α3ST: α 2,3sialyltransferase, A or B enzymes 為 α1,3N-acetylgalactosaminyl and α 1,3galactosyltransferases 分別由 ABO 基因座處的 A 和 B 等位基因編碼。Gb3S:
globosynthase, iGb3S: isoglobosynthase, GalNAc β 3T: β 1,3N-acetyl
galactosaminyltransferase, GalNAc α 3T: α 1,3N- acetylgalactosaminyl transferase 或Forssman synthase。(Type 4 型前驅物存在於 globo 和 ganglio (神經節)系列的 醣脂上，Type 5 型對應於醣脂乳糖苷神經酰胺(glycolipid lactosylceramide)等)
附圖6 諾羅病毒衣殼蛋白質 VP1 組裝成病毒顆粒模擬圖 [46]
紅色、藍色、黃色皆為相同的S domain (為避免混淆，由 S 與 P domain 所組成 之VP1 僅顯示 S domain，另外，僅圖 B 之白色為 P domain)，當諾羅病毒在組 裝時會以A / B 或 C / C 之呈彎曲或平板的二聚體為最小單位組裝，整個模擬組 裝過程如圖D，5 個 A / B 會組成五角狀，角狀周邊再加入 5 個 C / C。9 組 [5(A/B)+5(C/C)]相當於 90 個 VP1 二聚體會形成一個諾羅病毒顆粒。
A. B.
附圖7 VA387（GII.4）與 HBGA 之結合界面的晶體結構 [106]
(A)以俯視的視角觀察雙體化(各單體 P 蛋白質以白色與灰色表示)之 P 蛋白質與 HBGA (以黃色之三醣(trisaccharides)示意) 結合之介面。(B) 圖為放大(A)圖下方 之結合介面，三個主要結合界面為綠色(位點 I)，紅色(位點 II)和橙色(位點 III)，而淺藍色為會影響結合特異性之胺基酸，接合界面之三糖以 C-青色、O-紅色和N-藍色表示。
附圖8 比較 GII.4 與 GI.1 和 GII.3 之 P 蛋白質結構 [36]
(A) GI.1 P 蛋白質(藍色) 疊加在 GII.4 P 蛋白質(綠色)結構，可觀察到 GII.4 (綠 色)在箭頭所示的 P2 結構中具有三個額外的環狀結構。(B) GII.3 諾羅病毒的同 源模型(深藍色)，疊加在 GII.4 結構上(綠色)，雖然它們非常相似，但 GII.3 結 構在P2 結構中具有一個長環，黑色表示二者相同之位點。
附圖9 嗜甲醇酵母菌甲醇代謝路徑[88]
嗜甲醇酵母菌之甲醇代謝路徑中各個酵素縮寫如下：AOX: alcohol oxidase (EC 1.1.3.13), CAT: catalase (EC 1.11.1.6), FLD: formaldehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.1), FGH: S-formylglutathione hydrolase (EC 3.1.2.12), FDH: formate dehydrogenase (EC 1.2.1.2), DAS: dihydroxyacetone synthase (EC 2.2.1.3), TPI:
triosephosphate isomerase (EC 5.3.1.1), DAK: dihydroxy-acetone kinase (EC
2.7.1.29), FBA: fructose bisphosphate aldolase (EC 4.1.21.13), FBP: fructose 1,6-bisphosphatase (EC 3.1.3.11), MFS: methylformate synthase; DHA:
dihydroxyacetone, GAP: glyceraldehyde 3-phosphate, DHAP: dihydroxyacetone phosphate, F1,6 BP: fructose 1,6-bisphosphate, F6P: fructose 6-phosphate, Pi:
phosphate, Xu5P: xylulose 5-phosphate, GSH: glutathione, PYR: pyruvate; PPP:
pentose phosphate pathway, TCA: tricarboxylic acid cycle.
附圖10 以西方墨點法偵測原態或帶有組胺酸之 VP1 或 P 蛋白質
左側圖為SDS-PAGE 以 Coomassie Brilliant Blue 染色做蛋白質跑膠對照，右側 圖為以His 抗體(上方)或 NoV 抗體(下方)做諾羅病毒蛋白質西方墨點法分析。
以His 抗體，在 pPICZ B (質體負控制組)可辨識到一條約在 60 kDa 之非專一性 內源性蛋白質條帶(‘non-specific’ endogenous protein)，此條帶為帶有連續 11 個 His 之內生 transcriptional regulator YY1 [140]。