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超微量分光光度計 (NanoDrop Spectrophotometer) 壹、用途說明

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Academic year: 2022

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(1)

超微量分光光度計 (NanoDrop Spectrophotometer) 壹、用途說明

ND-1000

一、簡介

ND-1000 超微量分光光度計是 NanoDrop 的第一個產品,應用液體的表面張力特 性,只需要 1~2ul 樣品,在偵測台上,經上下臂的接觸拉出固定的光徑(1mm 及 0.2mm)達到快速、微量、高濃度、免石英管、免毛細管等耗材偵測吸收值的 優點。此產品設計受專利保護,並在全世界廣受歡迎,其準確度與便利性讓科學 家得以更有效率進行各項研究(網頁連結:

http://www.nanodrop.com/nd-1000-testimonials.html)。

ND-1000 使用高能量氙燈(pulsed xenon flash lamp)可提供 220~750nm 的全光譜 偵測,且不需要暖機,開機後可立即使用。搭配高感度 CCD array 偵測器,偵測 吸收值可高達 75Abs(dsDNA 濃度 2~3700ng/ul),大部分純化後的核酸幾乎都 不需要稀釋即可偵測。

待測樣品的均質性是 ND-1000 的最高要求,一般核酸、蛋白質樣品能在偵測前 以 vortex mixer 震勻為最佳,若無 vortex mixer 也應以 pipette 吸放數次混勻。若 擔心 genomic DNA 可能因前述動作而斷裂,則改以 55 ゚ C 加熱約一分鐘,使樣 品在偵測前呈現均勻狀態。

偵測時選擇不同偵測模式,可以得到最快速的結果:

Nucleic Acid – 吸收光譜、230nm, 260nm, 280nm 吸收值(換算成 10mm 光徑吸 收值)、260/280 ratio、260/230 ratio 及核酸濃度。

UV-Vis – 220~750nm 間所有波長的吸收值及光譜(以 1mm 光徑吸收值呈現)。

(2)

濃度範圍:

樣品種 類

最低 濃度

最高濃度 (超過此濃度

請稀釋樣品) 再現性 (五重複以上)

核酸 2 ng/ul

3700 ng/ul (dsDNA) 3000 ng/ul (RNA) 2400 ng/ul (ssDNA)

濃度範圍在 2-100 ng/ul 時,

SD 為 ± 2 ng/ul

濃度範圍大於 100 ng/ul 時,

CV 為 ± 2%

純 BSA

0.10

mg/ml 100 mg/ml

濃度範圍在 0.05-10 mg/ml 時,SD 為 ± 0.10 mg/ml 濃度大於 10 mg/ml 時,CV 為

± 2%

二、使用方法舉例

dsDNA:

在主畫面點選 Nucleic Acid,依軟體跳出對話框動作(確認台面清潔,並在偵測 台上點 1ul 二次水,放下上臂後再按 OK)完成電腦與儀器連線。依照 DNA 所 溶於之液體準備該溶液(務必確認 DNA 溶於二次水、TE buffer 或哪一組 kit 的 elution buffer)取出 1.5~2 ul 點在偵測台上,放下上臂後再按 Blank。在右上方拉 選 Sample Type DNA-50,在 Sample ID 位置輸入樣品名稱,將樣品混勻,取出 1.5~2 ul 點在偵測台上,放下上臂後再按 Measure。《示範影片》

結果:

(3)

DNA 濃度即以 65.003 x 50 = 3250.1 算出。 260/280 介於 1.8~2.0 通常代表此為較 純的 DNA(隨 DNA 組成不同會有差異)。 260/230 高於 260/280,介於 1.8~2.2 通常表示純化過程殘留污染物較少。若欲察看 220~340nm 間其他波長的吸收值,

可使用滑鼠拉動位於 230nm 的直線,或在右邊λ 處輸入其他數值。

三、結果整理:

當次偵測完的所有樣品可按 Show Report 得到,此 report 可另存為 ndj 檔案,使 用 excel 開啟。不同天的結果,可從 Data Viewer 內選 Import Samples,將欲放在 同一份 report 內的樣品挑選出來產生一份新的 report。《示範影片》

四、注意事項:

1. 嚴禁使用測定蛋白質

2. 偵測後立即使用拭鏡紙(Kimwipe 類)擦拭台面。先取一張將上下台面的液 體吸走,再將此 laboratory wipe 吸過樣品的面反折到內部,折疊四次後以單方向 多次擦拭台面(DNA 擦 5 次,Protein 擦 20 次)。《示範影片》

(4)

3. 同一滴液體只能做一次偵測,欲重複定量同一樣品,請擦掉前一滴,重新取 出一滴進行偵測。

4. 基本上核酸樣品可使用 1~2ul 做測量,隨各液體體積特性之不同會有不同體積 需求,原則上不超過 2ul。並請使用 2ul pipette 避免體積不足導致液柱無法完整 形成。唯蛋白質樣品因呈色劑與蛋白質本身特性,務必使用 2ul 進行偵測。

5. 當軟體跳出錯誤訊息時,請詳細閱讀並依指示進行障礙排除。最常發生的情 形是在偵測過程液柱並未正確形成,軟體會出現以下訊息。可先用肉眼觀察液柱 是否未完整連接上下台面,或樣品內有泡泡,將上臂拉起後,擦掉該滴樣品,再 重新進行偵測,必要時可將樣品體積加大至 2ul。

正確的液柱應為:

6. 不可使用含有 Hydrofluoric Acid (HF)之樣品,其他無腐蝕性之液體皆可使用。

7. 儀器上方的黑色線為光纖,使用時請勿拉扯。

(5)

五、日常與定期維護:

1.平時保持台面及儀器本身清潔。

2.定期校正。

3.其他 FAQ 請參考:ND-1000 Support 貳、使用規則

一、本機以隨到隨用為原則。

二、機器操作結束後,請使用拭鏡紙(Kimwipe 類)擦拭台面後,再用二次水測 讀背景值,並記載於登記簿上。

參、使用手冊

【ND-1000 使用手冊】

肆、相關連結

博克科技

參考文獻

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