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具拮抗能力放線菌菌株之鑑定與防治馬鈴薯瘡痂病效果評估

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Academic year: 2021

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(1)台灣農業研究 (J. Taiwan Agric. Res.) 69(2):122–131 (2020) DOI:10.6156/JTAR.202006_69(2).0002. 研究報告. 具拮抗能力放線菌菌株之鑑定與防治馬鈴薯瘡痂病效果評估 林靜宜 1,* 倪蕙芳 2 林慧如 3 摘要 林靜宜、倪蕙芳、林慧如。2020。具拮抗能力放線菌菌株之鑑定與防治馬鈴薯瘡痂病效果 評估。台灣農業研究 69(2):122–131。 馬鈴薯瘡痂病為嚴重影響馬鈴薯產量與品質之重要病害之一,目前並無有效之防治藥劑可用,而輪作及 抗病品種等耕作防治法效果亦有限。因此,本研究自高雄不同地區之土壤分離純化 85 株放線菌後,以玻璃 紙抗生法於培養基上初步篩選對馬鈴薯瘡痂病菌 Streptomyces europaeiscabiei 具有拮抗活性之菌株,再利用 拮抗菌株之培養濾液進一步測試其拮抗活性。結果發現,菌株 35-2 與 43-21 對 S. europaeiscabiei 病原之拮抗 能力最佳。進一步利用 16S rRNA 基因序列分析後初步鑑定 35-2 與 43-21 菌株為鏈黴菌 Streptomyces rochei 與 Streptomyces neopeptinius。溫室試驗結果亦顯示,以菌株 35-2 與 43-21 之培養濾液澆灌馬鈴薯植株後,薯 塊之罹病度分別為 28.0% 及 35.0%,明顯低於對照組之罹病度 61.5%。由此顯示,此兩拮抗菌株具有降低薯 塊發生馬鈴薯瘡痂病罹病度之潛力,同時此兩株拮抗菌具有促進馬鈴薯薯塊生長的效果。 關鍵詞:馬鈴薯瘡痂病、鏈黴菌、生物防治。. 前言 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 (common scab) 為 馬 鈴 薯 (Solanum tuberosum L.) 重要之細菌性土傳性病 害,廣泛存在於世界各地之馬鈴薯產區。本病的 病原菌為放線菌中具有致病性的鏈黴菌 (Streptomyces spp.), 已 知 主 要 的 病 原 菌 種 類 包 含: Streptomyces scabies (Lambert & Loria 1989b)、 Streptomyces acidiscabies (Lambert & Loria 1989a)、Streptomyces turgidiscabies (Miyajima et al. 1998) 及 Streptomyces europaeiscabiei (BouchekMechiche et al. 2000),其他鏈黴菌屬之 Streptomyces bottropensis、Streptomyces stelliscabiei 及 Streptomyces aureofaciens 等 亦 有 報 導 指 出 可 造 成 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 的 發 生 (Leiminger et al. 2013)。這些病原菌危害馬鈴薯後所產生的病 徵,主要為薯塊表面出現木栓化、瘡痂狀或疣 狀的褐色病斑,嚴重時病斑相互癒合並呈網狀. * 1 2 3. 龜裂,導致馬鈴薯外觀及品質降低且不耐儲藏, 嚴重影響馬鈴薯鮮食及加工的市場銷售價,造 成重大的經濟損失。 馬鈴薯瘡痂病之病原菌除了可存活於罹病 薯塊殘體,亦可藉腐生方式生存於土壤中,導 致此病害之防治與管理至今仍是個棘手的問 題。傳統的防治方法如輪作、管理土壤水分、 利用土壤改良劑調整土壤 pH、土壤燻蒸消毒 或是於種植前利用藥劑處理種薯等方式,其防 治 成 效 通 常 不 穩 定, 甚 至 有 些 方 法 對 於 作 物 生長與生態環境多有損害 (Larkin et al. 2011; Dees & Wanner 2012)。 抗 病 品 種 為 對 抗 病 害 的 有 效 方 式 之 一, 雖 然 馬 鈴 薯 品 種 繁 多, 且 已篩選出對馬鈴薯瘡痂病具有不同程度抗性 之 品 種, 然 而 截 至 目 前 為 止 並 未 發 現 具 有 完 全抗性 (免疫 ) 之品種 (Goth et al. 1993; Dees & Wanner 2012)。 近 年 來, 生 物 防 治 法 蓬 勃. 投稿日期:2019 年 9 月 5 日;接受日期:2019 年 12 月 17 日。 通訊作者:eris2024@dns.caes.gov.tw 農委會農業試驗所嘉義農業試驗分所植物保護系助理研究員。台灣 嘉義市。 農委會農業試驗所嘉義農業試驗分所植物保護系副研究員兼系主任。台灣 嘉義市。 農委會農業試驗所嘉義農業試驗分所植物保護系計畫助理。台灣 嘉義市。.

(2) 123. 放線菌防治馬鈴薯瘡痂病. 發展,已有不少鏈黴菌應用於植物病害防治的 成功案例,亦有些成功開發成商品化之植物保 護製劑,如 Actinovate ® (Streptomyces lydicus WYEC 108) 及 Mycostop ® (Streptomyces griseoviridis K61) 等。 台 灣 目 前 也 有 登 記 用 於 疫 病 等 病 害 防 治 的 純 白 鏈 黴 菌 (Streptomyces candidus Y21007) 商品化產品如安心寶 ® 等。 這些例子也提供了馬鈴薯瘡痂病防治策略另一 種具有發展潛力的新興防治途徑。 利用拮抗菌防治馬鈴薯瘡痂病的相關研 究 方 面, 目 前 已 發 現 除 了 以 無 病 原 性 鏈 黴 菌 (non-pathogenic Streptomyces spp.) (Hiltunen et al. 2009; Wanner et al. 2014; Sarwar et al. 2018; Sarwar et al. 2019) 作 為 拮 抗 菌 具 有 抑 制 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 菌 生 長 的 能 力, 可 提 供 生 物 防 治 的 效 果 之 外, 利 用 假 單 胞 菌 (Pseudomonas spp.) (Arseneault et al. 2015) 與芽孢桿菌 (Bacillus spp.) (Meng et al. 2013; Lin et al. 2018a) 作 為 生 物 防 治 菌, 亦 對 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 菌具有拮抗效果。而就馬鈴薯瘡痂病菌而言, 雖以 S. scabies 最廣為熟知,但近年來已陸續 發現多種具有病原性之鏈黴菌亦可引起馬鈴薯 瘡 痂 病, 如 S. turgidiscabies 及 S. europaeiscabiei 等,且研究指出多種馬鈴薯瘡痂病菌可 於田間發生複合感染 (Wanner 2009)。其中, S. europaeiscabiei 與 S. scabies 於 16S 核糖體 RNA (16S ribosomal RNA; 16S rRNA) 雖具有 高序列相似度,但分類上卻為不同種 (FloresGonzález et al. 2008)。目前對於 S. europaeiscabiei 之特性、與寄主和其他瘡痂病菌之交互 作用等方面資訊所知有限,且其分布有愈來愈 廣泛的趨勢。 目前除了是造成歐洲地區之馬鈴薯瘡痂病 的主要病原菌之外 (Flores-González et al. 2008; Leiminger et al. 2013), 近 年 來 亦 於 美 國、 加 拿大及南韓等地發現其蹤跡 (Song et al. 2004; Wanner 2009; Hiltunen et al. 2014), 台 灣 則 於 2015 年首次發現 (Lin et al. 2018b) 此病原菌之 危害。因此,本研究將以 S. europaeiscabiei 作 為研究標的,由林相土壤中篩選對其具有拮抗 效果之放線菌,並於溫室中評估其防治馬鈴薯 瘡痂病之效果。. 材料與方法 土壤放線菌菌株之採集、分離及保存 採集高雄市甲仙、美濃、田寮及燕巢地區 等不同林區根圈土壤,每份土樣之採集地點皆 以 GPS 衛 星 定 位。 收 集 之 土 樣 經 風 乾 後 利 用 孔徑 20 目 (mesh) 篩網過篩,保存於室溫下。 利用土壤系列稀釋平板法分離放線菌,每一土 樣秤取 10 g 加入 100 mL 無菌水攪拌 30 s,靜 置後取上清液以無菌水進行 10× 系列稀釋後, 分別取 10 -4 及 10 -5× 之土壤稀釋液 100 µL。以 L 型玻棒均勻塗布於添加 0.02% 尿酸 (urea) 及 50 µg mL -1 nystatin 之 1.5% water agar (WA) 培養基平板上,於室溫下培養 2 wk 以上。初 步 以 培 養 基 上 菌 落 型 態 為 依 據, 挑 取 疑 似 放 線 菌 之 菌 落 至 添 加 50 µg mL -1 nystatin 的 International Streptomyces Project medium 4 培 養基 (ISP-4, Becton, Dickinson and Company, Sparks, MD, USA) 平 板 上 純 化。 再 以 單 一 菌 落純化 3 次後,待菌株產孢後,刮取孢子至盛 裝滅菌土之保存管中供日後試驗使用 (Huang 2008)。. 供試馬鈴薯瘡痂病菌與放線菌接種源之 製備 本 研 究 使 用 之 瘡 痂 病 菌 菌 株 為 S. europaeiscabiei St1563,為本實驗室自嘉義地區罹 病馬鈴薯塊上分離並以滅菌土保存其孢子 (Lin et al. 2018b)。將保存的瘡痂病菌畫線於 ISP-4 培 養 基 上 活 化 後, 再 以 ISP-4 培 養 基 更 新 培 養。於 30℃恆溫培養箱中培養 7 d 後,刮取孢 子以無菌水製成懸浮液,懸浮液利用光電比色 計於 600 nm 波長下測定,調整其吸光值 (optical density; OD) 為 0.3, 菌 量 濃 度 約 為 10 8 CFU mL -1 (colony-forming unit; CFU) 即可作 為試驗中之接種源。. 放線菌與馬鈴薯瘡痂病菌之抗生測定 本 試 驗 利 用 玻 璃 紙 抗 生 法, 進 行 放 線 菌 對 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 菌 之 拮 抗 能 力 初 步 篩 選。 將 純化保存之放線菌菌株,分別畫線於 ISP-4 培 養基上活化後,再以 ISP-4 培養基更新培養。 於 30℃恆溫培養箱中培養 5 d 後所得之菌落,.

(3) 124. 台灣農業研究 第 69 卷 第 2 期. 以直徑 3 mm 打孔器切取菌塊,移至已貼有滅 菌 之 3.5 cm × 3.5 cm 玻 璃 紙 的 ISP-4 培 養 基 直 徑 5.5 cm 中 心 點 位 置。 於 30℃恆 溫 培 養 箱 中培養 72 h 後,將玻璃紙連同放線菌菌塊一 起撕下。再將培養於 ISP-4 培養基 7 d 後之 S. europaeiscabiei St1563 菌 株, 刮 取 孢 子 以 無 菌水製成懸浮液,取 100 µL 以 L 型玻棒均勻 塗布於前述 ISP-4 培養基。每處理 3 重複,置 於 30℃恆溫培養箱中,培養 7 d 後,取出測量 抑制圈大小。. 不 同 培 養 時 間 對 放 線 菌 培 養 液拮抗 S . europaeiscabiei St1563 能力之影響 利用放線菌小量培養之培養濾液,進行對 S. europaeiscabiei St1563 拮 抗 能 力 測 定。 以 無菌水配製拮抗放線菌之孢子懸浮液,將濃度 調整約為 10 8 CFU mL -1。取 1 mL 之細菌懸浮 液,加入裝有 100 mL 之營養液體培養基 (Luria Bertani, LB broth, Miller) (Becton, Dickinson and Company, Sparks, MD, USA) 的三角燒瓶 中, 置 於 30℃之 恆 溫 震 盪 培 養 箱 中 培 養, 培 養時間分為 0、7、14 及 21 d。培養之菌液以 雙 層 紗 布 濾 除 菌 體 後, 再 利 用 0.22 µm 濾 膜 過濾。所得之培養濾液取 200 µL 加入 9.0 cm ISP-4,培養基中心點位置已放置不鏽鋼培養 環 (內圈直徑 6 mm) 之中,再以滅菌棉花棒將 S. europaeiscabiei St1563 之 孢 子 懸 浮 液 均 勻 塗布於前述 ISP-4 培養基。每處理 3 重複,置 於 30℃恆溫培養箱中,培養 7 d 後,取出測量 抑制圈大小。. 16S rRNA 基因序列分析 參 考 Wang et al. (1993) 之 方 法 並 略 加 修 改 後 進 行 核 酸 萃 取, 將 拮 抗 菌 株 35-2 及 43-21 於 ISP-4 培 養 基 平 板 上 培 養 7 d 後, 刮 取 菌 落 放 入 50 µL 之 0.5 N NaOH, 劇 烈 震 盪 後 短 暫 離 心, 再 加 入 150 µL 之 1 M TrisHCl (pH 8.0) 混 合 均 勻。 取 10 µL 加 入 無 菌 水 稀 釋 10×, 再 以 此 製 備 液 1 µL 作 為 模 板。 利 用 16S rRNA 序 列 設 計 的 廣 效 性 引 子 對 UniF (5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’)/ UniR (5’-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3’) (Edwards et al. 1989) 進 行 聚 合 酵 素 連 鎖 反. 應 (Polymerase Chain Reaction; PCR)。 反 應 以 PCR 試 劑 套 組 (Fast-Run™ 2× Taq Master Mix, Protech, Taipei, Taiwan) 進 行, 反 應 總 體 積 為 20 μL。 反 應 條 件 如 下:94 ℃變 性 1 min;94℃變性 30 s,57℃黏合 30 s,72℃延伸 90 s, 共 35 個 循 環; 最 後 經 72℃延 伸 1 min 完成反應。反應完成後之產物,以於 1.5% 瓊 脂凝膠進行電泳分析,再經電泳圖譜結果得知 反應於 1,514 bp 處增幅出一特定條帶,經解序 (Tri-I Biotech Inc., Taipei, Taiwan) 後, 上 傳 National Center for Biotechnology Information (NCBI) 資料庫進行比對。. 具拮抗能力鏈黴菌防治馬鈴薯瘡痂病菌 之效果 本 研 究 以 馬 鈴 薯 栽 培 品 種 克 尼 伯 (Solanum tuberosum L. var. ‘Kennebec’) 作 為 供 試 植物,將已萌芽之馬鈴薯種薯切塊,每小塊至 少留有 1 芽眼。切塊後置陰涼處 1 d,再種植 於裝有泥炭土栽培介質之 4 吋軟盆中,生長 2 wk 後作為試驗接種植株。將具拮抗能力之菌 株 35-2 及 43-21 以 LB broth 小 量 培 養 7 d 後 之培養液,經雙層紗布濾除菌體後再利用 0.22 µm 濾膜過濾。所得之培養濾液以無菌水 10× 稀釋後,利用土壤澆灌法施用於馬鈴薯植株根 圈土壤。每株植物澆灌 150 mL,每 7 d 施用 1 次,連續 6 次。以未含拮抗放線菌 LB broth 濾 液處理之植株作為對照組。第 1 次施用後 7 d, 進 行 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 菌 接 種。 接 種 時 將 50 mL 之馬鈴薯瘡痂病菌孢子懸浮液 (10 8 CFU mL -1) 直 接 灌 注 根 圈 土 壤 中, 每 組 分 別 接 種 處 理 10 株馬鈴薯。本防治試驗進行 2 次。接種後的植 株於溫室中生長達 8 wk 後,收取其地下部薯 塊,依罹病指數 (disease index) 觀察其罹病等 級及發病情形,並計算罹病度 (disease severity)。瘡痂病罹病等級分為 5 級:0 級- 無病徵、 1 級-1–10% 薯 塊 表 面 積 出 現 木 栓 化、 瘡 痂 狀 或疣狀的褐色病斑、2 級-11–40% 薯塊表面積 出現瘡痂病病斑、3 級-41–60% 薯塊表面積出 現瘡痂病病斑、4 級-61–90% 薯塊表面積出現 瘡痂病病斑、5 級- > 90% 薯塊表面積出現瘡 痂 病 病 斑 (Leiminger et al. 2013), 再 依 照 下 列公式計算其罹病度。.

(4) 125. 放線菌防治馬鈴薯瘡痂病. Disease severity (%) = i:發病等級 ni:發病 i 級的薯塊數 N:調查的總薯塊數. Σni × i N×5. ×100%. (1). 表 1. 不同地區採集之土壤放線菌抑制瘡痂病菌之 效果。 Table 1. Effect of actinobacteria isolated from different locations with antagonistic activities against Streptomyces europaeiscabiei St1563 on ISP-4 medium.. 具拮抗能力鏈黴菌之培養濾液對馬鈴薯 生長的影響 分 別 將 拮 抗 菌 株 35-2 及 43-21 之 培 養 濾 液利用土壤澆灌法處理種植 1 wk 後之馬鈴薯 植 株, 每 次 澆 灌 150 mL, 每 7 d 施 用 1 次, 連續 4 次,對照組則以 150 mL LB broth 澆灌 植株。每組依前述方法分別接種處理 10 株馬 鈴薯,處理後的植株於溫室中生長 5 wk 後測 量植株之株高、鮮重及薯塊等之生長情形。. 統計分析 試 驗 資 料 利 用 SAS 9.1 版 統 計 分 析 軟 體 先 進 行 變 方 分 析 (analysis of variance; ANOVA),再以最小顯著性差異 (Fisher’s least significant difference; LSD) 測驗在 5% 顯著水準 下,比較處理間平均值之差異。. 結果 放線菌與馬鈴薯瘡痂病菌之抗生效果 本 研 究 自 高 雄 市 甲 仙、 美 濃、 田 寮、 燕 巢、 杉 林 及 那 瑪 夏 地 區 之 土 壤 分 離 篩 選 出 85 株 放 線 菌, 利 用 玻 璃 紙 抗 生 法 初 步 篩 選 對 S. europaeiscabiei St1563 具有拮抗能力之菌株。 結 果 顯 示, 其 中 18 株 菌 株 具 有 抑 制 S. europaeiscabiei St1563 生 長 的 效 果, 分 別 分 離 自 甲 仙、 美 濃、 田 寮、 燕 巢 及 杉 林, 惟 那 瑪 夏 地區未篩選出具有拮抗能力之菌株 (表 1)。進 一步將菌株抑制效果區分為抑制圈小於 1 cm (antagonistic activity index = 1)、抑制圈介於 1–2 cm 之間 (antagonistic activity index = 2)、 抑制圈介於 2–3 cm 之間 (antagonistic activity index = 3) 和 抑 制 圈 大 於 3 cm (antagonistic activity index = 4) 等 4 種, 結 果 發 現 抑 制 圈 大於 3 cm 者共有 2 株,分別篩選自杉林及田 寮地區 (表 1)。本試驗依抑制圈大小選擇抑制 效果最佳之菌株 35-2 與 43-21 進行後續試驗。. Collected location. z. Number of isolates. Number of collected isolates with antagonistic activity against St1563 0z. 1. 2. 3. 4. Jiaxian. 10. 6. 0. 3. 1. 0. Meinong. 39. 32. 0. 3. 4. 0. Tianliao. 16. 14. 0. 1. 0. 1. Yanchao. 7. 5. 0. 2. 0. 0. Shanlin. 4. 1. 2. 0. 0. 1. Namaxia. 9. 9. 0. 0. 0. 0. The antagonistic activity index was rated by the diameter of the inhibition zone: 0: no inhibition; 1: the diameter of inhibition zone < 1 cm; 2: 1 cm ≤ the diameter of inhibition zone < 2 cm; 3: 2 cm ≤ the diameter of inhibition zone < 3 cm; 4: the diameter of inhibition zone ≥ 3 cm.. 不同培養時間對放線菌培養濾液拮抗 S . europaeiscabiei St1563 能力之影響 本試驗選擇菌株 35-2 與 43-21,進行不同 培養時間對放線菌培養濾液拮抗 S. europaeiscabiei St1563 能力測定。將具有拮抗能力的 2 株土壤放線菌菌株 (35-2 與 43-21),分別培養 在 LB broth 小 量 培 養 0、7、14 及 21 d 後, 取其培養濾液於 ISP-4 培養基上進行對 S. europaeiscabiei St1563 之拮抗測試。結果顯示, 培養 7、14 及 21 d 的 35-2 菌株濾液皆具有抑 制 S. europaeiscabiei St1563 生 長 的 效 果, 抑 制效果以培養 7 d 之濾液最佳,抑制圈大小為 4.3 cm;其次為培養 14 及 21 d 之濾液,抑制 圈分別為 2.3 及 2.9 cm,兩者之間並無顯著差 異;而培養 0 d 之濾液,則無拮抗效果 (表 2)。 於 43-21 菌 株 方 面, 培 養 7 及 14 d 的 濾 液 皆 具有拮抗效果,以培養 7 d 之濾液最佳,抑制 圈大小為 5.2 cm;其次為培養 14 d 之濾液, 抑 制 圈 為 2.3 cm; 而 培 養 0 及 21 d 之 濾 液 則 無拮抗效果 (表 2)。. 具防治馬鈴薯瘡痂病能力之放線菌菌株 鑑定 利用 16S rRNA partial sequence 分析結果.

(5) 126. 台灣農業研究 第 69 卷 第 2 期. 表 2. 不同培養時間之鏈黴菌培養濾液於培養基上 對瘡痂病菌 Streptomyces europaeiscabiei St1563 之拮 抗效果。 Table 2. Effect of culture time for Streptomyces isolates 35-2 and 43-21 on antagonistic activity against Streptomyces europaeiscabiei St1563. Diameter of inhibition zone (cm). z. Culture duration (d). 35-2. 43-21. 0. 0.0 cz. 0.0 d. 7. 4.3 a. 5.2 a. 14. 2.3 b. 2.3 b. 21. 2.9 b. 0.0 c. Means within the same column followed by the same letter are not significantly different at 5% level by least significant difference (LSD) test.. 顯示,菌株 35-2 之序列與 NCBI 資料庫中 Streptomyces rochei strain HBUM174096 (GenBank: EU841560) 相似度為 100%,而菌株 43-21 之序 列 與 NCBI 資 料 庫 中 Streptomyces neopeptinius strain T41 (GenBank: KU324439) 相似度為 99%。 根據上述分析結果,分別將菌株 35-2 及 43-21 初步鑑定為鏈黴菌 S. rochei (GenBank accession number MN784372) 與 S. neopeptinius (GenBank accession number MN784373)。. 具拮抗能力鏈黴菌防治馬鈴薯瘡痂病菌 之效果 將 具 有 拮 抗 能 力 之 土 壤 鏈 黴 菌 菌 株 35-2 及 43-21,分別利用培養 7 d 之濾液以土壤澆 灌 法 進 行 對 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 防 治 的 溫 室 試 驗。 結果顯示,澆灌處理菌株 35-2 之植株瘡痂病. 罹病度為 28.0%,而澆灌處理菌株 43-21 之植 株瘡痂病罹病度為 35.0%,兩處理之罹病度並 無 顯 著 差 異, 但 皆 明 顯 低 於 對 照 組 之 罹 病 度 61.5% (表 3)。由罹病指數分析馬鈴薯薯塊之 瘡痂病斑發生程度,可發現對照組中共計 7 顆 薯塊的罹病指數 ≥ 4,亦即高達 53.8% (7/13) 的 薯 塊 90% 以 上 之 表 面 積 皆 為 病 斑 覆 蓋; 而 以 菌 株 35-2 及 43-21 澆 灌 之 植 株, 則 無 薯 塊 之罹病指數 ≥ 4。其中,多數薯塊為 10% 以下 之表面積為病斑覆蓋 (表 3)。由此可證實,菌 株 35-2 及 43-21 皆 可 有 效 降 低 馬 鈴 薯 瘡 痂 病 之病斑感染面積及罹病度 (圖 1)。. 具拮抗能力鏈黴菌之培養濾液對馬鈴薯 生長的影響 利 用 菌 株 35-2 及 43-21 之 培 養 濾 液 澆 灌 馬鈴薯植株,於處理後 5 wk 收取馬鈴薯之地 上 部 測 量 其 鮮 重 (fresh weight)、 株 高、 地 下 部 薯 塊 鮮 重 (tuber weight), 並 觀 察 薯 塊 表 面 是 否 有 瘡 痂 等 病 斑 生 成。 結 果 顯 示, 施 用 拮 抗菌株培養濾液之植株薯塊外觀正常,並無瘡 痂病斑生成;施用菌株 35-2 培養濾液之植株 鮮重平均為 33.1 g,與對照組的植株平均鮮重 為 36.7 g 並無顯著差異;而施用菌株 43-21 培 養濾液之植株鮮重平均為 31.8 g,較對照組稍 微減少 (表 4)。株高方面,施用拮抗菌株培養 濾 液 與 對 照 組 無 顯 著 差 異; 而 施 用 菌 株 35-2 及 43-21 培養濾液之薯塊鮮重分別為 24.9 g 及 25.4 g,與對照組 (15.4 g) 相較則有顯著增加 的情形 (表 4)。. 表 3. 具拮抗能力之鏈黴菌於溫室防治馬鈴薯瘡痂病之效果。 Table 3. Efficacy of antagonistic Streptomyces isolates 35-2 and 43-21 on controlling potato common scab in a greenhouse. Disease indexz Total number of potato tubes. 0. 1. 2. 3. 4. 5. Disease severityy (%). 35-2. 15. 2. 6. 6. 1. 0. 0. 28.0 bx. 43-21. 16. 1. 6. 5. 4. 0. 0. 35.0 b. CK (control). 13. 1. 2. 2. 1. 4. 3. 61.5 a. Treatment. z. Tubers were evaluated for disease severity on a rating scale: 0: no visible symptoms; 1–4: up to 10%, 40%, 60% and 90% of tuber surface infected, respectively; 5: heavy infections with > 90% of tuber surface infected. y Disease severity (%): [(Σ number of diseased tubes in each disease index × disease index)/(total number of tubes inoculated × 5)] × 100%. x Means within the same column followed by the same letter are not significantly different at 5% by Fisher’s least significant difference (LSD) test..

(6) 127. 放線菌防治馬鈴薯瘡痂病. (A). (B). (C). (D). 圖 1. 利用土壤拮抗菌於溫室防治馬鈴薯瘡痂病之效果。(A) 無菌水處理之對照組;(B) 接種 Streptomyces europaeiscabiei St1563;(C) 接種 Streptomyces europaeiscabiei St1563 並施用拮抗菌 35-2 菌株培養濾液;(D) 接種 Streptomyces europaeiscabiei St1563 並施用拮抗菌 43-21 菌株培養濾液。 Fig. 1. Effect of antagonistic actinobacteria on controlling potato common scab in a greenhouse. (A) Mock control; (B) inoculated with Streptomyces europaeiscabiei St1563; (C) treated with culture filtrates of 35-2 isolate and inoculated with Streptomyces europaeiscabiei St1563; and (D) treated with culture filtrates of 43-21 isolate and inoculated with Streptomyces europaeiscabiei St1563. 表 4. 拮抗鏈黴菌之培養濾液對馬鈴薯生長之影響。 Table 4. Effect of culture filtrates from antagonistic Streptomyces isolates 35-2 and 43-21 on growth of potato in greenhouse. Treatment. z. Fresh weight (g) plant-1. Plant height (cm). Tuber weight (g) plant-1. Tuber scab symptom. z. CK (control). 36.7 a. 36.9 a. 15.4 b. No. 35-2. 33.1 a. 34.6 a. 24.9 a. No. 43-21. 31.8 b. 35.8 a. 25.4 a. No. Means within the same column followed by the same letter are not significantly different at 5% by Fisher’s least significant difference (LSD) test.. 討論 馬鈴薯瘡痂病為世界馬鈴薯產區之重要細 菌性病害之一,不僅影響馬鈴薯薯塊產量,亦 影響外觀及市場價值。本研究自高雄市甲仙、 美濃及田寮等地區之土壤分離得到 85 株放線 菌 菌 株, 其 中 18 株 菌 株 可 於 ISP-4 培 養 基 上 抑制瘡痂病菌生長。從中選取拮抗性最佳之菌. 株 35-2 及 43-21,進行放線菌菌液態培養濾液 拮抗活性試驗及馬鈴薯瘡痂病防治試驗,結果 顯示此 2 株拮抗菌可於培養基上抑制 S. europaeiscabiei 之生長,於溫室中亦可有效降低馬 鈴 薯 瘡 痂 病 之 罹 病 度。 菌 株 35-2 與 43-21 經 由 16S rRNA 序列分析比對後,發現分別和 S. rochei 與 S. neopepcinnius 具有高度的序列相似 度。.

(7) 128. 台灣農業研究 第 69 卷 第 2 期. 鏈 黴 菌 廣 泛 存 在 於 土 壤 中, 為 放 線 菌 科 (Actinomycetaceae) 中最大的一屬,已知可藉 由抗生、競爭及超寄生等作用機制拮抗植物病 原菌 (Schlatter et al. 2009)。過去已有研究證 實利用 Streptomyces diastatochromogenes (Eckwall & Schottel 1997)、Streptomyces violaceusniger (Sarwar et al. 2019) 及 其 他 無 病 原 性 鏈 黴 菌 (Streptomyces spp.) (Ryan et al. 2004; Wanner et al. 2014) 等作為生物防治菌,皆對 S. scabies 具有拮抗的效果。而在其他馬鈴薯瘡痂病 病 原 菌 之 生 物 防 治 研 究 方 面,Hiltunen et al. (2009) 指出 S. griseoviridis 與鏈黴菌菌株 346 (Streptomyces strain 346) 可有效防治 S. turgidiscabies 引起之馬鈴薯瘡痂病。此外,Sarwar et al. (2018) 之研究證實鏈黴菌 (Streptomyces A1RT) 可產生抗生物質 isatropolone C,藉此 抑 制 S. europaeiscabiei 生 長, 同 時 也 對 多 種 馬鈴薯瘡痂病菌具有拮抗效果,包含 S. turgidiscabies、S. scabies 以及 S. stelliscabiei。本 研 究 結 果 也 顯 示 鏈 黴 菌 菌 株 35-2 與 43-21 可 抑 制 S. europaeiscabiei 生 長, 並 於 溫 室 試 驗 中有效降低馬鈴薯之罹病度,具有發展成為防 治馬鈴薯瘡痂病之微生物製劑的潛力,未來將 於田間進行實際應用並評估其可行性。另外, 由於拮抗菌所分泌之酵素或二次代謝物可經由 玻璃紙滲透至培養基中,進而抑制病原菌之生 長,而培養濾液亦是利用拮抗菌產生的二次代 謝物作為抑制病原菌生長之物質。因此,推測 本研究篩選之拮抗菌其抗病機制可能為抗生作 用,但提供拮抗活性之主要抗生物質為何,則 需進一步分析確認。 鏈黴菌除了可作為生物防治菌之外,部分 的鏈黴菌更具有促進植物生長或誘導植物產生 抗病性的效果 (Schlatter et al. 2009),因此鏈黴 菌在生物防治應用上極具潛力。目前研究已證 實 S. rochei 可作為生物製劑,對多種病原真菌 具有防治的效果,如 Rhizoctonia solani、Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici 及 Botryosphaeria dothidea 等。 此 外, 亦 有 增 加 植 物 根 長 及 植株乾重等促進植物生長的功效 (Kanini et al. 2013; Zhang et al. 2016; Zamoun et al. 2017)。 而 S. neopepcinnius 可 對 多 種 病 原 真 菌 表 現 廣 泛 性 的 拮 抗 效 果, 如 Sphaerotheca fusca、As-. pergillus carbonarius 及 Rhizoctonia solani 等, 同時對番茄幼苗等植物的生長具有促進的效果 (Kim et al. 2007; Han et al. 2008; Goudjal et al. 2016)。本研究結果發現,利用鏈黴菌 35-2 與 43-21 菌株培養濾液澆灌之馬鈴薯植株,每株生 產 薯 塊 的 重 量 明 顯 增 加。 因 此,35-2 與 43-21 菌株除了具有拮抗馬鈴薯瘡痂病菌的能力外, 亦具有增加馬鈴薯產量的潛力。 生物防治應用於田間時須面對許多挑戰, 在不同的生長季節,或是在相同季節中於不同 的田區中,生物防治菌之防治效果皆會受到影 響。因每個季節及不同地區之環境條件如土壤 特性、土壤溼度等都具有差異性,而環境亦會 影響病原菌與拮抗菌之生長以及與寄主植物之 間的相互作用,且田間微生物相複雜,常導致 生物防治菌於施用後難以達到預期之病害防治 效 果。Wanner et al. (2014) 於 4 個 不 同 地 區 之試驗田進行鏈黴菌對馬鈴薯瘡痂病之生物防 治試驗,結果顯示僅有 3 個地區的試驗田能顯 著 地 降 低 瘡 痂 病 的 罹 病 度, 同 時 也 發 現 馬 鈴 薯品種亦會影響拮抗菌的防治效果。於所測試 的 3 種馬鈴薯品種中,以「育空黃金」 (‘Yukon Gold’) 馬鈴薯的防治效果最佳,而對「大西洋」 (‘Atlantic’) 馬 鈴 薯 則 出 現 瘡 痂 病 徵 更 為 嚴 重 的情形。Ryan et al. (2004) 利用具拮抗性的鏈 黴菌防治馬鈴薯瘡痂病時,亦發現馬鈴薯品種 會影響生物防治效果,造成上述現象之原因可 能與馬鈴薯品種對病原菌的抗/感病程度有關 (Keinath & Loria 1991)。另外,生物防治菌於 田間的使用方式亦會影響其生物防治的效果、 栽培者使用的意願及經濟成本;將生物拮抗菌 S. violaceusniger 利用土壤澆灌的方式使用, 於田間試驗之效果顯著,可降低 83.07% 之馬 鈴薯瘡痂病罹病度 (Sarwar et al. 2019),但實 務 操 作 上 較 為 耗 時 費 工; 而 利 用 介 質 與 生 物 拮抗菌混拌後再黏附於薯塊表面等方式 (Hiltunen et al. 2009) 雖較為簡便,但仍需考慮生 物拮抗菌黏附度是否足夠。為了兼顧生物防治 菌於田間的使用效果以及栽培者使用上的簡便 性,生物防治技術仍需精益求精,未來將對本 研 究 篩 選 之 鏈 黴 菌 菌 株 35-2 與 43-21 進 行 物 理及化學等特性分析並研發適合之施用技術, 以期能適時、適地且有效地把生物製劑導入作.

(8) 放線菌防治馬鈴薯瘡痂病. 物病害綜合管理體系中,使其發揮優異的防病 功效。 隨著生態環境保護意識的抬頭與消費者對 食品安全的追求,擬定友善環境的農業栽培管 理策略,以維持農業永續經營已成為近年農業 發展的主要目標。其中,推動生物防治技術即 是 主 要 的 手 段 之 一, 本 研 究 所 篩 選 之 鏈 黴 菌 35-2 與 43-21 兼具促進薯塊生長與有效降低馬 鈴薯薯塊被瘡痂病菌感染的雙重效果,為具有 發展為生物製劑潛能之拮抗菌。. 誌謝 本研究工作承洪寶林先生提供土壤樣本及 本研究室同仁林江美華小姐協助試驗進行,特 此致謝。. 引用文獻 Arseneault, T., C. Goyer, and M. Filion. 2015. Pseudomonas fluorescens LBUM223 increases potato yield and reduces common scab symptoms in the field. Phytopathology 105:1311–1317. doi:10.1094/PHYTO-12-14-0358-R Bouchek-Mechiche, K., L. Gardan, P. Normand, and B. Jouan. 2000. DNA relatedness among strains of Streptomyces pathogenic to potato in France: Description of three new species, S. europaeiscabiei sp. nov. and S. stelliscabiei sp. nov. associated with common scab, and S. reticuliscabiei sp. nov. associated with netted scab. Intl. J. Syst. Evol. Microbiol. 50:91–99. doi:10.1099/00207713-50-1-91 Dees, M. W. and L. A. Wanner. 2012. In search of better management of potato common scab. Potato Res. 55:249–268. doi:10.1007/s11540-012-9206-9 Eckwall, E. C. and J. L. Schottel. 1997. Isolation and characterization of an antibiotic produced by the scab disease-suppressive Streptomyces diastatochromogenes strain PonSSII. J. Ind. Microbiol. Biotech. 19:220–225. doi:10.1038/sj.jim.2900455 Edwards, U., T. Rogall, H. Blöcker, M. Emde, and E. C. Böttger. 1989. Isolation and direct complete nucleotide determination of entire genes. Characterization of a gene coding for 16S ribosomal RNA. Nucleic Acids Res. 17:7843–7853. doi:10.1093/nar/17.19. 7843 Flores-González, R., I. Velasco, and F. Montes. 2008. Detection and characterization of Streptomyces causing potato common scab in Western Europe. Plant. 129. Pathol. 57:162–169. doi:10.1111/j.1365-3059.2007. 01734.x Goth, R. W., K. G. Haynes, and D. R. Wilson. 1993. Evaluation and characterization of advanced potato breeding clones for resistance to scab by cluster analysis. Plant Dis. 77:911–914. doi:10.1094/PD77-0911 Goudjal, Y., M. Zamoum, A. Meklat, N. Sabaou, F. Mathieu, and A. Zitouni. 2016. Plant-growth-promoting potential of endosymbiotic actinobacteria isolated from sand truffles (Terfezia leonis Tul.) of the Algerian Sahara. Ann. Microbiol. 66:91–100. doi:10.1007/s13213-015-1085-2 Han, J. H., I. C. Hwang, S. H. Cho, C. Jang, N. G. Kim, S. H. Yu, Y. M. Yu, and S. B. Kim. 2008. Description of Streptomyces neopeptinius sp. nov., an actinobacterium with broad spectrum antifungal activities. J. Microbiol. 46:295–299. doi:10.1007/s12275-0080011-8 Hiltunen, L. H., T. Ojanperä, H. Kortemaa, E. Richter, M. J. Lehtonen, and J. P. T. Valkonen. 2009. Interactions and biocontrol of pathogenic Streptomyces strains co-occurring in potato scab lesions. J. Appl. Microbiol. 106:199–212. doi:10.1111/j.1365-2672. 2008.03992.x Hiltunen, L. H., J. Kelloniemi, and J. P. T. Valkonen. 2014. First report of Streptomyces europaeiscabiei causing common scab on potato in Finland. Plant Dis. 98:1267. doi:10.1094/PDIS-03-14-0278-PDN Huang, C. W. 2008. Potato common scab caused by Streptomyces scabies in Taiwan- Biological characteristics of the pathogen and an attempted biocontrol by antagonistic Bacillus subtilis var. amyloliquefaciens WG6-14. Master Thesis, Department of Plant Pathology, National Chung Hsing University. Taichung, Taiwan. 92 pp. (in Chinese with English abstract) Kanini, G. S., E. A. Katsifas, A. L. Savvides, and A. D. Karagouni. 2013. Streptomyces rochei ACTA1551, an indigenous Greek isolate studied as a potential biocontrol agent against Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici. BioMed Res. Intl. 2013:387230. doi: 10.1155/2013/387230 Keinath, A. P. and R. Loria. 1991. Effects of inoculum density and cultivar resistance on common scab of potato and population dynamics of Streptomyces scabies. Amer. Potato J. 68:515–524. doi:10.1007/ BF02853768 Kim, Y. S., H. M. Kim, C. Chang, I. C. Hwang, H. Oh, J. S. Ahn, K. D. Kim, B. K. Hwang, and B. S. Kim. 2007. Biological evaluation of neopeptins isolated from a Streptomyces strain. Pest Manag. Sci. 63:1208–1214. doi:10.1002/ps.1450.

(9) 130. 台灣農業研究 第 69 卷 第 2 期. Lambert, D. H. and R. Loria. 1989a. Streptomyces acidiscabies sp. nov. Int. J. Syst. Bacteriol. 39:393–396. doi:10.1099/00207713-39-4-393 Lambert, D. H. and R. Loria. 1989b. Streptomyces scabies sp. nov., nom. rev. Intl. J. Syst. Evol. Microbiol. 39:387–392. doi:10.1099/00207713-39-4-387 Larkin, R. P., C. W. Honeycutt, T. S. Griffin, O. M. Olanya, J. M. Halloran, and Z. He. 2011. Effects of different potato cropping system approaches and water management on soilborne diseases and soil microbial communities. Phytopathology 101:58–67. doi:10. 1094/PHYTO-04-10-0100 Leiminger, J., M. Frank, C. Wenk, G. Poschenrieder, A. Kellermann, and A. Schwarzfischer. 2013. Distribution and characterization of Streptomyces species causing potato common scab in Germany. Plant Pathol. 62:611–623. doi:10.1111/j.1365-3059.2012. 02659.x Lin, C., C. H. Tsai, P. Y. Chen, C. Y. Wu, Y. L. Chang, Y. L. Yang, and Y. L. Chen. 2018a. Biological control of potato common scab by Bacillus amyloliquefaciens Ba01. PLoS One 13:e0196520. doi:10.1371/journal. pone.0196520 Lin, C. Y., H. F. Ni, and C. W. Huang. 2018b. First report of common scab on potato caused by Streptomyces europaeiscabiei in Taiwan. Plant Dis. 102:818. doi: 10.1094/PDIS-05-17-0667-PDN Meng, Q., L. E. Hanson, D. Douches, and J. J. Hao. 2013. Managing scab diseases of potato and radish caused by Streptomyces spp. using Bacillus amyloliquefaciens BAC03 and other biomaterials. Biol. Control 67:373–379. doi:10.1016/j.biocontrol.2013.09.009 Miyajima, K., F. Tanaka, T. Takeuchi, and S. Kuninaga. 1998. Streptomyces turgidiscabies sp. nov. Intl. J. Syst. Bacteriol. 48:495–502. doi:10.1099/0020771348-2-495 Ryan, A. D., L. L. Kinkel, and J. L. Schottel. 2004. Effect of pathogen isolate, potato cultivar, and antagonist strain on potato scab severity and biological control. Biocontrol Sci. Technol. 14:301–311. doi:10.1080/0 9583150410001665187 Sarwar, A., Z. Latif, S. Zhang, J. Zhu, D. L. Zechel, and A. Bechthold. 2018. Biological control of potato. common scab with rare Isatropolone C compound produced by plant growth promoting Streptomyces A1RT. Front. Microbiol. 9:1126. doi:10.3389/ fmicb.2018.01126 Sarwar, A., Z. Latif, S. Zhang, J. Hao, and A. Bechthold. 2019. A potential biocontrol agent Streptomyces violaceusniger AC12AB for managing potato common scab. Front. Microbiol. 10:202. doi:10.3389/ fmicb.2019.00202 Schlatter, D., A. Fubuh, K. Xiao, D. Hernandez, S. Hobbie, and L. Kinkel. 2009. Resource amendments influence density and competitive phenotypes of Streptomyces in soil. Microb. Ecol. 57:413–420. doi:10.1007/s00248-008-9433-4 Song, J., S. C. Lee, J. W. Kang, H. J. Baek, and J. W. Suh. 2004. Phylogenetic analysis of Streptomyces spp. isolated from potato scab lesions in Korea on the basis of 16S rRNA gene and 16S–23S rDNA internally transcribed spacer sequences. Intl. J. Syst. Evol. Microbiol. 54:203–209. doi:10.1099/ijs.0.026 24-0 Wang, H., M. Qi, and A. J. Cutler. 1993. A simple method of preparing plant samples for PCR. Nucleic Acids Res. 21:4153–4154. doi:10.1093/nar/21.17.4153 Wanner, L. A. 2009. A patchwork of Streptomyces species isolated from potato common scab lesions in North America. Amer. J. Pot. Res. 86:247–264. doi:10.10 07/s12230-009-9078-y Wanner, L. A., W. W. Kirk, and X. S. Qu. 2014. Field efficacy of nonpathogenic Streptomyces species against potato common scab. J. Appl. Microbiol. 116:123–133. doi:10.1111/jam.12336 Zamoum, M., Y. Goudjal, N. Sabaou, F. Mathieu, and A. Zitouni. 2017. Development of formulations based on Streptomyces rochei strain PTL2 spores for biocontrol of Rhizoctonia solani damping-off of tomato seedlings. Biocontrol Sci. Technol. 27:723–738. doi:10.1080/09583157.2017.1334257 Zhang, Q., D. Yong, Y. Zhang, X. Shi, B. Li, G. Li, W. Liang, and C. Wang. 2016. Streptomyces rochei A-1 induces resistance and defense-related responses against Botryosphaeria dothidea in apple fruit during storage. Postharvest Biol. Technol. 115:30– 37. doi:10.1016/j.postharvbio.2015.12.013.

(10) 放線菌防治馬鈴薯瘡痂病. 131. Identification and Evaluation of Antagonistic Actinobacteria on Controlling Potato Common Scab Ching-Yi Lin1,*, Hui-Fang Ni2, and Hui-Ju Lin3. Abstract Lin, C. Y., H. F. Ni, and H. J. Lin. 2020. Identification and evaluation of antagonistic actinobacteria on controlling potato common scab. J. Taiwan Agric. Res. 69(2):122–131.. Potato common scab is an economically important disease that is caused by several members of the genus Streptomyces in the world. As no effective pesticides and limited results of crop rotation and resistant potato cultivars for managing the disease, this study explored the possibility of using biological control. A total of 85 isolates of actinobacteria were isolated from soil from six different locations in Kaohsiung City. Cellophane paper antibiotic method and bacterial culture filtrates application were conducted to determine antagonistic activity against Streptomyces europaeiscabiei. Isolates 35-2 and 43-21 strongly inhibited S. europaeiscabiei growth in both assays. When potato plants were drenched with culture filtrates of isolates 35-2 and 43-21, respectively, significantly reduced potato common scab incidence was observed in pot assays. The disease severity was 28% after isolate 35-2 treatment and 35% after isolate 43-21 treatment. In addition, isolates 35-2 and 43-21 increased potato tubers weight in pot assays. These results suggested that isolates 35-2 and 43-21 could provide a dual benefit by decreasing potato common scab disease severity and increasing potato yield as an effective biological control agent. Based on 16S rRNA sequencing analysis, the two antagonistic isolates 35-2 and 43-21 showed a sequence identity of 100% and 99% with Streptomyces rochei and Streptomyces neopeptinius, respectively. Key words: Potato common scab, Streptomyces spp., Biologic control.. Received: September 5, 2019; Accepted: December 17, 2019. * Corresponding author, e-mail: eris2024@dns.caes.gov.tw 1 Assistant Research Fellow, Department of Plant Protection, Chiayi Agricultural Experiment Branch, Taiwan Agricultural Research Institute, Chiayi, Taiwan, ROC. 2 Associate Research Fellow and Head, Department of Plant Protection, Chiayi Agricultural Experiment Branch, Taiwan Agricultural Research Institute, Chiayi, Taiwan, ROC. 3 Project Assistant, Department of Plant Protection, Chiayi Agricultural Experiment Branch, Taiwan Agricultural Research Institute, Chiayi, Taiwan, ROC..

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參考文獻

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