基督長老教會是真柄最早成立的教會，在民國38 年的由傳道士進入真柄牧 會，當時因為人數較少，真柄尚未設立教堂，所以教友都到南溪一戶姓章的人家 裡做禮拜，直到民國39 年真柄以茅草搭建第一間教堂，才開始在真柄作禮拜。
民國45 年設立第二間教堂在現今的位置，當時仍是以茅草搭建，之後陸續修工 為瓦房，直到民國63 年完修為現代的水泥房。當時的教友曾經高達 100 多人，
至今約有40 戶信仰，每週固定參與禮拜的教友約 30~40 人不等，教會設有牧師 1 人，長老 6 人，執事 6 人。按照台灣基督長老會「教會法規」規定，以牧師和 長老組成三種會議來推行一切教會事工，各堂會的叫「小會」，各區域的叫「中 會」，與台灣全島的叫「總會」。台灣基督長老教會組織大致區分為小會、中會、
總會三個層級，總會之下設有常置委員會，然後其下層組織為各中會、區會、小
會(李粲然 1992：26-29)。真柄基督長老教會屬東美中會下的長濱區會之真柄長 老會，下設有小會，是由牧師1 人、長老 2 人組成，掌理傳道、敬拜、財務、任 免掌職等事務，是教會最高行政機構。小會下有長執會，負責執行小會決議的事 務，由長老與執事所組成。除了小會與長職會之外，還包括由全體信徒組成的會 員大會，會員可以選舉牧師、長老和執事(參見圖四)。
圖四、真柄基督長老教會組織架構。(參考張麗美 2005:59)
CT(59 歲，教會牧師，在真柄已牧會 11 年)表示基督長老教會在民國 38 年 初期剛進入真柄牧會的時後相當困難，因為當時的教義是反對族人參加豐年祭的 活動，甚至後來教友曾經因為豐年祭的參與和族人發生衝突。近20 年來，總會 開始強調地方特色的發展，教會的立場已經由過去的反對逐漸轉緩為開放但是仍 存在一些限制：
教會並不會限制教友是否參與部落的活動，但是希望教友能夠從活動當中獲 得啟發，比如說：豐年祭的活動是要強調團結的精神，但是年輕人卻沒有將 它應用在出社會工作的精神。基督長老教會注重日常的生活規範，鼓勵教友 唸聖經，因為母語的聖經要唸出來才會了解意思，無法用讀的，從閱讀聖經 裡獲得上帝給予的訊息或指示。我希望藉由教會來提倡社區教育的文化，和 現代社會文化同步，我認為社區現在的教育與現代脫節，一方面沒有將古老 的精神延續下來，另一方面族人在社會上競爭力也不夠充足。
基督長老教會在真柄的教友人數是第二多，僅次於天主教會，因為教會不再 限制教友參與部落傳統活動，加上禮拜的方式以比較歡樂的歌唱來讚頌對上帝的 愛，故吸引比較多年輕人和小孩成為教友。此外，在牧師教義的宣導下，教友普 遍從事長久穩定性的工作，較少從事打零工的現象，教友對於子女教育的態度也 比較積極。基督長老教會在真柄的立場已經從過去完全隔閡的態度，逐漸轉換為 協調的合作，目前僅有少數老人家不會參加部落的活動。以2007 年的豐年祭為 例，CT 牧師主持了開幕典禮中午吃豬肉前的帶禱儀式，並與部落一起在聚會所 共食豬肉。從CT 牧師參與豐年祭的開幕午餐行為來看，至少有幾個面向可以分 析：1.部落年齡組與基督長老教會試圖妥協彼此都認同的豐年祭參與，儘管午餐 的參與包括了大部分的族人，但是真耶穌教會和少數基督長老教友未前來參加。
說明了青年之父對牧師的邀請可能不只是對他的尊敬，也在期待其它少數基督長 老教友能夠一起參與豐年祭活動。2. 牧師只參加豐年祭五天行程中的開幕午 餐，似乎也代表著他並沒有完全接受豐年祭舉辦的形式，心理上仍是「條件性」
的參與，特別是喝酒的行為一直以來是牧師所反對的。然而牧師參與豐年祭的活 動是否具有帶頭的作用，不參加的基督長老教友會不會因此而加入豐年祭的活 動，則有待日後的觀察。