第二章、 研究方法
第三節、 研究設計
C. 西方墨漬法 Western blot
(一)細胞萃蛋白
萃蛋白前先做加藥處理,當細胞養到 8 分滿時,換 serum-free medium
(使細胞處於飢餓狀態)。
serum-free(12hrs)→銀杏、NAC 4 µM、DPI 10 µM (30min) →Ang II 0.1 µM (5min)→收細胞。
銀杏萃取液 (0.84 mg/ml = 840 µg/ml)
control 12.5 25 50 100 0µl 40µl 30µl 20µl 10µl 抗氧化劑
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NAC 4 µM DPI 10 µM 100µl 50µl
將舊的 medium 抽掉,以 PBS buffer 做 wash,重複洗 2 次之後加入 serum-free medium,並置於 37℃培養箱 12hrs。
(二)加藥處理
銀杏萃取液(0.84 mg/ml = 840 µg/ml)預配成(12.5、25、50、100 µg/ml stock),所以加入銀杏萃取液分別是(0、168、337、675、1351µl )、
NAC 4 µM(100µl)、DPI 10 µM(50µl),並置於 37℃培養箱 30 min。再 於每個plate中加入 Ang II 0.1µM (10µl) 再置於 37℃培養箱 5min 。 接著取出plate,並將 plate 放置於冰上,將 medium 倒掉於廢液瓶中。
加PBS buffer wash 2 次,同樣將 PBS buffer 倒掉,再用 pipette 將邊 緣的餘液儘量吸乾,加入大約200ul 的 lysis buffer 到 plate 中。將欲 分裝蛋白的eppendrof 標示好。用刮棒將 plate 上細胞刮下(先將刮棒 上酒精擦乾,刮的方式可先刮外面一圈,再刮 plate 中間部分,最後 將細胞集中在邊緣處)。將刮下的細胞分裝到新的 eppendrof。將 eppendrof 放到冰上後震盪,並且每隔 5 分鐘後震盪一次共 30 min,
之後再用12000rpm,4℃,離心 20min。最後取上清液,分裝到新的 eppendrof,保存於-80℃。
(三)蛋白質濃度測定( Lowry protein assay )
蛋白質的定量採用Lowry protein assay,其原理為蛋白質胜肽先與鹼
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性 溶 液 中 的 銅 離 子 作 用 , 蛋 白 質 中tyrosine 及tryptophan 再還原 phosphomolubdate 而形成有顏色之複合物。
本方法過程為當鹼性銅離子試劑與蛋白質中少數胜肽腱(peptide bond)反應,產生低層次之biuret顏色,其次當folin-Ciocalteu phenol reagent 試劑加入後,與蛋白質中的tyrosine 及tryptophan 反應後產生 藍綠色之複合物。
1. 首先配製 standard:
BSA 的濃度為 0.5mg/ml
µg/µl 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5
ddH20 50µl 40µl 30µl 20µl 10µl 0µl BSA 0µl 10µl 20µl 30µl 40µl 50µl 2. 配製 sample:
10X ddH20(PBS) 45µl
sample 5µl
同時以BSA (Bovine Serium Albumin)當作對照組,首先配製standard
(0,0.1,0.2,0.3,0.4,0.5 mg/ml,用來當作標準曲線,接著將樣 品稀釋為10倍(總體積為200 μ l),步驟為二重複。
1. 各取50ul 的 standard 及 sample
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2. 加入 250ul 的三種溶液均勻混合為一(Na-K:CuSO4:Na2CO3=1:
1:98 之比例混合,需現配先加 Na2CO3,再加 Na-K,最後加 CuSO4
後vortex 一下),於室溫下作用 10 分鐘。
3. 加入 25ul Folin reagent,混合並於室溫下 30 分鐘。
4. 取 200ul 到 96-well plate 上。以 750nm 吸光值波長測 ELISA 吸光 值。
SDS-聚丙烯胺板膠電泳之上層膠體為 12% Stacking gel,下層膠體為 12% Separating gel。先配 separating buffer 為 separating gel,加入水將 separating gel 壓平,約等 30 分鐘待凝,接著將水倒掉。接著再先配 stacking buffer 為 Stacking gel,且於 stacking gel 插上 comb,待凝,
等要加入蛋白樣品溶液再將comb 拔起來。取樣品蛋白 30 mg 與 5X Loading dye 混合均勻 protein denature 120℃,5 分鐘。再進行 SDS-聚丙烯胺板膠電泳分析,將做好之板膠固定到電泳裝置上,並將電泳 緩衝液(running buffer)注滿電泳槽,然後將處理過的蛋白樣品溶液 加入板膠上所形成的 U 型槽中,以 90 伏特(依所需時間進行調整)進 行電泳。電泳結束後配製transfer buffer 進行蛋白轉移,將膠體取出,
預先用甲醇浸濕的PVDF membrane。順序由下而上(由黑至白)置入:
菜瓜布→濾紙→膜→膠→濾紙→菜瓜布,扣上後放入 transfer system 內含有 transfer buffer。於 4℃下進行 100 伏特電壓轉移,電轉移 1 個
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半小時之後,取出 PVDF membrane 浸入含 5 %(w/v)脫脂牛奶 (Blocking buffer)/(TBS-non-fat milk powder)於室溫下搖動反應一小時。
將 PVDF membrane 置於 4℃冰箱中與一級抗體反應隔夜,之後以 Washing buffer(1XTBS)清洗三次,每一次 10 分鐘,最後再清洗一次 到掉即可。再以二級抗體 (2μl/ml /1X TBS buffer)於 4℃下反應 1 小時,
同樣以 TBS 清洗 PVDF membrane wash 3 次,每次 10min,加在 membrane 上加入混合體積 1:1=A:B 液,進行冷光螢光儀反應。
Separating:
2M Tris-base(PH8.8) 75ml
10%SDS 4ml
ddH2O 21ml
stacking:
1M Tris-base(PH6.8) 50ml
10%SDS 4ml
ddH2O 46ml
Separating gel(12%)三片量:
ddH2O 9.9ml
40%Acyl-Bis 6.75ml Separating 5.625ml 10%APS 180μl
TEMED 30μl stacking gel(12%)三片量:
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ddH2O 6.5625ml
40%Acyl-Bis 937μl
stacking 2.5ml 10%APS 80μl
TEMED 20μl Running buffer:
Tris-base 0.75g Glycine 3.675g 10%SDS 5ml ddH2O 加到 250ml
Transfer buffer:
Tris-base 3.033g Glycine 14.4g Methanol 200ml ddH2O 加到 1L
5% Blocking buffer:
奶粉 5g
1XTBS 100ml