第二章 研究方法
第一節 研究材料與儀器
3. 檢測細胞內粒線體膜電位的變化
DiOC6 (3-3’-dihexyloxacarbocyanine)為對粒線體具專一性之親脂 性陽離子螢光染劑,容易和帶有負電性之粒線體內膜結合,當粒線體受 刺激去極化而失去內膜之負電荷時,內膜被標定 DiOC6 會減少,因此 螢光強度也會降低,可作為偵測粒線體膜電位(MMP)之指標。在流式 細胞儀中可由488 nm 雷射激發出 525 nm 的螢光,以 FL1 之濾鏡偵測所 放出的螢光強度,藉以分析MMP。而粒線體的退極化(mitochondria membranes depolarization)伴隨早期的細胞凋亡發生,因此亦可做早期 凋亡偵測上的指標。
培養細胞之細胞數約 2×105/well,要有 1-2 個 well 做 blank。將人 類大腸直腸癌細胞株(COLO 205)種於 12 well 培養盤中,培養 24 小 時,給予 Catharidine 藥物,分別培養 3 小時、6 小時、12 小時後收集細 胞,PBS 清洗,離心後去除上清液,加入 MMP 試劑(10 μl DioC6/500 μl 之 1 倍的 PBS),量視細胞數多寡而定,混合均勻,Blank 只加等量 1X PBS,放入水浴鍋 37℃中,避光 30 分鐘,之後移置 FACS 管上流式細 胞儀分析。將 blank(斜線的 peak)調在 100~101之間,control (格線的 control)調在 101~102之間,樣品上機後,分析 MMP (peak 往右移代 表樣品的粒線體膜電位上升,表示藥物對粒線體沒影響。往左移代表粒 線體膜電位下降,導致細胞凋亡)。
4. 活性氧化物(Reactive oxygen species, ROS)產生之檢測(87)
2’,7’- Dichlorodihydrofluorescein diacetate (H2DCFDA),為一種具 有螢光性質可通過細胞膜並具特異性追蹤評估細胞內產生 ROS 的多 寡,進行細胞染色。當H2DCF-DA 細胞內的乙醯脂酶(easterase)去乙 醯化(deacetylate)後會形成非螢光性的 DCFH,DCFH 會被細胞內的 H2O 氧化成具螢光性質的 DCF,並聚集在粒線體中,在流式細胞儀中可 由 488 nm 雷射激發出 355 nm 的螢光,藉以分析細胞內的 ROS 含量。
培養細胞之細胞數約 2×105/well,要有 1-2 個 well 做 blank。將人 類大腸直腸癌細胞株(COLO 205)種於 12 well 培養盤中,培養 24 小 時,給予Cantharidin (20 μM),分別培養 3 小時、6 小時、12 小時後收 集細胞,1X PBS 清洗,離心後去上清液,加入 ROS 試劑(每支離心管 所需的量是 1 μl H2DCF-DA/500 μl 之 1X PBS)500 μl,混合均勻,Blank 只加等量1X PBS。放入水浴鍋 37℃中避光 30 分鐘,之後上流式細胞儀 分析。將 blank (斜線的 peak)調在 100~101之間,control (格線的 control) 調在101~102之間,樣品上機後,分析ROS (peak 往右移代表樣品的 ROS 增加,往左移則代表 ROS 被清除(抗氧化))。
5. Caspase-3,-8,-9 活性分析(88)
PhiPhiLux 是利用設計一段可供 Caspase-3 及 Caspase-3-like 蛋白 辨識, 且能主動被細胞嗜入, loop 結構兩端標有螢光的 peptide,此段 peptide 稱為 PhiPhiLux。當此 PhiPhiLux 與受到刺激而產生凋亡現象的 細胞 (suspension / adherence ) 共同培養時, 會主動被這些已經 Induced Living Cell 大量噬入,由於此活細胞內部產生的 Caspase-3 結合到 PhiPhiLux 上的 GDEVDGI, 加上序列 PNP 的輔助, 造成 PhiPhiLux 結構上的斷裂, 使 Loop 結構兩端的螢光物質結合, 因而產生螢光。也 因此設計原理, PhiPhiLux 有放大活細胞內 Caspase-3 與 Caspase-3-like 的訊號放大的功能,另外偵測 Caspase-8,-9 活性亦以相同原理,但用 CaspaLux 染劑來偵測。之後用流式細胞儀以 488 nm 激發光,偵測定量與 定性,偵測到更早期、更完整、更準確的活細胞凋亡狀態。
培養細胞之細胞數約2×105/well。將人類大腸直腸癌細胞株(COLO 205)種於 12 well 培養盤中,培養 24 小時,給予 Cantharidin (20 μM)
藥物,收集細胞,離心到第二次,去上清液,避光加入染劑,每管加25 μl (10 μM substrate [Phiphilux for Caspase-3, CaspaLux L1D2 for Caspase-8 CaspaLux M1D2 for Caspase-9]),於 37℃中避光 60 分鐘。60 分鐘後,離 心 1500 rpm、5 分鐘,先把染劑倒掉,再用 1X PBS 把殘留染劑洗 1~2 次後,每管加入 500μl 之 1X PBS,並移至 FACS 管,之後上流式細胞 儀分析。Control (格線的 control)調在 101~102之間,樣品上機後,分析 Caspase-3,-8,-9 活性(peak 往右代表樣品的 Caspase-3,-8,-9 活性產生)。
六、 細胞內分子螢光染色—TUNEL/DAPI 螢光染色法
(89)1. TUNEL (Terminal deoxynucltidetransferase dUTP Nick End Labeling) / DAPI (4-6-diamidine-2-phenyl indole)染色
DNA 雙鏈斷裂或只要一條鏈上出現缺口而產生的一系列 DNA 的 3’-OH 末端可在脫氧核糖核酸末端轉移脢(TdT)的作用下,將脫氧核 糖核酸和熒光素、過氧化物脢、堿性磷酸化脢或生物 Living beings 素形 成的衍生物 Living beings 標記到 DNA 的 3’-末端,從而可進行凋亡細 胞的檢測,這類方法一般稱為脫氧核糖核酸末端轉移脢介導的缺口末端 標記法(TUNEL)。DAPI 是一種核酸螢光染劑,會專一性的結合在 DNA 雙螺旋之小溝上的 AT 區,當細胞產生凋亡時會有染色質皺縮、DNA 片
Formaldehyde / 1X PBS,固定 15 分鐘,吸掉 3% Formaldehyde,用 1X PBS 洗二次,加入 0.1% Triton X-100 / in 1X PBS (1 ml)反應 15 分鐘,
再用1X PBS 洗二次,加入 In Situ Cell Death Detection Kit (TUNEL)中提 供的螢光染劑,在 37℃下避光反應 60 分鐘後用 1×PBS 清洗細胞三次,
再於避光環境加入加入 DAPI 染液 ( 1 μg/1 ml )約 300 μl,在 37℃避光 30 分鐘,吸掉染劑,用 1X PBS 洗三次,於倒立螢光顯微鏡 F = 200X
觀察細胞核與DNA 斷裂之變化並照相。 buffer、5μl ATP (1mM)與 5μl biotinylated MV peptide 當受質於 30℃反應 30 分鐘,再加入 200μl stop reagent 終止反應。然後離心(14,000 rpm,15 秒),將 100μl 的上清液移至經處理的 96-well 之培養皿中,於 25℃中避 光反應 1 小時後,去上清液,以 1X PBS 清洗 5 次,再加入 100μl POD-streptavidin 於 25℃中避光反應 30 分鐘,以 1X PBS 清洗 5 次最後 加入POD substrate 於 25℃中避光反應 5 分鐘,用 ELISA reader 於波長 492 nm 下測吸光值。
八、 即時定量聚合酵素連鎖反應(Real-time Polymerase Chain Reaction)(Real-time PCR)
(91)係利用對雙股 DNA 具有特異性結合能力的螢光染料,加入 PCR 反應過程之中。利用螢光信號積累即時監測整個 PCR 反應過程,最後 利用過程中的螢光信號及反應循環次數的數據,以數學計算分析得知未 知標本的DNA 的起始含量。每個標本的 Ct 值與該標本的起始拷貝數的
對數存在線性關係,起始拷貝數越多,Ct 值越小。
利用Gene QuantⅡ (Pharmacia Biotech)測量 RNA 濃度及 A260/280 在 1.8~2.0 之間確保 RNA 的純度及品質。
biotin / dNTP mixture 和 1 μl klenow enzyme (Roche Applied Science, Mannheim, Germany),混合均勻並放入 37℃水浴槽作用 20 小時。合成 好的探針須放在-20℃保存。
4. Real-time quantitative RT-PCR (qRT-PCR)的分析
利用LightCycler (Roche Applied science, Mannheim,
Germany) 進行 Real-time PCR,取 1μl 之 cDNA (約 50ng RNA),加 1μl 之 LC Fast Start DNA Master SYBR Green Kit (Roche Applied Science, Mannheim, Germany) 及 3-4mM MgCl2 和 0.5mM 待偵測基因 primers,
最後體積為 10μl。 PCR 條件為 95℃,5 秒,Anneal 溫度依 primer 而 異,時間為5 秒,最後 72℃ (temperature ramp was 20 ℃ / sec),8 秒,
進行45 cycles。擴增產物的專一性由 Melting curve 來判定。以 GAPDH gene 當作 internal control 來校正相對的 mRNA concentrations,為了要 保證實驗的準確性及再現性,在不同的時間點重覆實驗,Real-time PCR 之資料利用 LightCycler Software Version3.5 軟體內之 second derivative maximum method 來訂定 Ct,最後再用 ΔCt 方法來計算基因之表現量。
九、西方墨點法
1. 細胞總蛋白質的抽取(93)
培養細胞之細胞數約 1×107 cells。將人類大腸直腸細胞癌細 胞株(COLO 205)種於 75T 培養瓶中,培養 24 小時,給予 Cantharidin
(20 μM)至培養液中,分別培養 6 小時、12 小時、18 小時、24 小 時,分別以 trypin 處理,將細胞收集至離心管離心 1500 rpm、5 分鍾,
離心後去除上清液,加入適量1X PBS,將細胞收取下移至 1.5 ml 的 eppendorf tube,再離心一次,然後加入適量的 lysis buffer (pH 7.4 Tris-HCl 50 mM、EDTA 0.5 mM、EGTA 0.5 mM、5 μg/μuL Aprotinin 0.3% 2-Mercaptoethanol、0.2 mM PMSF、5 μg/μl Leupeptin、),置於 -80℃冰箱放置 24 小時後,取出然後離心 12000 rpm、20 分鐘、4℃,
取所有上清液此為總蛋白質,接著用 100℃沸水煮 5~10 分鍾,即可 置於-20℃冰箱保存備用,待所有時間點收齊再進行下面實驗。
2. 蛋白質定量
a. 檢量線的製作
以Bradford 定量法,使用胎牛血清白蛋白(Bovine serum albumin;
BSA)做為蛋白質標準品,利用酵素免疫分析儀(ELISA reader)在 O.D. 570 nm 測定蛋白質標準品吸光平均值來做檢量線(standard
curve),以計算蛋白質濃度,並求出趨勢線方程式及 r2值。
先取 Bradford reagent 染劑適量備用。取適量已配製好的標準品
(BSA 1mg/ml)加等量的二次水調配最終濃度梯度為 1、0.5、0.25、
0.125、0.0625、0 mg/ml,各取 10 μl 加 100 μl Bradford reagent 混合均 勻,置於 96 well plate 中(二重複),靜置 5 分鐘後以 O.D. 570 nm 測 量吸光值,測得標準品之吸光平均值,以 O.D. value (Y) 對蛋白質濃 度μg/ml(X),求出趨勢線方程式 y=ax+b,r2值趨近於0.99。
b.樣品定量
將待測蛋白稀釋10 倍,取 10 μl 已配製好的待測蛋白質加 100 μl Bradford reagent 混和均勻,置於 96 well plate 中(二重複),靜置 5 分鐘後以O.D. 570 nm 測量吸光值,所測得的 O.D. value (Y),帶入趨 勢線方程式y=ax+b,求出該待測蛋白的蛋白質濃度(μg/ml)。
3. SDS-PAGE 凝膠電泳
a.SDS-Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE)電泳:
電泳法是利用外加電場,對溶液中的帶電分子造成影響而使這些 分子移動,進而分離不同分子量的蛋白質。先配製下層膠,然後注入 膠台,緩緩用二次水去除氣泡並壓平下層膠的上緣,靜置一段時間待
樣品槽梳子(comb)到未凝固的膠體中,避免氣泡產生。靜置一段時 間,上層膠凝固後。將鑄好的膠體放入電泳槽中,加入電泳緩衝液
(Running buffer),然後小心拔出樣品槽梳子。做好的膠體先以 110 V、預跑 20 分鐘。將抽取好的蛋白質先 denature 然後與 4 倍 protein loading dye 混合 (蛋白質濃度約為 30 μg/μl)。取 5 μl 分子量標準品 (maker)和配製好的蛋白(30 μg/μl)由左至右分別 loading 到槽中。以 90 V 開始電泳。
4. 轉漬(Transfer)
電泳結束後,取下膠片將其放在Gel transfer device 轉漬到 PVDF 膜上。然後取下PVDF 膜用 5%脫脂牛奶 blocking 1 小時。然後置換 一級抗體(溶於 5﹪脫脂牛奶 in 0.05﹪ Tween 20 in 1X PBS 中),放在 4 ℃冰箱中 overnight。隔天取出 PVDF 膜後置於小盒中以 0.05﹪
Tween 20 in 1X PBS 清洗 5 分鐘共 3 次。加入二級抗體溶於 5﹪脫脂 牛奶in 0.05﹪ Tween 20 in 1X PBS 中,震盪 1 小時,再取出 PVDF 膜後以0.05﹪ Tween 20 in 1X PBS 於小盒中清洗 5 分鐘共 3 次,即 可入暗房壓片。
5. 壓片步驟:(暗房中進行)
將 ECL 試劑之混合液(每瓶各取適量等比例混合)均勻滴在 PVDF 膜上反應約一分鐘。壓片卡匣(Cassette)內先以投影片剪成兩半,再用 膠帶黏合成卡片形式,PVDF 膜正面朝上、marker 放左邊置於壓片卡 匣(Cassette)內。以 Hyperfilm 軟片(柯達)進行壓片,感光時間依 PVDF 膜上螢光亮度決定時間長短,約 5 秒至數小時不等。感光完成後放入 顯影劑進行顯影(時間依實際觀察決定),再以清水沖洗 30 秒後放入 定影劑中,過30 秒後再以清水沖洗 30 秒,將底片晾乾,最後在掃描 到電腦中存檔,最後利用Gel-pro 軟體分析各蛋白質的表現量。
第三節 統計方法
實驗數據結果採用 SPSS 電腦統計套裝軟體中之變異數分析 (one-way-ANOVA)進行統計分析,以平均值標準差(mean ± SD)表示,
實驗組與對照組間之數據以 Student-t test 進行統計比較。當 p<0.05 表示具統計學上有差異意義,以”*”代表。
第三章 研究結果
第 一 節 Cantharidin 對 人 類 結 腸 直 腸 癌 細 胞
(COLO 205)細胞型態的影響
COLO 205細胞給予濃度20μM Cantharidin各培養24、48小時後,
利用倒立式顯微鏡觀察細胞型態的變化(圖 十五)。結果可發現細胞 於第24小時,其細胞型態皺縮不規則化,且伴隨有凋亡小體的產生。
而在第48小時觀察發現皺縮不規則化狀況更加明顯,而且細胞質空泡 化、有凋亡小體的產生、細胞數目明顯減少。結果推論Cantharidin會 抑制COLO 205細胞增殖且有細胞凋亡的現象。
第二節 探討 Canthaeridin 對人類結腸直腸癌細胞存 活率的影響
將 人 類 結 腸 直 腸 癌 細 胞 株 (COLO 205 ) 加 入 不 同 濃 度 的 Cantharidin(濃度皆為 5、10、20、40 μM)。分別培養 24、48、72
將 人 類 結 腸 直 腸 癌 細 胞 株 (COLO 205 ) 加 入 不 同 濃 度 的 Cantharidin(濃度皆為 5、10、20、40 μM)。分別培養 24、48、72