[PDF] Top 20 利用空間相關結構片段快速尋找蛋白質結合片段與環境之研究

... 筆。觀察後發現部分沒被辨識出的原因在片段二及片段四並未辨認出這些蛋白 質鏈。對於這樣的問題，我們推測當片段中擁有高比例的二級結構組成時，在搜尋蛋白 質資料庫時不具鑒別度而無法提供有效的搜尋結果。因此，我們延長這種二級結構組成 ... See full document

... 搜 尋 相 似 結 構 元 。I-sites 先是將胺基酸序列打散，再將這些子序列 (subsequence)加以分群，分群好後再以結構再做一次分群，Tendulkar 則是選擇 56 個特性來分群。上述兩種方法都會面臨到不知道分幾群才適合、選擇群中心 ... See full document

... 首先感謝楊進木老師在我這幾年的研究所生涯的指導，無論是在我難過低潮時，老 師總會悉心指引我方向，提供各種方法來解決我的困境。又或是在我研究順利成果豐碩 時，老師總會真心地拍拍我的肩膀給我一聲讚賞與鼓勵。我不會忘記在老師想到什麼很 有趣的研究點子時，那種眉飛色舞、眼光閃耀的神情。對於研究未知的問題充滿好奇、 ... See full document

... 誌 謝 我謹將此論文獻給再這兩年一直祝福我的主耶穌，是他的祝福使我可以如 此順利的完成我的碩士論文，也感謝我的家人一直支持我、幫助我。謝謝 黃鎮剛教授，在我初踏進生資領域時，耐心的指導我如何做研究，告訴我 如何解決問題，他對科學的熱情與執著是我學習的目標。謝謝實驗室的夥 伴，少偉、建華、志鵬、志豪，在研究上給予我極大的協助，沒有你們我 ... See full document

... 在整個研究過程中，老師花費了很多心力及時間，悉心指導我的論文與研 究。老師對於學術研究的細心、嚴謹、堅持與執著，將是我未來持續學習 的目標。 這本論文能夠順利完成，要感謝實驗室所有同學的幫忙。特別感謝章 維，他早期的初步研究以及撰寫程式的功力，都為我奠定了穩固的基礎， ... See full document

... 我真的很遺憾，有認識好女生的話我會繼續努力。 謝謝黃少偉學長及游景盛學長對我研究上的指導，祝福林志鵬學長與徐蔚倫學姐感 情順利，連師母都有在關注你們的發展。謝謝幾乎顏士中學長與賴彥龍學長，看你們互 槓是研究生活的樂趣之一。謝謝李啟文學長與林肇基學長，他們的態度有值得我學習的 ... See full document

... 摘要 我們成功的利用熱氣相沉積法成長兩種型態氧化鋅奈米結構—氧化鋅奈米 鋸子以及氧化鎂鋅奈米線。 在鋸齒狀的氧化鋅奈米結構研究中，我們以X光繞射,電子顯微鏡，以及拉曼 光譜確定其為纖鋅礦結構的氧化鋅。在低激發功率的室溫光激發光光譜中，能量 ... See full document

... 讓人又愛又怕的宵夜、趕作業的革命情感、因為睡太晚而遮遮掩掩閃進實驗 室........，感謝眾位學長姐、同學、學弟妹的共同砥礪(墮落?)，你/妳們的陪 伴讓兩年的研究生活變得絢麗多彩。 感謝建華、草爸、水蛭、書瑋學長、蔚倫學姐們不厭其煩的指出我研究中的 缺失，且總能在我迷惘時為我解惑，也感謝鍾錡同學的幫忙，恭喜我們順利走過 這兩年。實驗室的松桓學弟當然也不能忘記，他的幫忙及搞笑我銘感在心。 ... See full document

... 如何與環境刺激交互作用，是生命科學先 驅性研究的重點。蛋白質不僅在細胞裡催 化大多數的反應，更控制著細胞的代謝過 程。目前確定蛋白質三維結構的主要技術 是利用X射線繞射結晶儀及磁核共振儀等 方法，但以上兩種方法皆屬相當緩慢且耗 ... See full document

... 國科會補助專題研究計畫成果報告自評表 請就研究內容與原計畫相符程度、達成預期目標情況、研究成果之學術或應用價 值（簡要敘述成果所代表之意義、價值、影響或進一步發展之可能性） 、是否適 合在學術期刊發表或申請專利、主要發現或其他有關價值等，作一綜合評估。 ... See full document

... 4 種成分所組成。稍後薩門霍夫加入這個團隊齧 開始對 DNA的4種成分進行定齬的分析。 鼙時普遍猜測 A、G、T、C 在 DNA 裡的比 率應該相去不遠齧但 3 人獲得的實驗數據卻完 全不是這麼回事齧他們發現在不同 DNA 鼙中齧 A、G、T、C 的比率並不相同。最有趣的是齧 不管 4 種成分的比率如何變化齧A 與 T 的數齬總 是非常相近齧G 與 C 的數齬也幾乎相同。鼙時 ... See full document

... 電影【花神咖啡館】的海報，兩組家庭，透過相同姿勢糾纏的擁抱，暗示著故事曲折。 （照片來源／一起擁抱幸福吧痞克邦） 一九六九年賈桂琳生下一患有唐氏症的男孩羅宏，丈夫卻因此拋棄母子，留下賈桂琳成為單親媽 媽，不幸的命運、眾人的唾棄，賈桂琳卻不因此認輸，全心全意疼愛照顧、教育羅宏；一日羅宏 遇見真命天女薇若，羅宏整日只想和她在一起，漸漸淡出對媽媽的愛，賈桂琳意識到自己的愛被 ... See full document

... 必須具有比對部份結構並可適當插入間隔的功能。 我們應用了 fastCOPS 做為蛋白質結構模板搜尋以及識別的工具。fastCOPS 利用許多的蛋白質結構模板做測試，包括 treble clef finger 以及 leucine-rich ... See full document

... Because the profile of pattern candidates were generated from alignments of ATP-binding domains and the protein sequences in dataset 1 are not all have “ATP-binding” annotations in “KW” [r] ... See full document

... 自然逐漸變得疏離陌生。便利的生活同時也帶來了大量對土地、環境與水的汙染 與破壞。在環境保護的議題愈趨重視與資源枯竭危機下，世界各國積極重視環境 友善與資源再生議題。 「禪」 ，講求的是心靈層次的感受與啟發，從自然的變化譬 如四季、二十四節氣中體悟生存之道。 ... See full document

... Study of chitinase and chitin binding protein from molecular cloning, structure and mechanistic action to the.. applications.[r] ... See full document

... 我們開發了一個定量的方法，用以客觀的描述星系周圍的宇宙大尺 度結構，進而定量地分析其星系性質與大尺度環境之間的關係。 我們的目標是要了解不同的大尺度環境與小尺度環境之中星系性質 ... See full document

... viii Acknowledgements 這一段旅程能夠走完，承蒙許多人的恩惠，在此無法一一詳述，但吾將由衷地感恩著。首 先要感謝廖光文老師，在這兩年研究生活中，能提供良好的實驗資源，不論在儀器設備上或著 材料的購買，也都願意給予我們大膽去嘗試與操作，難能可貴；而對於實驗的瓶頸也能秉著熱 心一起商量對策，很多時候都讓我當頭棒喝，豁然開朗之感。再來要感謝的是詩涵學姐，和我 ... See full document

... 這段求學時光裡，很感謝實驗室的成員們：特別謝謝雅惠和美珠學姊的耐心 指導，從剛進來養細胞開始帶領我們逐漸熟悉；謝謝冠勳和 Emy，我們一同在彼此 的陪伴激勵下成長，很想說，有你們真好；謝謝蔡博士，在轉換論文題目時及後 續的實驗安排等，提供我相當多的指導和協助；謝謝益誌、曉薇學姊和張姊在我 換到新環境後，帶領我能夠迅速進入狀況，並在實驗上提供建議和幫助。謝謝大 ... See full document

... 摘 要 隨著蛋白質結晶結構的快速增加，以結構為基礎之藥物設計與虛擬藥物篩選(virtual screening)在先導藥物開發過程日漸重要。目前一系列的分子對接(protein-ligand docking) 以及虛擬藥物篩選方法已經被應用到先導藥物發展中，並且已獲得數個成功的藥物開發 ... See full document