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0%

NEK1NR1H4 NR1I3

Mean of viability (%)

附錄五

GeneGo分析42個抑制細胞生長基因的分子路徑

42個抑制癌細胞生長基因,我們以 GeneGo 的 Shortest Path 模式分析可能的 分子傳遞路徑分析,產生了三條主要的訊息傳遞路徑 (Insulin receptor、IGF-1 receptor、ErbB4),主要經過 MAPK pathway 調控 CDK-3 的活性,來抑制口腔 癌細胞的生長。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄六

1 Development_ERBB-family signaling 0.000007 4/38

2 Transcription_Receptor-mediated HIF regulation 0.000008 4/39

3 Translation _Regulation activity of EIF2 0.000008 4/39

4 Transcription_CREB pathway 0.000011 4/42

5 CGU network cutoff=3 0.000013 5/92

6 Signal transduction_PTEN pathway 0.000016 4/46

7 Transcription_Transcription factor Tubby signaling pathways 0.000024 3/17

8 Development_IGF-RI signaling 0.000024 4/51

9 Immune response _IFN gamma signaling pathway 0.000031 4/54

10 Immune response_Fc epsilon RI pathway 0.000033 4/55

11 Development_EGFR signaling pathway 0.000036 4/56

12 Immune response_TREM1 signaling pathway 0.000036 4/56

13 Development_Prolactin receptor signaling 0.000041 4/58

14 Development_Angiotensin signaling via beta-Arrestin 0.000078 3/25

15 Immune response_CD16 signaling in NK cells 0.000081 4/69

16 Development_Dopamine D2 receptor transactivation of PDGFR in

non-neuronal cells 0.000151 3/31

17 Development_EGFR signaling via small GTPases 0.000166 3/32

18 Cell cycle_Role of Nek in cell cycle regulation 0.000166 3/32

19 CGUW6-map1 0.000209 4/88

20 Apoptosis and survival_Anti-apoptotic action of membrane-bound ESR1 0.000217 3/35

附錄七

GeneGo 統計分析 42 個抑制癌細胞生長基因的分子路徑 附錄六的圖表化整理,長條圖方式呈現。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄八

ERBB 家族的分子傳遞路徑圖

GeneGo Pathway Maps 模式,分析 42 個抑制癌細胞生長基因所參與的每一

條分子傳遞路徑,共有四個基因參與ERBB 家族的分子傳遞路徑,由圖中紅色長

條物所標示的(ERBB4、cCtl、PI3K reg class IA、MEK1/2)

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄九

HIF 藉由受器調控的分子路徑圖

GeneGo Pathway Maps 模式,分析 42 個抑制癌細胞生長基因所參與的每一

條分子傳遞路徑,共有四個基因參與HIF 藉由受器調控的分子路徑,由圖中紅色

長條物所標示的 (IGF-1 receptor、Insulin receptor、PI3K cat class IA、MEK1)。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄十

EIF2 調控轉錄層次的分子路徑圖

用 GeneGo Pathway Maps模式,分析 42個抑制癌細胞生長基因所參與的每一條 分子傳遞路徑,共有四個基因參與 EIF2 調控轉錄層次的分子路徑。由圖中紅色 長條物所標示的 (Insulin receptor、c-Ctl、PI3K reg class IA、MEK1)。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄十一

GeneGo評估42個基因的細胞生理功能

以 GeneGo Pathway Map Folder 模式分析基因的功能性,細胞週期 (cell cycle)

的調控是最主要抑制癌細胞生長的因素。其中由NEK 所參與的細胞週期調控路

徑,是主要的分子調控路徑(表十五、圖二十九、圖三十三)。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

Name pValue Network

objects

1 Cell cycle and its regulation 0.000669 6/252

2 Hypoxia response regulation 0.001080 4/105

3 Vascular development (Angiogenesis) 0.001975 9/687

4 Mitogenic signaling 0.002417 11/1012

5 Estrogen signaling 0.002973 7/456

6 Tissue remodeling and wound repair 0.003506 10/898

7 Calcium signaling 0.004259 7/486

8 Hemopoiesis regulation 0.009151 6/423

9 Myogenesis regulation 0.010270 3/103

10 Lipid Biosynthesis and regulation 0.019050 7/643

11 Cardiac Hypertrophy 0.022580 4/248

12 Protein synthesis 0.023120 5/377

13 DNA-damage response 0.037770 5/429

14 Nuclear receptor signaling 0.047660 7/776

15 Blood clotting 0.050190 4/319

16 Cell differentiation 0.084920 12/1848

17 Apoptosis 0.123000 8/1154

18 Androgen signaling 0.245700 2/214

19 Inflammatory response 0.279800 6/1003

20 Diuresis 0.335300 1/91

附錄十二

GeneGo評估42個基因的細胞生理功能 附錄十一的圖表化整理,長條圖方式呈現。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄十三

GeneGo評估42個基因的細胞週期調控

以 GeneGo Pathway Map Folder 模式分析基因的功能性,細胞週期 (cell cycle) 的調控是最主要抑制癌細胞生長的因素。其中由 NEK 所參與的細胞週期調控路 徑,是主要的分子調控路徑。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

Name pValue Network

objects

1 Cell cycle_Role of Nek in cell cycle regulation 0.094940 3/32 2 DNA damage_ATM / ATR regulation of G2 / M checkpoint 0.661300 1/26 3 Cell cycle_Regulation of G1/S transition (part 2) 0.661300 1/26 4 Cell cycle_Role of SCF complex in cell cycle regulation 0.705100 1/29 5 DNA damage_ATM/ATR regulation of G1/S checkpoint 0.744100 1/32 6 Cell cycle_ESR1 regulation of G1/S transition 0.756100 1/33 7 Cell cycle_The metaphase checkpoint 0.789300 1/36 8 Cell cycle_Regulation of G1/S transition (part 1) 0.809300 1/38

附錄十四

GeneGo 評估 42 個基因的細胞週期調控

以 GeneGo Pathway Map Folder 模式分析基因的功能性,細胞週期 (cell cycle)的調控是最主要抑制癌細胞生長的因素。其中由 NEK 所參與的細胞週期 調控路徑,是主要的分子調控路徑。附錄十三的圖表化整理,以長條圖方式呈 現。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)

附錄十五

NEK 所參與的細胞週期調控路徑

用 GeneGo Pathway Map Folder 模式,分析 42 個抑制癌細胞生長基因的功能 性,細胞週期 (cell cycle) 的調控是最主要抑制癌細胞生長的因素。其中由 NEK 所參與的細胞週期調控路徑,是主要的分子調控路徑。共有三個基因參與,由圖 中紅色長條物所標示的 (Insulin receptor、PI3K cat class IA、NEK1)。

(中國醫藥大學 高銘欽老師實驗室 未發表的研究成果)